RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000310418.8

CLTB-201, Transcript of clathrin light chain B, humanhuman

APPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC

Gene CLTB, Length 1,215 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLTB-201ENST00000310418 ROBO3Q96MS0 1386 aa27.18■■□□□ 1.94
CLTB-201ENST00000310418 GREB1LQ9C091 1923 aaPredicted RBP27.18■■□□□ 1.94
CLTB-201ENST00000310418 M0R2C6 588 aa27.17■■□□□ 1.94
CLTB-201ENST00000310418 CYBAP13498 195 aa27.17■■□□□ 1.94
CLTB-201ENST00000310418 GNAT2P19087 354 aa27.17■■□□□ 1.94
CLTB-201ENST00000310418 LRRFIP1Q32MZ4 808 aaKnown RBP27.17■■□□□ 1.94
CLTB-201ENST00000310418 ABRAQ8N0Z2 381 aa27.17■■□□□ 1.94
CLTB-201ENST00000310418 GDF15Q99988 308 aa27.17■■□□□ 1.94
CLTB-201ENST00000310418 EPB41L4AQ9HCS5 686 aaPredicted RBP27.17■■□□□ 1.94
CLTB-201ENST00000310418 SLC5A4Q9NY91 659 aa27.17■■□□□ 1.94
CLTB-201ENST00000310418 ERC2O15083 957 aa27.16■■□□□ 1.94
CLTB-201ENST00000310418 SLC25A27O95847 323 aa27.16■■□□□ 1.94
CLTB-201ENST00000310418 TDO2P48775 406 aa27.16■■□□□ 1.94
CLTB-201ENST00000310418 FAM83BQ5T0W9 1011 aa27.16■■□□□ 1.94
CLTB-201ENST00000310418 APPP05067 770 aa27.15■■□□□ 1.94
CLTB-201ENST00000310418 FCER1AP12319 257 aa27.15■■□□□ 1.94
CLTB-201ENST00000310418 BMP8BP34820 402 aa27.15■■□□□ 1.94
CLTB-201ENST00000310418 LRRC26Q2I0M4 334 aa27.15■■□□□ 1.94
CLTB-201ENST00000310418 PI4K2BQ8TCG2 481 aa27.15■■□□□ 1.94
CLTB-201ENST00000310418 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP27.15■■□□□ 1.94
CLTB-201ENST00000310418 PPP1R9AQ9ULJ8 1098 aa27.15■■□□□ 1.94
CLTB-201ENST00000310418 COL11A1P12107 1806 aaPredicted RBP27.15■■□□□ 1.94
CLTB-201ENST00000310418 VWA5AO00534 786 aa27.14■■□□□ 1.94
CLTB-201ENST00000310418 NYAP2Q9P242 653 aa27.14■■□□□ 1.94
CLTB-201ENST00000310418 SZT2Q5T011 3432 aa27.13■■□□□ 1.93
CLTB-201ENST00000310418 PATL2C9JE40 543 aaKnown RBP27.13■■□□□ 1.93
CLTB-201ENST00000310418 RRP1P56182 461 aaKnown RBP27.13■■□□□ 1.93
CLTB-201ENST00000310418 RIOX2Q8IUF8 465 aa27.13■■□□□ 1.93
CLTB-201ENST00000310418 SENP6Q9GZR1 1112 aaPredicted RBP27.13■■□□□ 1.93
CLTB-201ENST00000310418 MAGEA10P43363 369 aaPredicted RBP27.12■■□□□ 1.93
CLTB-201ENST00000310418 IFNL3Q8IZI9 196 aa27.12■■□□□ 1.93
CLTB-201ENST00000310418 MAML3Q96JK9 1138 aa27.12■■□□□ 1.93
CLTB-201ENST00000310418 SEC62Q99442 399 aaKnown RBP27.12■■□□□ 1.93
CLTB-201ENST00000310418 MMP19Q99542 508 aa27.12■■□□□ 1.93
CLTB-201ENST00000310418 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP27.12■■□□□ 1.93
CLTB-201ENST00000310418 FSD1Q9BTV5 496 aa27.12■■□□□ 1.93
CLTB-201ENST00000310418 ZNF287Q9HBT7 754 aa27.12■■□□□ 1.93
CLTB-201ENST00000310418 F5H6K3 240 aa27.11■■□□□ 1.93
CLTB-201ENST00000310418 DNM1LO00429 736 aa27.11■■□□□ 1.93
CLTB-201ENST00000310418 STAT3P40763 770 aa27.11■■□□□ 1.93
CLTB-201ENST00000310418 KLRC3Q07444 240 aa27.11■■□□□ 1.93
CLTB-201ENST00000310418 ZNF444Q8N0Y2 327 aaPredicted RBP27.11■■□□□ 1.93
CLTB-201ENST00000310418 REPS2Q8NFH8 660 aa27.11■■□□□ 1.93
CLTB-201ENST00000310418 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa27.1■■□□□ 1.93
CLTB-201ENST00000310418 SOX1O00570 391 aaPredicted RBP27.1■■□□□ 1.93
CLTB-201ENST00000310418 SEPT4O43236 478 aa27.1■■□□□ 1.93
CLTB-201ENST00000310418 PRDM1O75626 825 aa27.1■■□□□ 1.93
CLTB-201ENST00000310418 MX1P20591 662 aa27.1■■□□□ 1.93
CLTB-201ENST00000310418 PRAMEF19Q5SWL8 479 aa27.1■■□□□ 1.93
CLTB-201ENST00000310418 SLF1Q9BQI6 1058 aa27.1■■□□□ 1.93
CLTB-201ENST00000310418 NACAP1Q9BZK3 213 aa27.1■■□□□ 1.93
CLTB-201ENST00000310418 CLIP2Q9UDT6 1046 aa27.1■■□□□ 1.93
CLTB-201ENST00000310418 ZNF214Q9UL59 606 aaPredicted RBP27.1■■□□□ 1.93
CLTB-201ENST00000310418 NDUFB10O96000 172 aa27.09■■□□□ 1.93
CLTB-201ENST00000310418 COPB2P35606 906 aa27.09■■□□□ 1.93
CLTB-201ENST00000310418 ANO1Q5XXA6 986 aa27.09■■□□□ 1.93
CLTB-201ENST00000310418 ARRDC4Q8NCT1 418 aa27.09■■□□□ 1.93
CLTB-201ENST00000310418 ZNFX1Q9P2E3 1918 aaKnown RBP27.09■■□□□ 1.93
CLTB-201ENST00000310418 PGK2P07205 417 aa27.08■■□□□ 1.93
CLTB-201ENST00000310418 KCTD2Q14681 263 aa27.08■■□□□ 1.93
CLTB-201ENST00000310418 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa27.08■■□□□ 1.93
CLTB-201ENST00000310418 GJC2Q5T442 439 aaPredicted RBP27.08■■□□□ 1.93
CLTB-201ENST00000310418 ATN1P54259 1190 aaPredicted RBP27.07■■□□□ 1.92
CLTB-201ENST00000310418 CEP95Q96GE4 821 aa27.07■■□□□ 1.92
CLTB-201ENST00000310418 LRCH3Q96II8 777 aa27.07■■□□□ 1.92
CLTB-201ENST00000310418 CRBNQ96SW2 442 aa27.07■■□□□ 1.92
CLTB-201ENST00000310418 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP27.07■■□□□ 1.92
CLTB-201ENST00000310418 MYH4Q9Y623 1939 aa27.06■■□□□ 1.92
CLTB-201ENST00000310418 PRPF38AQ8NAV1 312 aaKnown RBP27.06■■□□□ 1.92
CLTB-201ENST00000310418 MKL1Q969V6 931 aa27.06■■□□□ 1.92
CLTB-201ENST00000310418 UBE2OQ9C0C9 1292 aaKnown RBP27.06■■□□□ 1.92
CLTB-201ENST00000310418 NAPBQ9H115 298 aa27.06■■□□□ 1.92
CLTB-201ENST00000310418 MTMR4Q9NYA4 1195 aa27.06■■□□□ 1.92
CLTB-201ENST00000310418 SALL3Q9BXA9 1300 aa27.06■■□□□ 1.92
CLTB-201ENST00000310418 KBTBD13C9JR72 458 aa27.05■■□□□ 1.92
CLTB-201ENST00000310418 PDE4BQ07343 736 aa27.05■■□□□ 1.92
CLTB-201ENST00000310418 ZNF792Q3KQV3 632 aa27.05■■□□□ 1.92
CLTB-201ENST00000310418 ANKRD45Q5TZF3 282 aa27.05■■□□□ 1.92
CLTB-201ENST00000310418 TEX13BQ9BXU2 312 aa27.05■■□□□ 1.92
CLTB-201ENST00000310418 NRBP1Q9UHY1 535 aa27.05■■□□□ 1.92
CLTB-201ENST00000310418 DIS3Q9Y2L1 958 aaKnown RBP27.05■■□□□ 1.92
CLTB-201ENST00000310418 TTLL1O95922 423 aa27.04■■□□□ 1.92
CLTB-201ENST00000310418 MYCNP04198 464 aaPredicted RBP27.04■■□□□ 1.92
CLTB-201ENST00000310418 SLC3A2P08195 630 aaKnown RBP27.04■■□□□ 1.92
CLTB-201ENST00000310418 SNRNP48Q6IEG0 339 aaKnown RBP27.04■■□□□ 1.92
CLTB-201ENST00000310418 TDHQ8IZJ6 230 aa27.04■■□□□ 1.92
CLTB-201ENST00000310418 TINF2Q9BSI4 451 aa27.04■■□□□ 1.92
CLTB-201ENST00000310418 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa27.04■■□□□ 1.92
CLTB-201ENST00000310418 PLXNA1Q9UIW2 1896 aa27.04■■□□□ 1.92
CLTB-201ENST00000310418 TSPY3P0CV98 308 aa27.03■■□□□ 1.92
CLTB-201ENST00000310418 TSPY8P0CW00 308 aa27.03■■□□□ 1.92
CLTB-201ENST00000310418 MDM2Q00987 491 aaPredicted RBP27.03■■□□□ 1.92
CLTB-201ENST00000310418 PPARAQ07869 468 aa27.03■■□□□ 1.92
CLTB-201ENST00000310418 LRRC47Q8N1G4 583 aaKnown RBP27.03■■□□□ 1.92
CLTB-201ENST00000310418 NEDD1Q8NHV4 660 aa27.03■■□□□ 1.92
CLTB-201ENST00000310418 PLIN4Q96Q06 1357 aa27.03■■□□□ 1.92
CLTB-201ENST00000310418 LAMA3Q16787 3333 aa27.03■■□□□ 1.92
CLTB-201ENST00000310418 ZBED4O75132 1171 aa27.02■■□□□ 1.92
CLTB-201ENST00000310418 RTP1P59025 263 aa27.02■■□□□ 1.92
CLTB-201ENST00000310418 FAM47AQ5JRC9 791 aa27.02■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 82.2 ms