RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000479976.5

CHTF18-209, Transcript of chromosome transmission fidelity factor 18, humanhuman

TSL 2

Gene CHTF18, Length 1,110 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHTF18-209ENST00000479976 AAMPQ13685 434 aa33.95■■■■□ 3.03
CHTF18-209ENST00000479976 NCAPG2Q86XI2 1143 aa33.95■■■■□ 3.03
CHTF18-209ENST00000479976 FBXO28Q9NVF7 368 aa33.95■■■■□ 3.03
CHTF18-209ENST00000479976 STAP2Q9UGK3 403 aa33.95■■■■□ 3.03
CHTF18-209ENST00000479976 TMEM132BQ14DG7 1078 aa33.94■■■■□ 3.02
CHTF18-209ENST00000479976 C11orf49Q9H6J7 331 aa33.94■■■■□ 3.02
CHTF18-209ENST00000479976 FAM83BQ5T0W9 1011 aa33.93■■■■□ 3.02
CHTF18-209ENST00000479976 ABRAQ8N0Z2 381 aa33.93■■■■□ 3.02
CHTF18-209ENST00000479976 RANBP2P49792 3224 aaKnown RBP33.92■■■■□ 3.02
CHTF18-209ENST00000479976 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa33.92■■■■□ 3.02
CHTF18-209ENST00000479976 PRDM1O75626 825 aa33.92■■■■□ 3.02
CHTF18-209ENST00000479976 IGHA2P01877 340 aa33.92■■■■□ 3.02
CHTF18-209ENST00000479976 CYP2C19P33261 490 aa33.92■■■■□ 3.02
CHTF18-209ENST00000479976 NAPBQ9H115 298 aa33.92■■■■□ 3.02
CHTF18-209ENST00000479976 CLIP2Q9UDT6 1046 aa33.92■■■■□ 3.02
CHTF18-209ENST00000479976 PPP1R9AQ9ULJ8 1098 aa33.92■■■■□ 3.02
CHTF18-209ENST00000479976 F5H6K3 240 aa33.91■■■■□ 3.02
CHTF18-209ENST00000479976 VWA5AO00534 786 aa33.91■■■■□ 3.02
CHTF18-209ENST00000479976 COBLO75128 1261 aa33.91■■■■□ 3.02
CHTF18-209ENST00000479976 SLC25A27O95847 323 aa33.91■■■■□ 3.02
CHTF18-209ENST00000479976 PDE1AP54750 535 aa33.91■■■■□ 3.02
CHTF18-209ENST00000479976 KLRC3Q07444 240 aa33.91■■■■□ 3.02
CHTF18-209ENST00000479976 OLFML2BQ68BL8 750 aa33.91■■■■□ 3.02
CHTF18-209ENST00000479976 EVI5LQ96CN4 794 aa33.91■■■■□ 3.02
CHTF18-209ENST00000479976 SLC5A4Q9NY91 659 aa33.91■■■■□ 3.02
CHTF18-209ENST00000479976 ZNF236Q9UL36 1845 aa33.9■■■■□ 3.02
CHTF18-209ENST00000479976 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP33.9■■■■□ 3.02
CHTF18-209ENST00000479976 PDE4BQ07343 736 aa33.9■■■■□ 3.02
CHTF18-209ENST00000479976 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP33.9■■■■□ 3.02
CHTF18-209ENST00000479976 ALPK3Q96L96 1907 aa33.9■■■■□ 3.02
CHTF18-209ENST00000479976 COL11A1P12107 1806 aaPredicted RBP33.89■■■■□ 3.02
CHTF18-209ENST00000479976 SLC3A2P08195 630 aaKnown RBP33.89■■■■□ 3.02
CHTF18-209ENST00000479976 FCER1AP12319 257 aa33.89■■■■□ 3.02
CHTF18-209ENST00000479976 RIOX2Q8IUF8 465 aa33.89■■■■□ 3.02
CHTF18-209ENST00000479976 MKL1Q969V6 931 aa33.89■■■■□ 3.02
CHTF18-209ENST00000479976 TRIOBPQ9H2D6 2365 aa33.88■■■■□ 3.01
CHTF18-209ENST00000479976 CNGA1P29973 690 aa33.88■■■■□ 3.01
CHTF18-209ENST00000479976 PPARAQ07869 468 aa33.88■■■■□ 3.01
CHTF18-209ENST00000479976 CEP95Q96GE4 821 aa33.88■■■■□ 3.01
CHTF18-209ENST00000479976 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP33.88■■■■□ 3.01
CHTF18-209ENST00000479976 MTMR4Q9NYA4 1195 aa33.88■■■■□ 3.01
CHTF18-209ENST00000479976 DDX20Q9UHI6 824 aaKnown RBP33.88■■■■□ 3.01
CHTF18-209ENST00000479976 MSCO60682 206 aa33.87■■■■□ 3.01
CHTF18-209ENST00000479976 NDUFB10O96000 172 aa33.87■■■■□ 3.01
CHTF18-209ENST00000479976 STAT3P40763 770 aa33.87■■■■□ 3.01
CHTF18-209ENST00000479976 TRPV1Q8NER1 839 aa33.87■■■■□ 3.01
CHTF18-209ENST00000479976 PRO3102Q9H379 93 aa33.87■■■■□ 3.01
CHTF18-209ENST00000479976 PFASO15067 1338 aa33.86■■■■□ 3.01
CHTF18-209ENST00000479976 COL6A1P12109 1028 aa33.86■■■■□ 3.01
CHTF18-209ENST00000479976 CCDC129Q6ZRS4 1044 aa33.86■■■■□ 3.01
CHTF18-209ENST00000479976 REPS2Q8NFH8 660 aa33.86■■■■□ 3.01
CHTF18-209ENST00000479976 SLF1Q9BQI6 1058 aa33.86■■■■□ 3.01
CHTF18-209ENST00000479976 PCDH10Q9P2E7 1040 aa33.86■■■■□ 3.01
CHTF18-209ENST00000479976 ZNF214Q9UL59 606 aaPredicted RBP33.86■■■■□ 3.01
CHTF18-209ENST00000479976 ZNFX1Q9P2E3 1918 aaKnown RBP33.85■■■■□ 3.01
CHTF18-209ENST00000479976 TTLL1O95922 423 aa33.85■■■■□ 3.01
CHTF18-209ENST00000479976 TSPY3P0CV98 308 aa33.85■■■■□ 3.01
CHTF18-209ENST00000479976 TSPY8P0CW00 308 aa33.85■■■■□ 3.01
CHTF18-209ENST00000479976 CYBAP13498 195 aa33.85■■■■□ 3.01
CHTF18-209ENST00000479976 C7orf61Q8IZ16 206 aa33.85■■■■□ 3.01
CHTF18-209ENST00000479976 NEDD1Q8NHV4 660 aa33.85■■■■□ 3.01
CHTF18-209ENST00000479976 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa33.85■■■■□ 3.01
CHTF18-209ENST00000479976 MYH4Q9Y623 1939 aa33.85■■■■□ 3.01
CHTF18-209ENST00000479976 FOXP2O15409 715 aa33.84■■■■□ 3.01
CHTF18-209ENST00000479976 PRPF38AQ8NAV1 312 aaKnown RBP33.84■■■■□ 3.01
CHTF18-209ENST00000479976 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP33.84■■■■□ 3.01
CHTF18-209ENST00000479976 COPB2P35606 906 aa33.83■■■■□ 3.01
CHTF18-209ENST00000479976 TFAP4Q01664 338 aa33.83■■■■□ 3.01
CHTF18-209ENST00000479976 FAM47AQ5JRC9 791 aa33.83■■■■□ 3.01
CHTF18-209ENST00000479976 MAML3Q96JK9 1138 aa33.83■■■■□ 3.01
CHTF18-209ENST00000479976 MMP19Q99542 508 aa33.83■■■■□ 3.01
CHTF18-209ENST00000479976 LNPKQ9C0E8 428 aa33.83■■■■□ 3.01
CHTF18-209ENST00000479976 HELLSQ9NRZ9 838 aa33.83■■■■□ 3.01
CHTF18-209ENST00000479976 DNAH12Q6ZR08 3092 aa33.83■■■■□ 3.01
CHTF18-209ENST00000479976 TICAM2Q86XR7 235 aa33.82■■■■□ 3
CHTF18-209ENST00000479976 SMC5Q8IY18 1101 aa33.82■■■■□ 3
CHTF18-209ENST00000479976 PLIN4Q96Q06 1357 aa33.82■■■■□ 3
CHTF18-209ENST00000479976 FRMPD3Q5JV73 1810 aa33.81■■■■□ 3
CHTF18-209ENST00000479976 KCTD2Q14681 263 aa33.81■■■■□ 3
CHTF18-209ENST00000479976 GMCL1P1Q8NEA9 526 aa33.81■■■■□ 3
CHTF18-209ENST00000479976 VPS53Q5VIR6 699 aa33.8■■■■□ 3
CHTF18-209ENST00000479976 LRRC47Q8N1G4 583 aaKnown RBP33.8■■■■□ 3
CHTF18-209ENST00000479976 TEX13BQ9BXU2 312 aa33.8■■■■□ 3
CHTF18-209ENST00000479976 SEPT4O43236 478 aa33.78■■■■□ 3
CHTF18-209ENST00000479976 PGK2P07205 417 aa33.78■■■■□ 3
CHTF18-209ENST00000479976 CTDSPL2Q05D32 466 aa33.78■■■■□ 3
CHTF18-209ENST00000479976 PRAMEF19Q5SWL8 479 aa33.78■■■■□ 3
CHTF18-209ENST00000479976 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa33.78■■■■□ 3
CHTF18-209ENST00000479976 FEM1BQ9UK73 627 aa33.78■■■■□ 3
CHTF18-209ENST00000479976 ZMYND8Q9ULU4 1186 aaPredicted RBP33.78■■■■□ 3
CHTF18-209ENST00000479976 DIS3Q9Y2L1 958 aaKnown RBP33.78■■■■□ 3
CHTF18-209ENST00000479976 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP33.78■■■■□ 3
CHTF18-209ENST00000479976 ZBED4O75132 1171 aa33.77■■■■□ 3
CHTF18-209ENST00000479976 ALX1Q15699 326 aa33.77■■■■□ 3
CHTF18-209ENST00000479976 MCMDC2Q4G0Z9 681 aa33.77■■■■□ 3
CHTF18-209ENST00000479976 SLFN13Q68D06 897 aa33.77■■■■□ 3
CHTF18-209ENST00000479976 SNRNP48Q6IEG0 339 aaKnown RBP33.77■■■■□ 3
CHTF18-209ENST00000479976 KIFC2Q96AC6 838 aa33.77■■■■□ 3
CHTF18-209ENST00000479976 FAM227BQ96M60 508 aa33.77■■■■□ 3
CHTF18-209ENST00000479976 SENP6Q9GZR1 1112 aaPredicted RBP33.77■■■■□ 3
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 52.3 ms