Protein–RNA interactions for Protein: P70414

Slc8a1, Sodium/calcium exchanger 1, mousemouse

Predictions only

Length 970 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc8a1P70414 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC36.24■■■■□ 3.39
Slc8a1P70414 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
Slc8a1P70414 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
Slc8a1P70414 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
Slc8a1P70414 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
Slc8a1P70414 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
Slc8a1P70414 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.51■■■□□ 2.79
Slc8a1P70414 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
Slc8a1P70414 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC32.06■■■□□ 2.72
Slc8a1P70414 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC31.5■■■□□ 2.63
Slc8a1P70414 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC31.5■■■□□ 2.63
Slc8a1P70414 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
Slc8a1P70414 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
Slc8a1P70414 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
Slc8a1P70414 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC30.68■■■□□ 2.5
Slc8a1P70414 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
Slc8a1P70414 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
Slc8a1P70414 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
Slc8a1P70414 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Slc8a1P70414 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Slc8a1P70414 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Slc8a1P70414 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Slc8a1P70414 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC30.32■■■□□ 2.44
Slc8a1P70414 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC30.3■■■□□ 2.44
Slc8a1P70414 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC30.25■■■□□ 2.43
Slc8a1P70414 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Slc8a1P70414 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
Slc8a1P70414 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Slc8a1P70414 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Slc8a1P70414 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Slc8a1P70414 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Slc8a1P70414 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Slc8a1P70414 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Slc8a1P70414 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Slc8a1P70414 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
Slc8a1P70414 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Slc8a1P70414 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Slc8a1P70414 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Slc8a1P70414 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Slc8a1P70414 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
Slc8a1P70414 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Slc8a1P70414 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Slc8a1P70414 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
Slc8a1P70414 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Slc8a1P70414 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Slc8a1P70414 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Slc8a1P70414 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Slc8a1P70414 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Slc8a1P70414 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Slc8a1P70414 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Slc8a1P70414 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Slc8a1P70414 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Slc8a1P70414 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Slc8a1P70414 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Slc8a1P70414 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Slc8a1P70414 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Slc8a1P70414 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Slc8a1P70414 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Slc8a1P70414 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Slc8a1P70414 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Slc8a1P70414 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Slc8a1P70414 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Slc8a1P70414 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Slc8a1P70414 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
Slc8a1P70414 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Slc8a1P70414 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
Slc8a1P70414 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Slc8a1P70414 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Slc8a1P70414 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Slc8a1P70414 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Slc8a1P70414 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Slc8a1P70414 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Slc8a1P70414 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Slc8a1P70414 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Slc8a1P70414 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Slc8a1P70414 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Slc8a1P70414 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Slc8a1P70414 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Slc8a1P70414 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Slc8a1P70414 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Slc8a1P70414 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Slc8a1P70414 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Slc8a1P70414 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Slc8a1P70414 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Slc8a1P70414 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Slc8a1P70414 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Slc8a1P70414 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
Slc8a1P70414 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Slc8a1P70414 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Slc8a1P70414 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Slc8a1P70414 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Slc8a1P70414 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Slc8a1P70414 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Slc8a1P70414 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Slc8a1P70414 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Slc8a1P70414 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Slc8a1P70414 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Slc8a1P70414 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Slc8a1P70414 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Slc8a1P70414 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms