RNA–Protein interactions for RNA: YKL195W

MIA40, Transcript of Mitochondrial oxidoreductase, yeast

Gene MIA40, Length 1,212 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Mitochondria .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
MIA40	YKL195W	BUD32	P53323	261 aa		6.57	□□□□□ -1.36
MIA40	YKL195W	ATP25	Q03153	612 aa		6.57	□□□□□ -1.36
MIA40	YKL195W	TRS31	Q03337	283 aa		6.57	□□□□□ -1.36
MIA40	YKL195W	ACL4	Q03771	387 aa		6.57	□□□□□ -1.36
MIA40	YKL195W	YMR155W	Q03795	547 aa		6.57	□□□□□ -1.36
MIA40	YKL195W	CSN9	Q03981	162 aa		6.57	□□□□□ -1.36
MIA40	YKL195W	RPN9	Q04062	393 aa	Known RBP	6.57	□□□□□ -1.36
MIA40	YKL195W	BCP1	Q06338	283 aa		6.57	□□□□□ -1.36
MIA40	YKL195W	MRI1	Q06489	411 aa	Known RBP	6.57	□□□□□ -1.36
MIA40	YKL195W	SLD7	Q08457	257 aa		6.57	□□□□□ -1.36
MIA40	YKL195W	RUP1	Q12242	671 aa		6.57	□□□□□ -1.36
MIA40	YKL195W	NHA1	Q99271	985 aa		6.57	□□□□□ -1.36
MIA40	YKL195W	YPR089W	O13585	888 aa		6.56	□□□□□ -1.36
MIA40	YKL195W	RPL24A	P04449	155 aa	Known RBP	6.56	□□□□□ -1.36
MIA40	YKL195W	RHO2	P06781	192 aa		6.56	□□□□□ -1.36
MIA40	YKL195W	SBP1	P10080	294 aa	Known RBP	6.56	□□□□□ -1.36
MIA40	YKL195W	HSP26	P15992	214 aa	Known RBP RIP-Chip data	6.56	□□□□□ -1.36	not detected
MIA40	YKL195W	VPS34	P22543	875 aa		6.56	□□□□□ -1.36
MIA40	YKL195W	NAR1	P23503	491 aa	Known RBP	6.56	□□□□□ -1.36
MIA40	YKL195W	SPR1	P32603	445 aa		6.56	□□□□□ -1.36
MIA40	YKL195W	SRP101	P32916	621 aa		6.56	□□□□□ -1.36
MIA40	YKL195W	SIP2	P34164	415 aa	Known RBP	6.56	□□□□□ -1.36
MIA40	YKL195W	NUP120	P35729	1037 aa		6.56	□□□□□ -1.36
MIA40	YKL195W	MAK5	P38112	773 aa	Predicted RBP	6.56	□□□□□ -1.36
MIA40	YKL195W	CTP1	P38152	299 aa		6.56	□□□□□ -1.36
MIA40	YKL195W	SIF2	P38262	535 aa		6.56	□□□□□ -1.36
MIA40	YKL195W	ATG12	P38316	186 aa		6.56	□□□□□ -1.36
MIA40	YKL195W	TSC10	P38342	320 aa		6.56	□□□□□ -1.36
MIA40	YKL195W	YHL041W	P38730	149 aa		6.56	□□□□□ -1.36
MIA40	YKL195W	VAC8	P39968	578 aa		6.56	□□□□□ -1.36
MIA40	YKL195W	JEM1	P40358	645 aa		6.56	□□□□□ -1.36
MIA40	YKL195W	OPT1	P40897	799 aa		6.56	□□□□□ -1.36
MIA40	YKL195W	CCT7	P42943	550 aa	Known RBP	6.56	□□□□□ -1.36
MIA40	YKL195W	BST1	P43571	1029 aa		6.56	□□□□□ -1.36
MIA40	YKL195W	DLD2	P46681	530 aa	Known RBP	6.56	□□□□□ -1.36
MIA40	YKL195W	SNG1	P46950	547 aa		6.56	□□□□□ -1.36
MIA40	YKL195W	MRX6	P48564	524 aa		6.56	□□□□□ -1.36
MIA40	YKL195W	ASN2	P49090	572 aa	Known RBP	6.56	□□□□□ -1.36
MIA40	YKL195W	COS6	P53344	381 aa		6.56	□□□□□ -1.36
MIA40	YKL195W	EFM6	P53970	246 aa		6.56	□□□□□ -1.36
MIA40	YKL195W	YDR109C	Q04585	715 aa		6.56	□□□□□ -1.36
MIA40	YKL195W	SEC10	Q06245	871 aa		6.56	□□□□□ -1.36
MIA40	YKL195W	LDB18	Q07887	179 aa		6.56	□□□□□ -1.36
MIA40	YKL195W	MRN1	Q08925	612 aa	Known RBP RIP-Chip data	6.56	□□□□□ -1.36	not detected
MIA40	YKL195W	YPR202W	Q08993	238 aa		6.56	□□□□□ -1.36
MIA40	YKL195W	GCD2	P12754	651 aa	Predicted RBP	6.55	□□□□□ -1.36
MIA40	YKL195W	NSP1	P14907	823 aa	Known RBP	6.55	□□□□□ -1.36
MIA40	YKL195W	IDI1	P15496	288 aa		6.55	□□□□□ -1.36
MIA40	YKL195W	PRP6	P19735	899 aa	Predicted RBP	6.55	□□□□□ -1.36
MIA40	YKL195W	SEC15	P22224	910 aa		6.55	□□□□□ -1.36
MIA40	YKL195W	SPS22	P25380	463 aa		6.55	□□□□□ -1.36
MIA40	YKL195W	BEM1	P29366	551 aa		6.55	□□□□□ -1.36
MIA40	YKL195W	BEM3	P32873	1128 aa		6.55	□□□□□ -1.36
MIA40	YKL195W	PTH2	P34222	208 aa		6.55	□□□□□ -1.36
MIA40	YKL195W	KAP104	P38217	918 aa	Known RBP	6.55	□□□□□ -1.36
MIA40	YKL195W	POA1	P38218	177 aa		6.55	□□□□□ -1.36
MIA40	YKL195W	UTP9	P38882	575 aa	Known RBP	6.55	□□□□□ -1.36
MIA40	YKL195W	ELO3	P40319	345 aa		6.55	□□□□□ -1.36
MIA40	YKL195W	LSB6	P42951	607 aa		6.55	□□□□□ -1.36
MIA40	YKL195W	PRP24	P49960	444 aa	Known RBP	6.55	□□□□□ -1.36
MIA40	YKL195W	TAN1	P53072	289 aa	Predicted RBP	6.55	□□□□□ -1.36
MIA40	YKL195W	TRM112	P53738	135 aa	Predicted RBP	6.55	□□□□□ -1.36
MIA40	YKL195W	REG1	Q00816	1014 aa		6.55	□□□□□ -1.36
MIA40	YKL195W	OSH6	Q02201	448 aa		6.55	□□□□□ -1.36
MIA40	YKL195W	YPL034W	Q03083	165 aa		6.55	□□□□□ -1.36
MIA40	YKL195W	YDR476C	Q03362	224 aa		6.55	□□□□□ -1.36
MIA40	YKL195W	ENT4	Q07872	247 aa		6.55	□□□□□ -1.36
MIA40	YKL195W	GLT1	Q12680	2145 aa	Known RBP	6.55	□□□□□ -1.36
MIA40	YKL195W	MRP10	O75012	95 aa		6.54	□□□□□ -1.36
MIA40	YKL195W	CAR1	P00812	333 aa	Known RBP	6.54	□□□□□ -1.36
MIA40	YKL195W	NMT1	P14743	455 aa		6.54	□□□□□ -1.36
MIA40	YKL195W	RPB4	P20433	221 aa	Predicted RBP	6.54	□□□□□ -1.36
MIA40	YKL195W	GFD2	P25370	566 aa	Known RBP	6.54	□□□□□ -1.36
MIA40	YKL195W	PGS1	P25578	521 aa		6.54	□□□□□ -1.36
MIA40	YKL195W	RAD27	P26793	382 aa		6.54	□□□□□ -1.36
MIA40	YKL195W	TFC3	P34111	1160 aa		6.54	□□□□□ -1.36
MIA40	YKL195W	TOM20	P35180	183 aa		6.54	□□□□□ -1.36
MIA40	YKL195W	GCS1	P35197	352 aa		6.54	□□□□□ -1.36
MIA40	YKL195W	TFA2	P36145	328 aa		6.54	□□□□□ -1.36
MIA40	YKL195W	KTR4	P38131	464 aa		6.54	□□□□□ -1.36
MIA40	YKL195W	ECM13	P38195	257 aa		6.54	□□□□□ -1.36
MIA40	YKL195W	SEO1	P39709	593 aa		6.54	□□□□□ -1.36
MIA40	YKL195W	RGI2	P40188	164 aa		6.54	□□□□□ -1.36
MIA40	YKL195W	YJR061W	P40355	935 aa		6.54	□□□□□ -1.36
MIA40	YKL195W	PRM2	P40534	656 aa		6.54	□□□□□ -1.36
MIA40	YKL195W	UFE1	P41834	346 aa		6.54	□□□□□ -1.36
MIA40	YKL195W	FOL2	P51601	243 aa	Known RBP	6.54	□□□□□ -1.36
MIA40	YKL195W	NUP84	P52891	726 aa		6.54	□□□□□ -1.36
MIA40	YKL195W	PEX8	P53248	589 aa		6.54	□□□□□ -1.36
MIA40	YKL195W	COG2	P53271	262 aa		6.54	□□□□□ -1.36
MIA40	YKL195W	GND2	P53319	492 aa		6.54	□□□□□ -1.36
MIA40	YKL195W	CUS2	P53830	285 aa	Predicted RBP	6.54	□□□□□ -1.36
MIA40	YKL195W	REX2	P54964	269 aa	Known RBP	6.54	□□□□□ -1.36
MIA40	YKL195W	PET117	Q02771	107 aa		6.54	□□□□□ -1.36
MIA40	YKL195W	FMP30	Q02883	468 aa		6.54	□□□□□ -1.36
MIA40	YKL195W	HER2	Q03557	464 aa		6.54	□□□□□ -1.36
MIA40	YKL195W	YET2	Q04210	160 aa		6.54	□□□□□ -1.36
MIA40	YKL195W	JIP5	Q06214	492 aa	Predicted RBP	6.54	□□□□□ -1.36
MIA40	YKL195W	EMG1	Q06287	252 aa	Known RBP	6.54	□□□□□ -1.36
MIA40	YKL195W	CRN1	Q06440	651 aa		6.54	□□□□□ -1.36

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