RNA–Protein interactions for RNA: YNL057W

YNL057W, Transcript of Dubious open reading frame, yeast

Gene YNL057W, Length 333 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YNL057W	YNL057W	CWC2	Q12046	339 aa	Predicted RBP	4.47	□□□□□ -1.69
YNL057W	YNL057W	YPL066W	Q12194	479 aa		4.47	□□□□□ -1.69
YNL057W	YNL057W	YDR262W	Q12331	272 aa		4.47	□□□□□ -1.69
YNL057W	YNL057W	DDP1	Q99321	188 aa	Known RBP	4.47	□□□□□ -1.69
YNL057W	YNL057W	UBR1	P19812	1950 aa		4.47	□□□□□ -1.69
YNL057W	YNL057W	EST1	P17214	699 aa	Predicted RBP	4.46	□□□□□ -1.7
YNL057W	YNL057W	GAL11	P19659	1081 aa		4.46	□□□□□ -1.7
YNL057W	YNL057W	SCL1	P21243	252 aa	Known RBP	4.46	□□□□□ -1.7
YNL057W	YNL057W	KIP2	P28743	706 aa		4.46	□□□□□ -1.7
YNL057W	YNL057W	MVD1	P32377	396 aa	Known RBP	4.46	□□□□□ -1.7
YNL057W	YNL057W	AIM26	P32858	118 aa		4.46	□□□□□ -1.7
YNL057W	YNL057W	MRS6	P32864	603 aa	Known RBP	4.46	□□□□□ -1.7
YNL057W	YNL057W	SEF1	P34228	1148 aa		4.46	□□□□□ -1.7
YNL057W	YNL057W	YET1	P35723	206 aa		4.46	□□□□□ -1.7
YNL057W	YNL057W	RRT5	P43607	289 aa		4.46	□□□□□ -1.7
YNL057W	YNL057W	SIP4	P46954	829 aa		4.46	□□□□□ -1.7
YNL057W	YNL057W	IKS1	P47042	667 aa		4.46	□□□□□ -1.7
YNL057W	YNL057W	PCL10	P53124	433 aa		4.46	□□□□□ -1.7
YNL057W	YNL057W	RPL34A	P87262	121 aa	Predicted RBP	4.46	□□□□□ -1.7
YNL057W	YNL057W	YOL024W	Q08172	172 aa		4.46	□□□□□ -1.7
YNL057W	YNL057W	PGC1	Q08959	321 aa		4.46	□□□□□ -1.7
YNL057W	YNL057W	RRP6	Q12149	733 aa	Known RBP	4.46	□□□□□ -1.7
YNL057W	YNL057W	OCA6	Q12454	224 aa		4.46	□□□□□ -1.7
YNL057W	YNL057W	YOR338W	Q99326	363 aa		4.46	□□□□□ -1.7
YNL057W	YNL057W	TUB3	P09734	445 aa	Known RBP	4.45	□□□□□ -1.7
YNL057W	YNL057W	UBA1	P22515	1024 aa	Known RBP	4.45	□□□□□ -1.7
YNL057W	YNL057W	YCR006C	P25350	157 aa		4.45	□□□□□ -1.7
YNL057W	YNL057W	HXT3	P32466	567 aa	Known RBP	4.45	□□□□□ -1.7
YNL057W	YNL057W	PET309	P32522	965 aa	Predicted RBP	4.45	□□□□□ -1.7
YNL057W	YNL057W	TAF14	P35189	244 aa		4.45	□□□□□ -1.7
YNL057W	YNL057W	TFA2	P36145	328 aa		4.45	□□□□□ -1.7
YNL057W	YNL057W	ADE17	P38009	592 aa	Known RBP	4.45	□□□□□ -1.7
YNL057W	YNL057W	SWC5	P38326	303 aa		4.45	□□□□□ -1.7
YNL057W	YNL057W	YBR259W	P38338	688 aa		4.45	□□□□□ -1.7
YNL057W	YNL057W	BIT2	P38346	545 aa		4.45	□□□□□ -1.7
YNL057W	YNL057W	YHL041W	P38730	149 aa		4.45	□□□□□ -1.7
YNL057W	YNL057W	YHL008C	P38750	627 aa		4.45	□□□□□ -1.7
YNL057W	YNL057W	CCT6	P39079	546 aa		4.45	□□□□□ -1.7
YNL057W	YNL057W	TMN3	P40071	706 aa		4.45	□□□□□ -1.7
YNL057W	YNL057W	ATM1	P40416	690 aa		4.45	□□□□□ -1.7
YNL057W	YNL057W	MKT1	P40850	830 aa	Known RBP	4.45	□□□□□ -1.7
YNL057W	YNL057W	MNN11	P46985	422 aa	Known RBP	4.45	□□□□□ -1.7
YNL057W	YNL057W	YJL132W	P47014	750 aa		4.45	□□□□□ -1.7
YNL057W	YNL057W	BIR1	P47134	954 aa		4.45	□□□□□ -1.7
YNL057W	YNL057W	TCB2	P48231	1178 aa		4.45	□□□□□ -1.7
YNL057W	YNL057W	YGL108C	P53139	140 aa		4.45	□□□□□ -1.7
YNL057W	YNL057W	YGR127W	P53275	312 aa		4.45	□□□□□ -1.7
YNL057W	YNL057W	SXM1	Q04175	944 aa	Known RBP	4.45	□□□□□ -1.7
YNL057W	YNL057W	GFD1	Q04839	188 aa	Known RBP	4.45	□□□□□ -1.7
YNL057W	YNL057W	YDR222W	Q04925	415 aa		4.45	□□□□□ -1.7
YNL057W	YNL057W	YPR078C	Q06813	372 aa		4.45	□□□□□ -1.7
YNL057W	YNL057W	YPR097W	Q06839	1073 aa		4.45	□□□□□ -1.7
YNL057W	YNL057W	PLB3	Q08108	686 aa		4.45	□□□□□ -1.7
YNL057W	YNL057W	CIR2	Q08822	631 aa		4.45	□□□□□ -1.7
YNL057W	YNL057W	TMS1	Q12116	473 aa		4.45	□□□□□ -1.7
YNL057W	YNL057W	GPM3	Q12326	303 aa		4.45	□□□□□ -1.7
YNL057W	YNL057W	EFG1	Q3E705	233 aa	Known RBP	4.45	□□□□□ -1.7
YNL057W	YNL057W	SEY1	Q99287	776 aa		4.45	□□□□□ -1.7
YNL057W	YNL057W	COX5A	P00424	153 aa		4.44	□□□□□ -1.7
YNL057W	YNL057W	HOP1	P20050	605 aa		4.44	□□□□□ -1.7
YNL057W	YNL057W	EPT1	P22140	391 aa		4.44	□□□□□ -1.7
YNL057W	YNL057W	TRX1	P22217	103 aa	Known RBP	4.44	□□□□□ -1.7
YNL057W	YNL057W	AAT2	P23542	418 aa	Known RBP	4.44	□□□□□ -1.7
YNL057W	YNL057W	DCC1	P25559	380 aa		4.44	□□□□□ -1.7
YNL057W	YNL057W	RFA2	P26754	273 aa	Known RBP	4.44	□□□□□ -1.7
YNL057W	YNL057W	SQT1	P35184	431 aa		4.44	□□□□□ -1.7
YNL057W	YNL057W	EMC3	P36039	253 aa		4.44	□□□□□ -1.7
YNL057W	YNL057W	IML3	P38265	245 aa		4.44	□□□□□ -1.7
YNL057W	YNL057W	DED81	P38707	554 aa	Known RBP	4.44	□□□□□ -1.7
YNL057W	YNL057W	MIP6	P38760	659 aa	Known RBP	4.44	□□□□□ -1.7
YNL057W	YNL057W	CYC2	P38909	366 aa		4.44	□□□□□ -1.7
YNL057W	YNL057W	TIM17	P39515	158 aa		4.44	□□□□□ -1.7
YNL057W	YNL057W	KHA1	P40309	873 aa		4.44	□□□□□ -1.7
YNL057W	YNL057W	CCT5	P40413	562 aa	Known RBP	4.44	□□□□□ -1.7
YNL057W	YNL057W	SSU1	P41930	458 aa		4.44	□□□□□ -1.7
YNL057W	YNL057W	ROK1	P45818	564 aa	Predicted RBP	4.44	□□□□□ -1.7
YNL057W	YNL057W	ROM1	P53046	1155 aa		4.44	□□□□□ -1.7
YNL057W	YNL057W	HST2	P53686	357 aa		4.44	□□□□□ -1.7
YNL057W	YNL057W	TGL2	P54857	326 aa		4.44	□□□□□ -1.7
YNL057W	YNL057W	CDC55	Q00362	526 aa		4.44	□□□□□ -1.7
YNL057W	YNL057W	YMR160W	Q03823	816 aa		4.44	□□□□□ -1.7
YNL057W	YNL057W	ARX1	Q03862	593 aa	Known RBP	4.44	□□□□□ -1.7
YNL057W	YNL057W	VID22	Q05934	901 aa		4.44	□□□□□ -1.7
YNL057W	YNL057W	PFA4	Q12006	378 aa		4.44	□□□□□ -1.7
YNL057W	YNL057W	HOG1	P32485	435 aa		4.43	□□□□□ -1.7
YNL057W	YNL057W	CDC13	P32797	924 aa	Known RBP	4.43	□□□□□ -1.7
YNL057W	YNL057W	CTP1	P38152	299 aa		4.43	□□□□□ -1.7
YNL057W	YNL057W	LYS1	P38998	373 aa	RIP-Chip data	4.43	□□□□□ -1.7	not detected
YNL057W	YNL057W	MMM1	P41800	426 aa		4.43	□□□□□ -1.7
YNL057W	YNL057W	TES1	P41903	349 aa	Known RBP	4.43	□□□□□ -1.7
YNL057W	YNL057W	YFR018C	P43599	363 aa		4.43	□□□□□ -1.7
YNL057W	YNL057W	YJR030C	P47101	745 aa		4.43	□□□□□ -1.7
YNL057W	YNL057W	TAD1	P53065	400 aa		4.43	□□□□□ -1.7
YNL057W	YNL057W	YGR111W	P53265	400 aa		4.43	□□□□□ -1.7
YNL057W	YNL057W	ARE2	P53629	642 aa	Known RBP	4.43	□□□□□ -1.7
YNL057W	YNL057W	HBT1	Q07653	1046 aa	Known RBP	4.43	□□□□□ -1.7
YNL057W	YNL057W	NEW1	Q08972	1196 aa	Known RBP	4.43	□□□□□ -1.7
YNL057W	YNL057W	RRP12	Q12754	1228 aa	Known RBP	4.43	□□□□□ -1.7
YNL057W	YNL057W	IZH4	Q99393	312 aa		4.43	□□□□□ -1.7
YNL057W	YNL057W	CDC9	P04819	755 aa		4.42	□□□□□ -1.7

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 61.7 ms