RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000530579.6

NEDD8-MDP1-201, Transcript of NEDD8-MDP1 readthrough, humanhuman

TSL 2

Gene NEDD8-MDP1, Length 471 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ASPRV1Q53RT3 343 aa9.88□□□□□ -0.83
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 LDLRAD1Q5T700 205 aa9.88□□□□□ -0.83
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 TMTC3Q6ZXV5 915 aa9.88□□□□□ -0.83
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 RASGRP2Q7LDG7 609 aa9.88□□□□□ -0.83
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ERO1BQ86YB8 467 aa9.88□□□□□ -0.83
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 SRBD1Q8N5C6 995 aaKnown RBP9.88□□□□□ -0.83
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa9.88□□□□□ -0.83
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 PIBF1Q8WXW3 757 aa9.88□□□□□ -0.83
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 OTUD5Q96G74 571 aa9.88□□□□□ -0.83
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 GMCL1Q96IK5 515 aa9.88□□□□□ -0.83
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP9.88□□□□□ -0.83
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 UBA5Q9GZZ9 404 aa9.88□□□□□ -0.83
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa9.88□□□□□ -0.83
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 VCPKMTQ9H867 229 aa9.88□□□□□ -0.83
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 TMOD4Q9NZQ9 345 aa9.88□□□□□ -0.83
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ORC3Q9UBD5 711 aaPredicted RBP9.88□□□□□ -0.83
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 KIF3AQ9Y496 699 aa9.88□□□□□ -0.83
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 V9GY48 417 aaPredicted RBP9.88□□□□□ -0.83
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 SIPA1L1O43166 1804 aa9.88□□□□□ -0.83
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 UNCXA6NJT0 531 aa9.87□□□□□ -0.83
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 C19orf81C9J6K1 198 aa9.87□□□□□ -0.83
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 TMEM232C9JQI7 657 aa9.87□□□□□ -0.83
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 FMNL1O95466 1100 aaPredicted RBP9.87□□□□□ -0.83
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 SNHG28P0DPA3 235 aa9.87□□□□□ -0.83
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 FOSBP53539 338 aa9.87□□□□□ -0.83
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 PPATQ06203 517 aa9.87□□□□□ -0.83
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 NTRK3Q16288 839 aa9.87□□□□□ -0.83
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa9.87□□□□□ -0.83
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 FAM83BQ5T0W9 1011 aa9.87□□□□□ -0.83
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 GPATCH4Q5T3I0 446 aaKnown RBP9.87□□□□□ -0.83
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 CST9Q5W186 159 aa9.87□□□□□ -0.83
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 LARP1BQ659C4 914 aaKnown RBP9.87□□□□□ -0.83
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 TTBK2Q6IQ55 1244 aa9.87□□□□□ -0.83
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP9.87□□□□□ -0.83
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa9.87□□□□□ -0.83
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 WASF1Q92558 559 aa9.87□□□□□ -0.83
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 OPTNQ96CV9 577 aa9.87□□□□□ -0.83
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 CPVLQ9H3G5 476 aa9.87□□□□□ -0.83
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 AFG3L2Q9Y4W6 797 aa9.87□□□□□ -0.83
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 NID2Q14112 1375 aa9.87□□□□□ -0.83
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 hCG_1642624A0A1W2PR95 340 aa9.86□□□□□ -0.83
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 SPDYE5A6NIY4 337 aa9.86□□□□□ -0.83
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 PRPF3O43395 683 aaKnown RBP9.86□□□□□ -0.83
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 TOMM70O94826 608 aa9.86□□□□□ -0.83
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 DEXIO95424 95 aa9.86□□□□□ -0.83
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 PDCP20941 246 aa9.86□□□□□ -0.83
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 SLC16A2P36021 539 aa9.86□□□□□ -0.83
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 HMGCS2P54868 508 aa9.86□□□□□ -0.83
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 PPIL2Q13356 520 aa9.86□□□□□ -0.83
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 DGKZQ13574 1117 aa9.86□□□□□ -0.83
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 NBPF11Q86T75 865 aa9.86□□□□□ -0.83
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP9.86□□□□□ -0.83
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP9.86□□□□□ -0.83
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 LPAR1Q92633 364 aa9.86□□□□□ -0.83
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 RRP36Q96EU6 259 aaKnown RBP9.86□□□□□ -0.83
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ALG1Q9BT22 464 aa9.86□□□□□ -0.83
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 EMILIN3Q9NT22 766 aa9.86□□□□□ -0.83
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa9.85□□□□□ -0.83
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 H3BQV1 296 aa9.85□□□□□ -0.83
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 CXCL11O14625 94 aa9.85□□□□□ -0.83
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 WDR46O15213 610 aaKnown RBP9.85□□□□□ -0.83
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 FDPSP14324 419 aaKnown RBP9.85□□□□□ -0.83
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 SMARCA1P28370 1054 aa9.85□□□□□ -0.83
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 HUNKP57058 714 aa9.85□□□□□ -0.83
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 FUT2Q10981 343 aa9.85□□□□□ -0.83
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 TRIM29Q14134 588 aa9.85□□□□□ -0.83
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 IFFO2Q5TF58 517 aa9.85□□□□□ -0.83
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 SYDE2Q5VT97 1194 aa9.85□□□□□ -0.83
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 GADL1Q6ZQY3 521 aa9.85□□□□□ -0.83
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 HOMER1Q86YM7 354 aa9.85□□□□□ -0.83
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ADGRF4Q8IZF3 695 aa9.85□□□□□ -0.83
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 CHURC1Q8WUH1 139 aa9.85□□□□□ -0.83
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 KIFC2Q96AC6 838 aa9.85□□□□□ -0.83
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 PIGSQ96S52 555 aa9.85□□□□□ -0.83
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 SPZ1Q9BXG8 430 aa9.85□□□□□ -0.83
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 RNF26Q9BY78 433 aaPredicted RBP9.85□□□□□ -0.83
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 TANGO6Q9C0B7 1094 aa9.85□□□□□ -0.83
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 RPAP3Q9H6T3 665 aaPredicted RBP9.85□□□□□ -0.83
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 CHMP5Q9NZZ3 219 aa9.85□□□□□ -0.83
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP9.85□□□□□ -0.83
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 SEC63Q9UGP8 760 aaKnown RBP9.85□□□□□ -0.83
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 FEM1BQ9UK73 627 aa9.85□□□□□ -0.83
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 STK36Q9NRP7 1315 aa9.84□□□□□ -0.83
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP9.84□□□□□ -0.83
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 IRF6O14896 467 aa9.84□□□□□ -0.83
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 CYTH3O43739 400 aa9.84□□□□□ -0.83
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 VCAM1P19320 739 aa9.84□□□□□ -0.83
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 SYT1P21579 422 aa9.84□□□□□ -0.83
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 STAT2P52630 851 aa9.84□□□□□ -0.83
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 NUCB2P80303 420 aa9.84□□□□□ -0.83
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 GUCY1B3Q02153 619 aa9.84□□□□□ -0.83
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 FSTL1Q12841 308 aa9.84□□□□□ -0.83
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP9.84□□□□□ -0.83
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 SLC35G1Q2M3R5 365 aa9.84□□□□□ -0.83
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP9.84□□□□□ -0.83
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 FAM160B2Q86V87 743 aa9.84□□□□□ -0.83
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP9.84□□□□□ -0.83
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 C8orf76Q96K31 380 aa9.84□□□□□ -0.83
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 RIOX1Q9H6W3 641 aa9.84□□□□□ -0.83
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 JMJD4Q9H9V9 463 aa9.84□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 63 ms