RNA–Protein interactions for RNA: YNL208W

YNL208W, Transcript of Protein of unknown function, yeast

Gene YNL208W, Length 600 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YNL208W	YNL208W	CET1	O13297	549 aa	Predicted RBP	13.79	□□□□□ -0.2
YNL208W	YNL208W	SBP1	P10080	294 aa	Known RBP	13.79	□□□□□ -0.2
YNL208W	YNL208W	HSC82	P15108	705 aa	Known RBP	13.79	□□□□□ -0.2
YNL208W	YNL208W	UBA1	P22515	1024 aa	Known RBP	13.79	□□□□□ -0.2
YNL208W	YNL208W	VAC17	P25591	423 aa		13.79	□□□□□ -0.2
YNL208W	YNL208W	YCR090C	P25654	182 aa	Known RBP	13.79	□□□□□ -0.2
YNL208W	YNL208W	BRF1	P29056	596 aa		13.79	□□□□□ -0.2
YNL208W	YNL208W	MUP3	P38734	546 aa		13.79	□□□□□ -0.2
YNL208W	YNL208W	YDR089W	P38966	869 aa		13.79	□□□□□ -0.2
YNL208W	YNL208W	YIR007W	P40566	764 aa		13.79	□□□□□ -0.2
YNL208W	YNL208W	GCD14	P46959	383 aa	Predicted RBP	13.79	□□□□□ -0.2
YNL208W	YNL208W	MAP1	Q01662	387 aa	Known RBP RIP-Chip data	13.79	□□□□□ -0.2	not detected
YNL208W	YNL208W	BLS1	Q06071	122 aa		13.79	□□□□□ -0.2
YNL208W	YNL208W	VTA1	Q06263	330 aa		13.79	□□□□□ -0.2
YNL208W	YNL208W	BUD7	Q08754	746 aa		13.79	□□□□□ -0.2
YNL208W	YNL208W	RHO2	P06781	192 aa		13.78	□□□□□ -0.2
YNL208W	YNL208W	SEC53	P07283	254 aa	Known RBP	13.78	□□□□□ -0.2
YNL208W	YNL208W	SPS1	P08458	490 aa		13.78	□□□□□ -0.2
YNL208W	YNL208W	SEC63	P14906	663 aa		13.78	□□□□□ -0.2
YNL208W	YNL208W	APA1	P16550	321 aa	Known RBP	13.78	□□□□□ -0.2
YNL208W	YNL208W	PHO3	P24031	467 aa		13.78	□□□□□ -0.2
YNL208W	YNL208W	SPS19	P32573	292 aa	Known RBP	13.78	□□□□□ -0.2
YNL208W	YNL208W	TFC3	P34111	1160 aa		13.78	□□□□□ -0.2
YNL208W	YNL208W	IRS4	P36115	615 aa	Known RBP	13.78	□□□□□ -0.2
YNL208W	YNL208W	ARP4	P80428	489 aa		13.78	□□□□□ -0.2
YNL208W	YNL208W	PEX13	P80667	386 aa		13.78	□□□□□ -0.2
YNL208W	YNL208W	OSH6	Q02201	448 aa		13.78	□□□□□ -0.2
YNL208W	YNL208W	MRH1	Q12117	320 aa	Predicted RBP	13.78	□□□□□ -0.2
YNL208W	YNL208W	YPR089W	O13585	888 aa		13.77	□□□□□ -0.21
YNL208W	YNL208W	SEM1	O94742	89 aa		13.77	□□□□□ -0.21
YNL208W	YNL208W	HEM2	P05373	342 aa		13.77	□□□□□ -0.21
YNL208W	YNL208W	PRP4	P20053	465 aa	Known RBP	13.77	□□□□□ -0.21
YNL208W	YNL208W	SNT1	P25357	1226 aa		13.77	□□□□□ -0.21
YNL208W	YNL208W	MRPL9	P31334	269 aa		13.77	□□□□□ -0.21
YNL208W	YNL208W	PRP18	P33411	251 aa	Predicted RBP	13.77	□□□□□ -0.21
YNL208W	YNL208W	YHB1	P39676	399 aa	Known RBP	13.77	□□□□□ -0.21
YNL208W	YNL208W	IRR1	P40541	1150 aa		13.77	□□□□□ -0.21
YNL208W	YNL208W	MRM2	P53123	320 aa		13.77	□□□□□ -0.21
YNL208W	YNL208W	COG7	P53195	279 aa		13.77	□□□□□ -0.21
YNL208W	YNL208W	NMA2	P53204	395 aa		13.77	□□□□□ -0.21
YNL208W	YNL208W	YNR061C	P53747	219 aa		13.77	□□□□□ -0.21
YNL208W	YNL208W	YMR102C	Q03177	834 aa		13.77	□□□□□ -0.21
YNL208W	YNL208W	SPO20	Q04359	397 aa		13.77	□□□□□ -0.21
YNL208W	YNL208W	ICT1	Q12385	394 aa		13.77	□□□□□ -0.21
YNL208W	YNL208W	GTT2	Q12390	233 aa		13.77	□□□□□ -0.21
YNL208W	YNL208W	NMT1	P14743	455 aa		13.76	□□□□□ -0.21
YNL208W	YNL208W	GUT1	P32190	709 aa		13.76	□□□□□ -0.21
YNL208W	YNL208W	TOA1	P32773	286 aa		13.76	□□□□□ -0.21
YNL208W	YNL208W	EFM1	P38732	585 aa		13.76	□□□□□ -0.21
YNL208W	YNL208W	UBP6	P43593	499 aa	Known RBP	13.76	□□□□□ -0.21
YNL208W	YNL208W	NUP84	P52891	726 aa		13.76	□□□□□ -0.21
YNL208W	YNL208W	ALR1	Q08269	859 aa		13.76	□□□□□ -0.21
YNL208W	YNL208W	STB3	Q12427	513 aa		13.76	□□□□□ -0.21
YNL208W	YNL208W	SEC15	P22224	910 aa		13.75	□□□□□ -0.21
YNL208W	YNL208W	NPP1	P25353	742 aa		13.75	□□□□□ -0.21
YNL208W	YNL208W	PTM1	P32857	523 aa		13.75	□□□□□ -0.21
YNL208W	YNL208W	CSE1	P33307	960 aa		13.75	□□□□□ -0.21
YNL208W	YNL208W	DCW1	P36091	449 aa		13.75	□□□□□ -0.21
YNL208W	YNL208W	GDH3	P39708	457 aa		13.75	□□□□□ -0.21
YNL208W	YNL208W	SER33	P40510	469 aa		13.75	□□□□□ -0.21
YNL208W	YNL208W	SET2	P46995	733 aa	Known RBP	13.75	□□□□□ -0.21
YNL208W	YNL208W	RNR4	P49723	345 aa	Known RBP	13.75	□□□□□ -0.21
YNL208W	YNL208W	AIF1	P52923	378 aa		13.75	□□□□□ -0.21
YNL208W	YNL208W	SWC4	P53201	476 aa		13.75	□□□□□ -0.21
YNL208W	YNL208W	CLD1	P53264	445 aa		13.75	□□□□□ -0.21
YNL208W	YNL208W	FRE4	P53746	719 aa		13.75	□□□□□ -0.21
YNL208W	YNL208W	RMI1	Q02685	241 aa		13.75	□□□□□ -0.21
YNL208W	YNL208W	YPR084W	Q06821	456 aa		13.75	□□□□□ -0.21
YNL208W	YNL208W	HBT1	Q07653	1046 aa	Known RBP	13.75	□□□□□ -0.21
YNL208W	YNL208W	ENT4	Q07872	247 aa		13.75	□□□□□ -0.21
YNL208W	YNL208W	YOR012W	Q12351	137 aa		13.75	□□□□□ -0.21
YNL208W	YNL208W	YMR084W	A2P2R3	262 aa		13.74	□□□□□ -0.21
YNL208W	YNL208W	MPH2	P0CD99	609 aa		13.74	□□□□□ -0.21
YNL208W	YNL208W	EXO70	P19658	623 aa		13.74	□□□□□ -0.21
YNL208W	YNL208W	PCL5	P38794	229 aa		13.74	□□□□□ -0.21
YNL208W	YNL208W	ERP5	P38819	212 aa		13.74	□□□□□ -0.21
YNL208W	YNL208W	BZZ1	P38822	633 aa		13.74	□□□□□ -0.21
YNL208W	YNL208W	SHU2	P38957	223 aa		13.74	□□□□□ -0.21
YNL208W	YNL208W	SEC31	P38968	1273 aa	Known RBP	13.74	□□□□□ -0.21
YNL208W	YNL208W	PRM2	P40534	656 aa		13.74	□□□□□ -0.21
YNL208W	YNL208W	LSM3	P57743	89 aa	Known RBP	13.74	□□□□□ -0.21
YNL208W	YNL208W	NPL3	Q01560	414 aa	Known RBP RIP-Chip data	13.74	□□□□□ -0.21	RIP-Chip
YNL208W	YNL208W	CCE1	Q03702	353 aa		13.74	□□□□□ -0.21
YNL208W	YNL208W	TAF12	Q03761	539 aa		13.74	□□□□□ -0.21
YNL208W	YNL208W	IRC10	Q08118	586 aa		13.74	□□□□□ -0.21
YNL208W	YNL208W	RNA1	P11745	407 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
YNL208W	YNL208W	PMT1	P33775	817 aa		13.73	□□□□□ -0.21
YNL208W	YNL208W	PTH2	P34222	208 aa		13.73	□□□□□ -0.21
YNL208W	YNL208W	CTP1	P38152	299 aa		13.73	□□□□□ -0.21
YNL208W	YNL208W	DBP8	P38719	431 aa		13.73	□□□□□ -0.21
YNL208W	YNL208W	MEP1	P40260	492 aa		13.73	□□□□□ -0.21
YNL208W	YNL208W	NNF1	P47149	201 aa		13.73	□□□□□ -0.21
YNL208W	YNL208W	GOT1	Q03554	138 aa		13.73	□□□□□ -0.21
YNL208W	YNL208W	CLU1	Q03690	1277 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
YNL208W	YNL208W	SPC24	Q04477	213 aa		13.73	□□□□□ -0.21
YNL208W	YNL208W	RCO1	Q04779	684 aa		13.73	□□□□□ -0.21
YNL208W	YNL208W	YOL019W	Q08157	551 aa		13.73	□□□□□ -0.21
YNL208W	YNL208W	RIB2	Q12362	591 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
YNL208W	YNL208W	YPL247C	Q12523	523 aa		13.73	□□□□□ -0.21
YNL208W	YNL208W	GAL11	P19659	1081 aa		13.72	□□□□□ -0.21

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 45.9 ms