RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560971.1

GCSHP2-201, Transcript of glycine cleavage system protein H pseudogene 2, humanhuman

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Gene GCSHP2, Length 527 nt, Biotype processed pseudogene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCSHP2-201ENST00000560971 TSPY3P0CV98 308 aa22.1■■□□□ 1.13
GCSHP2-201ENST00000560971 TSPY8P0CW00 308 aa22.1■■□□□ 1.13
GCSHP2-201ENST00000560971 CHMLP26374 656 aa22.1■■□□□ 1.13
GCSHP2-201ENST00000560971 FCGRTP55899 365 aa22.1■■□□□ 1.13
GCSHP2-201ENST00000560971 HAND2P61296 217 aa22.1■■□□□ 1.13
GCSHP2-201ENST00000560971 TFAP4Q01664 338 aa22.1■■□□□ 1.13
GCSHP2-201ENST00000560971 VCPKMTQ9H867 229 aa22.1■■□□□ 1.13
GCSHP2-201ENST00000560971 RBPJLQ9UBG7 517 aa22.1■■□□□ 1.13
GCSHP2-201ENST00000560971 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa22.1■■□□□ 1.13
GCSHP2-201ENST00000560971 GREB1LQ9C091 1923 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
GCSHP2-201ENST00000560971 GNRH1P01148 92 aa22.09■■□□□ 1.13
GCSHP2-201ENST00000560971 NEDD1Q8NHV4 660 aa22.09■■□□□ 1.13
GCSHP2-201ENST00000560971 CEP95Q96GE4 821 aa22.09■■□□□ 1.13
GCSHP2-201ENST00000560971 NBPF3Q9H094 633 aa22.09■■□□□ 1.13
GCSHP2-201ENST00000560971 MORF4L1Q9UBU8 362 aa22.09■■□□□ 1.13
GCSHP2-201ENST00000560971 CLIP2Q9UDT6 1046 aa22.09■■□□□ 1.13
GCSHP2-201ENST00000560971 RAD21O60216 631 aa22.08■■□□□ 1.13
GCSHP2-201ENST00000560971 LPAR1Q92633 364 aa22.08■■□□□ 1.13
GCSHP2-201ENST00000560971 PAGR1Q9BTK6 254 aa22.08■■□□□ 1.13
GCSHP2-201ENST00000560971 TANGO6Q9C0B7 1094 aa22.08■■□□□ 1.13
GCSHP2-201ENST00000560971 MTMR4Q9NYA4 1195 aa22.08■■□□□ 1.13
GCSHP2-201ENST00000560971 NYAP2Q9P242 653 aa22.08■■□□□ 1.13
GCSHP2-201ENST00000560971 SRRDQ9UH36 339 aa22.08■■□□□ 1.13
GCSHP2-201ENST00000560971 FGRP09769 529 aa22.07■■□□□ 1.12
GCSHP2-201ENST00000560971 Q3C1V9 767 aa22.07■■□□□ 1.12
GCSHP2-201ENST00000560971 GPRC5AQ8NFJ5 357 aa22.07■■□□□ 1.12
GCSHP2-201ENST00000560971 GOPCQ9HD26 462 aa22.07■■□□□ 1.12
GCSHP2-201ENST00000560971 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
GCSHP2-201ENST00000560971 TNPO2O14787 897 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
GCSHP2-201ENST00000560971 ORC4O43929 436 aa22.06■■□□□ 1.12
GCSHP2-201ENST00000560971 RANBP6O60518 1105 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
GCSHP2-201ENST00000560971 CNMDO75829 334 aa22.06■■□□□ 1.12
GCSHP2-201ENST00000560971 HOXD10P28358 340 aa22.06■■□□□ 1.12
GCSHP2-201ENST00000560971 PRKCZQ05513 592 aa22.06■■□□□ 1.12
GCSHP2-201ENST00000560971 TBC1D10CQ8IV04 446 aa22.06■■□□□ 1.12
GCSHP2-201ENST00000560971 DSCC1Q9BVC3 393 aa22.06■■□□□ 1.12
GCSHP2-201ENST00000560971 TOMM22Q9NS69 142 aa22.06■■□□□ 1.12
GCSHP2-201ENST00000560971 GABRQQ9UN88 632 aa22.06■■□□□ 1.12
GCSHP2-201ENST00000560971 PLIN4Q96Q06 1357 aa22.06■■□□□ 1.12
GCSHP2-201ENST00000560971 MYPNQ86TC9 1320 aa22.06■■□□□ 1.12
GCSHP2-201ENST00000560971 TSPY2A6NKD2 308 aa22.05■■□□□ 1.12
GCSHP2-201ENST00000560971 NMT2O60551 498 aa22.05■■□□□ 1.12
GCSHP2-201ENST00000560971 ERVK-9P63128 1117 aa22.05■■□□□ 1.12
GCSHP2-201ENST00000560971 ERVK-24P63145 666 aa22.05■■□□□ 1.12
GCSHP2-201ENST00000560971 COG2Q14746 738 aa22.05■■□□□ 1.12
GCSHP2-201ENST00000560971 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
GCSHP2-201ENST00000560971 GTF3C2Q8WUA4 911 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
GCSHP2-201ENST00000560971 IL17RBQ9NRM6 502 aa22.05■■□□□ 1.12
GCSHP2-201ENST00000560971 ZNF213O14771 459 aa22.04■■□□□ 1.12
GCSHP2-201ENST00000560971 WDR46O15213 610 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
GCSHP2-201ENST00000560971 TTLL1O95922 423 aa22.04■■□□□ 1.12
GCSHP2-201ENST00000560971 PRMT2P55345 433 aa22.04■■□□□ 1.12
GCSHP2-201ENST00000560971 FAM83BQ5T0W9 1011 aa22.04■■□□□ 1.12
GCSHP2-201ENST00000560971 LBX2Q6XYB7 198 aa22.04■■□□□ 1.12
GCSHP2-201ENST00000560971 LRRC47Q8N1G4 583 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
GCSHP2-201ENST00000560971 NKX2-3Q8TAU0 364 aa22.04■■□□□ 1.12
GCSHP2-201ENST00000560971 RUFY2Q8WXA3 655 aa22.04■■□□□ 1.12
GCSHP2-201ENST00000560971 MKL1Q969V6 931 aa22.04■■□□□ 1.12
GCSHP2-201ENST00000560971 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP22.04■■□□□ 1.12
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GCSHP2-201ENST00000560971 RAD50Q92878 1312 aa22.04■■□□□ 1.12
GCSHP2-201ENST00000560971 MGAMO43451 1857 aa22.03■■□□□ 1.12
GCSHP2-201ENST00000560971 F5H6K3 240 aa22.03■■□□□ 1.12
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GCSHP2-201ENST00000560971 KLRC3Q07444 240 aa22.03■■□□□ 1.12
GCSHP2-201ENST00000560971 AKNAD1Q5T1N1 836 aa22.03■■□□□ 1.12
GCSHP2-201ENST00000560971 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP22.03■■□□□ 1.12
GCSHP2-201ENST00000560971 MFSD6Q6ZSS7 791 aa22.03■■□□□ 1.12
GCSHP2-201ENST00000560971 SH3TC2Q8TF17 1288 aa22.03■■□□□ 1.12
GCSHP2-201ENST00000560971 STAG1Q8WVM7 1258 aa22.03■■□□□ 1.12
GCSHP2-201ENST00000560971 PORCNQ9H237 461 aa22.03■■□□□ 1.12
GCSHP2-201ENST00000560971 NDUFB10O96000 172 aa22.02■■□□□ 1.12
GCSHP2-201ENST00000560971 DSG3P32926 999 aa22.02■■□□□ 1.12
GCSHP2-201ENST00000560971 FLT3LGP49771 235 aa22.02■■□□□ 1.12
GCSHP2-201ENST00000560971 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa22.02■■□□□ 1.12
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GCSHP2-201ENST00000560971 FBXO28Q9NVF7 368 aa22.02■■□□□ 1.12
GCSHP2-201ENST00000560971 SGSM2O43147 1006 aa22.01■■□□□ 1.11
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GCSHP2-201ENST00000560971 ATG4CQ96DT6 458 aa22.01■■□□□ 1.11
GCSHP2-201ENST00000560971 CTNNA3Q9UI47 895 aa22.01■■□□□ 1.11
GCSHP2-201ENST00000560971 STX8Q9UNK0 236 aa22.01■■□□□ 1.11
GCSHP2-201ENST00000560971 NEDD4P46934 1319 aa22.01■■□□□ 1.11
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GCSHP2-201ENST00000560971 BMP2KLQ5H9B9 411 aa22■■□□□ 1.11
GCSHP2-201ENST00000560971 CHMP4CQ96CF2 233 aa22■■□□□ 1.11
GCSHP2-201ENST00000560971 RNF41Q9H4P4 317 aaPredicted RBP22■■□□□ 1.11
GCSHP2-201ENST00000560971 RLFQ13129 1914 aa22■■□□□ 1.11
GCSHP2-201ENST00000560971 PCP11498 1178 aaKnown RBP21.99■■□□□ 1.11
GCSHP2-201ENST00000560971 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP21.99■■□□□ 1.11
GCSHP2-201ENST00000560971 GMCL1P1Q8NEA9 526 aa21.99■■□□□ 1.11
GCSHP2-201ENST00000560971 ZNF333Q96JL9 665 aa21.99■■□□□ 1.11
GCSHP2-201ENST00000560971 GJD2Q9UKL4 321 aa21.99■■□□□ 1.11
GCSHP2-201ENST00000560971 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa21.99■■□□□ 1.11
GCSHP2-201ENST00000560971 MYCP01106 439 aaPredicted RBP21.98■■□□□ 1.11
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