RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481121.5

NELFE-208, Transcript of negative elongation factor complex member E, humanhuman

TSL 2

Gene NELFE, Length 1,543 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NELFE-208ENST00000481121 TSPY3P0CV98 308 aa24.71■■□□□ 1.55
NELFE-208ENST00000481121 TSPY8P0CW00 308 aa24.71■■□□□ 1.55
NELFE-208ENST00000481121 VCPKMTQ9H867 229 aa24.71■■□□□ 1.55
NELFE-208ENST00000481121 CATSPERGQ6ZRH7 1159 aa24.7■■□□□ 1.54
NELFE-208ENST00000481121 GTF3C2Q8WUA4 911 aaPredicted RBP24.7■■□□□ 1.54
NELFE-208ENST00000481121 TANGO6Q9C0B7 1094 aa24.7■■□□□ 1.54
NELFE-208ENST00000481121 GOPCQ9HD26 462 aa24.7■■□□□ 1.54
NELFE-208ENST00000481121 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP24.7■■□□□ 1.54
NELFE-208ENST00000481121 RAD50Q92878 1312 aa24.69■■□□□ 1.54
NELFE-208ENST00000481121 MORF4L1Q9UBU8 362 aa24.69■■□□□ 1.54
NELFE-208ENST00000481121 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa24.68■■□□□ 1.54
NELFE-208ENST00000481121 PRMT2P55345 433 aa24.68■■□□□ 1.54
NELFE-208ENST00000481121 FAM47AQ5JRC9 791 aa24.68■■□□□ 1.54
NELFE-208ENST00000481121 SPICE1Q8N0Z3 855 aa24.68■■□□□ 1.54
NELFE-208ENST00000481121 CEP95Q96GE4 821 aa24.68■■□□□ 1.54
NELFE-208ENST00000481121 NYAP2Q9P242 653 aa24.68■■□□□ 1.54
NELFE-208ENST00000481121 MYPNQ86TC9 1320 aa24.67■■□□□ 1.54
NELFE-208ENST00000481121 TSPY2A6NKD2 308 aa24.67■■□□□ 1.54
NELFE-208ENST00000481121 TNPO2O14787 897 aaKnown RBP24.67■■□□□ 1.54
NELFE-208ENST00000481121 HOXD10P28358 340 aa24.67■■□□□ 1.54
NELFE-208ENST00000481121 HAND2P61296 217 aa24.67■■□□□ 1.54
NELFE-208ENST00000481121 TFAP4Q01664 338 aa24.67■■□□□ 1.54
NELFE-208ENST00000481121 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa24.67■■□□□ 1.54
NELFE-208ENST00000481121 NEDD1Q8NHV4 660 aa24.67■■□□□ 1.54
NELFE-208ENST00000481121 RUFY2Q8WXA3 655 aa24.67■■□□□ 1.54
NELFE-208ENST00000481121 PAGR1Q9BTK6 254 aa24.67■■□□□ 1.54
NELFE-208ENST00000481121 DSCC1Q9BVC3 393 aa24.67■■□□□ 1.54
NELFE-208ENST00000481121 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa24.67■■□□□ 1.54
NELFE-208ENST00000481121 PLXNB2O15031 1838 aa24.67■■□□□ 1.54
NELFE-208ENST00000481121 RBBP6Q7Z6E9 1792 aaKnown RBP24.66■■□□□ 1.54
NELFE-208ENST00000481121 WDR46O15213 610 aaKnown RBP24.66■■□□□ 1.54
NELFE-208ENST00000481121 RAD21O60216 631 aa24.66■■□□□ 1.54
NELFE-208ENST00000481121 CHMLP26374 656 aa24.66■■□□□ 1.54
NELFE-208ENST00000481121 IL25Q9H293 177 aa24.66■■□□□ 1.54
NELFE-208ENST00000481121 TOMM22Q9NS69 142 aa24.66■■□□□ 1.54
NELFE-208ENST00000481121 SRRDQ9UH36 339 aa24.66■■□□□ 1.54
NELFE-208ENST00000481121 ORC4O43929 436 aa24.66■■□□□ 1.54
NELFE-208ENST00000481121 SKAP1Q86WV1 359 aa24.66■■□□□ 1.54
NELFE-208ENST00000481121 TXNRD2Q9NNW7 524 aa24.66■■□□□ 1.54
NELFE-208ENST00000481121 INCENPQ9NQS7 918 aa24.66■■□□□ 1.54
NELFE-208ENST00000481121 MTMR4Q9NYA4 1195 aa24.66■■□□□ 1.54
NELFE-208ENST00000481121 RANBP6O60518 1105 aaKnown RBP24.65■■□□□ 1.54
NELFE-208ENST00000481121 TTLL1O95922 423 aa24.65■■□□□ 1.54
NELFE-208ENST00000481121 GPRC5AQ8NFJ5 357 aa24.65■■□□□ 1.54
NELFE-208ENST00000481121 RBPJLQ9UBG7 517 aa24.65■■□□□ 1.54
NELFE-208ENST00000481121 CLIP2Q9UDT6 1046 aa24.65■■□□□ 1.54
NELFE-208ENST00000481121 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP24.64■■□□□ 1.53
NELFE-208ENST00000481121 PEX10O60683 326 aa24.64■■□□□ 1.53
NELFE-208ENST00000481121 FGRP09769 529 aa24.64■■□□□ 1.53
NELFE-208ENST00000481121 ERVK-9P63128 1117 aa24.64■■□□□ 1.53
NELFE-208ENST00000481121 ERVK-24P63145 666 aa24.64■■□□□ 1.53
NELFE-208ENST00000481121 PRKCZQ05513 592 aa24.64■■□□□ 1.53
NELFE-208ENST00000481121 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa24.64■■□□□ 1.53
NELFE-208ENST00000481121 LBX2Q6XYB7 198 aa24.64■■□□□ 1.53
NELFE-208ENST00000481121 TACC3Q9Y6A5 838 aa24.64■■□□□ 1.53
NELFE-208ENST00000481121 ZNF213O14771 459 aa24.63■■□□□ 1.53
NELFE-208ENST00000481121 PCP11498 1178 aaKnown RBP24.63■■□□□ 1.53
NELFE-208ENST00000481121 COG2Q14746 738 aa24.63■■□□□ 1.53
NELFE-208ENST00000481121 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP24.63■■□□□ 1.53
NELFE-208ENST00000481121 RAET1EQ8TD07 263 aa24.63■■□□□ 1.53
NELFE-208ENST00000481121 COA7Q96BR5 231 aa24.63■■□□□ 1.53
NELFE-208ENST00000481121 RABGAP1Q9Y3P9 1069 aa24.63■■□□□ 1.53
NELFE-208ENST00000481121 FLOT1O75955 427 aa24.62■■□□□ 1.53
NELFE-208ENST00000481121 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa24.62■■□□□ 1.53
NELFE-208ENST00000481121 AKNAD1Q5T1N1 836 aa24.62■■□□□ 1.53
NELFE-208ENST00000481121 MFSD6Q6ZSS7 791 aa24.62■■□□□ 1.53
NELFE-208ENST00000481121 TBC1D10CQ8IV04 446 aa24.62■■□□□ 1.53
NELFE-208ENST00000481121 LRRC47Q8N1G4 583 aaKnown RBP24.62■■□□□ 1.53
NELFE-208ENST00000481121 STAG1Q8WVM7 1258 aa24.62■■□□□ 1.53
NELFE-208ENST00000481121 NBPF3Q9H094 633 aa24.62■■□□□ 1.53
NELFE-208ENST00000481121 RNF41Q9H4P4 317 aaPredicted RBP24.62■■□□□ 1.53
NELFE-208ENST00000481121 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa24.62■■□□□ 1.53
NELFE-208ENST00000481121 IMMTQ16891 758 aaKnown RBP24.61■■□□□ 1.53
NELFE-208ENST00000481121 POTEEQ6S8J3 1075 aa24.61■■□□□ 1.53
NELFE-208ENST00000481121 HOXC10Q9NYD6 342 aa24.61■■□□□ 1.53
NELFE-208ENST00000481121 CTNNA3Q9UI47 895 aa24.61■■□□□ 1.53
NELFE-208ENST00000481121 STX8Q9UNK0 236 aa24.61■■□□□ 1.53
NELFE-208ENST00000481121 F5H6K3 240 aa24.61■■□□□ 1.53
NELFE-208ENST00000481121 KLRC3Q07444 240 aa24.61■■□□□ 1.53
NELFE-208ENST00000481121 BMP2KLQ5H9B9 411 aa24.61■■□□□ 1.53
NELFE-208ENST00000481121 FAM83BQ5T0W9 1011 aa24.61■■□□□ 1.53
NELFE-208ENST00000481121 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP24.61■■□□□ 1.53
NELFE-208ENST00000481121 MKL1Q969V6 931 aa24.61■■□□□ 1.53
NELFE-208ENST00000481121 GABRQQ9UN88 632 aa24.61■■□□□ 1.53
NELFE-208ENST00000481121 CNMDO75829 334 aa24.6■■□□□ 1.53
NELFE-208ENST00000481121 NDUFB10O96000 172 aa24.6■■□□□ 1.53
NELFE-208ENST00000481121 ARMC5Q96C12 935 aa24.6■■□□□ 1.53
NELFE-208ENST00000481121 NEDD4P46934 1319 aa24.59■■□□□ 1.53
NELFE-208ENST00000481121 BRCA2P51587 3418 aa24.59■■□□□ 1.53
NELFE-208ENST00000481121 SGSM2O43147 1006 aa24.59■■□□□ 1.53
NELFE-208ENST00000481121 NMT2O60551 498 aa24.59■■□□□ 1.53
NELFE-208ENST00000481121 MAPK4P31152 587 aa24.59■■□□□ 1.53
NELFE-208ENST00000481121 DSG3P32926 999 aa24.59■■□□□ 1.53
NELFE-208ENST00000481121 FLT3LGP49771 235 aa24.59■■□□□ 1.53
NELFE-208ENST00000481121 CCNA1P78396 465 aa24.59■■□□□ 1.53
NELFE-208ENST00000481121 Q3C1V9 767 aa24.59■■□□□ 1.53
NELFE-208ENST00000481121 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP24.59■■□□□ 1.53
NELFE-208ENST00000481121 NBPF11Q86T75 865 aa24.59■■□□□ 1.53
NELFE-208ENST00000481121 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP24.59■■□□□ 1.53
NELFE-208ENST00000481121 IL17RBQ9NRM6 502 aa24.59■■□□□ 1.53
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