RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000435348.5

TTC28-AS1-214, TTC28 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 4

Gene TTC28-AS1, Length 578 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC28-AS1-214ENST00000435348 SEMA6BQ9H3T3 888 aa12.42□□□□□ -0.42
TTC28-AS1-214ENST00000435348 USP40Q9NVE5 1235 aa12.42□□□□□ -0.42
TTC28-AS1-214ENST00000435348 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP12.42□□□□□ -0.42
TTC28-AS1-214ENST00000435348 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP12.41□□□□□ -0.42
TTC28-AS1-214ENST00000435348 SH3BP2P78314 561 aa12.41□□□□□ -0.42
TTC28-AS1-214ENST00000435348 PDE3AQ14432 1141 aa12.41□□□□□ -0.42
TTC28-AS1-214ENST00000435348 CDC42EP5Q6NZY7 148 aa12.41□□□□□ -0.42
TTC28-AS1-214ENST00000435348 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP12.41□□□□□ -0.42
TTC28-AS1-214ENST00000435348 TRMT44Q8IYL2 757 aaKnown RBP12.41□□□□□ -0.42
TTC28-AS1-214ENST00000435348 WDR66Q8TBY9 1149 aa12.41□□□□□ -0.42
TTC28-AS1-214ENST00000435348 IRF7Q92985 503 aa12.41□□□□□ -0.42
TTC28-AS1-214ENST00000435348 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP12.41□□□□□ -0.42
TTC28-AS1-214ENST00000435348 NUDT12Q9BQG2 462 aa12.41□□□□□ -0.42
TTC28-AS1-214ENST00000435348 DOCK2Q92608 1830 aa12.41□□□□□ -0.42
TTC28-AS1-214ENST00000435348 GRM8O00222 908 aa12.4□□□□□ -0.42
TTC28-AS1-214ENST00000435348 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP12.4□□□□□ -0.42
TTC28-AS1-214ENST00000435348 NFIAQ12857 509 aa12.4□□□□□ -0.42
TTC28-AS1-214ENST00000435348 NPAS3Q8IXF0 933 aa12.4□□□□□ -0.42
TTC28-AS1-214ENST00000435348 PROCA1Q8NCQ7 364 aaPredicted RBP12.4□□□□□ -0.42
TTC28-AS1-214ENST00000435348 SOCS4Q8WXH5 440 aa12.4□□□□□ -0.42
TTC28-AS1-214ENST00000435348 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP12.4□□□□□ -0.42
TTC28-AS1-214ENST00000435348 SENP6Q9GZR1 1112 aaPredicted RBP12.4□□□□□ -0.42
TTC28-AS1-214ENST00000435348 RAPGEFL1Q9UHV5 662 aa12.4□□□□□ -0.42
TTC28-AS1-214ENST00000435348 DAGLAQ9Y4D2 1042 aa12.4□□□□□ -0.42
TTC28-AS1-214ENST00000435348 DOCK1Q14185 1865 aa12.4□□□□□ -0.42
TTC28-AS1-214ENST00000435348 VCANP13611 3396 aa12.39□□□□□ -0.43
TTC28-AS1-214ENST00000435348 CTNND1O60716 968 aaKnown RBP12.39□□□□□ -0.43
TTC28-AS1-214ENST00000435348 COL6A1P12109 1028 aa12.39□□□□□ -0.43
TTC28-AS1-214ENST00000435348 EPHA10Q5JZY3 1008 aa12.39□□□□□ -0.43
TTC28-AS1-214ENST00000435348 TREML2Q5T2D2 321 aa12.39□□□□□ -0.43
TTC28-AS1-214ENST00000435348 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP12.39□□□□□ -0.43
TTC28-AS1-214ENST00000435348 PTPRFP10586 1907 aa12.39□□□□□ -0.43
TTC28-AS1-214ENST00000435348 MYH13Q9UKX3 1938 aa12.39□□□□□ -0.43
TTC28-AS1-214ENST00000435348 DOCK3Q8IZD9 2030 aa12.38□□□□□ -0.43
TTC28-AS1-214ENST00000435348 FAM181BA6NEQ2 426 aa12.38□□□□□ -0.43
TTC28-AS1-214ENST00000435348 PHF20L1A8MW92 1017 aa12.38□□□□□ -0.43
TTC28-AS1-214ENST00000435348 IRX3P78415 501 aaPredicted RBP12.38□□□□□ -0.43
TTC28-AS1-214ENST00000435348 SMAD3P84022 425 aaKnown RBP12.38□□□□□ -0.43
TTC28-AS1-214ENST00000435348 MAP3K21Q5TCX8 1036 aa12.38□□□□□ -0.43
TTC28-AS1-214ENST00000435348 IL27Q8NEV9 243 aa12.38□□□□□ -0.43
TTC28-AS1-214ENST00000435348 ZFP42Q96MM3 310 aa12.38□□□□□ -0.43
TTC28-AS1-214ENST00000435348 GJD2Q9UKL4 321 aa12.38□□□□□ -0.43
TTC28-AS1-214ENST00000435348 WASF2Q9Y6W5 498 aa12.38□□□□□ -0.43
TTC28-AS1-214ENST00000435348 EYSQ5T1H1 3165 aa12.38□□□□□ -0.43
TTC28-AS1-214ENST00000435348 PDE8BO95263 885 aa12.37□□□□□ -0.43
TTC28-AS1-214ENST00000435348 LDHBP07195 334 aaKnown RBP12.37□□□□□ -0.43
TTC28-AS1-214ENST00000435348 RGS3P49796 1198 aa12.37□□□□□ -0.43
TTC28-AS1-214ENST00000435348 CACNB2Q08289 660 aaPredicted RBP12.37□□□□□ -0.43
TTC28-AS1-214ENST00000435348 DIXDC1Q155Q3 683 aa12.37□□□□□ -0.43
TTC28-AS1-214ENST00000435348 BEND3Q5T5X7 828 aa12.37□□□□□ -0.43
TTC28-AS1-214ENST00000435348 RETREG3Q86VR2 466 aa12.37□□□□□ -0.43
TTC28-AS1-214ENST00000435348 PRDM5Q9NQX1 630 aaPredicted RBP12.37□□□□□ -0.43
TTC28-AS1-214ENST00000435348 PCDHGC3Q9UN70 934 aa12.37□□□□□ -0.43
TTC28-AS1-214ENST00000435348 MAST2Q6P0Q8 1798 aa12.36□□□□□ -0.43
TTC28-AS1-214ENST00000435348 F6X3S4 739 aa12.36□□□□□ -0.43
TTC28-AS1-214ENST00000435348 ENTPD3O75355 529 aa12.36□□□□□ -0.43
TTC28-AS1-214ENST00000435348 XRCC5P13010 732 aaKnown RBP12.36□□□□□ -0.43
TTC28-AS1-214ENST00000435348 CCND3P30281 292 aaPredicted RBP12.36□□□□□ -0.43
TTC28-AS1-214ENST00000435348 RGS2P41220 211 aa12.36□□□□□ -0.43
TTC28-AS1-214ENST00000435348 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP12.36□□□□□ -0.43
TTC28-AS1-214ENST00000435348 SHHQ15465 462 aa12.36□□□□□ -0.43
TTC28-AS1-214ENST00000435348 CCDC84Q86UT8 332 aaPredicted RBP12.36□□□□□ -0.43
TTC28-AS1-214ENST00000435348 TBC1D2Q9BYX2 928 aa12.36□□□□□ -0.43
TTC28-AS1-214ENST00000435348 ASCC2Q9H1I8 757 aaPredicted RBP12.36□□□□□ -0.43
TTC28-AS1-214ENST00000435348 SPTBN5Q9NRC6 3674 aaKnown RBP12.35□□□□□ -0.43
TTC28-AS1-214ENST00000435348 SLC5A1P13866 664 aa12.35□□□□□ -0.43
TTC28-AS1-214ENST00000435348 PRDX5P30044 214 aa12.35□□□□□ -0.43
TTC28-AS1-214ENST00000435348 HMGCS2P54868 508 aa12.35□□□□□ -0.43
TTC28-AS1-214ENST00000435348 SPP2Q13103 211 aa12.35□□□□□ -0.43
TTC28-AS1-214ENST00000435348 PICALMQ13492 652 aa12.35□□□□□ -0.43
TTC28-AS1-214ENST00000435348 SLC4A10Q6U841 1118 aa12.35□□□□□ -0.43
TTC28-AS1-214ENST00000435348 ZFPM1Q8IX07 1006 aa12.35□□□□□ -0.43
TTC28-AS1-214ENST00000435348 ZNF280CQ8ND82 737 aa12.35□□□□□ -0.43
TTC28-AS1-214ENST00000435348 TTYH1Q9H313 450 aaPredicted RBP12.35□□□□□ -0.43
TTC28-AS1-214ENST00000435348 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP12.35□□□□□ -0.43
TTC28-AS1-214ENST00000435348 FRMD4AQ9P2Q2 1039 aaPredicted RBP12.35□□□□□ -0.43
TTC28-AS1-214ENST00000435348 ATP11BQ9Y2G3 1177 aa12.35□□□□□ -0.43
TTC28-AS1-214ENST00000435348 KIF16BQ96L93 1317 aa12.35□□□□□ -0.43
TTC28-AS1-214ENST00000435348 PHIPQ8WWQ0 1821 aa12.34□□□□□ -0.43
TTC28-AS1-214ENST00000435348 CACNA1FO60840 1977 aa12.34□□□□□ -0.43
TTC28-AS1-214ENST00000435348 ATRNL1Q5VV63 1379 aa12.34□□□□□ -0.43
TTC28-AS1-214ENST00000435348 LOC285556D6RIA3 1793 aa12.34□□□□□ -0.43
TTC28-AS1-214ENST00000435348 MSCO60682 206 aa12.34□□□□□ -0.43
TTC28-AS1-214ENST00000435348 CNGA1P29973 690 aa12.34□□□□□ -0.43
TTC28-AS1-214ENST00000435348 MAPK4P31152 587 aa12.34□□□□□ -0.43
TTC28-AS1-214ENST00000435348 RTP1P59025 263 aa12.34□□□□□ -0.43
TTC28-AS1-214ENST00000435348 LRRC24Q50LG9 513 aa12.34□□□□□ -0.43
TTC28-AS1-214ENST00000435348 GPRC5AQ8NFJ5 357 aa12.34□□□□□ -0.43
TTC28-AS1-214ENST00000435348 SUCLG2Q96I99 432 aa12.34□□□□□ -0.43
TTC28-AS1-214ENST00000435348 APBA2Q99767 749 aa12.34□□□□□ -0.43
TTC28-AS1-214ENST00000435348 IDI2Q9BXS1 227 aa12.34□□□□□ -0.43
TTC28-AS1-214ENST00000435348 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP12.34□□□□□ -0.43
TTC28-AS1-214ENST00000435348 AS3MTQ9HBK9 375 aa12.34□□□□□ -0.43
TTC28-AS1-214ENST00000435348 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP12.34□□□□□ -0.43
TTC28-AS1-214ENST00000435348 TMOD4Q9NZQ9 345 aa12.34□□□□□ -0.43
TTC28-AS1-214ENST00000435348 PLXNB2O15031 1838 aa12.33□□□□□ -0.44
TTC28-AS1-214ENST00000435348 ALDH1L1O75891 902 aa12.33□□□□□ -0.44
TTC28-AS1-214ENST00000435348 MAP3K12Q12852 859 aa12.33□□□□□ -0.44
TTC28-AS1-214ENST00000435348 C9orf50Q5SZB4 431 aa12.33□□□□□ -0.44
TTC28-AS1-214ENST00000435348 MFSD14CQ5VZR4 134 aa12.33□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 60.7 ms