RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000233331.11

INO80B-201, Transcript of INO80 complex subunit B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene INO80B, Length 1,261 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INO80B-201ENST00000233331 PSMC4P43686 418 aa36.7■■■■□ 3.47
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INO80B-201ENST00000233331 TMEM179Q6ZVK1 233 aa36.7■■■■□ 3.47
INO80B-201ENST00000233331 EMILIN3Q9NT22 766 aa36.7■■■■□ 3.47
INO80B-201ENST00000233331 MINDY4BA8MYZ0 360 aa36.69■■■■□ 3.46
INO80B-201ENST00000233331 PATL2C9JE40 543 aaKnown RBP36.69■■■■□ 3.46
INO80B-201ENST00000233331 CTGFP29279 349 aa36.69■■■■□ 3.46
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INO80B-201ENST00000233331 USP14P54578 494 aa36.68■■■■□ 3.46
INO80B-201ENST00000233331 ANKRD13CQ8N6S4 541 aa36.68■■■■□ 3.46
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INO80B-201ENST00000233331 OSBPL3Q9H4L5 887 aa36.68■■■■□ 3.46
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INO80B-201ENST00000233331 RILPL2Q969X0 211 aa36.67■■■■□ 3.46
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INO80B-201ENST00000233331 C12orf42Q96LP6 360 aa36.67■■■■□ 3.46
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INO80B-201ENST00000233331 GCLCP48506 637 aaPredicted RBP36.65■■■■□ 3.46
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INO80B-201ENST00000233331 FAM110CQ1W6H9 321 aa36.64■■■■□ 3.46
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INO80B-201ENST00000233331 CLEC10AQ8IUN9 316 aa36.63■■■■□ 3.45
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INO80B-201ENST00000233331 HELLSQ9NRZ9 838 aa36.63■■■■□ 3.45
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INO80B-201ENST00000233331 HOXD10P28358 340 aa36.62■■■■□ 3.45
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INO80B-201ENST00000233331 FAM227BQ96M60 508 aa36.62■■■■□ 3.45
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INO80B-201ENST00000233331 A0A1W2PRG0 241 aa36.61■■■■□ 3.45
INO80B-201ENST00000233331 VCAM1P19320 739 aa36.61■■■■□ 3.45
INO80B-201ENST00000233331 TICAM2Q86XR7 235 aa36.61■■■■□ 3.45
INO80B-201ENST00000233331 MKNK2Q9HBH9 465 aa36.61■■■■□ 3.45
INO80B-201ENST00000233331 SRRDQ9UH36 339 aa36.61■■■■□ 3.45
INO80B-201ENST00000233331 A0A0D9SFI3 127 aa36.6■■■■□ 3.45
INO80B-201ENST00000233331 HERVK_113P62684 666 aa36.6■■■■□ 3.45
INO80B-201ENST00000233331 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa36.6■■■■□ 3.45
INO80B-201ENST00000233331 MYPNQ86TC9 1320 aa36.59■■■■□ 3.45
INO80B-201ENST00000233331 NMIQ13287 307 aaPredicted RBP36.59■■■■□ 3.45
INO80B-201ENST00000233331 HTTP42858 3142 aa36.59■■■■□ 3.45
INO80B-201ENST00000233331 USP17L15C9J2P7 530 aa36.58■■■■□ 3.45
INO80B-201ENST00000233331 USP17L13C9JLJ4 530 aa36.58■■■■□ 3.45
INO80B-201ENST00000233331 USP17L11C9JVI0 530 aa36.58■■■■□ 3.45
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INO80B-201ENST00000233331 USP17L22D6RA61 530 aa36.58■■■■□ 3.45
INO80B-201ENST00000233331 USP17L17D6RBQ6 530 aa36.58■■■■□ 3.45
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INO80B-201ENST00000233331 USP17L24Q0WX57 530 aa36.58■■■■□ 3.45
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INO80B-201ENST00000233331 SH2D4AQ9H788 454 aa36.57■■■■□ 3.44
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INO80B-201ENST00000233331 SIAH1Q8IUQ4 282 aa36.56■■■■□ 3.44
INO80B-201ENST00000233331 ARMC5Q96C12 935 aa36.56■■■■□ 3.44
INO80B-201ENST00000233331 RPAP3Q9H6T3 665 aaPredicted RBP36.56■■■■□ 3.44
INO80B-201ENST00000233331 ZNF287Q9HBT7 754 aa36.56■■■■□ 3.44
INO80B-201ENST00000233331 MORF4L1Q9UBU8 362 aa36.56■■■■□ 3.44
INO80B-201ENST00000233331 ATP2B2Q01814 1243 aa36.55■■■■□ 3.44
INO80B-201ENST00000233331 PPARAQ07869 468 aa36.55■■■■□ 3.44
INO80B-201ENST00000233331 CATSPERGQ6ZRH7 1159 aa36.55■■■■□ 3.44
INO80B-201ENST00000233331 RAET1EQ8TD07 263 aa36.55■■■■□ 3.44
INO80B-201ENST00000233331 GTF3C2Q8WUA4 911 aaPredicted RBP36.55■■■■□ 3.44
INO80B-201ENST00000233331 KANSL2Q9H9L4 492 aa36.55■■■■□ 3.44
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INO80B-201ENST00000233331 SDSP20132 328 aa36.54■■■■□ 3.44
INO80B-201ENST00000233331 TMX2Q9Y320 296 aa36.54■■■■□ 3.44
INO80B-201ENST00000233331 GREB1LQ9C091 1923 aaPredicted RBP36.53■■■■□ 3.44
INO80B-201ENST00000233331 PEX10O60683 326 aa36.53■■■■□ 3.44
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INO80B-201ENST00000233331 EEF2P13639 858 aaKnown RBP36.53■■■■□ 3.44
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INO80B-201ENST00000233331 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP36.53■■■■□ 3.44
INO80B-201ENST00000233331 TXNRD2Q9NNW7 524 aa36.53■■■■□ 3.44
INO80B-201ENST00000233331 NBPF11Q86T75 865 aa36.52■■■■□ 3.44
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INO80B-201ENST00000233331 ZNF444Q8N0Y2 327 aaPredicted RBP36.52■■■■□ 3.44
INO80B-201ENST00000233331 SH3TC2Q8TF17 1288 aa36.52■■■■□ 3.44
INO80B-201ENST00000233331 GABRQQ9UN88 632 aa36.52■■■■□ 3.44
INO80B-201ENST00000233331 PDE4BQ07343 736 aa36.51■■■■□ 3.44
INO80B-201ENST00000233331 GPRC5AQ8NFJ5 357 aa36.51■■■■□ 3.44
INO80B-201ENST00000233331 COA7Q96BR5 231 aa36.51■■■■□ 3.44
INO80B-201ENST00000233331 VCPKMTQ9H867 229 aa36.51■■■■□ 3.44
INO80B-201ENST00000233331 RBPJLQ9UBG7 517 aa36.51■■■■□ 3.44
INO80B-201ENST00000233331 CCDC171Q6TFL3 1326 aa36.51■■■■□ 3.43
INO80B-201ENST00000233331 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa36.5■■■■□ 3.43
INO80B-201ENST00000233331 LPAR1Q92633 364 aa36.5■■■■□ 3.43
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