RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000424082.6

RALGPS1-208, Transcript of Ral GEF with PH domain and SH3 binding motif 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RALGPS1, Length 2,362 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RALGPS1-208ENST00000424082 ZNF512BQ96KM6 892 aaPredicted RBP20.85■□□□□ 0.93
RALGPS1-208ENST00000424082 NAPBQ9H115 298 aa20.85■□□□□ 0.93
RALGPS1-208ENST00000424082 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP20.85■□□□□ 0.93
RALGPS1-208ENST00000424082 SRLQ86TD4 932 aa20.85■□□□□ 0.93
RALGPS1-208ENST00000424082 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa20.84■□□□□ 0.93
RALGPS1-208ENST00000424082 PDE8BO95263 885 aa20.84■□□□□ 0.93
RALGPS1-208ENST00000424082 USP5P45974 858 aa20.84■□□□□ 0.93
RALGPS1-208ENST00000424082 CRKLP46109 303 aaKnown RBP20.84■□□□□ 0.93
RALGPS1-208ENST00000424082 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP20.84■□□□□ 0.93
RALGPS1-208ENST00000424082 HDXQ7Z353 690 aa20.84■□□□□ 0.93
RALGPS1-208ENST00000424082 VPS18Q9P253 973 aa20.84■□□□□ 0.93
RALGPS1-208ENST00000424082 RSPH14Q9UHP6 348 aa20.84■□□□□ 0.93
RALGPS1-208ENST00000424082 PUF60Q9UHX1 559 aaKnown RBP20.84■□□□□ 0.93
RALGPS1-208ENST00000424082 RAB21Q9UL25 225 aa20.84■□□□□ 0.93
RALGPS1-208ENST00000424082 BCL9LQ86UU0 1499 aa20.84■□□□□ 0.93
RALGPS1-208ENST00000424082 SOWAHDA6NJG2 315 aa20.83■□□□□ 0.93
RALGPS1-208ENST00000424082 MBD4O95243 580 aa20.83■□□□□ 0.93
RALGPS1-208ENST00000424082 CTSWP56202 376 aa20.83■□□□□ 0.93
RALGPS1-208ENST00000424082 NR1I3Q14994 352 aa20.83■□□□□ 0.93
RALGPS1-208ENST00000424082 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP20.83■□□□□ 0.93
RALGPS1-208ENST00000424082 LZTFL1Q9NQ48 299 aa20.83■□□□□ 0.93
RALGPS1-208ENST00000424082 RRP15Q9Y3B9 282 aaKnown RBP20.83■□□□□ 0.93
RALGPS1-208ENST00000424082 AKR1B15C9JRZ8 316 aaPredicted RBP20.83■□□□□ 0.93
RALGPS1-208ENST00000424082 EIF5P55010 431 aaKnown RBP20.83■□□□□ 0.93
RALGPS1-208ENST00000424082 MCM6Q14566 821 aa20.83■□□□□ 0.93
RALGPS1-208ENST00000424082 RILPL1Q5EBL4 403 aa20.83■□□□□ 0.93
RALGPS1-208ENST00000424082 CEP112Q8N8E3 955 aa20.83■□□□□ 0.93
RALGPS1-208ENST00000424082 MSANTD4Q8NCY6 345 aa20.83■□□□□ 0.93
RALGPS1-208ENST00000424082 OXER1Q8TDS5 423 aa20.83■□□□□ 0.93
RALGPS1-208ENST00000424082 PANX2Q96RD6 677 aa20.83■□□□□ 0.93
RALGPS1-208ENST00000424082 PNKPQ96T60 521 aa20.83■□□□□ 0.93
RALGPS1-208ENST00000424082 ARMT1Q9H993 441 aa20.83■□□□□ 0.93
RALGPS1-208ENST00000424082 TOMM22Q9NS69 142 aa20.83■□□□□ 0.93
RALGPS1-208ENST00000424082 CDC23Q9UJX2 597 aa20.83■□□□□ 0.93
RALGPS1-208ENST00000424082 NUP98P52948 1817 aa20.83■□□□□ 0.92
RALGPS1-208ENST00000424082 PATL2C9JE40 543 aaKnown RBP20.82■□□□□ 0.92
RALGPS1-208ENST00000424082 POTEB2H3BUK9 544 aa20.82■□□□□ 0.92
RALGPS1-208ENST00000424082 ACTN4O43707 911 aaKnown RBP20.82■□□□□ 0.92
RALGPS1-208ENST00000424082 PTF1AQ7RTS3 328 aa20.82■□□□□ 0.92
RALGPS1-208ENST00000424082 MAGEB6Q8N7X4 407 aa20.82■□□□□ 0.92
RALGPS1-208ENST00000424082 WASF1Q92558 559 aa20.82■□□□□ 0.92
RALGPS1-208ENST00000424082 CCDC87Q9NVE4 849 aa20.82■□□□□ 0.92
RALGPS1-208ENST00000424082 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP20.82■□□□□ 0.92
RALGPS1-208ENST00000424082 DACH1Q9UI36 760 aa20.82■□□□□ 0.92
RALGPS1-208ENST00000424082 ADGRG1Q9Y653 693 aa20.82■□□□□ 0.92
RALGPS1-208ENST00000424082 TEX33O43247 280 aa20.82■□□□□ 0.92
RALGPS1-208ENST00000424082 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP20.82■□□□□ 0.92
RALGPS1-208ENST00000424082 TNNT3P45378 269 aaPredicted RBP20.82■□□□□ 0.92
RALGPS1-208ENST00000424082 KCNQ4P56696 695 aa20.82■□□□□ 0.92
RALGPS1-208ENST00000424082 TRIM22Q8IYM9 498 aa20.82■□□□□ 0.92
RALGPS1-208ENST00000424082 PLCD3Q8N3E9 789 aa20.82■□□□□ 0.92
RALGPS1-208ENST00000424082 CHD4Q14839 1912 aa20.82■□□□□ 0.92
RALGPS1-208ENST00000424082 A0A0U1RQJ8 604 aa20.81■□□□□ 0.92
RALGPS1-208ENST00000424082 PRKAB2O43741 272 aa20.81■□□□□ 0.92
RALGPS1-208ENST00000424082 ALX1Q15699 326 aa20.81■□□□□ 0.92
RALGPS1-208ENST00000424082 RTN1Q16799 776 aa20.81■□□□□ 0.92
RALGPS1-208ENST00000424082 AKNAD1Q5T1N1 836 aa20.81■□□□□ 0.92
RALGPS1-208ENST00000424082 RAD9BQ6WBX8 426 aa20.81■□□□□ 0.92
RALGPS1-208ENST00000424082 LEKR1Q6ZMV7 388 aa20.81■□□□□ 0.92
RALGPS1-208ENST00000424082 MSL3Q8N5Y2 521 aaKnown RBP20.81■□□□□ 0.92
RALGPS1-208ENST00000424082 ATRIPQ8WXE1 791 aa20.81■□□□□ 0.92
RALGPS1-208ENST00000424082 CSRNP2Q9H175 543 aa20.81■□□□□ 0.92
RALGPS1-208ENST00000424082 FOXP1Q9H334 677 aaPredicted RBP20.81■□□□□ 0.92
RALGPS1-208ENST00000424082 SNAP23O00161 211 aa20.81■□□□□ 0.92
RALGPS1-208ENST00000424082 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP20.81■□□□□ 0.92
RALGPS1-208ENST00000424082 MFSD6Q6ZSS7 791 aa20.81■□□□□ 0.92
RALGPS1-208ENST00000424082 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP20.81■□□□□ 0.92
RALGPS1-208ENST00000424082 CDHR2Q9BYE9 1310 aa20.8■□□□□ 0.92
RALGPS1-208ENST00000424082 A0A1B0GTH6 734 aa20.8■□□□□ 0.92
RALGPS1-208ENST00000424082 KIF5CO60282 957 aa20.8■□□□□ 0.92
RALGPS1-208ENST00000424082 PLCD1P51178 756 aa20.8■□□□□ 0.92
RALGPS1-208ENST00000424082 EFCC1Q9HA90 598 aa20.8■□□□□ 0.92
RALGPS1-208ENST00000424082 L1RE1Q9UN81 338 aa20.8■□□□□ 0.92
RALGPS1-208ENST00000424082 SRPRBQ9Y5M8 271 aaKnown RBP20.8■□□□□ 0.92
RALGPS1-208ENST00000424082 ERVV-1B6SEH8 477 aa20.8■□□□□ 0.92
RALGPS1-208ENST00000424082 N4BP1O75113 896 aaKnown RBP20.8■□□□□ 0.92
RALGPS1-208ENST00000424082 ERLIN1O75477 346 aa20.8■□□□□ 0.92
RALGPS1-208ENST00000424082 IVLP07476 585 aa20.8■□□□□ 0.92
RALGPS1-208ENST00000424082 CASP1P29466 404 aa20.8■□□□□ 0.92
RALGPS1-208ENST00000424082 KLHL10Q6JEL2 608 aa20.8■□□□□ 0.92
RALGPS1-208ENST00000424082 TRIML1Q8N9V2 468 aa20.8■□□□□ 0.92
RALGPS1-208ENST00000424082 CPLX3Q8WVH0 158 aa20.8■□□□□ 0.92
RALGPS1-208ENST00000424082 ABCB6Q9NP58 842 aa20.8■□□□□ 0.92
RALGPS1-208ENST00000424082 CABP5Q9NP86 173 aa20.8■□□□□ 0.92
RALGPS1-208ENST00000424082 GSG1L2A8MUP6 293 aa20.79■□□□□ 0.92
RALGPS1-208ENST00000424082 EIF3JO75822 258 aaKnown RBP20.79■□□□□ 0.92
RALGPS1-208ENST00000424082 ZNF34Q8IZ26 560 aa20.79■□□□□ 0.92
RALGPS1-208ENST00000424082 SPATA5Q8NB90 893 aa20.79■□□□□ 0.92
RALGPS1-208ENST00000424082 SPATA20Q8TB22 786 aa20.79■□□□□ 0.92
RALGPS1-208ENST00000424082 CNNM2Q9H8M5 875 aa20.79■□□□□ 0.92
RALGPS1-208ENST00000424082 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa20.79■□□□□ 0.92
RALGPS1-208ENST00000424082 A0A087X0B3 334 aa20.79■□□□□ 0.92
RALGPS1-208ENST00000424082 FAM205CA6NFA0 338 aa20.79■□□□□ 0.92
RALGPS1-208ENST00000424082 STX17P56962 302 aa20.79■□□□□ 0.92
RALGPS1-208ENST00000424082 TUBB2AQ13885 445 aa20.79■□□□□ 0.92
RALGPS1-208ENST00000424082 WTAPQ15007 396 aa20.79■□□□□ 0.92
RALGPS1-208ENST00000424082 VPS72Q15906 364 aa20.79■□□□□ 0.92
RALGPS1-208ENST00000424082 APTXQ7Z2E3 356 aaKnown RBP20.79■□□□□ 0.92
RALGPS1-208ENST00000424082 CRACR2BQ8N4Y2 399 aaPredicted RBP20.79■□□□□ 0.92
RALGPS1-208ENST00000424082 ZNF579Q8NAF0 562 aaKnown RBP20.79■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 50.6 ms