RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000502484.6

PDE4D-208, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PDE4D, Length 2,478 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-208ENST00000502484 ZNF646O15015 1829 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
PDE4D-208ENST00000502484 ESPNB1AK53 854 aa9.47□□□□□ -0.89
PDE4D-208ENST00000502484 PRPF3O43395 683 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
PDE4D-208ENST00000502484 PPP6R2O75170 966 aa9.47□□□□□ -0.89
PDE4D-208ENST00000502484 PLCG2P16885 1265 aa9.47□□□□□ -0.89
PDE4D-208ENST00000502484 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP9.47□□□□□ -0.89
PDE4D-208ENST00000502484 NOSTRINQ8IVI9 506 aa9.47□□□□□ -0.89
PDE4D-208ENST00000502484 FMR1NBQ8N0W7 255 aaPredicted RBP9.47□□□□□ -0.89
PDE4D-208ENST00000502484 FAM200AQ8TCP9 573 aa9.47□□□□□ -0.89
PDE4D-208ENST00000502484 MAP3K14Q99558 947 aa9.47□□□□□ -0.89
PDE4D-208ENST00000502484 FOXP1Q9H334 677 aaPredicted RBP9.47□□□□□ -0.89
PDE4D-208ENST00000502484 NMT2O60551 498 aa9.47□□□□□ -0.89
PDE4D-208ENST00000502484 KINO60870 393 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
PDE4D-208ENST00000502484 PTPAQ15257 358 aa9.47□□□□□ -0.89
PDE4D-208ENST00000502484 PKN1Q16512 942 aa9.47□□□□□ -0.89
PDE4D-208ENST00000502484 AXDND1Q5T1B0 1012 aaPredicted RBP9.47□□□□□ -0.89
PDE4D-208ENST00000502484 RCSD1Q6JBY9 416 aa9.47□□□□□ -0.89
PDE4D-208ENST00000502484 OLFM4Q6UX06 510 aa9.47□□□□□ -0.89
PDE4D-208ENST00000502484 TMTC3Q6ZXV5 915 aa9.47□□□□□ -0.89
PDE4D-208ENST00000502484 DIS3L2Q8IYB7 885 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
PDE4D-208ENST00000502484 MPNDQ8N594 471 aa9.47□□□□□ -0.89
PDE4D-208ENST00000502484 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa9.47□□□□□ -0.89
PDE4D-208ENST00000502484 BTBD18B2RXH4 712 aa9.46□□□□□ -0.89
PDE4D-208ENST00000502484 PLEKHA8P1O95397 391 aa9.46□□□□□ -0.89
PDE4D-208ENST00000502484 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP9.46□□□□□ -0.89
PDE4D-208ENST00000502484 RHBDL3P58872 404 aa9.46□□□□□ -0.89
PDE4D-208ENST00000502484 AKAP17AQ02040 695 aaKnown RBP9.46□□□□□ -0.89
PDE4D-208ENST00000502484 CCDC178Q5BJE1 867 aa9.46□□□□□ -0.89
PDE4D-208ENST00000502484 SASS6Q6UVJ0 657 aa9.46□□□□□ -0.89
PDE4D-208ENST00000502484 DGKHQ86XP1 1220 aa9.46□□□□□ -0.89
PDE4D-208ENST00000502484 C7orf43Q8WVR3 580 aa9.46□□□□□ -0.89
PDE4D-208ENST00000502484 ANKS1AQ92625 1134 aa9.46□□□□□ -0.89
PDE4D-208ENST00000502484 EIF4ENIF1Q9NRA8 985 aaKnown RBP9.46□□□□□ -0.89
PDE4D-208ENST00000502484 TCP11L1Q9NUJ3 509 aa9.46□□□□□ -0.89
PDE4D-208ENST00000502484 USP25Q9UHP3 1055 aa9.46□□□□□ -0.89
PDE4D-208ENST00000502484 KCNJ14Q9UNX9 436 aa9.46□□□□□ -0.89
PDE4D-208ENST00000502484 A0A1B0GVL5 298 aa9.46□□□□□ -0.9
PDE4D-208ENST00000502484 XBP1P17861 261 aa9.46□□□□□ -0.9
PDE4D-208ENST00000502484 CMA1P23946 247 aa9.46□□□□□ -0.9
PDE4D-208ENST00000502484 GTF2IP78347 998 aa9.46□□□□□ -0.9
PDE4D-208ENST00000502484 TFAP4Q01664 338 aa9.46□□□□□ -0.9
PDE4D-208ENST00000502484 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa9.46□□□□□ -0.9
PDE4D-208ENST00000502484 ANO6Q4KMQ2 910 aa9.46□□□□□ -0.9
PDE4D-208ENST00000502484 MAPKAPK5Q8IW41 473 aa9.46□□□□□ -0.9
PDE4D-208ENST00000502484 TEX11Q8IYF3 940 aa9.46□□□□□ -0.9
PDE4D-208ENST00000502484 ADAMTSL1Q8N6G6 1762 aa9.46□□□□□ -0.9
PDE4D-208ENST00000502484 JMYQ8N9B5 988 aa9.46□□□□□ -0.9
PDE4D-208ENST00000502484 CTCFLQ8NI51 663 aaPredicted RBP9.46□□□□□ -0.9
PDE4D-208ENST00000502484 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa9.46□□□□□ -0.9
PDE4D-208ENST00000502484 DYNLL2Q96FJ2 89 aa9.46□□□□□ -0.9
PDE4D-208ENST00000502484 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP9.46□□□□□ -0.9
PDE4D-208ENST00000502484 IL17RBQ9NRM6 502 aa9.46□□□□□ -0.9
PDE4D-208ENST00000502484 FLT1P17948 1338 aa9.45□□□□□ -0.9
PDE4D-208ENST00000502484 RIMBP2O15034 1052 aa9.45□□□□□ -0.9
PDE4D-208ENST00000502484 WDHD1O75717 1129 aaPredicted RBP9.45□□□□□ -0.9
PDE4D-208ENST00000502484 CAVIN2O95810 425 aa9.45□□□□□ -0.9
PDE4D-208ENST00000502484 PLCD1P51178 756 aa9.45□□□□□ -0.9
PDE4D-208ENST00000502484 NDUFA8P51970 172 aa9.45□□□□□ -0.9
PDE4D-208ENST00000502484 RILPL1Q5EBL4 403 aa9.45□□□□□ -0.9
PDE4D-208ENST00000502484 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP9.45□□□□□ -0.9
PDE4D-208ENST00000502484 SHISA4Q96DD7 197 aa9.45□□□□□ -0.9
PDE4D-208ENST00000502484 MKNK2Q9HBH9 465 aa9.45□□□□□ -0.9
PDE4D-208ENST00000502484 ZNF287Q9HBT7 754 aa9.45□□□□□ -0.9
PDE4D-208ENST00000502484 TAOK2Q9UL54 1235 aa9.45□□□□□ -0.9
PDE4D-208ENST00000502484 SNED1Q8TER0 1413 aa9.45□□□□□ -0.9
PDE4D-208ENST00000502484 SCN9AQ15858 1988 aa9.45□□□□□ -0.9
PDE4D-208ENST00000502484 MARCKSP29966 332 aaPredicted RBP9.45□□□□□ -0.9
PDE4D-208ENST00000502484 CCDC93Q567U6 631 aa9.45□□□□□ -0.9
PDE4D-208ENST00000502484 SOGA3Q5TF21 947 aa9.45□□□□□ -0.9
PDE4D-208ENST00000502484 ZSCAN30Q86W11 494 aa9.45□□□□□ -0.9
PDE4D-208ENST00000502484 PHF20Q9BVI0 1012 aa9.45□□□□□ -0.9
PDE4D-208ENST00000502484 DAGLAQ9Y4D2 1042 aa9.45□□□□□ -0.9
PDE4D-208ENST00000502484 FAM237AA0A1B0GTK4 181 aa9.44□□□□□ -0.9
PDE4D-208ENST00000502484 TSPY3P0CV98 308 aa9.44□□□□□ -0.9
PDE4D-208ENST00000502484 TSPY8P0CW00 308 aa9.44□□□□□ -0.9
PDE4D-208ENST00000502484 RASA1P20936 1047 aa9.44□□□□□ -0.9
PDE4D-208ENST00000502484 KIF5BP33176 963 aa9.44□□□□□ -0.9
PDE4D-208ENST00000502484 CLCN1P35523 988 aa9.44□□□□□ -0.9
PDE4D-208ENST00000502484 TOB1P50616 345 aaPredicted RBP9.44□□□□□ -0.9
PDE4D-208ENST00000502484 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa9.44□□□□□ -0.9
PDE4D-208ENST00000502484 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa9.44□□□□□ -0.9
PDE4D-208ENST00000502484 C16orf86Q6ZW13 317 aa9.44□□□□□ -0.9
PDE4D-208ENST00000502484 ZNF444Q8N0Y2 327 aaPredicted RBP9.44□□□□□ -0.9
PDE4D-208ENST00000502484 SRBD1Q8N5C6 995 aaKnown RBP9.44□□□□□ -0.9
PDE4D-208ENST00000502484 KAT14Q9H8E8 782 aa9.44□□□□□ -0.9
PDE4D-208ENST00000502484 CBX8Q9HC52 389 aa9.44□□□□□ -0.9
PDE4D-208ENST00000502484 CCDC39Q9UFE4 941 aa9.44□□□□□ -0.9
PDE4D-208ENST00000502484 SAP30BPQ9UHR5 308 aaKnown RBP9.44□□□□□ -0.9
PDE4D-208ENST00000502484 V9GY48 417 aaPredicted RBP9.44□□□□□ -0.9
PDE4D-208ENST00000502484 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa9.44□□□□□ -0.9
PDE4D-208ENST00000502484 GRIN3BO60391 1043 aa9.44□□□□□ -0.9
PDE4D-208ENST00000502484 ADCY5O95622 1261 aa9.44□□□□□ -0.9
PDE4D-208ENST00000502484 PFKFB1P16118 471 aa9.44□□□□□ -0.9
PDE4D-208ENST00000502484 NR5A1Q13285 461 aa9.44□□□□□ -0.9
PDE4D-208ENST00000502484 RTKN2Q8IZC4 609 aa9.44□□□□□ -0.9
PDE4D-208ENST00000502484 CERS5Q8N5B7 392 aa9.44□□□□□ -0.9
PDE4D-208ENST00000502484 PNMA1Q8ND90 353 aa9.44□□□□□ -0.9
PDE4D-208ENST00000502484 OXER1Q8TDS5 423 aa9.44□□□□□ -0.9
PDE4D-208ENST00000502484 EYA3Q99504 573 aa9.44□□□□□ -0.9
PDE4D-208ENST00000502484 VPS54Q9P1Q0 977 aa9.44□□□□□ -0.9
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