RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000423945.5

SBDSP1-202, Transcript of SBDS, ribosome maturation factor pseudogene 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene SBDSP1, Length 618 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SBDSP1-202ENST00000423945 POTEEQ6S8J3 1075 aa21.42■■□□□ 1.02
SBDSP1-202ENST00000423945 FSD1Q9BTV5 496 aa21.42■■□□□ 1.02
SBDSP1-202ENST00000423945 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP21.42■■□□□ 1.02
SBDSP1-202ENST00000423945 SRRDQ9UH36 339 aa21.42■■□□□ 1.02
SBDSP1-202ENST00000423945 TAOK2Q9UL54 1235 aa21.42■■□□□ 1.02
SBDSP1-202ENST00000423945 GREB1LQ9C091 1923 aaPredicted RBP21.41■■□□□ 1.02
SBDSP1-202ENST00000423945 FMNL1O95466 1100 aaPredicted RBP21.41■■□□□ 1.02
SBDSP1-202ENST00000423945 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP21.41■■□□□ 1.02
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SBDSP1-202ENST00000423945 FAM110CQ1W6H9 321 aa21.41■■□□□ 1.02
SBDSP1-202ENST00000423945 SBK1Q52WX2 424 aa21.41■■□□□ 1.02
SBDSP1-202ENST00000423945 SIAH1Q8IUQ4 282 aa21.41■■□□□ 1.02
SBDSP1-202ENST00000423945 P2RX7Q99572 595 aaKnown RBP21.41■■□□□ 1.02
SBDSP1-202ENST00000423945 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa21.41■■□□□ 1.02
SBDSP1-202ENST00000423945 PEX10O60683 326 aa21.4■■□□□ 1.02
SBDSP1-202ENST00000423945 PRMT2P55345 433 aa21.4■■□□□ 1.02
SBDSP1-202ENST00000423945 NUCB1Q02818 461 aa21.4■■□□□ 1.02
SBDSP1-202ENST00000423945 GIMAP6Q6P9H5 292 aa21.4■■□□□ 1.02
SBDSP1-202ENST00000423945 CLEC10AQ8IUN9 316 aa21.4■■□□□ 1.02
SBDSP1-202ENST00000423945 ZNF333Q96JL9 665 aa21.4■■□□□ 1.02
SBDSP1-202ENST00000423945 ARPP21Q9UBL0 812 aaPredicted RBP21.4■■□□□ 1.02
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SBDSP1-202ENST00000423945 KIAA0100Q14667 2235 aaKnown RBP21.4■■□□□ 1.02
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SBDSP1-202ENST00000423945 FOXP2O15409 715 aa21.39■■□□□ 1.01
SBDSP1-202ENST00000423945 GCLCP48506 637 aaPredicted RBP21.39■■□□□ 1.01
SBDSP1-202ENST00000423945 FCGRTP55899 365 aa21.39■■□□□ 1.01
SBDSP1-202ENST00000423945 HERVK_113P62684 666 aa21.39■■□□□ 1.01
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SBDSP1-202ENST00000423945 SH3TC2Q8TF17 1288 aa21.39■■□□□ 1.01
SBDSP1-202ENST00000423945 DDRGK1Q96HY6 314 aa21.39■■□□□ 1.01
SBDSP1-202ENST00000423945 TXNRD2Q9NNW7 524 aa21.39■■□□□ 1.01
SBDSP1-202ENST00000423945 MORF4L1Q9UBU8 362 aa21.39■■□□□ 1.01
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SBDSP1-202ENST00000423945 MYPNQ86TC9 1320 aa21.38■■□□□ 1.01
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SBDSP1-202ENST00000423945 VCAM1P19320 739 aa21.38■■□□□ 1.01
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SBDSP1-202ENST00000423945 LRRFIP1Q32MZ4 808 aaKnown RBP21.38■■□□□ 1.01
SBDSP1-202ENST00000423945 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa21.38■■□□□ 1.01
SBDSP1-202ENST00000423945 TMEM179Q6ZVK1 233 aa21.38■■□□□ 1.01
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SBDSP1-202ENST00000423945 FEZ1Q99689 392 aa21.38■■□□□ 1.01
SBDSP1-202ENST00000423945 POTEFA5A3E0 1075 aa21.37■■□□□ 1.01
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SBDSP1-202ENST00000423945 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa21.37■■□□□ 1.01
SBDSP1-202ENST00000423945 CCDC129Q6ZRS4 1044 aa21.37■■□□□ 1.01
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SBDSP1-202ENST00000423945 IFNL3Q8IZI9 196 aa21.37■■□□□ 1.01
SBDSP1-202ENST00000423945 RBPJLQ9UBG7 517 aa21.37■■□□□ 1.01
SBDSP1-202ENST00000423945 HOXD10P28358 340 aa21.36■■□□□ 1.01
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SBDSP1-202ENST00000423945 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP21.36■■□□□ 1.01
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SBDSP1-202ENST00000423945 STK11IPQ8N1F8 1099 aa21.35■■□□□ 1.01
SBDSP1-202ENST00000423945 OSBPL3Q9H4L5 887 aa21.35■■□□□ 1.01
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SBDSP1-202ENST00000423945 PARP14Q460N5 1801 aa21.34■■□□□ 1.01
SBDSP1-202ENST00000423945 USP17L15C9J2P7 530 aa21.34■■□□□ 1.01
SBDSP1-202ENST00000423945 USP17L13C9JLJ4 530 aa21.34■■□□□ 1.01
SBDSP1-202ENST00000423945 USP17L11C9JVI0 530 aa21.34■■□□□ 1.01
SBDSP1-202ENST00000423945 USP17L18D6R9N7 530 aa21.34■■□□□ 1.01
SBDSP1-202ENST00000423945 USP17L22D6RA61 530 aa21.34■■□□□ 1.01
SBDSP1-202ENST00000423945 USP17L17D6RBQ6 530 aa21.34■■□□□ 1.01
SBDSP1-202ENST00000423945 USP17L19D6RCP7 530 aa21.34■■□□□ 1.01
SBDSP1-202ENST00000423945 USP17L20D6RJB6 530 aa21.34■■□□□ 1.01
SBDSP1-202ENST00000423945 TNPO2O14787 897 aaKnown RBP21.34■■□□□ 1.01
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SBDSP1-202ENST00000423945 FLT3LGP49771 235 aa21.34■■□□□ 1.01
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SBDSP1-202ENST00000423945 USP17L24Q0WX57 530 aa21.34■■□□□ 1.01
SBDSP1-202ENST00000423945 Q3C1V9 767 aa21.34■■□□□ 1.01
SBDSP1-202ENST00000423945 RAET1EQ8TD07 263 aa21.34■■□□□ 1.01
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SBDSP1-202ENST00000423945 GRK4P32298 578 aa21.33■■□□□ 1.01
SBDSP1-202ENST00000423945 TDO2P48775 406 aa21.33■■□□□ 1.01
SBDSP1-202ENST00000423945 VPS53Q5VIR6 699 aa21.33■■□□□ 1.01
SBDSP1-202ENST00000423945 NBPF11Q86T75 865 aa21.33■■□□□ 1.01
SBDSP1-202ENST00000423945 FAM227BQ96M60 508 aa21.33■■□□□ 1.01
SBDSP1-202ENST00000423945 RPAP3Q9H6T3 665 aaPredicted RBP21.33■■□□□ 1.01
SBDSP1-202ENST00000423945 TMX2Q9Y320 296 aa21.33■■□□□ 1.01
SBDSP1-202ENST00000423945 A0A0G2JMZ2 1700 aa21.32■■□□□ 1
SBDSP1-202ENST00000423945 A0A0D9SFI3 127 aa21.32■■□□□ 1
SBDSP1-202ENST00000423945 SLC34A2O95436 690 aa21.32■■□□□ 1
SBDSP1-202ENST00000423945 MYCP01106 439 aaPredicted RBP21.32■■□□□ 1
SBDSP1-202ENST00000423945 MTFR1Q15390 333 aa21.32■■□□□ 1
SBDSP1-202ENST00000423945 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP21.31■■□□□ 1
SBDSP1-202ENST00000423945 EEF2P13639 858 aaKnown RBP21.31■■□□□ 1
SBDSP1-202ENST00000423945 PDE4AP27815 886 aa21.31■■□□□ 1
SBDSP1-202ENST00000423945 ERVK-9P63128 1117 aa21.31■■□□□ 1
SBDSP1-202ENST00000423945 ERVK-24P63145 666 aa21.31■■□□□ 1
SBDSP1-202ENST00000423945 IRF5Q13568 498 aa21.31■■□□□ 1
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