RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000016569.10

Pds5b-201, Transcript of Sister chromatid cohesion protein PDS5 homolog B, mousemouse

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene Pds5b, Length 7,417 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pds5b-201ENSMUST00000016569 NppbP40753 121 aa14.72□□□□□ -0.05
Pds5b-201ENSMUST00000016569 Tlr7P58681 1050 aa14.72□□□□□ -0.05
Pds5b-201ENSMUST00000016569 Lig3P97386 1015 aa14.72□□□□□ -0.05
Pds5b-201ENSMUST00000016569 Nsun2Q1HFZ0 757 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
Pds5b-201ENSMUST00000016569 Krt39Q6IFX4 482 aa14.72□□□□□ -0.05
Pds5b-201ENSMUST00000016569 Dzip3Q7TPV2 1204 aa14.72□□□□□ -0.05
Pds5b-201ENSMUST00000016569 Osbpl1aQ91XL9 950 aa14.72□□□□□ -0.05
Pds5b-201ENSMUST00000016569 Ddx24Q9ESV0 857 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
Pds5b-201ENSMUST00000016569 Rilpl1Q9JJC6 406 aa14.72□□□□□ -0.05
Pds5b-201ENSMUST00000016569 Kdm6aO70546 1401 aa14.72□□□□□ -0.05
Pds5b-201ENSMUST00000016569 Ppp1r7Q3UM45 361 aa14.72□□□□□ -0.05
Pds5b-201ENSMUST00000016569 Tsr1Q5SWD9 803 aa14.72□□□□□ -0.05
Pds5b-201ENSMUST00000016569 Trerf1Q8BXJ2 1205 aa14.72□□□□□ -0.05
Pds5b-201ENSMUST00000016569 Cbx6Q9DBY5 414 aa14.72□□□□□ -0.05
Pds5b-201ENSMUST00000016569 Cpb1B2RS76 415 aa14.72□□□□□ -0.05
Pds5b-201ENSMUST00000016569 Serpini1O35684 410 aa14.72□□□□□ -0.05
Pds5b-201ENSMUST00000016569 Zbtb7bQ64321 544 aa14.72□□□□□ -0.05
Pds5b-201ENSMUST00000016569 Bank1Q80VH0 783 aa14.72□□□□□ -0.05
Pds5b-201ENSMUST00000016569 Ttc41Q692V3 1318 aa14.72□□□□□ -0.05
Pds5b-201ENSMUST00000016569 Trim60Q8VI40 466 aa14.71□□□□□ -0.05
Pds5b-201ENSMUST00000016569 Wdr17E9Q271 1322 aa14.71□□□□□ -0.05
Pds5b-201ENSMUST00000016569 Stk38lQ7TSE6 464 aa14.71□□□□□ -0.05
Pds5b-201ENSMUST00000016569 Cnot10Q8BH15 744 aa14.71□□□□□ -0.05
Pds5b-201ENSMUST00000016569 Taf12Q8VE65 161 aa14.71□□□□□ -0.05
Pds5b-201ENSMUST00000016569 1700020D05RikQ99PB1 294 aa14.71□□□□□ -0.05
Pds5b-201ENSMUST00000016569 CacybpQ9CXW3 229 aa14.71□□□□□ -0.05
Pds5b-201ENSMUST00000016569 Adcy8P97490 1249 aa14.71□□□□□ -0.05
Pds5b-201ENSMUST00000016569 Adam1aQ60813 791 aa14.71□□□□□ -0.05
Pds5b-201ENSMUST00000016569 Rbm41Q8JZV4 413 aa14.71□□□□□ -0.05
Pds5b-201ENSMUST00000016569 Tmem119Q8R138 280 aa14.71□□□□□ -0.05
Pds5b-201ENSMUST00000016569 Fam207aP58468 219 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
Pds5b-201ENSMUST00000016569 Arhgef40Q3UPH7 1517 aa14.71□□□□□ -0.05
Pds5b-201ENSMUST00000016569 Slc10a4Q3UEZ8 437 aa14.71□□□□□ -0.05
Pds5b-201ENSMUST00000016569 Ccdc160Q3UYG1 323 aa14.71□□□□□ -0.05
Pds5b-201ENSMUST00000016569 Ccdc125Q5U465 500 aa14.71□□□□□ -0.05
Pds5b-201ENSMUST00000016569 Ctdspl2Q8BG15 465 aa14.71□□□□□ -0.05
Pds5b-201ENSMUST00000016569 LgsnQ8CIX8 563 aa14.71□□□□□ -0.05
Pds5b-201ENSMUST00000016569 Fam217aQ9D9W6 419 aa14.71□□□□□ -0.05
Pds5b-201ENSMUST00000016569 Dctpp1Q9QY93 170 aa14.71□□□□□ -0.05
Pds5b-201ENSMUST00000016569 Ankrd2Q9WV06 328 aa14.71□□□□□ -0.05
Pds5b-201ENSMUST00000016569 Cpsf2O35218 782 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.06
Pds5b-201ENSMUST00000016569 Tgfb1i1Q62219 461 aa14.71□□□□□ -0.06
Pds5b-201ENSMUST00000016569 Nxf7Q80SZ6 620 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.06
Pds5b-201ENSMUST00000016569 Mier3Q3UHF3 551 aa14.7□□□□□ -0.06
Pds5b-201ENSMUST00000016569 Ppp2r3dQ9Z176 491 aa14.7□□□□□ -0.06
Pds5b-201ENSMUST00000016569 Ubn1Q4G0F8 1135 aa14.7□□□□□ -0.06
Pds5b-201ENSMUST00000016569 DbnlQ62418 436 aa14.7□□□□□ -0.06
Pds5b-201ENSMUST00000016569 Serpinb6eI7HJI3 429 aa14.7□□□□□ -0.06
Pds5b-201ENSMUST00000016569 Nr1i2O54915 431 aa14.7□□□□□ -0.06
Pds5b-201ENSMUST00000016569 Rnaseh1O70338 285 aa14.7□□□□□ -0.06
Pds5b-201ENSMUST00000016569 Slain2Q8CI08 581 aa14.7□□□□□ -0.06
Pds5b-201ENSMUST00000016569 Pde6cQ91ZQ1 861 aa14.7□□□□□ -0.06
Pds5b-201ENSMUST00000016569 Scyl1Q9EQC5 806 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
Pds5b-201ENSMUST00000016569 Ube3bQ9ES34 1070 aa14.7□□□□□ -0.06
Pds5b-201ENSMUST00000016569 FliiQ9JJ28 1271 aa14.7□□□□□ -0.06
Pds5b-201ENSMUST00000016569 Rps6ka2Q9WUT3 733 aa14.7□□□□□ -0.06
Pds5b-201ENSMUST00000016569 Gm14525B1AZA0 212 aa14.7□□□□□ -0.06
Pds5b-201ENSMUST00000016569 Gm2012B1B0R1 212 aa14.7□□□□□ -0.06
Pds5b-201ENSMUST00000016569 Parp2O88554 559 aa14.7□□□□□ -0.06
Pds5b-201ENSMUST00000016569 YwhaeP62259 255 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
Pds5b-201ENSMUST00000016569 AticQ9CWJ9 592 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
Pds5b-201ENSMUST00000016569 DohhA0A1Y7VJ29 135 aa14.7□□□□□ -0.06
Pds5b-201ENSMUST00000016569 CaluO35887 315 aa14.7□□□□□ -0.06
Pds5b-201ENSMUST00000016569 Nxf2Q4ZGD8 691 aa14.7□□□□□ -0.06
Pds5b-201ENSMUST00000016569 Ankk1Q8BZ25 745 aa14.7□□□□□ -0.06
Pds5b-201ENSMUST00000016569 PaoxQ8C0L6 504 aa14.7□□□□□ -0.06
Pds5b-201ENSMUST00000016569 Drc3Q9D5E4 523 aa14.7□□□□□ -0.06
Pds5b-201ENSMUST00000016569 Xrcc6P23475 608 aa14.7□□□□□ -0.06
Pds5b-201ENSMUST00000016569 PhbP67778 272 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
Pds5b-201ENSMUST00000016569 Slc8a1P70414 970 aa14.7□□□□□ -0.06
Pds5b-201ENSMUST00000016569 Glrx3Q9CQM9 337 aa14.7□□□□□ -0.06
Pds5b-201ENSMUST00000016569 CactinQ9CS00 772 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
Pds5b-201ENSMUST00000016569 Ccdc124Q9D8X2 217 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
Pds5b-201ENSMUST00000016569 Pex3Q9QXY9 372 aa14.7□□□□□ -0.06
Pds5b-201ENSMUST00000016569 Hfm1D3Z4R1 1434 aa14.69□□□□□ -0.06
Pds5b-201ENSMUST00000016569 Sem1P60897 70 aa14.69□□□□□ -0.06
Pds5b-201ENSMUST00000016569 Bola2Q8BGS2 86 aa14.69□□□□□ -0.06
Pds5b-201ENSMUST00000016569 Ca8P28651 291 aa14.69□□□□□ -0.06
Pds5b-201ENSMUST00000016569 Bbs9Q811G0 885 aa14.69□□□□□ -0.06
Pds5b-201ENSMUST00000016569 Pex11aQ9Z211 246 aa14.69□□□□□ -0.06
Pds5b-201ENSMUST00000016569 Nom1Q3UFM5 854 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
Pds5b-201ENSMUST00000016569 Trim37Q6PCX9 961 aa14.69□□□□□ -0.06
Pds5b-201ENSMUST00000016569 Slc44a1Q6X893 653 aa14.69□□□□□ -0.06
Pds5b-201ENSMUST00000016569 Dnm3Q8BZ98 863 aa14.69□□□□□ -0.06
Pds5b-201ENSMUST00000016569 Mknk2Q8CDB0 459 aa14.69□□□□□ -0.06
Pds5b-201ENSMUST00000016569 Ccdc87Q8CDL9 855 aa14.69□□□□□ -0.06
Pds5b-201ENSMUST00000016569 Ncoa5Q91W39 579 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
Pds5b-201ENSMUST00000016569 Oxsr1Q6P9R2 527 aa14.69□□□□□ -0.06
Pds5b-201ENSMUST00000016569 Rapgef5Q8C0Q9 814 aa14.69□□□□□ -0.06
Pds5b-201ENSMUST00000016569 Ushbp1Q8R370 680 aa14.69□□□□□ -0.06
Pds5b-201ENSMUST00000016569 Med23Q80YQ2 1367 aa14.69□□□□□ -0.06
Pds5b-201ENSMUST00000016569 Xrcc5P27641 732 aa14.69□□□□□ -0.06
Pds5b-201ENSMUST00000016569 Polr2fP61219 127 aa14.69□□□□□ -0.06
Pds5b-201ENSMUST00000016569 Myo1fP70248 1099 aa14.69□□□□□ -0.06
Pds5b-201ENSMUST00000016569 Ncoa7Q6DFV7 943 aa14.69□□□□□ -0.06
Pds5b-201ENSMUST00000016569 Gja8P28236 440 aa14.68□□□□□ -0.06
Pds5b-201ENSMUST00000016569 Krt87Q6IMF0 495 aa14.68□□□□□ -0.06
Pds5b-201ENSMUST00000016569 Pih1h3bQ8C6P5 218 aa14.68□□□□□ -0.06
Pds5b-201ENSMUST00000016569 Xpo5Q924C1 1204 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
Pds5b-201ENSMUST00000016569 Prdm11A2AGX3 565 aa14.68□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 46 ms