Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW12

Cnga4, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnga4Q3UW12 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
Cnga4Q3UW12 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC34.19■■■■□ 3.06
Cnga4Q3UW12 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.93■■■■□ 3.02
Cnga4Q3UW12 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
Cnga4Q3UW12 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC33.01■■■□□ 2.87
Cnga4Q3UW12 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
Cnga4Q3UW12 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Cnga4Q3UW12 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Cnga4Q3UW12 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.7
Cnga4Q3UW12 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
Cnga4Q3UW12 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
Cnga4Q3UW12 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
Cnga4Q3UW12 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.62
Cnga4Q3UW12 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
Cnga4Q3UW12 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC31.08■■■□□ 2.57
Cnga4Q3UW12 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
Cnga4Q3UW12 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
Cnga4Q3UW12 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC30.96■■■□□ 2.55
Cnga4Q3UW12 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Cnga4Q3UW12 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Cnga4Q3UW12 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Cnga4Q3UW12 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
Cnga4Q3UW12 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC30.55■■■□□ 2.48
Cnga4Q3UW12 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
Cnga4Q3UW12 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC30.44■■■□□ 2.46
Cnga4Q3UW12 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Cnga4Q3UW12 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Cnga4Q3UW12 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Cnga4Q3UW12 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
Cnga4Q3UW12 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
Cnga4Q3UW12 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Cnga4Q3UW12 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Cnga4Q3UW12 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
Cnga4Q3UW12 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Cnga4Q3UW12 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Cnga4Q3UW12 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC29.76■■■□□ 2.36
Cnga4Q3UW12 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
Cnga4Q3UW12 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Cnga4Q3UW12 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Cnga4Q3UW12 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Cnga4Q3UW12 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Cnga4Q3UW12 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Cnga4Q3UW12 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Cnga4Q3UW12 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
Cnga4Q3UW12 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Cnga4Q3UW12 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Cnga4Q3UW12 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Cnga4Q3UW12 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Cnga4Q3UW12 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Cnga4Q3UW12 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Cnga4Q3UW12 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Cnga4Q3UW12 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Cnga4Q3UW12 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
Cnga4Q3UW12 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Cnga4Q3UW12 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Cnga4Q3UW12 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Cnga4Q3UW12 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Cnga4Q3UW12 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Cnga4Q3UW12 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
Cnga4Q3UW12 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Cnga4Q3UW12 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Cnga4Q3UW12 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Cnga4Q3UW12 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Cnga4Q3UW12 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Cnga4Q3UW12 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Cnga4Q3UW12 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
Cnga4Q3UW12 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Cnga4Q3UW12 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Cnga4Q3UW12 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Cnga4Q3UW12 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Cnga4Q3UW12 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Cnga4Q3UW12 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Cnga4Q3UW12 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Cnga4Q3UW12 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
Cnga4Q3UW12 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Cnga4Q3UW12 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Cnga4Q3UW12 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Cnga4Q3UW12 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Cnga4Q3UW12 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Cnga4Q3UW12 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Cnga4Q3UW12 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Cnga4Q3UW12 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Cnga4Q3UW12 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Cnga4Q3UW12 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Cnga4Q3UW12 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Cnga4Q3UW12 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Cnga4Q3UW12 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Cnga4Q3UW12 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Cnga4Q3UW12 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Cnga4Q3UW12 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Cnga4Q3UW12 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Cnga4Q3UW12 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Cnga4Q3UW12 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Cnga4Q3UW12 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Cnga4Q3UW12 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Cnga4Q3UW12 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Cnga4Q3UW12 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Cnga4Q3UW12 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Cnga4Q3UW12 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Cnga4Q3UW12 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 7.5 ms