RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516653.1

RNU6-113P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 113, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-113P, Length 101 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-113P-201ENST00000516653 ZNF552Q9H707 407 aaPredicted RBP2.78□□□□□ -1.96
RNU6-113P-201ENST00000516653 C1orf115Q9H7X2 142 aa2.78□□□□□ -1.96
RNU6-113P-201ENST00000516653 EGFL7Q9UHF1 273 aa2.78□□□□□ -1.96
RNU6-113P-201ENST00000516653 NDUFB5O43674 189 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-113P-201ENST00000516653 CST3P01034 146 aaPredicted RBP2.77□□□□□ -1.97
RNU6-113P-201ENST00000516653 NEFLP07196 543 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-113P-201ENST00000516653 RAC2P15153 192 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-113P-201ENST00000516653 GRK4P32298 578 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-113P-201ENST00000516653 KIR3DS1Q14943 382 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-113P-201ENST00000516653 WIPI1Q5MNZ9 446 aaPredicted RBP2.77□□□□□ -1.97
RNU6-113P-201ENST00000516653 TCERG1LQ5VWI1 586 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-113P-201ENST00000516653 DBX2Q6ZNG2 339 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-113P-201ENST00000516653 TMC7Q7Z402 723 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-113P-201ENST00000516653 DNAJB8Q8NHS0 232 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-113P-201ENST00000516653 TMC1Q8TDI8 760 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-113P-201ENST00000516653 PPP1R13LQ8WUF5 828 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-113P-201ENST00000516653 DACT3Q96B18 629 aaPredicted RBP2.77□□□□□ -1.97
RNU6-113P-201ENST00000516653 TJP2Q9UDY2 1190 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-113P-201ENST00000516653 MBD1Q9UIS9 605 aaPredicted RBP2.77□□□□□ -1.97
RNU6-113P-201ENST00000516653 YBX2Q9Y2T7 364 aaKnown RBP2.77□□□□□ -1.97
RNU6-113P-201ENST00000516653 PCDHA11Q9Y5I1 949 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-113P-201ENST00000516653 PNMA6FA0A0J9YX94 578 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-113P-201ENST00000516653 TEX51A0A1B0GUA7 166 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-113P-201ENST00000516653 SHISA3A0PJX4 238 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-113P-201ENST00000516653 PRICKLE3O43900 615 aaPredicted RBP2.76□□□□□ -1.97
RNU6-113P-201ENST00000516653 CAP2P40123 477 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-113P-201ENST00000516653 EGR3Q06889 387 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-113P-201ENST00000516653 KRTAP1-1Q07627 177 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-113P-201ENST00000516653 PDE3BQ13370 1112 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-113P-201ENST00000516653 DSC3Q14574 896 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-113P-201ENST00000516653 PCNX4Q63HM2 1172 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-113P-201ENST00000516653 TMEFF1Q8IYR6 380 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-113P-201ENST00000516653 CCDC82Q8N4S0 544 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-113P-201ENST00000516653 MFSD2AQ8NA29 543 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-113P-201ENST00000516653 TP53I13Q8NBR0 393 aaPredicted RBP2.76□□□□□ -1.97
RNU6-113P-201ENST00000516653 ALKBH8Q96BT7 664 aaKnown RBP2.76□□□□□ -1.97
RNU6-113P-201ENST00000516653 G6PC3Q9BUM1 346 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-113P-201ENST00000516653 NLRP2Q9NX02 1062 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-113P-201ENST00000516653 SERPINA10Q9UK55 444 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-113P-201ENST00000516653 WWC3Q9ULE0 1092 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-113P-201ENST00000516653 PCDHB5Q9Y5E4 795 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-113P-201ENST00000516653 SLC22A31A6NKX4 558 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-113P-201ENST00000516653 UPK3BL1B0FP48 263 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-113P-201ENST00000516653 UPK3BL2E5RIL1 263 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-113P-201ENST00000516653 GFRA2O00451 464 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-113P-201ENST00000516653 PEX10O60683 326 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-113P-201ENST00000516653 SEMA7AO75326 666 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-113P-201ENST00000516653 ADRB1P08588 477 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-113P-201ENST00000516653 CELA3BP08861 270 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-113P-201ENST00000516653 XRCC5P13010 732 aaKnown RBP2.75□□□□□ -1.97
RNU6-113P-201ENST00000516653 INSRRP14616 1297 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-113P-201ENST00000516653 PDE6BP35913 854 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-113P-201ENST00000516653 ETF1P62495 437 aaKnown RBP2.75□□□□□ -1.97
RNU6-113P-201ENST00000516653 SEPT6Q14141 434 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-113P-201ENST00000516653 TMEM132EQ6IEE7 984 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-113P-201ENST00000516653 TMPRSS7Q7RTY8 843 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-113P-201ENST00000516653 HID1Q8IV36 788 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-113P-201ENST00000516653 KCT2Q8NC54 265 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-113P-201ENST00000516653 PDZD8Q8NEN9 1154 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-113P-201ENST00000516653 CNTD2Q9H8S5 307 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-113P-201ENST00000516653 DUSP13Q9UII6 198 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-113P-201ENST00000516653 GPR160Q9UJ42 338 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-113P-201ENST00000516653 AFF3P51826 1226 aaKnown RBP2.74□□□□□ -1.97
RNU6-113P-201ENST00000516653 SRSF3P84103 164 aaKnown RBP2.74□□□□□ -1.97
RNU6-113P-201ENST00000516653 TEKQ02763 1124 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-113P-201ENST00000516653 PUM1Q14671 1186 aaKnown RBP eCLIP2.74□□□□□ -1.97
RNU6-113P-201ENST00000516653 ZNF385BQ569K4 471 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-113P-201ENST00000516653 ZPBP2Q6X784 338 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-113P-201ENST00000516653 TXNDC2Q86VQ3 553 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-113P-201ENST00000516653 TSPYL5Q86VY4 417 aaPredicted RBP2.74□□□□□ -1.97
RNU6-113P-201ENST00000516653 DTWD2Q8NBA8 298 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-113P-201ENST00000516653 CCDC120Q96HB5 630 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-113P-201ENST00000516653 CITED4Q96RK1 184 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-113P-201ENST00000516653 RBCK1Q9BYM8 510 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-113P-201ENST00000516653 SLC6A17Q9H1V8 727 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-113P-201ENST00000516653 MTMR7Q9Y216 660 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-113P-201ENST00000516653 CORINQ9Y5Q5 1042 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-113P-201ENST00000516653 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP2.73□□□□□ -1.97
RNU6-113P-201ENST00000516653 USP2O75604 605 aaPredicted RBP2.73□□□□□ -1.97
RNU6-113P-201ENST00000516653 VIPR1P32241 457 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-113P-201ENST00000516653 KIR3DL1P43629 444 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-113P-201ENST00000516653 CDR1P51861 262 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-113P-201ENST00000516653 EFEMP1Q12805 493 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-113P-201ENST00000516653 NR0B2Q15466 257 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-113P-201ENST00000516653 ENOX2Q16206 610 aaKnown RBP2.73□□□□□ -1.97
RNU6-113P-201ENST00000516653 ADGRF1Q5T601 910 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-113P-201ENST00000516653 NLRX1Q86UT6 975 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-113P-201ENST00000516653 LINC01599Q8WXQ3 324 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-113P-201ENST00000516653 ACSF2Q96CM8 615 aaPredicted RBP2.73□□□□□ -1.97
RNU6-113P-201ENST00000516653 PLCD4Q9BRC7 762 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-113P-201ENST00000516653 GPR62Q9BZJ7 368 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-113P-201ENST00000516653 RNF19AQ9NV58 838 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-113P-201ENST00000516653 PLA2G2DQ9UNK4 145 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-113P-201ENST00000516653 ZNF281Q9Y2X9 895 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-113P-201ENST00000516653 AKAP8O43823 692 aaKnown RBP2.72□□□□□ -1.97
RNU6-113P-201ENST00000516653 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP2.72□□□□□ -1.97
RNU6-113P-201ENST00000516653 NCKAP1LP55160 1127 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-113P-201ENST00000516653 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP2.72□□□□□ -1.97
RNU6-113P-201ENST00000516653 RTP5Q14D33 572 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-113P-201ENST00000516653 LRRC14Q15048 493 aa2.72□□□□□ -1.97
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.4 ms