RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000503687.2

RABGEF1-211, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 2

Gene RABGEF1, Length 4,139 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-211ENST00000503687 TRAF5O00463 557 aa14.36□□□□□ -0.11
RABGEF1-211ENST00000503687 ZMYND10O75800 440 aa14.36□□□□□ -0.11
RABGEF1-211ENST00000503687 GYS2P54840 703 aa14.36□□□□□ -0.11
RABGEF1-211ENST00000503687 PTPROQ16827 1216 aa14.36□□□□□ -0.11
RABGEF1-211ENST00000503687 NELFCDQ8IXH7 590 aa14.36□□□□□ -0.11
RABGEF1-211ENST00000503687 LRRC47Q8N1G4 583 aaKnown RBP14.36□□□□□ -0.11
RABGEF1-211ENST00000503687 NEK11Q8NG66 645 aa14.36□□□□□ -0.11
RABGEF1-211ENST00000503687 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP14.36□□□□□ -0.11
RABGEF1-211ENST00000503687 OSBPL5Q9H0X9 879 aaPredicted RBP14.36□□□□□ -0.11
RABGEF1-211ENST00000503687 ZCCHC17Q9NP64 241 aaKnown RBP14.36□□□□□ -0.11
RABGEF1-211ENST00000503687 RFX7Q2KHR2 1363 aa14.36□□□□□ -0.11
RABGEF1-211ENST00000503687 OAS2P29728 719 aaKnown RBP14.36□□□□□ -0.11
RABGEF1-211ENST00000503687 HLTFQ14527 1009 aaKnown RBP eCLIP14.36□□□□□ -0.114e-6■■□□□ 11.9
RABGEF1-211ENST00000503687 CT47A1Q5JQC4 288 aaPredicted RBP14.36□□□□□ -0.11
RABGEF1-211ENST00000503687 CYP26C1Q6V0L0 522 aa14.36□□□□□ -0.11
RABGEF1-211ENST00000503687 CABP7Q86V35 215 aa14.36□□□□□ -0.11
RABGEF1-211ENST00000503687 ENOX1Q8TC92 643 aaKnown RBP14.36□□□□□ -0.11
RABGEF1-211ENST00000503687 NLRC4Q9NPP4 1024 aa14.36□□□□□ -0.11
RABGEF1-211ENST00000503687 LUC7LQ9NQ29 371 aaKnown RBP14.36□□□□□ -0.11
RABGEF1-211ENST00000503687 RPN1P04843 607 aaKnown RBP14.35□□□□□ -0.11
RABGEF1-211ENST00000503687 CUL4BQ13620 913 aa14.35□□□□□ -0.11
RABGEF1-211ENST00000503687 USP17L2Q6R6M4 530 aa14.35□□□□□ -0.11
RABGEF1-211ENST00000503687 STAG1Q8WVM7 1258 aa14.35□□□□□ -0.11
RABGEF1-211ENST00000503687 EYA3Q99504 573 aa14.35□□□□□ -0.11
RABGEF1-211ENST00000503687 MINPP1Q9UNW1 487 aa14.35□□□□□ -0.11
RABGEF1-211ENST00000503687 ZNF804BA4D1E1 1349 aa14.35□□□□□ -0.11
RABGEF1-211ENST00000503687 MFSD14BQ5SR56 506 aa14.35□□□□□ -0.11
RABGEF1-211ENST00000503687 TAF4BQ92750 862 aa14.35□□□□□ -0.11
RABGEF1-211ENST00000503687 CALCOCO1Q9P1Z2 691 aa14.35□□□□□ -0.11
RABGEF1-211ENST00000503687 TRIM49BA6NDI0 452 aa14.35□□□□□ -0.11
RABGEF1-211ENST00000503687 H0YHG0 523 aa14.35□□□□□ -0.11
RABGEF1-211ENST00000503687 GTF2IP78347 998 aa14.35□□□□□ -0.11
RABGEF1-211ENST00000503687 PPP2R5BQ15173 497 aa14.35□□□□□ -0.11
RABGEF1-211ENST00000503687 SGMS1Q86VZ5 419 aa14.35□□□□□ -0.11
RABGEF1-211ENST00000503687 TMTC1Q8IUR5 882 aa14.35□□□□□ -0.11
RABGEF1-211ENST00000503687 FAM114A1Q8IWE2 563 aa14.35□□□□□ -0.11
RABGEF1-211ENST00000503687 WDR24Q96S15 920 aa14.35□□□□□ -0.11
RABGEF1-211ENST00000503687 LRWD1Q9UFC0 647 aa14.35□□□□□ -0.11
RABGEF1-211ENST00000503687 CPDO75976 1380 aa14.34□□□□□ -0.11
RABGEF1-211ENST00000503687 NONOQ15233 471 aaKnown RBP eCLIP14.34□□□□□ -0.116e-7■■■■□ 23.7
RABGEF1-211ENST00000503687 SPAG5Q96R06 1193 aa14.34□□□□□ -0.11
RABGEF1-211ENST00000503687 FAM107BQ9H098 131 aa14.34□□□□□ -0.11
RABGEF1-211ENST00000503687 PRPF4BQ13523 1007 aaKnown RBP14.34□□□□□ -0.11
RABGEF1-211ENST00000503687 SMC1AQ14683 1233 aaKnown RBP14.34□□□□□ -0.11
RABGEF1-211ENST00000503687 ODF2Q5BJF6 829 aa14.34□□□□□ -0.11
RABGEF1-211ENST00000503687 SV2BQ7L1I2 683 aa14.34□□□□□ -0.11
RABGEF1-211ENST00000503687 TYW1BQ6NUM6 668 aa14.34□□□□□ -0.11
RABGEF1-211ENST00000503687 RBM43Q6ZSC3 357 aaKnown RBP14.34□□□□□ -0.11
RABGEF1-211ENST00000503687 WDR66Q8TBY9 1149 aa14.34□□□□□ -0.11
RABGEF1-211ENST00000503687 SCNN1DP51172 638 aa14.34□□□□□ -0.11
RABGEF1-211ENST00000503687 COPB1P53618 953 aaKnown RBP14.34□□□□□ -0.11
RABGEF1-211ENST00000503687 KRT83P78385 493 aa14.34□□□□□ -0.11
RABGEF1-211ENST00000503687 MRPS25P82663 173 aaKnown RBP14.34□□□□□ -0.11
RABGEF1-211ENST00000503687 MAP9Q49MG5 647 aa14.34□□□□□ -0.11
RABGEF1-211ENST00000503687 SLF2Q8IX21 1173 aa14.34□□□□□ -0.11
RABGEF1-211ENST00000503687 GSDMAQ96QA5 445 aa14.34□□□□□ -0.11
RABGEF1-211ENST00000503687 TSPYL1Q9H0U9 437 aa14.34□□□□□ -0.11
RABGEF1-211ENST00000503687 BCCIPQ9P287 314 aaKnown RBP eCLIP14.34□□□□□ -0.11
RABGEF1-211ENST00000503687 RSPH14Q9UHP6 348 aa14.34□□□□□ -0.11
RABGEF1-211ENST00000503687 B4DLN1 442 aa14.33□□□□□ -0.12
RABGEF1-211ENST00000503687 IQCEQ6IPM2 695 aa14.33□□□□□ -0.12
RABGEF1-211ENST00000503687 FAM196AQ6ZSG2 479 aa14.33□□□□□ -0.12
RABGEF1-211ENST00000503687 TRIML1Q8N9V2 468 aa14.33□□□□□ -0.12
RABGEF1-211ENST00000503687 OR8K1Q8NGG5 319 aa14.33□□□□□ -0.12
RABGEF1-211ENST00000503687 SNX29Q8TEQ0 813 aa14.33□□□□□ -0.12
RABGEF1-211ENST00000503687 CDHR2Q9BYE9 1310 aa14.33□□□□□ -0.12
RABGEF1-211ENST00000503687 FGFR1OPO95684 399 aaKnown RBP14.33□□□□□ -0.12
RABGEF1-211ENST00000503687 USP8P40818 1118 aa14.33□□□□□ -0.12
RABGEF1-211ENST00000503687 ST5P78524 1137 aa14.33□□□□□ -0.12
RABGEF1-211ENST00000503687 ITPK1Q13572 414 aa14.33□□□□□ -0.12
RABGEF1-211ENST00000503687 FOXP4Q8IVH2 680 aaPredicted RBP14.33□□□□□ -0.12
RABGEF1-211ENST00000503687 ARPP21Q9UBL0 812 aaPredicted RBP14.33□□□□□ -0.12
RABGEF1-211ENST00000503687 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP14.33□□□□□ -0.12
RABGEF1-211ENST00000503687 CYP27A1Q02318 531 aa14.33□□□□□ -0.12
RABGEF1-211ENST00000503687 FBXO2Q9UK22 296 aaPredicted RBP14.33□□□□□ -0.12
RABGEF1-211ENST00000503687 EFCAB8A8MWE9 144 aa14.32□□□□□ -0.12
RABGEF1-211ENST00000503687 C2CD5Q86YS7 1000 aa14.32□□□□□ -0.12
RABGEF1-211ENST00000503687 JAKMIP2Q96AA8 810 aa14.32□□□□□ -0.12
RABGEF1-211ENST00000503687 IL17RAQ96F46 866 aa14.32□□□□□ -0.12
RABGEF1-211ENST00000503687 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP14.32□□□□□ -0.12
RABGEF1-211ENST00000503687 ALS2CR12Q96Q35 445 aa14.32□□□□□ -0.12
RABGEF1-211ENST00000503687 AGXT2Q9BYV1 514 aa14.32□□□□□ -0.12
RABGEF1-211ENST00000503687 HLA-DOAP06340 250 aa14.32□□□□□ -0.12
RABGEF1-211ENST00000503687 ERCC5P28715 1186 aaPredicted RBP14.32□□□□□ -0.12
RABGEF1-211ENST00000503687 DMTNQ08495 405 aa14.32□□□□□ -0.12
RABGEF1-211ENST00000503687 PLS1Q14651 629 aa14.32□□□□□ -0.12
RABGEF1-211ENST00000503687 LRRC41Q15345 812 aa14.32□□□□□ -0.12
RABGEF1-211ENST00000503687 REXO1Q8N1G1 1221 aaKnown RBP14.32□□□□□ -0.12
RABGEF1-211ENST00000503687 STAG2Q8N3U4 1231 aa14.32□□□□□ -0.12
RABGEF1-211ENST00000503687 IFT81Q8WYA0 676 aa14.32□□□□□ -0.12
RABGEF1-211ENST00000503687 PARD6BQ9BYG5 372 aa14.32□□□□□ -0.12
RABGEF1-211ENST00000503687 PRPF3O43395 683 aaKnown RBP14.32□□□□□ -0.12
RABGEF1-211ENST00000503687 GTPBP6O43824 516 aaPredicted RBP14.32□□□□□ -0.12
RABGEF1-211ENST00000503687 TACC1O75410 805 aa14.32□□□□□ -0.12
RABGEF1-211ENST00000503687 LRP10Q7Z4F1 713 aa14.32□□□□□ -0.12
RABGEF1-211ENST00000503687 NBPF11Q86T75 865 aa14.32□□□□□ -0.12
RABGEF1-211ENST00000503687 FCHSD1Q86WN1 690 aa14.32□□□□□ -0.12
RABGEF1-211ENST00000503687 EPN1Q9Y6I3 576 aaPredicted RBP14.32□□□□□ -0.12
RABGEF1-211ENST00000503687 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa14.31□□□□□ -0.12
RABGEF1-211ENST00000503687 BICDL2A1A5D9 508 aa14.31□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46.1 ms