RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000389416.8

PTPRN2-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type N2, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRN2, Length 4,692 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRN2-202ENST00000389416 FMNL1O95466 1100 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
PTPRN2-202ENST00000389416 NCAPG2Q86XI2 1143 aa14.7□□□□□ -0.06
PTPRN2-202ENST00000389416 PGBD1Q96JS3 809 aa14.7□□□□□ -0.06
PTPRN2-202ENST00000389416 CENPHQ9H3R5 247 aa14.7□□□□□ -0.06
PTPRN2-202ENST00000389416 PXDNQ92626 1479 aa14.7□□□□□ -0.06
PTPRN2-202ENST00000389416 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa14.7□□□□□ -0.06
PTPRN2-202ENST00000389416 GSG1L2A8MUP6 293 aa14.7□□□□□ -0.06
PTPRN2-202ENST00000389416 ERLIN1O75477 346 aa14.7□□□□□ -0.06
PTPRN2-202ENST00000389416 PNOCQ13519 176 aa14.7□□□□□ -0.06
PTPRN2-202ENST00000389416 NELFCDQ8IXH7 590 aa14.7□□□□□ -0.06
PTPRN2-202ENST00000389416 CRAMP1Q96RY5 1269 aa14.7□□□□□ -0.06
PTPRN2-202ENST00000389416 GJB4Q9NTQ9 266 aa14.7□□□□□ -0.06
PTPRN2-202ENST00000389416 CYLC1P35663 651 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
PTPRN2-202ENST00000389416 ZSWIM4Q9H7M6 989 aa14.69□□□□□ -0.06
PTPRN2-202ENST00000389416 NFE2L3Q9Y4A8 694 aa14.69□□□□□ -0.06
PTPRN2-202ENST00000389416 OR52Z1P0C646 297 aa14.69□□□□□ -0.06
PTPRN2-202ENST00000389416 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
PTPRN2-202ENST00000389416 SMTNP53814 917 aa14.69□□□□□ -0.06
PTPRN2-202ENST00000389416 TBC1D8BQ0IIM8 1120 aa14.69□□□□□ -0.06
PTPRN2-202ENST00000389416 TRMT44Q8IYL2 757 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
PTPRN2-202ENST00000389416 NEK11Q8NG66 645 aa14.69□□□□□ -0.06
PTPRN2-202ENST00000389416 CPVLQ9H3G5 476 aa14.69□□□□□ -0.06
PTPRN2-202ENST00000389416 AZI2Q9H6S1 392 aa14.69□□□□□ -0.06
PTPRN2-202ENST00000389416 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
PTPRN2-202ENST00000389416 NMT2O60551 498 aa14.69□□□□□ -0.06
PTPRN2-202ENST00000389416 ZNF771Q7L3S4 317 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
PTPRN2-202ENST00000389416 MLKLQ8NB16 471 aa14.69□□□□□ -0.06
PTPRN2-202ENST00000389416 NEDD4P46934 1319 aa14.69□□□□□ -0.06
PTPRN2-202ENST00000389416 CCDC172P0C7W6 258 aa14.69□□□□□ -0.06
PTPRN2-202ENST00000389416 CTNNBL1Q8WYA6 563 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
PTPRN2-202ENST00000389416 GLG1Q92896 1179 aa14.69□□□□□ -0.06
PTPRN2-202ENST00000389416 DRC1Q96MC2 740 aa14.69□□□□□ -0.06
PTPRN2-202ENST00000389416 CBX8Q9HC52 389 aa14.69□□□□□ -0.06
PTPRN2-202ENST00000389416 MROH7-TTC4A0A0A0MT08 1334 aa14.69□□□□□ -0.06
PTPRN2-202ENST00000389416 FAM193AP78312 1265 aa14.68□□□□□ -0.06
PTPRN2-202ENST00000389416 MYCT1Q8N699 235 aa14.68□□□□□ -0.06
PTPRN2-202ENST00000389416 TMEM87AQ8NBN3 555 aa14.68□□□□□ -0.06
PTPRN2-202ENST00000389416 STAG1Q8WVM7 1258 aa14.68□□□□□ -0.06
PTPRN2-202ENST00000389416 ALS2CR12Q96Q35 445 aa14.68□□□□□ -0.06
PTPRN2-202ENST00000389416 PLEKHA8P1O95397 391 aa14.68□□□□□ -0.06
PTPRN2-202ENST00000389416 CYP4A11Q02928 519 aa14.68□□□□□ -0.06
PTPRN2-202ENST00000389416 BRDTQ58F21 947 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
PTPRN2-202ENST00000389416 GALNT17Q6IS24 598 aa14.68□□□□□ -0.06
PTPRN2-202ENST00000389416 CYB5R4Q7L1T6 521 aa14.68□□□□□ -0.06
PTPRN2-202ENST00000389416 DGKHQ86XP1 1220 aa14.68□□□□□ -0.06
PTPRN2-202ENST00000389416 KAZALD1Q96I82 304 aa14.68□□□□□ -0.06
PTPRN2-202ENST00000389416 NOC4LQ9BVI4 516 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
PTPRN2-202ENST00000389416 JADE2Q9NQC1 790 aa14.68□□□□□ -0.06
PTPRN2-202ENST00000389416 LUC7L2Q9Y383 392 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
PTPRN2-202ENST00000389416 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa14.68□□□□□ -0.06
PTPRN2-202ENST00000389416 NEBLO76041 1014 aa14.68□□□□□ -0.06
PTPRN2-202ENST00000389416 PLA2G4DQ86XP0 818 aa14.68□□□□□ -0.06
PTPRN2-202ENST00000389416 CCDC42Q96M95 316 aa14.68□□□□□ -0.06
PTPRN2-202ENST00000389416 DDX25Q9UHL0 483 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
PTPRN2-202ENST00000389416 DKC1O60832 514 aaKnown RBP eCLIP14.68□□□□□ -0.067e-7■■■■■ 69.8
PTPRN2-202ENST00000389416 SLC15A2Q16348 729 aa14.68□□□□□ -0.06
PTPRN2-202ENST00000389416 DPH6Q7L8W6 267 aa14.68□□□□□ -0.06
PTPRN2-202ENST00000389416 IFT74Q96LB3 600 aa14.68□□□□□ -0.06
PTPRN2-202ENST00000389416 FRMD4BQ9Y2L6 1034 aa14.68□□□□□ -0.06
PTPRN2-202ENST00000389416 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
PTPRN2-202ENST00000389416 PAK1Q13153 545 aa14.67□□□□□ -0.06
PTPRN2-202ENST00000389416 TOB2Q14106 344 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
PTPRN2-202ENST00000389416 ZNF827Q17R98 1081 aa14.67□□□□□ -0.06
PTPRN2-202ENST00000389416 MIER3Q7Z3K6 550 aa14.67□□□□□ -0.06
PTPRN2-202ENST00000389416 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
PTPRN2-202ENST00000389416 CETN3O15182 167 aa14.67□□□□□ -0.06
PTPRN2-202ENST00000389416 RAPGEF1Q13905 1077 aa14.67□□□□□ -0.06
PTPRN2-202ENST00000389416 GNPTABQ3T906 1256 aa14.67□□□□□ -0.06
PTPRN2-202ENST00000389416 NOD1Q9Y239 953 aa14.67□□□□□ -0.06
PTPRN2-202ENST00000389416 CMA1P23946 247 aa14.67□□□□□ -0.06
PTPRN2-202ENST00000389416 KIF23Q02241 960 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
PTPRN2-202ENST00000389416 BIRC3Q13489 604 aa14.67□□□□□ -0.06
PTPRN2-202ENST00000389416 TICAM2Q86XR7 235 aa14.67□□□□□ -0.06
PTPRN2-202ENST00000389416 NSUN4Q96CB9 384 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
PTPRN2-202ENST00000389416 RNF181Q9P0P0 153 aa14.67□□□□□ -0.06
PTPRN2-202ENST00000389416 GOLGA6L9A6NEM1 432 aa14.66□□□□□ -0.06
PTPRN2-202ENST00000389416 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
PTPRN2-202ENST00000389416 CTR9Q6PD62 1173 aa14.66□□□□□ -0.06
PTPRN2-202ENST00000389416 NT5C3AQ9H0P0 336 aa14.66□□□□□ -0.06
PTPRN2-202ENST00000389416 SPON1Q9HCB6 807 aa14.66□□□□□ -0.06
PTPRN2-202ENST00000389416 RTEL1Q9NZ71 1219 aa14.66□□□□□ -0.06
PTPRN2-202ENST00000389416 SYNRGQ9UMZ2 1314 aa14.66□□□□□ -0.06
PTPRN2-202ENST00000389416 NDUFA8P51970 172 aa14.66□□□□□ -0.06
PTPRN2-202ENST00000389416 STAT2P52630 851 aa14.66□□□□□ -0.06
PTPRN2-202ENST00000389416 NLRP12P59046 1061 aa14.66□□□□□ -0.06
PTPRN2-202ENST00000389416 SNAP25P60880 206 aa14.66□□□□□ -0.06
PTPRN2-202ENST00000389416 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP14.66□□□□□ -0.06
PTPRN2-202ENST00000389416 MCF2L2Q86YR7 1114 aa14.66□□□□□ -0.06
PTPRN2-202ENST00000389416 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP14.66□□□□□ -0.06
PTPRN2-202ENST00000389416 FOXP1Q9H334 677 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
PTPRN2-202ENST00000389416 SYNCQ9H7C4 482 aa14.66□□□□□ -0.06
PTPRN2-202ENST00000389416 KIAA1468Q9P260 1216 aa14.66□□□□□ -0.06
PTPRN2-202ENST00000389416 GCNT3O95395 438 aa14.66□□□□□ -0.06
PTPRN2-202ENST00000389416 GYS1P13807 737 aa14.66□□□□□ -0.06
PTPRN2-202ENST00000389416 SEPT2Q15019 361 aa14.66□□□□□ -0.06
PTPRN2-202ENST00000389416 ZNF341Q9BYN7 854 aa14.66□□□□□ -0.06
PTPRN2-202ENST00000389416 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
PTPRN2-202ENST00000389416 ASNSP08243 561 aa14.66□□□□□ -0.06
PTPRN2-202ENST00000389416 PPP1R2P41236 205 aa14.66□□□□□ -0.06
PTPRN2-202ENST00000389416 TAF3Q5VWG9 929 aa14.66□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 57.9 ms