RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486028.1

HMG20B-211, Transcript of high mobility group 20B, humanhuman

TSL 2

Gene HMG20B, Length 719 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMG20B-211ENST00000486028 SKAP1Q86WV1 359 aa14.76□□□□□ -0.05
HMG20B-211ENST00000486028 CLEC10AQ8IUN9 316 aa14.76□□□□□ -0.05
HMG20B-211ENST00000486028 ANKRD13CQ8N6S4 541 aa14.76□□□□□ -0.05
HMG20B-211ENST00000486028 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa14.76□□□□□ -0.05
HMG20B-211ENST00000486028 GTF3C2Q8WUA4 911 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
HMG20B-211ENST00000486028 LPAR1Q92633 364 aa14.76□□□□□ -0.05
HMG20B-211ENST00000486028 P2RX7Q99572 595 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
HMG20B-211ENST00000486028 NYAP2Q9P242 653 aa14.76□□□□□ -0.05
HMG20B-211ENST00000486028 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP14.76□□□□□ -0.05
HMG20B-211ENST00000486028 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa14.75□□□□□ -0.05
HMG20B-211ENST00000486028 TSPY2A6NKD2 308 aa14.75□□□□□ -0.05
HMG20B-211ENST00000486028 RANBP6O60518 1105 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
HMG20B-211ENST00000486028 FMNL1O95466 1100 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
HMG20B-211ENST00000486028 GNRH1P01148 92 aa14.75□□□□□ -0.05
HMG20B-211ENST00000486028 FGRP09769 529 aa14.75□□□□□ -0.05
HMG20B-211ENST00000486028 PCP11498 1178 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
HMG20B-211ENST00000486028 PSMC4P43686 418 aa14.75□□□□□ -0.05
HMG20B-211ENST00000486028 HAND2P61296 217 aa14.75□□□□□ -0.05
HMG20B-211ENST00000486028 HERVK_113P62684 666 aa14.75□□□□□ -0.05
HMG20B-211ENST00000486028 FAM47AQ5JRC9 791 aa14.75□□□□□ -0.05
HMG20B-211ENST00000486028 FBXO46Q6PJ61 603 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
HMG20B-211ENST00000486028 CATSPERGQ6ZRH7 1159 aa14.75□□□□□ -0.05
HMG20B-211ENST00000486028 RNF41Q9H4P4 317 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
HMG20B-211ENST00000486028 RPAP3Q9H6T3 665 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
HMG20B-211ENST00000486028 VCPKMTQ9H867 229 aa14.75□□□□□ -0.05
HMG20B-211ENST00000486028 GOPCQ9HD26 462 aa14.75□□□□□ -0.05
HMG20B-211ENST00000486028 INCENPQ9NQS7 918 aa14.75□□□□□ -0.05
HMG20B-211ENST00000486028 TOMM22Q9NS69 142 aa14.75□□□□□ -0.05
HMG20B-211ENST00000486028 MTMR4Q9NYA4 1195 aa14.75□□□□□ -0.05
HMG20B-211ENST00000486028 CLIP2Q9UDT6 1046 aa14.75□□□□□ -0.05
HMG20B-211ENST00000486028 LOC285556D6RIA3 1793 aa14.75□□□□□ -0.05
HMG20B-211ENST00000486028 MYH8P13535 1937 aa14.74□□□□□ -0.05
HMG20B-211ENST00000486028 TTLL1O95922 423 aa14.74□□□□□ -0.05
HMG20B-211ENST00000486028 HOXD10P28358 340 aa14.74□□□□□ -0.05
HMG20B-211ENST00000486028 FCGRTP55899 365 aa14.74□□□□□ -0.05
HMG20B-211ENST00000486028 FAM110CQ1W6H9 321 aa14.74□□□□□ -0.05
HMG20B-211ENST00000486028 AKNAD1Q5T1N1 836 aa14.74□□□□□ -0.05
HMG20B-211ENST00000486028 MFSD6Q6ZSS7 791 aa14.74□□□□□ -0.05
HMG20B-211ENST00000486028 CEP95Q96GE4 821 aa14.74□□□□□ -0.05
HMG20B-211ENST00000486028 ABHD8Q96I13 439 aa14.74□□□□□ -0.05
HMG20B-211ENST00000486028 HOXC10Q9NYD6 342 aa14.74□□□□□ -0.05
HMG20B-211ENST00000486028 SGSM2O43147 1006 aa14.73□□□□□ -0.05
HMG20B-211ENST00000486028 RAD21O60216 631 aa14.73□□□□□ -0.05
HMG20B-211ENST00000486028 COG2Q14746 738 aa14.73□□□□□ -0.05
HMG20B-211ENST00000486028 IMMTQ16891 758 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
HMG20B-211ENST00000486028 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
HMG20B-211ENST00000486028 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa14.73□□□□□ -0.05
HMG20B-211ENST00000486028 SPICE1Q8N0Z3 855 aa14.73□□□□□ -0.05
HMG20B-211ENST00000486028 GPRC5AQ8NFJ5 357 aa14.73□□□□□ -0.05
HMG20B-211ENST00000486028 STAG1Q8WVM7 1258 aa14.73□□□□□ -0.05
HMG20B-211ENST00000486028 MKL1Q969V6 931 aa14.73□□□□□ -0.05
HMG20B-211ENST00000486028 TANGO6Q9C0B7 1094 aa14.73□□□□□ -0.05
HMG20B-211ENST00000486028 ARHGAP39Q9C0H5 1083 aa14.73□□□□□ -0.05
HMG20B-211ENST00000486028 IL25Q9H293 177 aa14.73□□□□□ -0.05
HMG20B-211ENST00000486028 MORF4L1Q9UBU8 362 aa14.73□□□□□ -0.05
HMG20B-211ENST00000486028 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa14.73□□□□□ -0.05
HMG20B-211ENST00000486028 TACC3Q9Y6A5 838 aa14.73□□□□□ -0.05
HMG20B-211ENST00000486028 PLIN4Q96Q06 1357 aa14.73□□□□□ -0.05
HMG20B-211ENST00000486028 F5H6K3 240 aa14.72□□□□□ -0.05
HMG20B-211ENST00000486028 WDR46O15213 610 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
HMG20B-211ENST00000486028 NT5C2P49902 561 aa14.72□□□□□ -0.05
HMG20B-211ENST00000486028 PRMT2P55345 433 aa14.72□□□□□ -0.05
HMG20B-211ENST00000486028 CAP1Q01518 475 aa14.72□□□□□ -0.05
HMG20B-211ENST00000486028 KLRC3Q07444 240 aa14.72□□□□□ -0.05
HMG20B-211ENST00000486028 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa14.72□□□□□ -0.05
HMG20B-211ENST00000486028 TRIM47Q96LD4 638 aa14.72□□□□□ -0.05
HMG20B-211ENST00000486028 RBPJLQ9UBG7 517 aa14.72□□□□□ -0.05
HMG20B-211ENST00000486028 PTPN22Q9Y2R2 807 aa14.72□□□□□ -0.05
HMG20B-211ENST00000486028 CASC1Q6TDU7 716 aa14.71□□□□□ -0.05
HMG20B-211ENST00000486028 TBC1D10CQ8IV04 446 aa14.71□□□□□ -0.05
HMG20B-211ENST00000486028 ESR2Q92731 530 aa14.71□□□□□ -0.05
HMG20B-211ENST00000486028 NBPF3Q9H094 633 aa14.71□□□□□ -0.05
HMG20B-211ENST00000486028 HPS5Q9UPZ3 1129 aa14.71□□□□□ -0.05
HMG20B-211ENST00000486028 RABGAP1Q9Y3P9 1069 aa14.71□□□□□ -0.05
HMG20B-211ENST00000486028 TNPO2O14787 897 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
HMG20B-211ENST00000486028 FLOT1O75955 427 aa14.7□□□□□ -0.06
HMG20B-211ENST00000486028 NDUFB10O96000 172 aa14.7□□□□□ -0.06
HMG20B-211ENST00000486028 CTGFP29279 349 aa14.7□□□□□ -0.06
HMG20B-211ENST00000486028 PTH1RQ03431 593 aa14.7□□□□□ -0.06
HMG20B-211ENST00000486028 IFFO2Q5TF58 517 aa14.7□□□□□ -0.06
HMG20B-211ENST00000486028 LBX2Q6XYB7 198 aa14.7□□□□□ -0.06
HMG20B-211ENST00000486028 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
HMG20B-211ENST00000486028 GMCL1P1Q8NEA9 526 aa14.7□□□□□ -0.06
HMG20B-211ENST00000486028 COA7Q96BR5 231 aa14.7□□□□□ -0.06
HMG20B-211ENST00000486028 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa14.7□□□□□ -0.06
HMG20B-211ENST00000486028 PAGR1Q9BTK6 254 aa14.7□□□□□ -0.06
HMG20B-211ENST00000486028 TXNRD2Q9NNW7 524 aa14.7□□□□□ -0.06
HMG20B-211ENST00000486028 IL17RBQ9NRM6 502 aa14.7□□□□□ -0.06
HMG20B-211ENST00000486028 TCP11L1Q9NUJ3 509 aa14.7□□□□□ -0.06
HMG20B-211ENST00000486028 SRRDQ9UH36 339 aa14.7□□□□□ -0.06
HMG20B-211ENST00000486028 STX8Q9UNK0 236 aa14.7□□□□□ -0.06
HMG20B-211ENST00000486028 CCDC85CA6NKD9 419 aa14.69□□□□□ -0.06
HMG20B-211ENST00000486028 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
HMG20B-211ENST00000486028 NMT2O60551 498 aa14.69□□□□□ -0.06
HMG20B-211ENST00000486028 DSG3P32926 999 aa14.69□□□□□ -0.06
HMG20B-211ENST00000486028 ERVK-9P63128 1117 aa14.69□□□□□ -0.06
HMG20B-211ENST00000486028 ERVK-24P63145 666 aa14.69□□□□□ -0.06
HMG20B-211ENST00000486028 CCNA1P78396 465 aa14.69□□□□□ -0.06
HMG20B-211ENST00000486028 FAM83BQ5T0W9 1011 aa14.69□□□□□ -0.06
HMG20B-211ENST00000486028 LRRC47Q8N1G4 583 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 159.3 ms