RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000453216.1

TRAM2-AS1-201, Transcript of TRAM2 antisense RNA 1 (head to head), humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene TRAM2-AS1, Length 664 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TANGO6Q9C0B7 1094 aa31.5■■■□□ 2.63
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa31.5■■■□□ 2.63
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CDK8P49336 464 aa31.49■■■□□ 2.63
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CACNB2Q08289 660 aaPredicted RBP31.49■■■□□ 2.63
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 HOXC10Q9NYD6 342 aa31.49■■■□□ 2.63
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 OGDHLQ9ULD0 1010 aa31.49■■■□□ 2.63
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TRIOBPQ9H2D6 2365 aa31.49■■■□□ 2.63
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SLC15A5A6NIM6 579 aa31.48■■■□□ 2.63
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SMIM22K7EJ46 135 aa31.48■■■□□ 2.63
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ICA1Q05084 483 aa31.48■■■□□ 2.63
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 C16orf86Q6ZW13 317 aa31.48■■■□□ 2.63
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SH2D4AQ9H788 454 aa31.48■■■□□ 2.63
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 IVNS1ABPQ9Y6Y0 642 aa31.48■■■□□ 2.63
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CLEC10AQ8IUN9 316 aa31.47■■■□□ 2.63
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 LPAR1Q92633 364 aa31.47■■■□□ 2.63
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 NBPF3Q9H094 633 aa31.47■■■□□ 2.63
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TMX2Q9Y320 296 aa31.47■■■□□ 2.63
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa31.46■■■□□ 2.63
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CTR9Q6PD62 1173 aa31.46■■■□□ 2.63
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SIAH1Q8IUQ4 282 aa31.46■■■□□ 2.63
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 KBTBD3Q8NAB2 608 aa31.46■■■□□ 2.63
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MNX1P50219 401 aaPredicted RBP31.44■■■□□ 2.62
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 GRB14Q14449 540 aa31.44■■■□□ 2.62
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TSHZ3Q63HK5 1081 aa31.44■■■□□ 2.62
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 VCPKMTQ9H867 229 aa31.44■■■□□ 2.62
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ARPP21Q9UBL0 812 aaPredicted RBP31.44■■■□□ 2.62
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MFSD14CQ5VZR4 134 aa31.43■■■□□ 2.62
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SPICE1Q8N0Z3 855 aa31.43■■■□□ 2.62
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MOV10L1Q9BXT6 1211 aaKnown RBP31.43■■■□□ 2.62
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 C11orf49Q9H6J7 331 aa31.43■■■□□ 2.62
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 HOXC6P09630 235 aa31.42■■■□□ 2.62
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MB21D1Q8N884 522 aa31.42■■■□□ 2.62
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RLFQ13129 1914 aa31.41■■■□□ 2.62
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ALPK3Q96L96 1907 aa31.41■■■□□ 2.62
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RANBP2P49792 3224 aaKnown RBP31.41■■■□□ 2.62
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 FLOT1O75955 427 aa31.41■■■□□ 2.62
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 DSG3P32926 999 aa31.41■■■□□ 2.62
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ATP2B2Q01814 1243 aa31.41■■■□□ 2.62
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 APPBP2Q92624 585 aa31.41■■■□□ 2.62
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SPATC1LQ9H0A9 340 aa31.41■■■□□ 2.62
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PRO3102Q9H379 93 aa31.41■■■□□ 2.62
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 KANSL2Q9H9L4 492 aa31.41■■■□□ 2.62
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 FLRT1Q9NZU1 646 aa31.41■■■□□ 2.62
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 A0A0G2JMZ2 1700 aa31.41■■■□□ 2.62
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RNF113AO15541 343 aaKnown RBP31.4■■■□□ 2.62
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 EEF2P13639 858 aaKnown RBP31.4■■■□□ 2.62
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 LHX8Q68G74 356 aa31.4■■■□□ 2.62
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 OSBP2Q969R2 916 aa31.4■■■□□ 2.62
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ZFYP08048 801 aaPredicted RBP31.39■■■□□ 2.62
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SBK1Q52WX2 424 aa31.39■■■□□ 2.62
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 GIMAP6Q6P9H5 292 aa31.39■■■□□ 2.62
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SHCBP1Q8NEM2 672 aa31.39■■■□□ 2.62
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa31.39■■■□□ 2.62
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 GSG1L2A8MUP6 293 aa31.38■■■□□ 2.61
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 STRNO43815 780 aa31.38■■■□□ 2.61
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PLS1Q14651 629 aa31.38■■■□□ 2.61
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 DPP9Q86TI2 863 aa31.38■■■□□ 2.61
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 C7orf61Q8IZ16 206 aa31.38■■■□□ 2.61
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 NPLOC4Q8TAT6 608 aa31.38■■■□□ 2.61
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ATG4CQ96DT6 458 aa31.38■■■□□ 2.61
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ERCC3P19447 782 aa31.37■■■□□ 2.61
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP31.37■■■□□ 2.61
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TTC41PQ6P2S7 1318 aa31.36■■■□□ 2.61
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ADORA2AP29274 412 aa31.36■■■□□ 2.61
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 GOPCQ9HD26 462 aa31.36■■■□□ 2.61
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ZNF236Q9UL36 1845 aa31.35■■■□□ 2.61
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MINDY4BA8MYZ0 360 aa31.35■■■□□ 2.61
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 GPAA1O43292 621 aa31.35■■■□□ 2.61
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CYP2C19P33261 490 aa31.35■■■□□ 2.61
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 GNAT2P19087 354 aa31.34■■■□□ 2.61
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 STK11IPQ8N1F8 1099 aa31.34■■■□□ 2.61
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP31.34■■■□□ 2.61
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 STAP2Q9UGK3 403 aa31.34■■■□□ 2.61
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RAD21O60216 631 aa31.33■■■□□ 2.61
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 COL6A1P12109 1028 aa31.33■■■□□ 2.61
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RASA1P20936 1047 aa31.33■■■□□ 2.61
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CNGA1P29973 690 aa31.33■■■□□ 2.61
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 DDX20Q9UHI6 824 aaKnown RBP31.33■■■□□ 2.61
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PARP14Q460N5 1801 aa31.33■■■□□ 2.61
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ROBO3Q96MS0 1386 aa31.32■■■□□ 2.6
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 M0R2C6 588 aa31.32■■■□□ 2.6
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MSCO60682 206 aa31.32■■■□□ 2.6
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TDO2P48775 406 aa31.32■■■□□ 2.6
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RRP1P56182 461 aaKnown RBP31.32■■■□□ 2.6
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 OLFML2BQ68BL8 750 aa31.32■■■□□ 2.6
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SLC5A4Q9NY91 659 aa31.32■■■□□ 2.6
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ZMYND8Q9ULU4 1186 aaPredicted RBP31.32■■■□□ 2.6
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 A0A1W2PPC1 479 aa31.31■■■□□ 2.6
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