RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429595.1

PTPRK-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRK, Length 558 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-211ENST00000429595 ZNF252P-AS1Q0IIN9 211 aa9.33□□□□□ -0.92
PTPRK-211ENST00000429595 DSC3Q14574 896 aa9.33□□□□□ -0.92
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PTPRK-211ENST00000429595 C3orf58Q8NDZ4 430 aa9.33□□□□□ -0.92
PTPRK-211ENST00000429595 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP9.33□□□□□ -0.92
PTPRK-211ENST00000429595 GPBAR1Q8TDU6 330 aa9.33□□□□□ -0.92
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PTPRK-211ENST00000429595 PHF6Q8IWS0 365 aaKnown RBP eCLIP9.3□□□□□ -0.92
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PTPRK-211ENST00000429595 TNKS2Q9H2K2 1166 aa9.3□□□□□ -0.92
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PTPRK-211ENST00000429595 MAP3K5Q99683 1374 aa9.29□□□□□ -0.92
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PTPRK-211ENST00000429595 SHANK3Q9BYB0 1731 aa9.29□□□□□ -0.92
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PTPRK-211ENST00000429595 FAM168AQ92567 244 aa9.28□□□□□ -0.92
PTPRK-211ENST00000429595 SSU72Q9NP77 194 aaKnown RBP9.28□□□□□ -0.92
PTPRK-211ENST00000429595 CSADQ9Y600 493 aa9.28□□□□□ -0.92
PTPRK-211ENST00000429595 E9PCH4 1651 aa9.27□□□□□ -0.93
PTPRK-211ENST00000429595 TMEM265A0A087WTH1 108 aa9.27□□□□□ -0.93
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PTPRK-211ENST00000429595 BMP6P22004 513 aa9.27□□□□□ -0.93
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PTPRK-211ENST00000429595 CBX8Q9HC52 389 aa9.27□□□□□ -0.93
PTPRK-211ENST00000429595 RING1Q06587 406 aa9.26□□□□□ -0.93
PTPRK-211ENST00000429595 CHRNA2Q15822 529 aa9.26□□□□□ -0.93
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PTPRK-211ENST00000429595 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa9.26□□□□□ -0.93
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PTPRK-211ENST00000429595 NUP155O75694 1391 aa9.25□□□□□ -0.93
PTPRK-211ENST00000429595 GPRASP1Q5JY77 1395 aa9.25□□□□□ -0.93
PTPRK-211ENST00000429595 TXNRD1Q16881 649 aa9.25□□□□□ -0.93
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PTPRK-211ENST00000429595 TPTE2Q6XPS3 522 aa9.25□□□□□ -0.93
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PTPRK-211ENST00000429595 SETDB2Q96T68 719 aa9.25□□□□□ -0.93
PTPRK-211ENST00000429595 PRDM7Q9NQW5 492 aa9.25□□□□□ -0.93
PTPRK-211ENST00000429595 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP9.25□□□□□ -0.93
PTPRK-211ENST00000429595 TECPR2O15040 1411 aa9.24□□□□□ -0.93
PTPRK-211ENST00000429595 DCDC2CA8MYV0 355 aa9.24□□□□□ -0.93
PTPRK-211ENST00000429595 FBXO24O75426 580 aa9.24□□□□□ -0.93
PTPRK-211ENST00000429595 PLCB3Q01970 1234 aa9.24□□□□□ -0.93
PTPRK-211ENST00000429595 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP9.24□□□□□ -0.93
PTPRK-211ENST00000429595 PRDM10Q9NQV6 1147 aa9.24□□□□□ -0.93
PTPRK-211ENST00000429595 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa9.23□□□□□ -0.93
PTPRK-211ENST00000429595 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa9.23□□□□□ -0.93
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