Protein–RNA interactions for Protein: Q99PB1

1700020D05Rik, Mage-g2, mousemouse

Predictions only

Length 294 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700020D05RikQ99PB1 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC38.64■■■■□ 3.78
1700020D05RikQ99PB1 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.56
1700020D05RikQ99PB1 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
1700020D05RikQ99PB1 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.01■■■■□ 3.35
1700020D05RikQ99PB1 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
1700020D05RikQ99PB1 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
1700020D05RikQ99PB1 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC34.78■■■■□ 3.16
1700020D05RikQ99PB1 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
1700020D05RikQ99PB1 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC34.51■■■■□ 3.12
1700020D05RikQ99PB1 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
1700020D05RikQ99PB1 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC33.88■■■■□ 3.01
1700020D05RikQ99PB1 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
1700020D05RikQ99PB1 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
1700020D05RikQ99PB1 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC33.66■■■□□ 2.98
1700020D05RikQ99PB1 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
1700020D05RikQ99PB1 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
1700020D05RikQ99PB1 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
1700020D05RikQ99PB1 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
1700020D05RikQ99PB1 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
1700020D05RikQ99PB1 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC33.15■■■□□ 2.9
1700020D05RikQ99PB1 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
1700020D05RikQ99PB1 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
1700020D05RikQ99PB1 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
1700020D05RikQ99PB1 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
1700020D05RikQ99PB1 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
1700020D05RikQ99PB1 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
1700020D05RikQ99PB1 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC32.69■■■□□ 2.82
1700020D05RikQ99PB1 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
1700020D05RikQ99PB1 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
1700020D05RikQ99PB1 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
1700020D05RikQ99PB1 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC32.42■■■□□ 2.78
1700020D05RikQ99PB1 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
1700020D05RikQ99PB1 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
1700020D05RikQ99PB1 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC32.36■■■□□ 2.77
1700020D05RikQ99PB1 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
1700020D05RikQ99PB1 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
1700020D05RikQ99PB1 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
1700020D05RikQ99PB1 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
1700020D05RikQ99PB1 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
1700020D05RikQ99PB1 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
1700020D05RikQ99PB1 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC31.9■■■□□ 2.7
1700020D05RikQ99PB1 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC31.9■■■□□ 2.7
1700020D05RikQ99PB1 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC31.83■■■□□ 2.69
1700020D05RikQ99PB1 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
1700020D05RikQ99PB1 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC31.74■■■□□ 2.67
1700020D05RikQ99PB1 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC31.71■■■□□ 2.67
1700020D05RikQ99PB1 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
1700020D05RikQ99PB1 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC31.68■■■□□ 2.66
1700020D05RikQ99PB1 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
1700020D05RikQ99PB1 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
1700020D05RikQ99PB1 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
1700020D05RikQ99PB1 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC31.16■■■□□ 2.58
1700020D05RikQ99PB1 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
1700020D05RikQ99PB1 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
1700020D05RikQ99PB1 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
1700020D05RikQ99PB1 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC31■■■□□ 2.55
1700020D05RikQ99PB1 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
1700020D05RikQ99PB1 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
1700020D05RikQ99PB1 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
1700020D05RikQ99PB1 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC30.84■■■□□ 2.53
1700020D05RikQ99PB1 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
1700020D05RikQ99PB1 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
1700020D05RikQ99PB1 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
1700020D05RikQ99PB1 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC30.73■■■□□ 2.51
1700020D05RikQ99PB1 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.68■■■□□ 2.5
1700020D05RikQ99PB1 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.66■■■□□ 2.5
1700020D05RikQ99PB1 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
1700020D05RikQ99PB1 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
1700020D05RikQ99PB1 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC30.62■■■□□ 2.49
1700020D05RikQ99PB1 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.61■■■□□ 2.49
1700020D05RikQ99PB1 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
1700020D05RikQ99PB1 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
1700020D05RikQ99PB1 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
1700020D05RikQ99PB1 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
1700020D05RikQ99PB1 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
1700020D05RikQ99PB1 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
1700020D05RikQ99PB1 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
1700020D05RikQ99PB1 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
1700020D05RikQ99PB1 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC30.37■■■□□ 2.45
1700020D05RikQ99PB1 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
1700020D05RikQ99PB1 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
1700020D05RikQ99PB1 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC30.26■■■□□ 2.43
1700020D05RikQ99PB1 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
1700020D05RikQ99PB1 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
1700020D05RikQ99PB1 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
1700020D05RikQ99PB1 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
1700020D05RikQ99PB1 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
1700020D05RikQ99PB1 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
1700020D05RikQ99PB1 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
1700020D05RikQ99PB1 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
1700020D05RikQ99PB1 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
1700020D05RikQ99PB1 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
1700020D05RikQ99PB1 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC30.03■■■□□ 2.4
1700020D05RikQ99PB1 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
1700020D05RikQ99PB1 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
1700020D05RikQ99PB1 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
1700020D05RikQ99PB1 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
1700020D05RikQ99PB1 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
1700020D05RikQ99PB1 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
1700020D05RikQ99PB1 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 6.9 ms