RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000426683.5

HERC3-205, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

TSL 4

Gene HERC3, Length 559 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-205ENST00000426683 FAM110CQ1W6H9 321 aa21.38■■□□□ 1.01
HERC3-205ENST00000426683 SPICE1Q8N0Z3 855 aa21.38■■□□□ 1.01
HERC3-205ENST00000426683 CEP95Q96GE4 821 aa21.38■■□□□ 1.01
HERC3-205ENST00000426683 TOMM22Q9NS69 142 aa21.38■■□□□ 1.01
HERC3-205ENST00000426683 PPP4R2Q9NY27 417 aa21.38■■□□□ 1.01
HERC3-205ENST00000426683 PTPN22Q9Y2R2 807 aa21.38■■□□□ 1.01
HERC3-205ENST00000426683 TSPY2A6NKD2 308 aa21.37■■□□□ 1.01
HERC3-205ENST00000426683 ZNF213O14771 459 aa21.37■■□□□ 1.01
HERC3-205ENST00000426683 ORC4O43929 436 aa21.37■■□□□ 1.01
HERC3-205ENST00000426683 RAD21O60216 631 aa21.37■■□□□ 1.01
HERC3-205ENST00000426683 RANBP6O60518 1105 aaKnown RBP21.37■■□□□ 1.01
HERC3-205ENST00000426683 FGRP09769 529 aa21.37■■□□□ 1.01
HERC3-205ENST00000426683 BMP2KLQ5H9B9 411 aa21.37■■□□□ 1.01
HERC3-205ENST00000426683 TRIM47Q96LD4 638 aa21.37■■□□□ 1.01
HERC3-205ENST00000426683 GOPCQ9HD26 462 aa21.37■■□□□ 1.01
HERC3-205ENST00000426683 MTMR4Q9NYA4 1195 aa21.37■■□□□ 1.01
HERC3-205ENST00000426683 CLIP2Q9UDT6 1046 aa21.37■■□□□ 1.01
HERC3-205ENST00000426683 GREB1LQ9C091 1923 aaPredicted RBP21.37■■□□□ 1.01
HERC3-205ENST00000426683 CAPN15O75808 1086 aa21.36■■□□□ 1.01
HERC3-205ENST00000426683 GNRH1P01148 92 aa21.36■■□□□ 1.01
HERC3-205ENST00000426683 FCGRTP55899 365 aa21.36■■□□□ 1.01
HERC3-205ENST00000426683 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP21.36■■□□□ 1.01
HERC3-205ENST00000426683 IFFO2Q5TF58 517 aa21.36■■□□□ 1.01
HERC3-205ENST00000426683 TBC1D10CQ8IV04 446 aa21.36■■□□□ 1.01
HERC3-205ENST00000426683 GTF3C2Q8WUA4 911 aaPredicted RBP21.36■■□□□ 1.01
HERC3-205ENST00000426683 TANGO6Q9C0B7 1094 aa21.36■■□□□ 1.01
HERC3-205ENST00000426683 NBPF3Q9H094 633 aa21.36■■□□□ 1.01
HERC3-205ENST00000426683 MORF4L1Q9UBU8 362 aa21.36■■□□□ 1.01
HERC3-205ENST00000426683 HPS5Q9UPZ3 1129 aa21.36■■□□□ 1.01
HERC3-205ENST00000426683 WDR46O15213 610 aaKnown RBP21.35■■□□□ 1.01
HERC3-205ENST00000426683 SGSM2O43147 1006 aa21.35■■□□□ 1.01
HERC3-205ENST00000426683 PEX10O60683 326 aa21.35■■□□□ 1.01
HERC3-205ENST00000426683 TTLL1O95922 423 aa21.35■■□□□ 1.01
HERC3-205ENST00000426683 AKNAD1Q5T1N1 836 aa21.35■■□□□ 1.01
HERC3-205ENST00000426683 MFSD6Q6ZSS7 791 aa21.35■■□□□ 1.01
HERC3-205ENST00000426683 STAG1Q8WVM7 1258 aa21.35■■□□□ 1.01
HERC3-205ENST00000426683 PAGR1Q9BTK6 254 aa21.35■■□□□ 1.01
HERC3-205ENST00000426683 TXNRD2Q9NNW7 524 aa21.35■■□□□ 1.01
HERC3-205ENST00000426683 RBPJLQ9UBG7 517 aa21.35■■□□□ 1.01
HERC3-205ENST00000426683 CTNNA3Q9UI47 895 aa21.35■■□□□ 1.01
HERC3-205ENST00000426683 ZSWIM8A7E2V4 1837 aa21.34■■□□□ 1.01
HERC3-205ENST00000426683 PCP11498 1178 aaKnown RBP21.34■■□□□ 1.01
HERC3-205ENST00000426683 HOXD10P28358 340 aa21.34■■□□□ 1.01
HERC3-205ENST00000426683 IMMTQ16891 758 aaKnown RBP21.34■■□□□ 1.01
HERC3-205ENST00000426683 POTEEQ6S8J3 1075 aa21.34■■□□□ 1.01
HERC3-205ENST00000426683 GPRC5AQ8NFJ5 357 aa21.34■■□□□ 1.01
HERC3-205ENST00000426683 RNF41Q9H4P4 317 aaPredicted RBP21.34■■□□□ 1.01
HERC3-205ENST00000426683 CCDC85CA6NKD9 419 aa21.33■■□□□ 1.01
HERC3-205ENST00000426683 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP21.33■■□□□ 1.01
HERC3-205ENST00000426683 TNPO2O14787 897 aaKnown RBP21.33■■□□□ 1.01
HERC3-205ENST00000426683 PTH1RQ03431 593 aa21.33■■□□□ 1.01
HERC3-205ENST00000426683 COG2Q14746 738 aa21.33■■□□□ 1.01
HERC3-205ENST00000426683 LRRC47Q8N1G4 583 aaKnown RBP21.33■■□□□ 1.01
HERC3-205ENST00000426683 MKL1Q969V6 931 aa21.33■■□□□ 1.01
HERC3-205ENST00000426683 SRRDQ9UH36 339 aa21.33■■□□□ 1.01
HERC3-205ENST00000426683 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa21.33■■□□□ 1.01
HERC3-205ENST00000426683 F5H6K3 240 aa21.32■■□□□ 1
HERC3-205ENST00000426683 NMT2O60551 498 aa21.32■■□□□ 1
HERC3-205ENST00000426683 FLOT1O75955 427 aa21.32■■□□□ 1
HERC3-205ENST00000426683 NDUFB10O96000 172 aa21.32■■□□□ 1
HERC3-205ENST00000426683 PRMT2P55345 433 aa21.32■■□□□ 1
HERC3-205ENST00000426683 ERVK-9P63128 1117 aa21.32■■□□□ 1
HERC3-205ENST00000426683 ERVK-24P63145 666 aa21.32■■□□□ 1
HERC3-205ENST00000426683 KLRC3Q07444 240 aa21.32■■□□□ 1
HERC3-205ENST00000426683 Q3C1V9 767 aa21.32■■□□□ 1
HERC3-205ENST00000426683 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa21.32■■□□□ 1
HERC3-205ENST00000426683 FAM83BQ5T0W9 1011 aa21.32■■□□□ 1
HERC3-205ENST00000426683 LBX2Q6XYB7 198 aa21.32■■□□□ 1
HERC3-205ENST00000426683 IL17RBQ9NRM6 502 aa21.32■■□□□ 1
HERC3-205ENST00000426683 HOXC10Q9NYD6 342 aa21.32■■□□□ 1
HERC3-205ENST00000426683 STX8Q9UNK0 236 aa21.32■■□□□ 1
HERC3-205ENST00000426683 RABGAP1Q9Y3P9 1069 aa21.32■■□□□ 1
HERC3-205ENST00000426683 NEDD4P46934 1319 aa21.31■■□□□ 1
HERC3-205ENST00000426683 MYPNQ86TC9 1320 aa21.31■■□□□ 1
HERC3-205ENST00000426683 CNMDO75829 334 aa21.31■■□□□ 1
HERC3-205ENST00000426683 DSG3P32926 999 aa21.31■■□□□ 1
HERC3-205ENST00000426683 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa21.31■■□□□ 1
HERC3-205ENST00000426683 PRKCZQ05513 592 aa21.3■■□□□ 1
HERC3-205ENST00000426683 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP21.3■■□□□ 1
HERC3-205ENST00000426683 COA7Q96BR5 231 aa21.3■■□□□ 1
HERC3-205ENST00000426683 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP21.3■■□□□ 1
HERC3-205ENST00000426683 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa21.3■■□□□ 1
HERC3-205ENST00000426683 SLFN13Q68D06 897 aa21.29■■□□□ 1
HERC3-205ENST00000426683 GMCL1P1Q8NEA9 526 aa21.29■■□□□ 1
HERC3-205ENST00000426683 NKX2-3Q8TAU0 364 aa21.29■■□□□ 1
HERC3-205ENST00000426683 RAET1EQ8TD07 263 aa21.29■■□□□ 1
HERC3-205ENST00000426683 ESR2Q92731 530 aa21.29■■□□□ 1
HERC3-205ENST00000426683 ATG4CQ96DT6 458 aa21.29■■□□□ 1
HERC3-205ENST00000426683 TCP11L1Q9NUJ3 509 aa21.29■■□□□ 1
HERC3-205ENST00000426683 FBXO28Q9NVF7 368 aa21.29■■□□□ 1
HERC3-205ENST00000426683 BTBD7Q9P203 1132 aa21.29■■□□□ 1
HERC3-205ENST00000426683 GABRQQ9UN88 632 aa21.29■■□□□ 1
HERC3-205ENST00000426683 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP21.29■■□□□ 1
HERC3-205ENST00000426683 NOVP48745 357 aa21.28■■□□□ 1
HERC3-205ENST00000426683 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa21.28■■□□□ 1
HERC3-205ENST00000426683 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP21.28■■□□□ 1
HERC3-205ENST00000426683 PORCNQ9H237 461 aa21.28■■□□□ 1
HERC3-205ENST00000426683 CDC45O75419 566 aa21.27■■□□□ 1
HERC3-205ENST00000426683 FLT3LGP49771 235 aa21.27■■□□□ 1
HERC3-205ENST00000426683 NT5C2P49902 561 aa21.27■■□□□ 1
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