RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498163.1

RPL23AP55-201, Transcript of ribosomal protein L23a pseudogene 55, humanhuman

BASIC

Gene RPL23AP55, Length 452 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL23AP55-201ENST00000498163 TOP6BLQ8N6T0 577 aa4.97□□□□□ -1.61
RPL23AP55-201ENST00000498163 GIMAP7Q8NHV1 300 aa4.97□□□□□ -1.61
RPL23AP55-201ENST00000498163 RIN3Q8TB24 985 aa4.97□□□□□ -1.61
RPL23AP55-201ENST00000498163 BAHD1Q8TBE0 780 aaPredicted RBP4.97□□□□□ -1.61
RPL23AP55-201ENST00000498163 KIF2CQ99661 725 aa4.97□□□□□ -1.61
RPL23AP55-201ENST00000498163 MIPEPQ99797 713 aa4.97□□□□□ -1.61
RPL23AP55-201ENST00000498163 CSTF2TQ9H0L4 616 aaKnown RBP eCLIP4.97□□□□□ -1.61
RPL23AP55-201ENST00000498163 TNKS2Q9H2K2 1166 aa4.97□□□□□ -1.61
RPL23AP55-201ENST00000498163 ZNF214Q9UL59 606 aaPredicted RBP4.97□□□□□ -1.61
RPL23AP55-201ENST00000498163 MAPK8IP1Q9UQF2 711 aa4.97□□□□□ -1.61
RPL23AP55-201ENST00000498163 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa4.97□□□□□ -1.61
RPL23AP55-201ENST00000498163 LTBP3Q9NS15 1303 aa4.97□□□□□ -1.61
RPL23AP55-201ENST00000498163 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa4.96□□□□□ -1.62
RPL23AP55-201ENST00000498163 FAM87AP0C7U9 286 aa4.96□□□□□ -1.62
RPL23AP55-201ENST00000498163 ZNF865P0CJ78 1059 aaPredicted RBP4.96□□□□□ -1.62
RPL23AP55-201ENST00000498163 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP4.96□□□□□ -1.62
RPL23AP55-201ENST00000498163 ETV3P41162 512 aa4.96□□□□□ -1.62
RPL23AP55-201ENST00000498163 PMS1P54277 932 aaKnown RBP4.96□□□□□ -1.62
RPL23AP55-201ENST00000498163 CCDC144BQ3MJ40 725 aa4.96□□□□□ -1.62
RPL23AP55-201ENST00000498163 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa4.96□□□□□ -1.62
RPL23AP55-201ENST00000498163 EGFLAMQ63HQ2 1017 aa4.96□□□□□ -1.62
RPL23AP55-201ENST00000498163 ANKS3Q6ZW76 656 aa4.96□□□□□ -1.62
RPL23AP55-201ENST00000498163 ZNF765Q7L2R6 523 aa4.96□□□□□ -1.62
RPL23AP55-201ENST00000498163 ZDHHC13Q8IUH4 622 aa4.96□□□□□ -1.62
RPL23AP55-201ENST00000498163 CKAP2LQ8IYA6 745 aa4.96□□□□□ -1.62
RPL23AP55-201ENST00000498163 PHACTR4Q8IZ21 702 aa4.96□□□□□ -1.62
RPL23AP55-201ENST00000498163 RNF141Q8WVD5 230 aa4.96□□□□□ -1.62
RPL23AP55-201ENST00000498163 MFSD14AQ96MC6 490 aa4.96□□□□□ -1.62
RPL23AP55-201ENST00000498163 FBXL18Q96ME1 805 aa4.96□□□□□ -1.62
RPL23AP55-201ENST00000498163 HEXIM2Q96MH2 286 aaKnown RBP4.96□□□□□ -1.62
RPL23AP55-201ENST00000498163 TBC1D32Q96NH3 1257 aa4.96□□□□□ -1.62
RPL23AP55-201ENST00000498163 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP4.96□□□□□ -1.62
RPL23AP55-201ENST00000498163 ASPNQ9BXN1 380 aa4.96□□□□□ -1.62
RPL23AP55-201ENST00000498163 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP4.96□□□□□ -1.62
RPL23AP55-201ENST00000498163 PRDM16Q9HAZ2 1276 aa4.96□□□□□ -1.62
RPL23AP55-201ENST00000498163 MKNK2Q9HBH9 465 aa4.96□□□□□ -1.62
RPL23AP55-201ENST00000498163 LGR6Q9HBX8 967 aa4.96□□□□□ -1.62
RPL23AP55-201ENST00000498163 ACTR10Q9NZ32 417 aa4.96□□□□□ -1.62
RPL23AP55-201ENST00000498163 SUCOQ9UBS9 1254 aaKnown RBP4.96□□□□□ -1.62
RPL23AP55-201ENST00000498163 MSRB2Q9Y3D2 182 aa4.96□□□□□ -1.62
RPL23AP55-201ENST00000498163 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa4.96□□□□□ -1.62
RPL23AP55-201ENST00000498163 PRR19A6NJB7 356 aa4.95□□□□□ -1.62
RPL23AP55-201ENST00000498163 FAM170BA6NMN3 283 aa4.95□□□□□ -1.62
RPL23AP55-201ENST00000498163 ITGB7P26010 798 aa4.95□□□□□ -1.62
RPL23AP55-201ENST00000498163 HSD3B2P26439 372 aa4.95□□□□□ -1.62
RPL23AP55-201ENST00000498163 NFE2L2Q16236 605 aa4.95□□□□□ -1.62
RPL23AP55-201ENST00000498163 PPFIBP1Q86W92 1011 aa4.95□□□□□ -1.62
RPL23AP55-201ENST00000498163 SHKBP1Q8TBC3 707 aa4.95□□□□□ -1.62
RPL23AP55-201ENST00000498163 HNRNPLLQ8WVV9 542 aaKnown RBP4.95□□□□□ -1.62
RPL23AP55-201ENST00000498163 KLHL6Q8WZ60 621 aa4.95□□□□□ -1.62
RPL23AP55-201ENST00000498163 DHRS1Q96LJ7 313 aa4.95□□□□□ -1.62
RPL23AP55-201ENST00000498163 KREMEN1Q96MU8 473 aa4.95□□□□□ -1.62
RPL23AP55-201ENST00000498163 SLC6A18Q96N87 628 aa4.95□□□□□ -1.62
RPL23AP55-201ENST00000498163 UBA5Q9GZZ9 404 aa4.95□□□□□ -1.62
RPL23AP55-201ENST00000498163 TBX22Q9Y458 520 aa4.95□□□□□ -1.62
RPL23AP55-201ENST00000498163 PTMSP20962 102 aa4.94□□□□□ -1.62
RPL23AP55-201ENST00000498163 KIR3DL1P43629 444 aa4.94□□□□□ -1.62
RPL23AP55-201ENST00000498163 RNF4P78317 190 aa4.94□□□□□ -1.62
RPL23AP55-201ENST00000498163 DDR2Q16832 855 aa4.94□□□□□ -1.62
RPL23AP55-201ENST00000498163 BBS9Q3SYG4 887 aa4.94□□□□□ -1.62
RPL23AP55-201ENST00000498163 CYP27C1Q4G0S4 372 aa4.94□□□□□ -1.62
RPL23AP55-201ENST00000498163 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP4.94□□□□□ -1.62
RPL23AP55-201ENST00000498163 LRP10Q7Z4F1 713 aa4.94□□□□□ -1.62
RPL23AP55-201ENST00000498163 CDH24Q86UP0 819 aa4.94□□□□□ -1.62
RPL23AP55-201ENST00000498163 CELF2-AS1Q8N7Q2 184 aa4.94□□□□□ -1.62
RPL23AP55-201ENST00000498163 XAGE3Q8WTP9 111 aa4.94□□□□□ -1.62
RPL23AP55-201ENST00000498163 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP4.94□□□□□ -1.62
RPL23AP55-201ENST00000498163 MKL1Q969V6 931 aa4.94□□□□□ -1.62
RPL23AP55-201ENST00000498163 ZSWIM4Q9H7M6 989 aa4.94□□□□□ -1.62
RPL23AP55-201ENST00000498163 PRDM5Q9NQX1 630 aaPredicted RBP4.94□□□□□ -1.62
RPL23AP55-201ENST00000498163 U3KQE9 123 aa4.94□□□□□ -1.62
RPL23AP55-201ENST00000498163 SHOXO15266 292 aa4.93□□□□□ -1.62
RPL23AP55-201ENST00000498163 CLEC3AO75596 197 aa4.93□□□□□ -1.62
RPL23AP55-201ENST00000498163 CYP7A1P22680 504 aa4.93□□□□□ -1.62
RPL23AP55-201ENST00000498163 GBP1P32455 592 aa4.93□□□□□ -1.62
RPL23AP55-201ENST00000498163 OXCT1P55809 520 aa4.93□□□□□ -1.62
RPL23AP55-201ENST00000498163 NCAPHQ15003 741 aa4.93□□□□□ -1.62
RPL23AP55-201ENST00000498163 FXNQ16595 210 aa4.93□□□□□ -1.62
RPL23AP55-201ENST00000498163 ANKRD39Q53RE8 183 aa4.93□□□□□ -1.62
RPL23AP55-201ENST00000498163 SMC5Q8IY18 1101 aa4.93□□□□□ -1.62
RPL23AP55-201ENST00000498163 Q96M66 194 aa4.93□□□□□ -1.62
RPL23AP55-201ENST00000498163 OSBPL2Q9H1P3 480 aa4.93□□□□□ -1.62
RPL23AP55-201ENST00000498163 PRR13Q9NZ81 148 aa4.93□□□□□ -1.62
RPL23AP55-201ENST00000498163 SIRPGQ9P1W8 387 aa4.93□□□□□ -1.62
RPL23AP55-201ENST00000498163 KLHL42Q9P2K6 505 aa4.93□□□□□ -1.62
RPL23AP55-201ENST00000498163 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa4.93□□□□□ -1.62
RPL23AP55-201ENST00000498163 CCDC194A0A1B0GVG4 234 aa4.92□□□□□ -1.62
RPL23AP55-201ENST00000498163 WDR64B1ANS9 1081 aa4.92□□□□□ -1.62
RPL23AP55-201ENST00000498163 C9IYK1 514 aa4.92□□□□□ -1.62
RPL23AP55-201ENST00000498163 FURINP09958 794 aa4.92□□□□□ -1.62
RPL23AP55-201ENST00000498163 RASA3Q14644 834 aa4.92□□□□□ -1.62
RPL23AP55-201ENST00000498163 NBPF9Q3BBW0 867 aa4.92□□□□□ -1.62
RPL23AP55-201ENST00000498163 PRSS36Q5K4E3 855 aa4.92□□□□□ -1.62
RPL23AP55-201ENST00000498163 SFRP5Q5T4F7 317 aa4.92□□□□□ -1.62
RPL23AP55-201ENST00000498163 DUSP27Q5VZP5 1158 aa4.92□□□□□ -1.62
RPL23AP55-201ENST00000498163 FBXL6Q8N531 539 aa4.92□□□□□ -1.62
RPL23AP55-201ENST00000498163 ZNF513Q8N8E2 541 aaPredicted RBP4.92□□□□□ -1.62
RPL23AP55-201ENST00000498163 PIWIL2Q8TC59 973 aaKnown RBP4.92□□□□□ -1.62
RPL23AP55-201ENST00000498163 SUSD2Q9UGT4 822 aa4.92□□□□□ -1.62
RPL23AP55-201ENST00000498163 PRKAB1Q9Y478 270 aa4.92□□□□□ -1.62
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43 ms