RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000384006.1

RNU6-641P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 641, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-641P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-641P-201ENST00000384006 LMCD1Q9NZU5 365 aa5.08□□□□□ -1.6
RNU6-641P-201ENST00000384006 SLC5A6Q9Y289 635 aa5.08□□□□□ -1.6
RNU6-641P-201ENST00000384006 MSRB2Q9Y3D2 182 aa5.08□□□□□ -1.6
RNU6-641P-201ENST00000384006 R3HCC1Q9Y3T6 440 aaKnown RBP5.08□□□□□ -1.6
RNU6-641P-201ENST00000384006 FHOD1Q9Y613 1164 aa5.08□□□□□ -1.6
RNU6-641P-201ENST00000384006 FAM86C2PA6NEL3 165 aa5.07□□□□□ -1.6
RNU6-641P-201ENST00000384006 H3BS24 57 aa5.07□□□□□ -1.6
RNU6-641P-201ENST00000384006 HYAL3O43820 417 aaPredicted RBP5.07□□□□□ -1.6
RNU6-641P-201ENST00000384006 AOC3Q16853 763 aa5.07□□□□□ -1.6
RNU6-641P-201ENST00000384006 GNPTABQ3T906 1256 aa5.07□□□□□ -1.6
RNU6-641P-201ENST00000384006 TDRD10Q5VZ19 366 aaKnown RBP5.07□□□□□ -1.6
RNU6-641P-201ENST00000384006 LRP10Q7Z4F1 713 aa5.07□□□□□ -1.6
RNU6-641P-201ENST00000384006 FAM178BQ8IXR5 827 aa5.07□□□□□ -1.6
RNU6-641P-201ENST00000384006 ZNF655Q8N720 491 aaPredicted RBP5.07□□□□□ -1.6
RNU6-641P-201ENST00000384006 DHX38Q92620 1227 aaKnown RBP5.07□□□□□ -1.6
RNU6-641P-201ENST00000384006 ZNF669Q96BR6 464 aaPredicted RBP5.07□□□□□ -1.6
RNU6-641P-201ENST00000384006 GBP3Q9H0R5 595 aa5.07□□□□□ -1.6
RNU6-641P-201ENST00000384006 EPN3Q9H201 632 aa5.07□□□□□ -1.6
RNU6-641P-201ENST00000384006 GP6Q9HCN6 339 aa5.07□□□□□ -1.6
RNU6-641P-201ENST00000384006 SIRPGQ9P1W8 387 aa5.07□□□□□ -1.6
RNU6-641P-201ENST00000384006 WHRNQ9P202 907 aa5.07□□□□□ -1.6
RNU6-641P-201ENST00000384006 SUSD2Q9UGT4 822 aa5.07□□□□□ -1.6
RNU6-641P-201ENST00000384006 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP5.07□□□□□ -1.6
RNU6-641P-201ENST00000384006 SHISA3A0PJX4 238 aa5.06□□□□□ -1.6
RNU6-641P-201ENST00000384006 ANKRD34BA5PLL1 514 aa5.06□□□□□ -1.6
RNU6-641P-201ENST00000384006 ITGA4P13612 1032 aa5.06□□□□□ -1.6
RNU6-641P-201ENST00000384006 CD247P20963 164 aa5.06□□□□□ -1.6
RNU6-641P-201ENST00000384006 SNW1Q13573 536 aaKnown RBP5.06□□□□□ -1.6
RNU6-641P-201ENST00000384006 TCEAL1Q15170 157 aa5.06□□□□□ -1.6
RNU6-641P-201ENST00000384006 ANGEL2Q5VTE6 544 aaKnown RBP5.06□□□□□ -1.6
RNU6-641P-201ENST00000384006 CDKAL1Q5VV42 579 aa5.06□□□□□ -1.6
RNU6-641P-201ENST00000384006 LARP1BQ659C4 914 aaKnown RBP5.06□□□□□ -1.6
RNU6-641P-201ENST00000384006 KIAA1211LQ6NV74 962 aa5.06□□□□□ -1.6
RNU6-641P-201ENST00000384006 TMC3Q7Z5M5 1100 aa5.06□□□□□ -1.6
RNU6-641P-201ENST00000384006 CELF2-AS1Q8N7Q2 184 aa5.06□□□□□ -1.6
RNU6-641P-201ENST00000384006 AGBL5Q8NDL9 886 aa5.06□□□□□ -1.6
RNU6-641P-201ENST00000384006 FLCNQ8NFG4 579 aa5.06□□□□□ -1.6
RNU6-641P-201ENST00000384006 MKL1Q969V6 931 aa5.06□□□□□ -1.6
RNU6-641P-201ENST00000384006 TRIM55Q9BYV6 548 aa5.06□□□□□ -1.6
RNU6-641P-201ENST00000384006 ZFP64Q9NPA5 681 aa5.06□□□□□ -1.6
RNU6-641P-201ENST00000384006 PAK6Q9NQU5 681 aaPredicted RBP5.06□□□□□ -1.6
RNU6-641P-201ENST00000384006 CHST7Q9NS84 486 aa5.06□□□□□ -1.6
RNU6-641P-201ENST00000384006 SCO2A0A1W2PP80 73 aa5.05□□□□□ -1.6
RNU6-641P-201ENST00000384006 B2RBV5 119 aa5.05□□□□□ -1.6
RNU6-641P-201ENST00000384006 GJB6O95452 261 aa5.05□□□□□ -1.6
RNU6-641P-201ENST00000384006 PRAMEF1O95521 474 aa5.05□□□□□ -1.6
RNU6-641P-201ENST00000384006 WNT11O96014 354 aa5.05□□□□□ -1.6
RNU6-641P-201ENST00000384006 EPHX1P07099 455 aa5.05□□□□□ -1.6
RNU6-641P-201ENST00000384006 ENDOUP21128 410 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
RNU6-641P-201ENST00000384006 FUT4P22083 530 aa5.05□□□□□ -1.6
RNU6-641P-201ENST00000384006 TPP2P29144 1249 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
RNU6-641P-201ENST00000384006 CLEC16AQ2KHT3 1053 aa5.05□□□□□ -1.6
RNU6-641P-201ENST00000384006 DCAF15Q66K64 600 aa5.05□□□□□ -1.6
RNU6-641P-201ENST00000384006 HEATR6Q6AI08 1181 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
RNU6-641P-201ENST00000384006 MRM1Q6IN84 353 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
RNU6-641P-201ENST00000384006 C6orf15Q6UXA7 325 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
RNU6-641P-201ENST00000384006 RNF111Q6ZNA4 994 aa5.05□□□□□ -1.6
RNU6-641P-201ENST00000384006 EEPD1Q7L9B9 569 aa5.05□□□□□ -1.6
RNU6-641P-201ENST00000384006 ZNF513Q8N8E2 541 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
RNU6-641P-201ENST00000384006 MICAL1Q8TDZ2 1067 aa5.05□□□□□ -1.6
RNU6-641P-201ENST00000384006 UBE2FQ969M7 185 aa5.05□□□□□ -1.6
RNU6-641P-201ENST00000384006 RCC1LQ96I51 464 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
RNU6-641P-201ENST00000384006 CCDC113Q9H0I3 377 aa5.05□□□□□ -1.6
RNU6-641P-201ENST00000384006 ATP13A1Q9HD20 1204 aa5.05□□□□□ -1.6
RNU6-641P-201ENST00000384006 GFOD1Q9NXC2 390 aa5.05□□□□□ -1.6
RNU6-641P-201ENST00000384006 FBXL21Q9UKT6 434 aa5.05□□□□□ -1.6
RNU6-641P-201ENST00000384006 PCDHB10Q9UN67 800 aa5.05□□□□□ -1.6
RNU6-641P-201ENST00000384006 ZNF451Q9Y4E5 1061 aa5.05□□□□□ -1.6
RNU6-641P-201ENST00000384006 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP5.04□□□□□ -1.6
RNU6-641P-201ENST00000384006 SUSD5O60279 629 aa5.04□□□□□ -1.6
RNU6-641P-201ENST00000384006 ADAMTS4O75173 837 aa5.04□□□□□ -1.6
RNU6-641P-201ENST00000384006 ESR1P03372 595 aa5.04□□□□□ -1.6
RNU6-641P-201ENST00000384006 TP53P04637 393 aaPredicted RBP5.04□□□□□ -1.6
RNU6-641P-201ENST00000384006 GSNP06396 782 aa5.04□□□□□ -1.6
RNU6-641P-201ENST00000384006 CD8BP10966 210 aa5.04□□□□□ -1.6
RNU6-641P-201ENST00000384006 BMP8BP34820 402 aa5.04□□□□□ -1.6
RNU6-641P-201ENST00000384006 ZNF445P59923 1031 aa5.04□□□□□ -1.6
RNU6-641P-201ENST00000384006 GRB10Q13322 594 aa5.04□□□□□ -1.6
RNU6-641P-201ENST00000384006 IKZF1Q13422 519 aa5.04□□□□□ -1.6
RNU6-641P-201ENST00000384006 SPRED2Q7Z698 418 aa5.04□□□□□ -1.6
RNU6-641P-201ENST00000384006 LINC00116Q8NCU8 138 aa5.04□□□□□ -1.6
RNU6-641P-201ENST00000384006 ST13P5Q8NFI4 369 aaPredicted RBP5.04□□□□□ -1.6
RNU6-641P-201ENST00000384006 ZSWIM5Q9P217 1185 aa5.04□□□□□ -1.6
RNU6-641P-201ENST00000384006 DUSP13Q9UII6 198 aa5.04□□□□□ -1.6
RNU6-641P-201ENST00000384006 DIS3Q9Y2L1 958 aaKnown RBP5.04□□□□□ -1.6
RNU6-641P-201ENST00000384006 ZNF281Q9Y2X9 895 aa5.04□□□□□ -1.6
RNU6-641P-201ENST00000384006 PPM1BO75688 479 aa5.03□□□□□ -1.6
RNU6-641P-201ENST00000384006 DDAH1O94760 285 aa5.03□□□□□ -1.6
RNU6-641P-201ENST00000384006 ZNF205O95201 554 aa5.03□□□□□ -1.6
RNU6-641P-201ENST00000384006 BNIP3Q12983 259 aa5.03□□□□□ -1.6
RNU6-641P-201ENST00000384006 RASGRF1Q13972 1273 aa5.03□□□□□ -1.6
RNU6-641P-201ENST00000384006 RASA3Q14644 834 aa5.03□□□□□ -1.6
RNU6-641P-201ENST00000384006 SLC23A3Q6PIS1 610 aa5.03□□□□□ -1.6
RNU6-641P-201ENST00000384006 ZNF574Q6ZN55 896 aaPredicted RBP5.03□□□□□ -1.6
RNU6-641P-201ENST00000384006 ARHGEF39Q8N4T4 335 aa5.03□□□□□ -1.6
RNU6-641P-201ENST00000384006 CRACR2BQ8N4Y2 399 aaPredicted RBP5.03□□□□□ -1.6
RNU6-641P-201ENST00000384006 TCTN2Q96GX1 697 aa5.03□□□□□ -1.6
RNU6-641P-201ENST00000384006 CCDC120Q96HB5 630 aa5.03□□□□□ -1.6
RNU6-641P-201ENST00000384006 SF3B6Q9Y3B4 125 aaKnown RBP5.03□□□□□ -1.6
RNU6-641P-201ENST00000384006 LTKP29376 864 aa5.02□□□□□ -1.61
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.8 ms