Protein–RNA interactions for Protein: B2RS76

Cpb1, Carboxypeptidase B1 (Tissue), isoform CRA_b, mousemouse

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpb1B2RS76 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC42.91■■■■■ 4.46
Cpb1B2RS76 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC39.63■■■■□ 3.93
Cpb1B2RS76 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.05■■■■□ 3.84
Cpb1B2RS76 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC37.6■■■■□ 3.61
Cpb1B2RS76 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.6
Cpb1B2RS76 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC37.11■■■■□ 3.53
Cpb1B2RS76 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
Cpb1B2RS76 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC36.77■■■■□ 3.48
Cpb1B2RS76 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
Cpb1B2RS76 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.28■■■■□ 3.4
Cpb1B2RS76 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
Cpb1B2RS76 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
Cpb1B2RS76 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC35.82■■■■□ 3.32
Cpb1B2RS76 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
Cpb1B2RS76 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
Cpb1B2RS76 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC35.06■■■■□ 3.2
Cpb1B2RS76 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
Cpb1B2RS76 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
Cpb1B2RS76 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
Cpb1B2RS76 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC34.64■■■■□ 3.14
Cpb1B2RS76 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC34.61■■■■□ 3.13
Cpb1B2RS76 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC34.6■■■■□ 3.13
Cpb1B2RS76 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
Cpb1B2RS76 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
Cpb1B2RS76 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
Cpb1B2RS76 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
Cpb1B2RS76 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC34.44■■■■□ 3.1
Cpb1B2RS76 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
Cpb1B2RS76 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC34.23■■■■□ 3.07
Cpb1B2RS76 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.2■■■■□ 3.07
Cpb1B2RS76 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
Cpb1B2RS76 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
Cpb1B2RS76 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
Cpb1B2RS76 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
Cpb1B2RS76 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC33.83■■■■□ 3.01
Cpb1B2RS76 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC33.75■■■□□ 2.99
Cpb1B2RS76 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC33.67■■■□□ 2.98
Cpb1B2RS76 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
Cpb1B2RS76 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
Cpb1B2RS76 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
Cpb1B2RS76 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
Cpb1B2RS76 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
Cpb1B2RS76 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
Cpb1B2RS76 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.1■■■□□ 2.89
Cpb1B2RS76 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC33.06■■■□□ 2.88
Cpb1B2RS76 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
Cpb1B2RS76 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
Cpb1B2RS76 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC33.02■■■□□ 2.88
Cpb1B2RS76 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC32.93■■■□□ 2.86
Cpb1B2RS76 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
Cpb1B2RS76 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
Cpb1B2RS76 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC32.88■■■□□ 2.85
Cpb1B2RS76 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC32.7■■■□□ 2.83
Cpb1B2RS76 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
Cpb1B2RS76 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC32.64■■■□□ 2.82
Cpb1B2RS76 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
Cpb1B2RS76 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC32.6■■■□□ 2.81
Cpb1B2RS76 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.59■■■□□ 2.81
Cpb1B2RS76 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
Cpb1B2RS76 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
Cpb1B2RS76 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
Cpb1B2RS76 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.34■■■□□ 2.77
Cpb1B2RS76 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Cpb1B2RS76 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Cpb1B2RS76 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC32.32■■■□□ 2.76
Cpb1B2RS76 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
Cpb1B2RS76 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC32.27■■■□□ 2.76
Cpb1B2RS76 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
Cpb1B2RS76 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC32.25■■■□□ 2.75
Cpb1B2RS76 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
Cpb1B2RS76 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Cpb1B2RS76 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Cpb1B2RS76 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC32.17■■■□□ 2.74
Cpb1B2RS76 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Cpb1B2RS76 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
Cpb1B2RS76 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Cpb1B2RS76 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Cpb1B2RS76 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
Cpb1B2RS76 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
Cpb1B2RS76 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Cpb1B2RS76 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC31.93■■■□□ 2.7
Cpb1B2RS76 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC31.9■■■□□ 2.7
Cpb1B2RS76 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC31.89■■■□□ 2.7
Cpb1B2RS76 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC31.87■■■□□ 2.69
Cpb1B2RS76 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
Cpb1B2RS76 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
Cpb1B2RS76 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
Cpb1B2RS76 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.73■■■□□ 2.67
Cpb1B2RS76 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC31.7■■■□□ 2.67
Cpb1B2RS76 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC31.69■■■□□ 2.66
Cpb1B2RS76 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
Cpb1B2RS76 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
Cpb1B2RS76 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC31.67■■■□□ 2.66
Cpb1B2RS76 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
Cpb1B2RS76 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
Cpb1B2RS76 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
Cpb1B2RS76 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
Cpb1B2RS76 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC31.46■■■□□ 2.63
Cpb1B2RS76 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
Cpb1B2RS76 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC31.44■■■□□ 2.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.7 ms