RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000597315.5

BRD4-208, Transcript of bromodomain containing 4, human

TSL 5

Gene BRD4, Length 892 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BRD4-208	ENST00000597315	BCR	P11274	1271 aa		32.2	■■■□□ 2.75
BRD4-208	ENST00000597315	PSMC4	P43686	418 aa		32.2	■■■□□ 2.75
BRD4-208	ENST00000597315	ASCC2	Q9H1I8	757 aa	Predicted RBP	32.2	■■■□□ 2.75
BRD4-208	ENST00000597315	GCLC	P48506	637 aa	Predicted RBP	32.19	■■■□□ 2.74
BRD4-208	ENST00000597315	TICAM2	Q86XR7	235 aa		32.19	■■■□□ 2.74
BRD4-208	ENST00000597315	IFNL3	Q8IZI9	196 aa		32.19	■■■□□ 2.74
BRD4-208	ENST00000597315	ARHGAP39	Q9C0H5	1083 aa		32.19	■■■□□ 2.74
BRD4-208	ENST00000597315	OSBPL3	Q9H4L5	887 aa		32.19	■■■□□ 2.74
BRD4-208	ENST00000597315	MKNK2	Q9HBH9	465 aa		32.19	■■■□□ 2.74
BRD4-208	ENST00000597315	ZNF287	Q9HBT7	754 aa		32.19	■■■□□ 2.74
BRD4-208	ENST00000597315	FCGRT	P55899	365 aa		32.18	■■■□□ 2.74
BRD4-208	ENST00000597315	ANKRD13C	Q8N6S4	541 aa		32.18	■■■□□ 2.74
BRD4-208	ENST00000597315	KIAA1683	Q9H0B3	1180 aa		32.18	■■■□□ 2.74
BRD4-208	ENST00000597315	NAPB	Q9H115	298 aa		32.18	■■■□□ 2.74
BRD4-208	ENST00000597315	HELLS	Q9NRZ9	838 aa		32.18	■■■□□ 2.74
BRD4-208	ENST00000597315	HOXA7	P31268	230 aa	Predicted RBP	32.17	■■■□□ 2.74
BRD4-208	ENST00000597315	PRMT2	P55345	433 aa		32.17	■■■□□ 2.74
BRD4-208	ENST00000597315	STK11IP	Q8N1F8	1099 aa		32.17	■■■□□ 2.74
BRD4-208	ENST00000597315	ARHGEF10L	Q9HCE6	1279 aa		32.17	■■■□□ 2.74
BRD4-208	ENST00000597315	EMILIN3	Q9NT22	766 aa		32.17	■■■□□ 2.74
BRD4-208	ENST00000597315	MYH8	P13535	1937 aa		32.17	■■■□□ 2.74
BRD4-208	ENST00000597315	AKR1B1	P15121	316 aa		32.16	■■■□□ 2.74
BRD4-208	ENST00000597315	ACER1	Q8TDN7	264 aa		32.16	■■■□□ 2.74
BRD4-208	ENST00000597315	SH2D4A	Q9H788	454 aa		32.16	■■■□□ 2.74
BRD4-208	ENST00000597315	EPB41L4A	Q9HCS5	686 aa	Predicted RBP	32.16	■■■□□ 2.74
BRD4-208	ENST00000597315	SLC3A2	P08195	630 aa	Known RBP	32.15	■■■□□ 2.74
BRD4-208	ENST00000597315	GUCY1A2	P33402	732 aa		32.15	■■■□□ 2.74
BRD4-208	ENST00000597315	C12orf42	Q96LP6	360 aa		32.15	■■■□□ 2.74
BRD4-208	ENST00000597315	SMIM22	K7EJ46	135 aa		32.14	■■■□□ 2.74
BRD4-208	ENST00000597315	CAP1	Q01518	475 aa		32.14	■■■□□ 2.74
BRD4-208	ENST00000597315	ICA1	Q05084	483 aa		32.14	■■■□□ 2.74
BRD4-208	ENST00000597315	FAM110C	Q1W6H9	321 aa		32.14	■■■□□ 2.74
BRD4-208	ENST00000597315	CCDC129	Q6ZRS4	1044 aa		32.14	■■■□□ 2.74
BRD4-208	ENST00000597315	TRIM47	Q96LD4	638 aa		32.14	■■■□□ 2.74
BRD4-208	ENST00000597315	USP17L15	C9J2P7	530 aa		32.13	■■■□□ 2.73
BRD4-208	ENST00000597315	USP17L13	C9JLJ4	530 aa		32.13	■■■□□ 2.73
BRD4-208	ENST00000597315	USP17L11	C9JVI0	530 aa		32.13	■■■□□ 2.73
BRD4-208	ENST00000597315	USP17L18	D6R9N7	530 aa		32.13	■■■□□ 2.73
BRD4-208	ENST00000597315	USP17L22	D6RA61	530 aa		32.13	■■■□□ 2.73
BRD4-208	ENST00000597315	USP17L17	D6RBQ6	530 aa		32.13	■■■□□ 2.73
BRD4-208	ENST00000597315	USP17L19	D6RCP7	530 aa		32.13	■■■□□ 2.73
BRD4-208	ENST00000597315	USP17L20	D6RJB6	530 aa		32.13	■■■□□ 2.73
BRD4-208	ENST00000597315	USP17L24	Q0WX57	530 aa		32.13	■■■□□ 2.73
BRD4-208	ENST00000597315	MCMDC2	Q4G0Z9	681 aa		32.13	■■■□□ 2.73
BRD4-208	ENST00000597315	PTCH2	Q9Y6C5	1203 aa		32.13	■■■□□ 2.73
BRD4-208	ENST00000597315	ATP2B2	Q01814	1243 aa		32.12	■■■□□ 2.73
BRD4-208	ENST00000597315	NBPF11	Q86T75	865 aa		32.12	■■■□□ 2.73
BRD4-208	ENST00000597315	GTF3C2	Q8WUA4	911 aa	Predicted RBP	32.12	■■■□□ 2.73
BRD4-208	ENST00000597315	P2RX7	Q99572	595 aa	Known RBP	32.12	■■■□□ 2.73
BRD4-208	ENST00000597315	SRRD	Q9UH36	339 aa		32.12	■■■□□ 2.73
BRD4-208	ENST00000597315	SLC9C1	Q4G0N8	1177 aa		32.11	■■■□□ 2.73
BRD4-208	ENST00000597315	ZNF444	Q8N0Y2	327 aa	Predicted RBP	32.11	■■■□□ 2.73
BRD4-208	ENST00000597315	RAET1E	Q8TD07	263 aa		32.11	■■■□□ 2.73
BRD4-208	ENST00000597315	KANSL2	Q9H9L4	492 aa		32.11	■■■□□ 2.73
BRD4-208	ENST00000597315	ROBO3	Q96MS0	1386 aa		32.1	■■■□□ 2.73
BRD4-208	ENST00000597315	MYPN	Q86TC9	1320 aa		32.1	■■■□□ 2.73
BRD4-208	ENST00000597315	TNPO2	O14787	897 aa	Known RBP	32.1	■■■□□ 2.73
BRD4-208	ENST00000597315	VCAM1	P19320	739 aa		32.1	■■■□□ 2.73
BRD4-208	ENST00000597315	MFAP1	P55081	439 aa	Known RBP	32.1	■■■□□ 2.73
BRD4-208	ENST00000597315	HERVK_113	P62684	666 aa		32.1	■■■□□ 2.73
BRD4-208	ENST00000597315	PDE4B	Q07343	736 aa		32.1	■■■□□ 2.73
BRD4-208	ENST00000597315	FAM227B	Q96M60	508 aa		32.1	■■■□□ 2.73
BRD4-208	ENST00000597315	SOX10	P56693	466 aa		32.09	■■■□□ 2.73
BRD4-208	ENST00000597315	NMI	Q13287	307 aa	Predicted RBP	32.09	■■■□□ 2.73
BRD4-208	ENST00000597315	COA7	Q96BR5	231 aa		32.09	■■■□□ 2.73
BRD4-208	ENST00000597315	DIAPH3	Q9NSV4	1193 aa		32.09	■■■□□ 2.73
BRD4-208	ENST00000597315		A0A0D9SFI3	127 aa		32.08	■■■□□ 2.73
BRD4-208	ENST00000597315	HIP1	O00291	1037 aa		32.08	■■■□□ 2.73
BRD4-208	ENST00000597315	CTGF	P29279	349 aa		32.08	■■■□□ 2.73
BRD4-208	ENST00000597315	CCAR1	Q8IX12	1150 aa	Known RBP	32.08	■■■□□ 2.73
BRD4-208	ENST00000597315	RPAP3	Q9H6T3	665 aa	Predicted RBP	32.08	■■■□□ 2.73
BRD4-208	ENST00000597315	SDS	P20132	328 aa		32.07	■■■□□ 2.72
BRD4-208	ENST00000597315	PPARA	Q07869	468 aa		32.07	■■■□□ 2.72
BRD4-208	ENST00000597315	ZSWIM8	A7E2V4	1837 aa		32.07	■■■□□ 2.72
BRD4-208	ENST00000597315		A0A1W2PRG0	241 aa		32.06	■■■□□ 2.72
BRD4-208	ENST00000597315	RASA1	P20936	1047 aa		32.06	■■■□□ 2.72
BRD4-208	ENST00000597315	CATSPERG	Q6ZRH7	1159 aa		32.06	■■■□□ 2.72
BRD4-208	ENST00000597315	CLEC10A	Q8IUN9	316 aa		32.06	■■■□□ 2.72
BRD4-208	ENST00000597315	GPRC5A	Q8NFJ5	357 aa		32.06	■■■□□ 2.72
BRD4-208	ENST00000597315	LPAR1	Q92633	364 aa		32.06	■■■□□ 2.72
BRD4-208	ENST00000597315	PAGR1	Q9BTK6	254 aa		32.06	■■■□□ 2.72
BRD4-208	ENST00000597315	TMX2	Q9Y320	296 aa		32.06	■■■□□ 2.72
BRD4-208	ENST00000597315	EEF2	P13639	858 aa	Known RBP	32.05	■■■□□ 2.72
BRD4-208	ENST00000597315	TANGO6	Q9C0B7	1094 aa		32.05	■■■□□ 2.72
BRD4-208	ENST00000597315	MORF4L1	Q9UBU8	362 aa		32.05	■■■□□ 2.72
BRD4-208	ENST00000597315	RAD21	O60216	631 aa		32.04	■■■□□ 2.72
BRD4-208	ENST00000597315	PRDM1	O75626	825 aa		32.04	■■■□□ 2.72
BRD4-208	ENST00000597315	PRKCZ	Q05513	592 aa		32.04	■■■□□ 2.72
BRD4-208	ENST00000597315	CWC22	Q9HCG8	908 aa	Known RBP	32.04	■■■□□ 2.72
BRD4-208	ENST00000597315	GOPC	Q9HD26	462 aa		32.04	■■■□□ 2.72
BRD4-208	ENST00000597315	CCDC171	Q6TFL3	1326 aa		32.03	■■■□□ 2.72
BRD4-208	ENST00000597315	PDE4A	P27815	886 aa		32.03	■■■□□ 2.72
BRD4-208	ENST00000597315	VPS53	Q5VIR6	699 aa		32.03	■■■□□ 2.72
BRD4-208	ENST00000597315	ARMC5	Q96C12	935 aa		32.03	■■■□□ 2.72
BRD4-208	ENST00000597315	VCPKMT	Q9H867	229 aa		32.03	■■■□□ 2.72
BRD4-208	ENST00000597315	TSPY3	P0CV98	308 aa		32.02	■■■□□ 2.72
BRD4-208	ENST00000597315	TSPY8	P0CW00	308 aa		32.02	■■■□□ 2.72
BRD4-208	ENST00000597315	BIN2	Q9UBW5	565 aa	Predicted RBP	32.02	■■■□□ 2.72
BRD4-208	ENST00000597315	MGAM	O43451	1857 aa		32.01	■■■□□ 2.72
BRD4-208	ENST00000597315	ALX1	Q15699	326 aa		32.01	■■■□□ 2.71

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