RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264938.7

SLC9A3-201, Transcript of solute carrier family 9 member A3, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene SLC9A3, Length 2,584 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A3-201ENST00000264938 RIC1Q4ADV7 1423 aa26.1■■□□□ 1.77
SLC9A3-201ENST00000264938 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP26.1■■□□□ 1.77
SLC9A3-201ENST00000264938 MRPS25P82663 173 aaKnown RBP26.1■■□□□ 1.77
SLC9A3-201ENST00000264938 ZNF174Q15697 407 aa26.1■■□□□ 1.77
SLC9A3-201ENST00000264938 IRF2BP1Q8IU81 584 aa26.1■■□□□ 1.77
SLC9A3-201ENST00000264938 SYNE4Q8N205 404 aa26.1■■□□□ 1.77
SLC9A3-201ENST00000264938 AENQ8WTP8 325 aaKnown RBP26.1■■□□□ 1.77
SLC9A3-201ENST00000264938 HDAC7Q8WUI4 952 aa26.1■■□□□ 1.77
SLC9A3-201ENST00000264938 SAMM50Q9Y512 469 aa26.1■■□□□ 1.77
SLC9A3-201ENST00000264938 WTAPQ15007 396 aa26.09■■□□□ 1.77
SLC9A3-201ENST00000264938 AKNAD1Q5T1N1 836 aa26.09■■□□□ 1.77
SLC9A3-201ENST00000264938 NID2Q14112 1375 aa26.09■■□□□ 1.77
SLC9A3-201ENST00000264938 PRDM1O75626 825 aa26.09■■□□□ 1.77
SLC9A3-201ENST00000264938 GNGT1P63211 74 aa26.09■■□□□ 1.77
SLC9A3-201ENST00000264938 TCIRG1Q13488 830 aa26.09■■□□□ 1.77
SLC9A3-201ENST00000264938 FANCBQ8NB91 859 aa26.09■■□□□ 1.77
SLC9A3-201ENST00000264938 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP26.09■■□□□ 1.77
SLC9A3-201ENST00000264938 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa26.09■■□□□ 1.77
SLC9A3-201ENST00000264938 PATL2C9JE40 543 aaKnown RBP26.08■■□□□ 1.77
SLC9A3-201ENST00000264938 EIF3HO15372 352 aaKnown RBP eCLIP26.08■■□□□ 1.77
SLC9A3-201ENST00000264938 SPAG1Q07617 926 aa26.08■■□□□ 1.77
SLC9A3-201ENST00000264938 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP26.08■■□□□ 1.77
SLC9A3-201ENST00000264938 ALX1Q15699 326 aa26.08■■□□□ 1.77
SLC9A3-201ENST00000264938 DNAJC7Q99615 494 aa26.08■■□□□ 1.77
SLC9A3-201ENST00000264938 FBXO3Q9UK99 471 aa26.08■■□□□ 1.77
SLC9A3-201ENST00000264938 GDAQ9Y2T3 454 aa26.08■■□□□ 1.77
SLC9A3-201ENST00000264938 LUC7L2Q9Y383 392 aaKnown RBP26.08■■□□□ 1.77
SLC9A3-201ENST00000264938 CHD4Q14839 1912 aa26.08■■□□□ 1.77
SLC9A3-201ENST00000264938 CKAP4Q07065 602 aaKnown RBP26.08■■□□□ 1.77
SLC9A3-201ENST00000264938 MFSD6Q6ZSS7 791 aa26.08■■□□□ 1.77
SLC9A3-201ENST00000264938 SND1Q7KZF4 910 aaKnown RBP eCLIP26.08■■□□□ 1.77
SLC9A3-201ENST00000264938 RPGRIP1Q96KN7 1286 aa26.08■■□□□ 1.77
SLC9A3-201ENST00000264938 TRIM49BA6NDI0 452 aa26.07■■□□□ 1.76
SLC9A3-201ENST00000264938 PRKAB2O43741 272 aa26.07■■□□□ 1.76
SLC9A3-201ENST00000264938 PHKA1P46020 1223 aa26.07■■□□□ 1.76
SLC9A3-201ENST00000264938 KIAA1328Q86T90 577 aa26.07■■□□□ 1.76
SLC9A3-201ENST00000264938 ANKLE2Q86XL3 938 aa26.07■■□□□ 1.76
SLC9A3-201ENST00000264938 ARMT1Q9H993 441 aa26.07■■□□□ 1.76
SLC9A3-201ENST00000264938 ANKRD20A12PQ8NF67 263 aa26.07■■□□□ 1.76
SLC9A3-201ENST00000264938 FAM184BQ9ULE4 1060 aa26.07■■□□□ 1.76
SLC9A3-201ENST00000264938 MYH6P13533 1939 aa26.07■■□□□ 1.76
SLC9A3-201ENST00000264938 PES1O00541 588 aaKnown RBP26.06■■□□□ 1.76
SLC9A3-201ENST00000264938 MBD4O95243 580 aa26.06■■□□□ 1.76
SLC9A3-201ENST00000264938 PPARAQ07869 468 aa26.06■■□□□ 1.76
SLC9A3-201ENST00000264938 MB21D1Q8N884 522 aa26.06■■□□□ 1.76
SLC9A3-201ENST00000264938 ISCA1Q9BUE6 129 aa26.06■■□□□ 1.76
SLC9A3-201ENST00000264938 DMGDHQ9UI17 866 aaKnown RBP26.06■■□□□ 1.76
SLC9A3-201ENST00000264938 PARP1P09874 1014 aaKnown RBP26.06■■□□□ 1.76
SLC9A3-201ENST00000264938 MNAT1P51948 309 aa26.06■■□□□ 1.76
SLC9A3-201ENST00000264938 ZNF654Q8IZM8 581 aa26.06■■□□□ 1.76
SLC9A3-201ENST00000264938 SH3GL2Q99962 352 aa26.06■■□□□ 1.76
SLC9A3-201ENST00000264938 JADE2Q9NQC1 790 aa26.06■■□□□ 1.76
SLC9A3-201ENST00000264938 PRCPP42785 496 aa26.05■■□□□ 1.76
SLC9A3-201ENST00000264938 GSCP56915 257 aaPredicted RBP26.05■■□□□ 1.76
SLC9A3-201ENST00000264938 PDXDC2PQ6P474 469 aa26.05■■□□□ 1.76
SLC9A3-201ENST00000264938 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa26.05■■□□□ 1.76
SLC9A3-201ENST00000264938 CCDC91Q7Z6B0 441 aa26.05■■□□□ 1.76
SLC9A3-201ENST00000264938 FERMT2Q96AC1 680 aa26.05■■□□□ 1.76
SLC9A3-201ENST00000264938 PKN1Q16512 942 aa26.05■■□□□ 1.76
SLC9A3-201ENST00000264938 KRT23Q9C075 422 aa26.05■■□□□ 1.76
SLC9A3-201ENST00000264938 CNNM2Q9H8M5 875 aa26.05■■□□□ 1.76
SLC9A3-201ENST00000264938 GSG1L2A8MUP6 293 aa26.04■■□□□ 1.76
SLC9A3-201ENST00000264938 IDEP14735 1019 aa26.04■■□□□ 1.76
SLC9A3-201ENST00000264938 INPP5BP32019 993 aa26.04■■□□□ 1.76
SLC9A3-201ENST00000264938 TTLL11Q8NHH1 800 aa26.04■■□□□ 1.76
SLC9A3-201ENST00000264938 ARL8AQ96BM9 186 aa26.04■■□□□ 1.76
SLC9A3-201ENST00000264938 LRRC1Q9BTT6 524 aa26.04■■□□□ 1.76
SLC9A3-201ENST00000264938 AGPAT5Q9NUQ2 364 aa26.04■■□□□ 1.76
SLC9A3-201ENST00000264938 CAPN11Q9UMQ6 739 aa26.04■■□□□ 1.76
SLC9A3-201ENST00000264938 MACROD2A1Z1Q3 448 aa26.04■■□□□ 1.76
SLC9A3-201ENST00000264938 KRT86O43790 486 aa26.04■■□□□ 1.76
SLC9A3-201ENST00000264938 CSF1RP07333 972 aa26.04■■□□□ 1.76
SLC9A3-201ENST00000264938 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa26.04■■□□□ 1.76
SLC9A3-201ENST00000264938 PMS1P54277 932 aaKnown RBP26.04■■□□□ 1.76
SLC9A3-201ENST00000264938 PTGDRQ13258 359 aa26.04■■□□□ 1.76
SLC9A3-201ENST00000264938 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa26.04■■□□□ 1.76
SLC9A3-201ENST00000264938 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP26.04■■□□□ 1.76
SLC9A3-201ENST00000264938 MYH13Q9UKX3 1938 aa26.04■■□□□ 1.76
SLC9A3-201ENST00000264938 KRT2P35908 639 aa26.03■■□□□ 1.76
SLC9A3-201ENST00000264938 CYP27A1Q02318 531 aa26.03■■□□□ 1.76
SLC9A3-201ENST00000264938 ZNF507Q8TCN5 953 aa26.03■■□□□ 1.76
SLC9A3-201ENST00000264938 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa26.03■■□□□ 1.76
SLC9A3-201ENST00000264938 SHTN1A0MZ66 631 aa26.03■■□□□ 1.76
SLC9A3-201ENST00000264938 ZNF658Q5TYW1 1059 aaPredicted RBP26.03■■□□□ 1.76
SLC9A3-201ENST00000264938 KRT28Q7Z3Y7 464 aa26.03■■□□□ 1.76
SLC9A3-201ENST00000264938 MAGEB6Q8N7X4 407 aa26.03■■□□□ 1.76
SLC9A3-201ENST00000264938 PHF20Q9BVI0 1012 aa26.03■■□□□ 1.76
SLC9A3-201ENST00000264938 KRT83P78385 493 aa26.02■■□□□ 1.76
SLC9A3-201ENST00000264938 SLC7A5Q01650 507 aa26.02■■□□□ 1.76
SLC9A3-201ENST00000264938 TTMPQ5BVD1 217 aa26.02■■□□□ 1.76
SLC9A3-201ENST00000264938 TSEN2Q8NCE0 465 aaKnown RBP26.02■■□□□ 1.76
SLC9A3-201ENST00000264938 LGALS16A8MUM7 142 aa26.02■■□□□ 1.76
SLC9A3-201ENST00000264938 CREG2Q8IUH2 290 aa26.02■■□□□ 1.76
SLC9A3-201ENST00000264938 SMCR8Q8TEV9 937 aaPredicted RBP26.02■■□□□ 1.76
SLC9A3-201ENST00000264938 IL17AQ16552 155 aa26.02■■□□□ 1.76
SLC9A3-201ENST00000264938 TSR1Q2NL82 804 aaKnown RBP26.02■■□□□ 1.76
SLC9A3-201ENST00000264938 ZNF512BQ96KM6 892 aaPredicted RBP26.02■■□□□ 1.76
SLC9A3-201ENST00000264938 GREM2Q9H772 168 aa26.02■■□□□ 1.76
SLC9A3-201ENST00000264938 POLD4Q9HCU8 107 aa26.02■■□□□ 1.76
SLC9A3-201ENST00000264938 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa26.01■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.1 ms