RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552958.5

AC004801.5-201, humanhuman

TSL 4 BASIC

Gene AC004801.5, Length 550 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AC004801.5-201ENST00000552958 USP17L21D6R901 530 aa11.19□□□□□ -0.62
AC004801.5-201ENST00000552958 SOX1O00570 391 aaPredicted RBP11.19□□□□□ -0.62
AC004801.5-201ENST00000552958 XRCC5P13010 732 aaKnown RBP11.19□□□□□ -0.62
AC004801.5-201ENST00000552958 PTPREP23469 700 aa11.19□□□□□ -0.62
AC004801.5-201ENST00000552958 MAP2K5Q13163 448 aa11.19□□□□□ -0.62
AC004801.5-201ENST00000552958 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP11.19□□□□□ -0.62
AC004801.5-201ENST00000552958 LHX8Q68G74 356 aa11.19□□□□□ -0.62
AC004801.5-201ENST00000552958 APBA2Q99767 749 aa11.19□□□□□ -0.62
AC004801.5-201ENST00000552958 LRRCC1Q9C099 1032 aa11.19□□□□□ -0.62
AC004801.5-201ENST00000552958 NBPF3Q9H094 633 aa11.19□□□□□ -0.62
AC004801.5-201ENST00000552958 PUS7LQ9H0K6 701 aaKnown RBP11.19□□□□□ -0.62
AC004801.5-201ENST00000552958 C11orf49Q9H6J7 331 aa11.19□□□□□ -0.62
AC004801.5-201ENST00000552958 OGDHLQ9ULD0 1010 aa11.19□□□□□ -0.62
AC004801.5-201ENST00000552958 CEP290O15078 2479 aa11.18□□□□□ -0.62
AC004801.5-201ENST00000552958 CYP2C19P33261 490 aa11.18□□□□□ -0.62
AC004801.5-201ENST00000552958 CDK8P49336 464 aa11.18□□□□□ -0.62
AC004801.5-201ENST00000552958 ATP2B2Q01814 1243 aa11.18□□□□□ -0.62
AC004801.5-201ENST00000552958 C12orf60Q5U649 245 aa11.18□□□□□ -0.62
AC004801.5-201ENST00000552958 ANKLE1Q8NAG6 615 aa11.18□□□□□ -0.62
AC004801.5-201ENST00000552958 TRPV1Q8NER1 839 aa11.18□□□□□ -0.62
AC004801.5-201ENST00000552958 LRCH3Q96II8 777 aa11.18□□□□□ -0.62
AC004801.5-201ENST00000552958 MOV10L1Q9BXT6 1211 aaKnown RBP11.18□□□□□ -0.62
AC004801.5-201ENST00000552958 SLC4A4Q9Y6R1 1079 aa11.18□□□□□ -0.62
AC004801.5-201ENST00000552958 TRIOBPQ9H2D6 2365 aa11.18□□□□□ -0.62
AC004801.5-201ENST00000552958 SZT2Q5T011 3432 aa11.17□□□□□ -0.62
AC004801.5-201ENST00000552958 CNGA1P29973 690 aa11.17□□□□□ -0.62
AC004801.5-201ENST00000552958 CCNA1P78396 465 aa11.17□□□□□ -0.62
AC004801.5-201ENST00000552958 PLS1Q14651 629 aa11.17□□□□□ -0.62
AC004801.5-201ENST00000552958 COG2Q14746 738 aa11.17□□□□□ -0.62
AC004801.5-201ENST00000552958 ANO1Q5XXA6 986 aa11.17□□□□□ -0.62
AC004801.5-201ENST00000552958 CTR9Q6PD62 1173 aa11.17□□□□□ -0.62
AC004801.5-201ENST00000552958 TMED8Q6PL24 325 aaPredicted RBP11.17□□□□□ -0.62
AC004801.5-201ENST00000552958 TMEM179Q6ZVK1 233 aa11.17□□□□□ -0.62
AC004801.5-201ENST00000552958 GTF3C2Q8WUA4 911 aaPredicted RBP11.17□□□□□ -0.62
AC004801.5-201ENST00000552958 ATG4CQ96DT6 458 aa11.17□□□□□ -0.62
AC004801.5-201ENST00000552958 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP11.17□□□□□ -0.62
AC004801.5-201ENST00000552958 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP11.17□□□□□ -0.62
AC004801.5-201ENST00000552958 FBXO28Q9NVF7 368 aa11.17□□□□□ -0.62
AC004801.5-201ENST00000552958 RLFQ13129 1914 aa11.16□□□□□ -0.62
AC004801.5-201ENST00000552958 SLC15A5A6NIM6 579 aa11.16□□□□□ -0.62
AC004801.5-201ENST00000552958 RAD21O60216 631 aa11.16□□□□□ -0.62
AC004801.5-201ENST00000552958 COBLO75128 1261 aa11.16□□□□□ -0.62
AC004801.5-201ENST00000552958 FLOT1O75955 427 aa11.16□□□□□ -0.62
AC004801.5-201ENST00000552958 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP11.16□□□□□ -0.62
AC004801.5-201ENST00000552958 EEF2P13639 858 aaKnown RBP11.16□□□□□ -0.62
AC004801.5-201ENST00000552958 ERCC3P19447 782 aa11.16□□□□□ -0.62
AC004801.5-201ENST00000552958 ICA1Q05084 483 aa11.16□□□□□ -0.62
AC004801.5-201ENST00000552958 GRB14Q14449 540 aa11.16□□□□□ -0.62
AC004801.5-201ENST00000552958 UBE3CQ15386 1083 aa11.16□□□□□ -0.62
AC004801.5-201ENST00000552958 LRRC26Q2I0M4 334 aa11.16□□□□□ -0.62
AC004801.5-201ENST00000552958 PRAMEF19Q5SWL8 479 aa11.16□□□□□ -0.62
AC004801.5-201ENST00000552958 LBX2Q6XYB7 198 aa11.16□□□□□ -0.62
AC004801.5-201ENST00000552958 ATP8A2Q9NTI2 1148 aa11.16□□□□□ -0.62
AC004801.5-201ENST00000552958 SWAP70Q9UH65 585 aa11.16□□□□□ -0.62
AC004801.5-201ENST00000552958 IVNS1ABPQ9Y6Y0 642 aa11.16□□□□□ -0.62
AC004801.5-201ENST00000552958 RANBP2P49792 3224 aaKnown RBP11.15□□□□□ -0.62
AC004801.5-201ENST00000552958 GLRX3O76003 335 aaKnown RBP11.15□□□□□ -0.62
AC004801.5-201ENST00000552958 IGHDP01880 384 aa11.15□□□□□ -0.62
AC004801.5-201ENST00000552958 COL6A1P12109 1028 aa11.15□□□□□ -0.62
AC004801.5-201ENST00000552958 ADORA2AP29274 412 aa11.15□□□□□ -0.62
AC004801.5-201ENST00000552958 DSG3P32926 999 aa11.15□□□□□ -0.62
AC004801.5-201ENST00000552958 MFSD14CQ5VZR4 134 aa11.15□□□□□ -0.62
AC004801.5-201ENST00000552958 C16orf86Q6ZW13 317 aa11.15□□□□□ -0.62
AC004801.5-201ENST00000552958 DPP9Q86TI2 863 aa11.15□□□□□ -0.62
AC004801.5-201ENST00000552958 NCAPG2Q86XI2 1143 aa11.15□□□□□ -0.62
AC004801.5-201ENST00000552958 TRMT44Q8IYL2 757 aaKnown RBP11.15□□□□□ -0.62
AC004801.5-201ENST00000552958 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP11.15□□□□□ -0.62
AC004801.5-201ENST00000552958 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP11.15□□□□□ -0.62
AC004801.5-201ENST00000552958 GDF15Q99988 308 aa11.15□□□□□ -0.62
AC004801.5-201ENST00000552958 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP11.15□□□□□ -0.62
AC004801.5-201ENST00000552958 SPATC1LQ9H0A9 340 aa11.15□□□□□ -0.62
AC004801.5-201ENST00000552958 VCPKMTQ9H867 229 aa11.15□□□□□ -0.62
AC004801.5-201ENST00000552958 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa11.15□□□□□ -0.62
AC004801.5-201ENST00000552958 ECHDC1Q9NTX5 307 aa11.15□□□□□ -0.62
AC004801.5-201ENST00000552958 TMX2Q9Y320 296 aa11.15□□□□□ -0.62
AC004801.5-201ENST00000552958 MYH8P13535 1937 aa11.14□□□□□ -0.63
AC004801.5-201ENST00000552958 GSG1L2A8MUP6 293 aa11.14□□□□□ -0.63
AC004801.5-201ENST00000552958 MINDY4BA8MYZ0 360 aa11.14□□□□□ -0.63
AC004801.5-201ENST00000552958 M0R2C6 588 aa11.14□□□□□ -0.63
AC004801.5-201ENST00000552958 MYCNP04198 464 aaPredicted RBP11.14□□□□□ -0.63
AC004801.5-201ENST00000552958 MAGEA10P43363 369 aaPredicted RBP11.14□□□□□ -0.63
AC004801.5-201ENST00000552958 ATN1P54259 1190 aaPredicted RBP11.14□□□□□ -0.63
AC004801.5-201ENST00000552958 TMEM132BQ14DG7 1078 aa11.14□□□□□ -0.63
AC004801.5-201ENST00000552958 SMC5Q8IY18 1101 aa11.14□□□□□ -0.63
AC004801.5-201ENST00000552958 OSBP2Q969R2 916 aa11.14□□□□□ -0.63
AC004801.5-201ENST00000552958 STRBPQ96SI9 672 aaKnown RBP11.14□□□□□ -0.63
AC004801.5-201ENST00000552958 SEC62Q99442 399 aaKnown RBP11.14□□□□□ -0.63
AC004801.5-201ENST00000552958 SENP6Q9GZR1 1112 aaPredicted RBP11.14□□□□□ -0.63
AC004801.5-201ENST00000552958 HOXC10Q9NYD6 342 aa11.14□□□□□ -0.63
AC004801.5-201ENST00000552958 DDX20Q9UHI6 824 aaKnown RBP11.14□□□□□ -0.63
AC004801.5-201ENST00000552958 A0A0G2JMZ2 1700 aa11.14□□□□□ -0.63
AC004801.5-201ENST00000552958 FRMPD3Q5JV73 1810 aa11.14□□□□□ -0.63
AC004801.5-201ENST00000552958 MYH7P12883 1935 aa11.13□□□□□ -0.63
AC004801.5-201ENST00000552958 PRDM1O75626 825 aa11.13□□□□□ -0.63
AC004801.5-201ENST00000552958 PGK2P07205 417 aa11.13□□□□□ -0.63
AC004801.5-201ENST00000552958 HOXC6P09630 235 aa11.13□□□□□ -0.63
AC004801.5-201ENST00000552958 CAPN2P17655 700 aa11.13□□□□□ -0.63
AC004801.5-201ENST00000552958 MDM2Q00987 491 aaPredicted RBP11.13□□□□□ -0.63
AC004801.5-201ENST00000552958 FAM83BQ5T0W9 1011 aa11.13□□□□□ -0.63
AC004801.5-201ENST00000552958 GJC2Q5T442 439 aaPredicted RBP11.13□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.8 ms