RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000438777.5

CCDC18-AS1-211, CCDC18 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3

Gene CCDC18-AS1, Length 752 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 JAK2O60674 1132 aa6.64□□□□□ -1.35
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 SNHG28P0DPA3 235 aa6.64□□□□□ -1.35
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 PTMSP20962 102 aa6.64□□□□□ -1.35
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 SMARCA1P28370 1054 aa6.64□□□□□ -1.35
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 CDC27P30260 824 aa6.64□□□□□ -1.35
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 SSTR3P32745 418 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP6.64□□□□□ -1.359e-6■□□□□ 8.1
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 EIF6P56537 245 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 TFAP4Q01664 338 aa6.64□□□□□ -1.35
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 NFKBIBQ15653 356 aa6.64□□□□□ -1.35
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 SWT1Q5T5J6 900 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 IFIT1BQ5T764 474 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 CPLX2Q6PUV4 134 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 SAMD7Q7Z3H4 446 aa6.64□□□□□ -1.35
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 NBPF11Q86T75 865 aa6.64□□□□□ -1.35
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 ZNF444Q8N0Y2 327 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 FANCBQ8NB91 859 aa6.64□□□□□ -1.35
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 TMEM87AQ8NBN3 555 aa6.64□□□□□ -1.35
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 SLC44A5Q8NCS7 719 aa6.64□□□□□ -1.35
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 DYNLL2Q96FJ2 89 aa6.64□□□□□ -1.35
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 GBP4Q96PP9 640 aa6.64□□□□□ -1.35
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 RNF26Q9BY78 433 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 KDM4CQ9H3R0 1056 aa6.64□□□□□ -1.35
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 TMEM134Q9H6X4 195 aa6.64□□□□□ -1.35
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 MKNK2Q9HBH9 465 aa6.64□□□□□ -1.35
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 NCOA5Q9HCD5 579 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 MYOZ2Q9NPC6 264 aa6.64□□□□□ -1.35
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 CDKN2AIPQ9NXV6 580 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 SAP30BPQ9UHR5 308 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa6.64□□□□□ -1.35
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 ZNF541Q9H0D2 1346 aa6.64□□□□□ -1.35
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 SCN4AP35499 1836 aa6.64□□□□□ -1.35
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 ATAD5Q96QE3 1844 aa6.64□□□□□ -1.35
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 DDTLA6NHG4 134 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 GOLGA8AA7E2F4 631 aa6.63□□□□□ -1.35
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 PRDM1O75626 825 aa6.63□□□□□ -1.35
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 BAG4O95429 457 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 FMNL1O95466 1100 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 F13A1P00488 732 aa6.63□□□□□ -1.35
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 TSPY3P0CV98 308 aa6.63□□□□□ -1.35
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 TSPY8P0CW00 308 aa6.63□□□□□ -1.35
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP6.63□□□□□ -1.35
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 MCM4P33991 863 aa6.63□□□□□ -1.35
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 GMPSP49915 693 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 STK3Q13188 491 aa6.63□□□□□ -1.35
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 TNFAIP1Q13829 316 aa6.63□□□□□ -1.35
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 GRM4Q14833 912 aa6.63□□□□□ -1.35
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 RTN1Q16799 776 aa6.63□□□□□ -1.35
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 ATL3Q6DD88 541 aa6.63□□□□□ -1.35
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa6.63□□□□□ -1.35
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 TMTC3Q6ZXV5 915 aa6.63□□□□□ -1.35
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 CATIPQ7Z7H3 387 aa6.63□□□□□ -1.35
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 MICU3Q86XE3 530 aa6.63□□□□□ -1.35
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 ZFPM1Q8IX07 1006 aa6.63□□□□□ -1.35
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 PARP9Q8IXQ6 854 aa6.63□□□□□ -1.35
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 CRACR2BQ8N4Y2 399 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 FBXO18Q8NFZ0 1043 aa6.63□□□□□ -1.35
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 MKL1Q969V6 931 aa6.63□□□□□ -1.35
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 WDR90Q96KV7 1748 aa6.63□□□□□ -1.35
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa6.63□□□□□ -1.35
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 ZSCAN16Q9H4T2 348 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 TOMM22Q9NS69 142 aa6.63□□□□□ -1.35
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 GINM1Q9NU53 330 aa6.63□□□□□ -1.35
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 MTMR4Q9NYA4 1195 aa6.63□□□□□ -1.35
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 GPRC5DQ9NZD1 345 aa6.63□□□□□ -1.35
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 TMOD2Q9NZR1 351 aa6.63□□□□□ -1.35
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 ATP6V1DQ9Y5K8 247 aa6.63□□□□□ -1.35
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 DOCK1Q14185 1865 aa6.62□□□□□ -1.35
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa6.62□□□□□ -1.35
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 CPLX1O14810 134 aa6.62□□□□□ -1.35
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 PRPF3O43395 683 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 MYO1BO43795 1136 aa6.62□□□□□ -1.35
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 NMT2O60551 498 aa6.62□□□□□ -1.35
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 DEXIO95424 95 aa6.62□□□□□ -1.35
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 TOP1P11387 765 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 KIF5BP33176 963 aa6.62□□□□□ -1.35
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 ADD1P35611 737 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 GNAQP50148 359 aa6.62□□□□□ -1.35
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP6.62□□□□□ -1.35
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 CCT2P78371 535 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 RESTQ13127 1097 aa6.62□□□□□ -1.35
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 PICALMQ13492 652 aa6.62□□□□□ -1.35
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 FAM47AQ5JRC9 791 aa6.62□□□□□ -1.35
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 LARP1BQ659C4 914 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 NFXL1Q6ZNB6 911 aa6.62□□□□□ -1.35
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 TMEM179Q6ZVK1 233 aa6.62□□□□□ -1.35
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 PNMA1Q8ND90 353 aa6.62□□□□□ -1.35
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 WASF1Q92558 559 aa6.62□□□□□ -1.35
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 CEP95Q96GE4 821 aa6.62□□□□□ -1.35
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 TEPSINQ96N21 525 aa6.62□□□□□ -1.35
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 TMEM47Q9BQJ4 181 aa6.62□□□□□ -1.35
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 LZTS2Q9BRK4 669 aa6.62□□□□□ -1.35
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 ZKSCAN3Q9BRR0 538 aa6.62□□□□□ -1.35
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 SPZ1Q9BXG8 430 aa6.62□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.5 ms