RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000615007.4

LYNX1-208, Transcript of Ly6/neurotoxin 1, human

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LYNX1, Length 1,293 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LYNX1-208	ENST00000615007	IVNS1ABP	Q9Y6Y0	642 aa		32.44	■■■□□ 2.78
LYNX1-208	ENST00000615007	RNF113A	O15541	343 aa	Known RBP	32.43	■■■□□ 2.78
LYNX1-208	ENST00000615007	HABP4	Q5JVS0	413 aa	Known RBP	32.43	■■■□□ 2.78
LYNX1-208	ENST00000615007	WDR78	Q5VTH9	848 aa		32.43	■■■□□ 2.78
LYNX1-208	ENST00000615007	TSHZ3	Q63HK5	1081 aa		32.43	■■■□□ 2.78
LYNX1-208	ENST00000615007	CTR9	Q6PD62	1173 aa		32.43	■■■□□ 2.78
LYNX1-208	ENST00000615007	STRBP	Q96SI9	672 aa	Known RBP	32.43	■■■□□ 2.78
LYNX1-208	ENST00000615007	TMX2	Q9Y320	296 aa		32.43	■■■□□ 2.78
LYNX1-208	ENST00000615007		A0A0G2JMZ2	1700 aa		32.43	■■■□□ 2.78
LYNX1-208	ENST00000615007		H0YGN5	161 aa		32.42	■■■□□ 2.78
LYNX1-208	ENST00000615007	ZBTB47	Q9UFB7	747 aa	Predicted RBP	32.42	■■■□□ 2.78
LYNX1-208	ENST00000615007	NR2E3	Q9Y5X4	410 aa		32.42	■■■□□ 2.78
LYNX1-208	ENST00000615007	PRKAR2A	P13861	404 aa	Known RBP	32.41	■■■□□ 2.78
LYNX1-208	ENST00000615007	GNAT2	P19087	354 aa		32.41	■■■□□ 2.78
LYNX1-208	ENST00000615007	TRIM32	Q13049	653 aa		32.41	■■■□□ 2.78
LYNX1-208	ENST00000615007	MAP2K5	Q13163	448 aa		32.41	■■■□□ 2.78
LYNX1-208	ENST00000615007	MAP3K21	Q5TCX8	1036 aa		32.41	■■■□□ 2.78
LYNX1-208	ENST00000615007	KANSL2	Q9H9L4	492 aa		32.41	■■■□□ 2.78
LYNX1-208	ENST00000615007	BTBD7	Q9P203	1132 aa		32.41	■■■□□ 2.78
LYNX1-208	ENST00000615007	CEP290	O15078	2479 aa		32.4	■■■□□ 2.78
LYNX1-208	ENST00000615007	SLC15A5	A6NIM6	579 aa		32.4	■■■□□ 2.78
LYNX1-208	ENST00000615007	SBK1	Q52WX2	424 aa		32.4	■■■□□ 2.78
LYNX1-208	ENST00000615007	MB21D1	Q8N884	522 aa		32.4	■■■□□ 2.78
LYNX1-208	ENST00000615007	VCPKMT	Q9H867	229 aa		32.4	■■■□□ 2.78
LYNX1-208	ENST00000615007	NECAB2	Q7Z6G3	386 aa		32.39	■■■□□ 2.78
LYNX1-208	ENST00000615007	OSBP2	Q969R2	916 aa		32.39	■■■□□ 2.78
LYNX1-208	ENST00000615007	RLF	Q13129	1914 aa		32.39	■■■□□ 2.78
LYNX1-208	ENST00000615007	WDR46	O15213	610 aa	Known RBP	32.38	■■■□□ 2.77
LYNX1-208	ENST00000615007	GPAA1	O43292	621 aa		32.38	■■■□□ 2.77
LYNX1-208	ENST00000615007	PTPRE	P23469	700 aa		32.38	■■■□□ 2.77
LYNX1-208	ENST00000615007	CLEC10A	Q8IUN9	316 aa		32.38	■■■□□ 2.77
LYNX1-208	ENST00000615007	PARP14	Q460N5	1801 aa		32.37	■■■□□ 2.77
LYNX1-208	ENST00000615007	ROBO3	Q96MS0	1386 aa		32.37	■■■□□ 2.77
LYNX1-208	ENST00000615007	GSG1L2	A8MUP6	293 aa		32.37	■■■□□ 2.77
LYNX1-208	ENST00000615007	ZNF236	Q9UL36	1845 aa		32.37	■■■□□ 2.77
LYNX1-208	ENST00000615007	GREB1L	Q9C091	1923 aa	Predicted RBP	32.36	■■■□□ 2.77
LYNX1-208	ENST00000615007	SMIM22	K7EJ46	135 aa		32.36	■■■□□ 2.77
LYNX1-208	ENST00000615007	FLOT1	O75955	427 aa		32.36	■■■□□ 2.77
LYNX1-208	ENST00000615007	ATP2B2	Q01814	1243 aa		32.36	■■■□□ 2.77
LYNX1-208	ENST00000615007	GRB14	Q14449	540 aa		32.36	■■■□□ 2.77
LYNX1-208	ENST00000615007	SIAH1	Q8IUQ4	282 aa		32.36	■■■□□ 2.77
LYNX1-208	ENST00000615007	PAWR	Q96IZ0	340 aa	Known RBP	32.36	■■■□□ 2.77
LYNX1-208	ENST00000615007	ZNF287	Q9HBT7	754 aa		32.36	■■■□□ 2.77
LYNX1-208	ENST00000615007	GOPC	Q9HD26	462 aa		32.36	■■■□□ 2.77
LYNX1-208	ENST00000615007	MX1	P20591	662 aa		32.35	■■■□□ 2.77
LYNX1-208	ENST00000615007	DSG3	P32926	999 aa		32.35	■■■□□ 2.77
LYNX1-208	ENST00000615007	TDO2	P48775	406 aa		32.35	■■■□□ 2.77
LYNX1-208	ENST00000615007	CACNB2	Q08289	660 aa	Predicted RBP	32.35	■■■□□ 2.77
LYNX1-208	ENST00000615007	MFSD14C	Q5VZR4	134 aa		32.35	■■■□□ 2.77
LYNX1-208	ENST00000615007	SPICE1	Q8N0Z3	855 aa		32.35	■■■□□ 2.77
LYNX1-208	ENST00000615007	SHCBP1	Q8NEM2	672 aa		32.35	■■■□□ 2.77
LYNX1-208	ENST00000615007	PI4K2B	Q8TCG2	481 aa		32.35	■■■□□ 2.77
LYNX1-208	ENST00000615007	SPATC1L	Q9H0A9	340 aa		32.35	■■■□□ 2.77
LYNX1-208	ENST00000615007	MKNK2	Q9HBH9	465 aa		32.35	■■■□□ 2.77
LYNX1-208	ENST00000615007	EVI5	O60447	810 aa		32.34	■■■□□ 2.77
LYNX1-208	ENST00000615007	HOXC6	P09630	235 aa		32.34	■■■□□ 2.77
LYNX1-208	ENST00000615007	EEF2	P13639	858 aa	Known RBP	32.34	■■■□□ 2.77
LYNX1-208	ENST00000615007	CCL14	Q16627	93 aa		32.34	■■■□□ 2.77
LYNX1-208	ENST00000615007	KIAA1755	Q5JYT7	1200 aa		32.34	■■■□□ 2.77
LYNX1-208	ENST00000615007	FSD1	Q9BTV5	496 aa		32.34	■■■□□ 2.77
LYNX1-208	ENST00000615007	OGDHL	Q9ULD0	1010 aa		32.34	■■■□□ 2.77
LYNX1-208	ENST00000615007	COLQ	Q9Y215	455 aa	Predicted RBP	32.34	■■■□□ 2.77
LYNX1-208	ENST00000615007	MINDY4B	A8MYZ0	360 aa		32.33	■■■□□ 2.77
LYNX1-208	ENST00000615007	STRN	O43815	780 aa		32.33	■■■□□ 2.77
LYNX1-208	ENST00000615007	CRBN	Q96SW2	442 aa		32.33	■■■□□ 2.77
LYNX1-208	ENST00000615007	MOV10L1	Q9BXT6	1211 aa	Known RBP	32.33	■■■□□ 2.77
LYNX1-208	ENST00000615007	NACAP1	Q9BZK3	213 aa		32.33	■■■□□ 2.77
LYNX1-208	ENST00000615007	NBPF3	Q9H094	633 aa		32.33	■■■□□ 2.77
LYNX1-208	ENST00000615007	APP	P05067	770 aa		32.32	■■■□□ 2.76
LYNX1-208	ENST00000615007		M0R2C6	588 aa		32.31	■■■□□ 2.76
LYNX1-208	ENST00000615007	DIS3L	Q8TF46	1054 aa	Known RBP	32.31	■■■□□ 2.76
LYNX1-208	ENST00000615007	PATL2	C9JE40	543 aa	Known RBP	32.3	■■■□□ 2.76
LYNX1-208	ENST00000615007	RASA1	P20936	1047 aa		32.3	■■■□□ 2.76
LYNX1-208	ENST00000615007	PLS1	Q14651	629 aa		32.3	■■■□□ 2.76
LYNX1-208	ENST00000615007	ATG4C	Q96DT6	458 aa		32.3	■■■□□ 2.76
LYNX1-208	ENST00000615007	MROH8	Q9H579	483 aa		32.3	■■■□□ 2.76
LYNX1-208	ENST00000615007	EPB41L4A	Q9HCS5	686 aa	Predicted RBP	32.3	■■■□□ 2.76
LYNX1-208	ENST00000615007	ALPK3	Q96L96	1907 aa		32.3	■■■□□ 2.76
LYNX1-208	ENST00000615007	FRMPD3	Q5JV73	1810 aa		32.29	■■■□□ 2.76
LYNX1-208	ENST00000615007	AAMP	Q13685	434 aa		32.29	■■■□□ 2.76
LYNX1-208	ENST00000615007	CHRDL2	Q6WN34	429 aa		32.29	■■■□□ 2.76
LYNX1-208	ENST00000615007	DPP9	Q86TI2	863 aa		32.29	■■■□□ 2.76
LYNX1-208	ENST00000615007	OTUD7A	Q8TE49	926 aa	Predicted RBP	32.29	■■■□□ 2.76
LYNX1-208	ENST00000615007	SLC5A4	Q9NY91	659 aa		32.29	■■■□□ 2.76
LYNX1-208	ENST00000615007	COL11A1	P12107	1806 aa	Predicted RBP	32.28	■■■□□ 2.76
LYNX1-208	ENST00000615007	RAD21	O60216	631 aa		32.28	■■■□□ 2.76
LYNX1-208	ENST00000615007	ERCC3	P19447	782 aa		32.28	■■■□□ 2.76
LYNX1-208	ENST00000615007	CCND3	P30281	292 aa	Predicted RBP	32.28	■■■□□ 2.76
LYNX1-208	ENST00000615007	HDAC1	Q13547	482 aa	Predicted RBP	32.28	■■■□□ 2.76
LYNX1-208	ENST00000615007	ANKRD45	Q5TZF3	282 aa		32.28	■■■□□ 2.76
LYNX1-208	ENST00000615007	C11orf49	Q9H6J7	331 aa		32.28	■■■□□ 2.76
LYNX1-208	ENST00000615007	ADORA2A	P29274	412 aa		32.27	■■■□□ 2.76
LYNX1-208	ENST00000615007	SAMD1	Q6SPF0	538 aa	Predicted RBP	32.27	■■■□□ 2.76
LYNX1-208	ENST00000615007	IFNL3	Q8IZI9	196 aa		32.27	■■■□□ 2.76
LYNX1-208	ENST00000615007	ZNF444	Q8N0Y2	327 aa	Predicted RBP	32.27	■■■□□ 2.76
LYNX1-208	ENST00000615007	STK11IP	Q8N1F8	1099 aa		32.27	■■■□□ 2.76
LYNX1-208	ENST00000615007	YTHDC1	Q96MU7	727 aa	Known RBP	32.27	■■■□□ 2.76
LYNX1-208	ENST00000615007	NYAP2	Q9P242	653 aa		32.27	■■■□□ 2.76
LYNX1-208	ENST00000615007	PCDH10	Q9P2E7	1040 aa		32.27	■■■□□ 2.76
LYNX1-208	ENST00000615007	MYH4	Q9Y623	1939 aa		32.27	■■■□□ 2.76

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 49.1 ms