Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGU5

Ccny, Cyclin-Y, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcnyQ8BGU5 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC37.57■■■■□ 3.6
CcnyQ8BGU5 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
CcnyQ8BGU5 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
CcnyQ8BGU5 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
CcnyQ8BGU5 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
CcnyQ8BGU5 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.88■■■■□ 3.01
CcnyQ8BGU5 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC33.34■■■□□ 2.93
CcnyQ8BGU5 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
CcnyQ8BGU5 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC32.66■■■□□ 2.82
CcnyQ8BGU5 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC32.56■■■□□ 2.8
CcnyQ8BGU5 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC32.29■■■□□ 2.76
CcnyQ8BGU5 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
CcnyQ8BGU5 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
CcnyQ8BGU5 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC32.03■■■□□ 2.72
CcnyQ8BGU5 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
CcnyQ8BGU5 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
CcnyQ8BGU5 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC31.46■■■□□ 2.63
CcnyQ8BGU5 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
CcnyQ8BGU5 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
CcnyQ8BGU5 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
CcnyQ8BGU5 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
CcnyQ8BGU5 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
CcnyQ8BGU5 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
CcnyQ8BGU5 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
CcnyQ8BGU5 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
CcnyQ8BGU5 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
CcnyQ8BGU5 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
CcnyQ8BGU5 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
CcnyQ8BGU5 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC31.15■■■□□ 2.58
CcnyQ8BGU5 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
CcnyQ8BGU5 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
CcnyQ8BGU5 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
CcnyQ8BGU5 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
CcnyQ8BGU5 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
CcnyQ8BGU5 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
CcnyQ8BGU5 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC30.67■■■□□ 2.5
CcnyQ8BGU5 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC30.65■■■□□ 2.5
CcnyQ8BGU5 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
CcnyQ8BGU5 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
CcnyQ8BGU5 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
CcnyQ8BGU5 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
CcnyQ8BGU5 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
CcnyQ8BGU5 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
CcnyQ8BGU5 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
CcnyQ8BGU5 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
CcnyQ8BGU5 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
CcnyQ8BGU5 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
CcnyQ8BGU5 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
CcnyQ8BGU5 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC29.87■■■□□ 2.37
CcnyQ8BGU5 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
CcnyQ8BGU5 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC29.68■■■□□ 2.34
CcnyQ8BGU5 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
CcnyQ8BGU5 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
CcnyQ8BGU5 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
CcnyQ8BGU5 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
CcnyQ8BGU5 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CcnyQ8BGU5 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CcnyQ8BGU5 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CcnyQ8BGU5 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
CcnyQ8BGU5 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CcnyQ8BGU5 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CcnyQ8BGU5 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
CcnyQ8BGU5 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CcnyQ8BGU5 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CcnyQ8BGU5 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CcnyQ8BGU5 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
CcnyQ8BGU5 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CcnyQ8BGU5 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CcnyQ8BGU5 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CcnyQ8BGU5 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CcnyQ8BGU5 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
CcnyQ8BGU5 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CcnyQ8BGU5 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CcnyQ8BGU5 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CcnyQ8BGU5 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CcnyQ8BGU5 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CcnyQ8BGU5 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
CcnyQ8BGU5 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CcnyQ8BGU5 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CcnyQ8BGU5 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CcnyQ8BGU5 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CcnyQ8BGU5 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CcnyQ8BGU5 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CcnyQ8BGU5 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CcnyQ8BGU5 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
CcnyQ8BGU5 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
CcnyQ8BGU5 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
CcnyQ8BGU5 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CcnyQ8BGU5 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CcnyQ8BGU5 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CcnyQ8BGU5 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CcnyQ8BGU5 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CcnyQ8BGU5 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CcnyQ8BGU5 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CcnyQ8BGU5 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CcnyQ8BGU5 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CcnyQ8BGU5 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CcnyQ8BGU5 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CcnyQ8BGU5 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CcnyQ8BGU5 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 139.7 ms