RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000636120.1

PDE4D-228, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PDE4D, Length 6,659 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-228ENST00000636120 FBXO11Q86XK2 927 aa7.19□□□□□ -1.26
PDE4D-228ENST00000636120 SIRT2Q8IXJ6 389 aa7.19□□□□□ -1.26
PDE4D-228ENST00000636120 ARFGAP2Q8N6H7 521 aa7.19□□□□□ -1.26
PDE4D-228ENST00000636120 FAM212AQ96EL1 285 aa7.19□□□□□ -1.26
PDE4D-228ENST00000636120 CAPZA3Q96KX2 299 aa7.19□□□□□ -1.26
PDE4D-228ENST00000636120 DIP2BQ9P265 1576 aa7.19□□□□□ -1.26
PDE4D-228ENST00000636120 NOP56O00567 594 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
PDE4D-228ENST00000636120 CROCCP2Q86T23 111 aa7.19□□□□□ -1.26
PDE4D-228ENST00000636120 FBXO18Q8NFZ0 1043 aa7.19□□□□□ -1.26
PDE4D-228ENST00000636120 USP28Q96RU2 1077 aa7.19□□□□□ -1.26
PDE4D-228ENST00000636120 DDX25Q9UHL0 483 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
PDE4D-228ENST00000636120 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa7.18□□□□□ -1.26
PDE4D-228ENST00000636120 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa7.18□□□□□ -1.26
PDE4D-228ENST00000636120 GCNT3O95395 438 aa7.18□□□□□ -1.26
PDE4D-228ENST00000636120 SERPINB2P05120 415 aa7.18□□□□□ -1.26
PDE4D-228ENST00000636120 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP7.18□□□□□ -1.26
PDE4D-228ENST00000636120 GRAPQ13588 217 aa7.18□□□□□ -1.26
PDE4D-228ENST00000636120 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP7.18□□□□□ -1.26
PDE4D-228ENST00000636120 MAK16Q9BXY0 300 aaKnown RBP7.18□□□□□ -1.26
PDE4D-228ENST00000636120 PCDHB13Q9Y5F0 798 aa7.18□□□□□ -1.26
PDE4D-228ENST00000636120 MROH2AA6NES4 1674 aa7.18□□□□□ -1.26
PDE4D-228ENST00000636120 GAS7O60861 476 aa7.18□□□□□ -1.26
PDE4D-228ENST00000636120 FLOT1O75955 427 aa7.18□□□□□ -1.26
PDE4D-228ENST00000636120 SLC8A3P57103 927 aa7.18□□□□□ -1.26
PDE4D-228ENST00000636120 BIRC3Q13489 604 aa7.18□□□□□ -1.26
PDE4D-228ENST00000636120 TRPC3Q13507 836 aa7.18□□□□□ -1.26
PDE4D-228ENST00000636120 MORC3Q14149 939 aa7.18□□□□□ -1.26
PDE4D-228ENST00000636120 PPP1R7Q15435 360 aa7.18□□□□□ -1.26
PDE4D-228ENST00000636120 GRIPAP1Q4V328 841 aa7.18□□□□□ -1.26
PDE4D-228ENST00000636120 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa7.18□□□□□ -1.26
PDE4D-228ENST00000636120 MIER3Q7Z3K6 550 aa7.18□□□□□ -1.26
PDE4D-228ENST00000636120 IQCGQ9H095 443 aaKnown RBP7.18□□□□□ -1.26
PDE4D-228ENST00000636120 DHX36Q9H2U1 1008 aaKnown RBP7.18□□□□□ -1.26
PDE4D-228ENST00000636120 NR1I2O75469 434 aa7.18□□□□□ -1.26
PDE4D-228ENST00000636120 TTLL1O95922 423 aa7.18□□□□□ -1.26
PDE4D-228ENST00000636120 CFBP00751 764 aa7.18□□□□□ -1.26
PDE4D-228ENST00000636120 CYP21A2P08686 494 aa7.18□□□□□ -1.26
PDE4D-228ENST00000636120 ABCD1P33897 745 aa7.18□□□□□ -1.26
PDE4D-228ENST00000636120 MYOCDQ8IZQ8 938 aa7.18□□□□□ -1.26
PDE4D-228ENST00000636120 NSUN7Q8NE18 718 aaKnown RBP7.18□□□□□ -1.26
PDE4D-228ENST00000636120 MAIP1Q8WWC4 291 aa7.18□□□□□ -1.26
PDE4D-228ENST00000636120 MRFAP1L1Q96HT8 127 aa7.18□□□□□ -1.26
PDE4D-228ENST00000636120 RPGRIP1Q96KN7 1286 aa7.18□□□□□ -1.26
PDE4D-228ENST00000636120 SH3GLB2Q9NR46 395 aa7.18□□□□□ -1.26
PDE4D-228ENST00000636120 SLC5A4Q9NY91 659 aa7.18□□□□□ -1.26
PDE4D-228ENST00000636120 PCDHA7Q9UN72 937 aa7.18□□□□□ -1.26
PDE4D-228ENST00000636120 IVNS1ABPQ9Y6Y0 642 aa7.18□□□□□ -1.26
PDE4D-228ENST00000636120 PABPN1LA6NDY0 278 aaKnown RBP7.18□□□□□ -1.26
PDE4D-228ENST00000636120 A6NNZ2 444 aa7.18□□□□□ -1.26
PDE4D-228ENST00000636120 KCNJ18B7U540 433 aa7.18□□□□□ -1.26
PDE4D-228ENST00000636120 ICA1Q05084 483 aa7.18□□□□□ -1.26
PDE4D-228ENST00000636120 CALCOCO2Q13137 446 aa7.18□□□□□ -1.26
PDE4D-228ENST00000636120 KCNJ12Q14500 433 aa7.18□□□□□ -1.26
PDE4D-228ENST00000636120 SLC39A14Q15043 492 aa7.18□□□□□ -1.26
PDE4D-228ENST00000636120 TUBB8Q3ZCM7 444 aa7.18□□□□□ -1.26
PDE4D-228ENST00000636120 CCDC14Q49A88 953 aa7.18□□□□□ -1.26
PDE4D-228ENST00000636120 APOA5Q6Q788 366 aa7.18□□□□□ -1.26
PDE4D-228ENST00000636120 ZNF589Q86UQ0 364 aaPredicted RBP7.18□□□□□ -1.26
PDE4D-228ENST00000636120 RGS22Q8NE09 1264 aa7.18□□□□□ -1.26
PDE4D-228ENST00000636120 KIFC2Q96AC6 838 aa7.18□□□□□ -1.26
PDE4D-228ENST00000636120 CCDC94Q9BW85 323 aaPredicted RBP7.18□□□□□ -1.26
PDE4D-228ENST00000636120 TEKT3Q9BXF9 490 aa7.18□□□□□ -1.26
PDE4D-228ENST00000636120 OGFRQ9NZT2 677 aa7.18□□□□□ -1.26
PDE4D-228ENST00000636120 PKD2L1Q9P0L9 805 aa7.18□□□□□ -1.26
PDE4D-228ENST00000636120 TRIM37O94972 964 aa7.18□□□□□ -1.26
PDE4D-228ENST00000636120 GCFC2P16383 781 aaKnown RBP7.18□□□□□ -1.26
PDE4D-228ENST00000636120 ABCB5Q2M3G0 1257 aa7.18□□□□□ -1.26
PDE4D-228ENST00000636120 C6orf163Q5TEZ5 329 aa7.18□□□□□ -1.26
PDE4D-228ENST00000636120 CCDC24Q8N4L8 307 aa7.18□□□□□ -1.26
PDE4D-228ENST00000636120 ANKS4BQ8N8V4 417 aa7.18□□□□□ -1.26
PDE4D-228ENST00000636120 TRAF3IP1Q8TDR0 691 aaPredicted RBP7.18□□□□□ -1.26
PDE4D-228ENST00000636120 VTI1AQ96AJ9 217 aa7.18□□□□□ -1.26
PDE4D-228ENST00000636120 PPP1R9BQ96SB3 815 aa7.18□□□□□ -1.26
PDE4D-228ENST00000636120 TAB2Q9NYJ8 693 aa7.18□□□□□ -1.26
PDE4D-228ENST00000636120 V9GYY5 206 aaPredicted RBP7.18□□□□□ -1.26
PDE4D-228ENST00000636120 C1orf167Q5SNV9 1468 aa7.18□□□□□ -1.26
PDE4D-228ENST00000636120 PRPF3O43395 683 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
PDE4D-228ENST00000636120 FERP16591 822 aa7.17□□□□□ -1.26
PDE4D-228ENST00000636120 NBPF11Q86T75 865 aa7.17□□□□□ -1.26
PDE4D-228ENST00000636120 GPR161Q8N6U8 529 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
PDE4D-228ENST00000636120 BRIP1Q9BX63 1249 aa7.17□□□□□ -1.26
PDE4D-228ENST00000636120 SASH1O94885 1247 aa7.17□□□□□ -1.26
PDE4D-228ENST00000636120 RPN1P04843 607 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
PDE4D-228ENST00000636120 NPR1P16066 1061 aa7.17□□□□□ -1.26
PDE4D-228ENST00000636120 LIFRP42702 1097 aa7.17□□□□□ -1.26
PDE4D-228ENST00000636120 RCAN1P53805 252 aa7.17□□□□□ -1.26
PDE4D-228ENST00000636120 ADCK5Q3MIX3 580 aa7.17□□□□□ -1.26
PDE4D-228ENST00000636120 ARHGEF16Q5VV41 709 aa7.17□□□□□ -1.26
PDE4D-228ENST00000636120 DYMQ7RTS9 669 aa7.17□□□□□ -1.26
PDE4D-228ENST00000636120 KRT27Q7Z3Y8 459 aa7.17□□□□□ -1.26
PDE4D-228ENST00000636120 GPBP1Q86WP2 473 aa7.17□□□□□ -1.26
PDE4D-228ENST00000636120 FRMPD2Q68DX3 1309 aaPredicted RBP7.17□□□□□ -1.26
PDE4D-228ENST00000636120 ADRA2BP18089 450 aa7.17□□□□□ -1.26
PDE4D-228ENST00000636120 ADD1P35611 737 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
PDE4D-228ENST00000636120 USP14P54578 494 aa7.17□□□□□ -1.26
PDE4D-228ENST00000636120 IFT20Q8IY31 132 aa7.17□□□□□ -1.26
PDE4D-228ENST00000636120 PPP1R14CQ8TAE6 165 aa7.17□□□□□ -1.26
PDE4D-228ENST00000636120 GPT2Q8TD30 523 aa7.17□□□□□ -1.26
PDE4D-228ENST00000636120 MTA3Q9BTC8 594 aa7.17□□□□□ -1.26
PDE4D-228ENST00000636120 BLZF1Q9H2G9 400 aa7.17□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 71.5 ms