RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000555658.5

FOXN3-210, Transcript of forkhead box N3, humanhuman

TSL 3

Gene FOXN3, Length 648 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXN3-210ENST00000555658 CTNND2Q9UQB3 1225 aa5.87□□□□□ -1.47
FOXN3-210ENST00000555658 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa5.87□□□□□ -1.47
FOXN3-210ENST00000555658 MLH3Q9UHC1 1453 aa5.87□□□□□ -1.47
FOXN3-210ENST00000555658 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa5.86□□□□□ -1.47
FOXN3-210ENST00000555658 DUOX2Q9NRD8 1548 aa5.86□□□□□ -1.47
FOXN3-210ENST00000555658 ERBINQ96RT1 1412 aa5.86□□□□□ -1.47
FOXN3-210ENST00000555658 KANK1Q14678 1352 aa5.86□□□□□ -1.47
FOXN3-210ENST00000555658 EOMESO95936 686 aa5.86□□□□□ -1.47
FOXN3-210ENST00000555658 CYP7A1P22680 504 aa5.86□□□□□ -1.47
FOXN3-210ENST00000555658 NTF4P34130 210 aa5.86□□□□□ -1.47
FOXN3-210ENST00000555658 RING1Q06587 406 aa5.86□□□□□ -1.47
FOXN3-210ENST00000555658 TMEM67Q5HYA8 995 aa5.86□□□□□ -1.47
FOXN3-210ENST00000555658 LCE1DQ5T752 114 aa5.86□□□□□ -1.47
FOXN3-210ENST00000555658 MFSD2AQ8NA29 543 aa5.86□□□□□ -1.47
FOXN3-210ENST00000555658 KIRREL1Q96J84 757 aa5.86□□□□□ -1.47
FOXN3-210ENST00000555658 TOX2Q96NM4 488 aa5.86□□□□□ -1.47
FOXN3-210ENST00000555658 OSBPL7Q9BZF2 842 aa5.86□□□□□ -1.47
FOXN3-210ENST00000555658 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa5.86□□□□□ -1.47
FOXN3-210ENST00000555658 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP5.86□□□□□ -1.47
FOXN3-210ENST00000555658 MAST1Q9Y2H9 1570 aa5.85□□□□□ -1.47
FOXN3-210ENST00000555658 MAGI2Q86UL8 1455 aa5.85□□□□□ -1.47
FOXN3-210ENST00000555658 GLI1P08151 1106 aa5.85□□□□□ -1.47
FOXN3-210ENST00000555658 USP17L7P0C7H9 530 aa5.85□□□□□ -1.47
FOXN3-210ENST00000555658 GGT6Q6P531 493 aa5.85□□□□□ -1.47
FOXN3-210ENST00000555658 UBE3DQ7Z6J8 389 aa5.85□□□□□ -1.47
FOXN3-210ENST00000555658 ZSCAN18Q8TBC5 510 aaPredicted RBP5.85□□□□□ -1.47
FOXN3-210ENST00000555658 ANKRD24Q8TF21 1146 aa5.85□□□□□ -1.47
FOXN3-210ENST00000555658 HSPA12BQ96MM6 686 aa5.85□□□□□ -1.47
FOXN3-210ENST00000555658 C12orf49Q9H741 205 aa5.85□□□□□ -1.47
FOXN3-210ENST00000555658 ATP7AQ04656 1500 aa5.84□□□□□ -1.47
FOXN3-210ENST00000555658 A2MP01023 1474 aa5.84□□□□□ -1.47
FOXN3-210ENST00000555658 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa5.84□□□□□ -1.47
FOXN3-210ENST00000555658 H3BS24 57 aa5.84□□□□□ -1.47
FOXN3-210ENST00000555658 CELA3AP09093 270 aa5.84□□□□□ -1.47
FOXN3-210ENST00000555658 RAC2P15153 192 aa5.84□□□□□ -1.47
FOXN3-210ENST00000555658 FGD1P98174 961 aa5.84□□□□□ -1.47
FOXN3-210ENST00000555658 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP5.84□□□□□ -1.47
FOXN3-210ENST00000555658 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa5.84□□□□□ -1.47
FOXN3-210ENST00000555658 LRFN4Q6PJG9 635 aa5.84□□□□□ -1.47
FOXN3-210ENST00000555658 SV2BQ7L1I2 683 aa5.84□□□□□ -1.47
FOXN3-210ENST00000555658 HID1Q8IV36 788 aa5.84□□□□□ -1.47
FOXN3-210ENST00000555658 PLPPR2Q96GM1 343 aa5.84□□□□□ -1.47
FOXN3-210ENST00000555658 LIN37Q96GY3 246 aaPredicted RBP5.84□□□□□ -1.47
FOXN3-210ENST00000555658 COX4I2Q96KJ9 171 aa5.84□□□□□ -1.47
FOXN3-210ENST00000555658 FRMD6Q96NE9 622 aa5.84□□□□□ -1.47
FOXN3-210ENST00000555658 WNT10AQ9GZT5 417 aa5.84□□□□□ -1.47
FOXN3-210ENST00000555658 ATP13A1Q9HD20 1204 aa5.84□□□□□ -1.47
FOXN3-210ENST00000555658 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa5.84□□□□□ -1.47
FOXN3-210ENST00000555658 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP5.83□□□□□ -1.48
FOXN3-210ENST00000555658 ZNF503-AS2A6NEH8 195 aa5.83□□□□□ -1.48
FOXN3-210ENST00000555658 SLITRK5O94991 958 aa5.83□□□□□ -1.48
FOXN3-210ENST00000555658 CBX7O95931 251 aa5.83□□□□□ -1.48
FOXN3-210ENST00000555658 MESP2Q0VG99 397 aa5.83□□□□□ -1.48
FOXN3-210ENST00000555658 INPP5AQ14642 412 aa5.83□□□□□ -1.48
FOXN3-210ENST00000555658 FBLN7Q53RD9 439 aa5.83□□□□□ -1.48
FOXN3-210ENST00000555658 WIPI1Q5MNZ9 446 aaPredicted RBP5.83□□□□□ -1.48
FOXN3-210ENST00000555658 LETMD1Q6P1Q0 360 aa5.83□□□□□ -1.48
FOXN3-210ENST00000555658 C22orf34Q6ZV56 151 aa5.83□□□□□ -1.48
FOXN3-210ENST00000555658 ANKLE2Q86XL3 938 aa5.83□□□□□ -1.48
FOXN3-210ENST00000555658 ASB16Q96NS5 453 aa5.83□□□□□ -1.48
FOXN3-210ENST00000555658 SIN3AQ96ST3 1273 aa5.83□□□□□ -1.48
FOXN3-210ENST00000555658 PLXNC1O60486 1568 aa5.83□□□□□ -1.48
FOXN3-210ENST00000555658 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa5.83□□□□□ -1.48
FOXN3-210ENST00000555658 ATP10AO60312 1499 aa5.83□□□□□ -1.48
FOXN3-210ENST00000555658 KDM5CP41229 1560 aa5.82□□□□□ -1.48
FOXN3-210ENST00000555658 NFIBO00712 420 aa5.82□□□□□ -1.48
FOXN3-210ENST00000555658 ZNF865P0CJ78 1059 aaPredicted RBP5.82□□□□□ -1.48
FOXN3-210ENST00000555658 GDNFP39905 211 aa5.82□□□□□ -1.48
FOXN3-210ENST00000555658 CAP2P40123 477 aa5.82□□□□□ -1.48
FOXN3-210ENST00000555658 TTBK2Q6IQ55 1244 aa5.82□□□□□ -1.48
FOXN3-210ENST00000555658 SYDE1Q6ZW31 735 aaPredicted RBP5.82□□□□□ -1.48
FOXN3-210ENST00000555658 THAP5Q7Z6K1 395 aa5.82□□□□□ -1.48
FOXN3-210ENST00000555658 FAM120AQ9NZB2 1118 aaKnown RBP eCLIP5.82□□□□□ -1.481e-6■■■■■ 33.8
FOXN3-210ENST00000555658 YEATS2Q9ULM3 1422 aa5.82□□□□□ -1.48
FOXN3-210ENST00000555658 CROCC2H7BZ55 1655 aa5.82□□□□□ -1.48
FOXN3-210ENST00000555658 TONSLQ96HA7 1378 aa5.81□□□□□ -1.48
FOXN3-210ENST00000555658 TSPAN15O95858 294 aa5.81□□□□□ -1.48
FOXN3-210ENST00000555658 LDHBP07195 334 aaKnown RBP5.81□□□□□ -1.48
FOXN3-210ENST00000555658 EIF4BP23588 611 aaKnown RBP5.81□□□□□ -1.48
FOXN3-210ENST00000555658 ETV3P41162 512 aa5.81□□□□□ -1.48
FOXN3-210ENST00000555658 KIR3DL1P43629 444 aa5.81□□□□□ -1.48
FOXN3-210ENST00000555658 SLBPQ14493 270 aaKnown RBP eCLIP5.81□□□□□ -1.48
FOXN3-210ENST00000555658 CCDC85BQ15834 202 aaPredicted RBP5.81□□□□□ -1.48
FOXN3-210ENST00000555658 RASIP1Q5U651 963 aa5.81□□□□□ -1.48
FOXN3-210ENST00000555658 FYB2Q5VWT5 728 aa5.81□□□□□ -1.48
FOXN3-210ENST00000555658 XAGE3Q8WTP9 111 aa5.81□□□□□ -1.48
FOXN3-210ENST00000555658 UBE2FQ969M7 185 aa5.81□□□□□ -1.48
FOXN3-210ENST00000555658 ALPK1Q96QP1 1244 aa5.81□□□□□ -1.48
FOXN3-210ENST00000555658 SETDB2Q96T68 719 aa5.81□□□□□ -1.48
FOXN3-210ENST00000555658 FBRSQ9HAH7 460 aa5.81□□□□□ -1.48
FOXN3-210ENST00000555658 SEMA3GQ9NS98 782 aa5.81□□□□□ -1.48
FOXN3-210ENST00000555658 ZSWIM5Q9P217 1185 aa5.81□□□□□ -1.48
FOXN3-210ENST00000555658 WWC3Q9ULE0 1092 aa5.81□□□□□ -1.48
FOXN3-210ENST00000555658 CAPN6Q9Y6Q1 641 aa5.81□□□□□ -1.48
FOXN3-210ENST00000555658 GCC2Q8IWJ2 1684 aa5.81□□□□□ -1.48
FOXN3-210ENST00000555658 ADGBQ8N7X0 1667 aa5.81□□□□□ -1.48
FOXN3-210ENST00000555658 KDM6BO15054 1643 aa5.81□□□□□ -1.48
FOXN3-210ENST00000555658 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa5.8□□□□□ -1.48
FOXN3-210ENST00000555658 HECW2Q9P2P5 1572 aa5.8□□□□□ -1.48
FOXN3-210ENST00000555658 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP5.8□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36 ms