RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000074721.5

Hoxd8-202, Transcript of Homeobox protein Hox-D8, mousemouse

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene Hoxd8, Length 1,758 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Ckap2Q3V1H1 664 aa35.74■■■■□ 3.31
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Trpv1Q704Y3 839 aa35.73■■■■□ 3.31
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Scfd1Q8BRF7 639 aaKnown RBP35.73■■■■□ 3.31
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Dmrtc1Q9D9R7 182 aa35.73■■■■□ 3.31
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 PgfP49764 158 aa35.72■■■■□ 3.31
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Traf3ip1Q149C2 625 aa35.72■■■■□ 3.31
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Gimap7Q8R379 293 aa35.72■■■■□ 3.31
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Usp31E9Q6Y8 1344 aa35.71■■■■□ 3.31
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Irx3P81067 507 aa35.71■■■■□ 3.31
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Senp5Q6NXL6 749 aa35.71■■■■□ 3.31
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Garem2Q6PAJ3 880 aa35.71■■■■□ 3.31
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Eid1Q9DCR4 169 aa35.71■■■■□ 3.31
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Cxcl9P18340 126 aa35.71■■■■□ 3.31
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Tmtc2Q56A06 836 aa35.71■■■■□ 3.31
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Iffo2Q8R2V2 512 aa35.71■■■■□ 3.31
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Has3O08650 554 aa35.7■■■■□ 3.31
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Mmp10O55123 476 aa35.7■■■■□ 3.31
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Gprin1Q3UNH4 932 aa35.7■■■■□ 3.31
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Nlgn2Q69ZK9 836 aa35.7■■■■□ 3.31
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Prkab1Q9R078 270 aa35.7■■■■□ 3.31
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Frmpd4A2AFR3 1320 aa35.69■■■■□ 3.3
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Ces3aQ63880 571 aa35.69■■■■□ 3.3
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Ces3bQ8VCU1 571 aa35.69■■■■□ 3.3
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Fam71e1A1L3C1 212 aa35.68■■■■□ 3.3
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 ThbdP15306 577 aa35.68■■■■□ 3.3
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Llgl2Q3TJ91 1027 aa35.68■■■■□ 3.3
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Rcan1Q9JHG6 198 aa35.68■■■■□ 3.3
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Stag2O35638 1231 aa35.67■■■■□ 3.3
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Calm1P0DP26 149 aaKnown RBP35.67■■■■□ 3.3
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Calm2P0DP27 149 aaKnown RBP35.67■■■■□ 3.3
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Calm3P0DP28 149 aaKnown RBP35.67■■■■□ 3.3
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Cep63Q3UPP8 700 aa35.66■■■■□ 3.3
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Ankrd13cQ3UX43 541 aa35.66■■■■□ 3.3
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 S1pr4Q9Z0L1 386 aa35.66■■■■□ 3.3
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Gm20425E9Q035 978 aaKnown RBP35.65■■■■□ 3.3
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 SrprbP47758 269 aa35.65■■■■□ 3.3
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Ranbp6Q8BIV3 1105 aa35.65■■■■□ 3.3
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 PtpraP18052 829 aa35.64■■■■□ 3.3
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Smarcc2Q6PDG5 1213 aa35.64■■■■□ 3.3
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Zfp341Q6PGC9 846 aa35.64■■■■□ 3.3
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 RubcnQ80U62 956 aa35.64■■■■□ 3.3
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Ireb2Q811J3 963 aaKnown RBP35.64■■■■□ 3.3
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Casq1O09165 405 aa35.64■■■■□ 3.3
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Sulf1Q8K007 870 aa35.64■■■■□ 3.3
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Rtn1Q8K0T0 780 aa35.63■■■■□ 3.29
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 CerkQ8K4Q7 531 aa35.63■■■■□ 3.29
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Smc3Q9CW03 1217 aaKnown RBP35.63■■■■□ 3.29
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Gdpd2Q9ESM6 539 aa35.63■■■■□ 3.29
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Wdr19Q3UGF1 1341 aa35.62■■■■□ 3.29
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Haus6Q6NV99 933 aaKnown RBP35.62■■■■□ 3.29
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Arhgef6Q8K4I3 771 aa35.62■■■■□ 3.29
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Zfp804bA0A0G2JGH6 1343 aa35.62■■■■□ 3.29
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Fgfr2P21803 821 aa35.61■■■■□ 3.29
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Foxp1P58462 705 aa35.61■■■■□ 3.29
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Sap30bpQ02614 308 aa35.61■■■■□ 3.29
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Lrrc15Q80X72 579 aa35.61■■■■□ 3.29
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Cnksr2Q80YA9 1032 aa35.61■■■■□ 3.29
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Ubac1Q8VDI7 409 aa35.61■■■■□ 3.29
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Sall1Q9ER74 1322 aa35.61■■■■□ 3.29
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Rgs9O54828 675 aa35.61■■■■□ 3.29
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Ddx49Q4FZF3 480 aaKnown RBP35.61■■■■□ 3.29
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Ccp110Q7TSH4 1004 aa35.61■■■■□ 3.29
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Lca5lQ8C0X0 741 aa35.61■■■■□ 3.29
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Copb2O55029 905 aa35.6■■■■□ 3.29
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Limch1Q3UH68 1057 aa35.6■■■■□ 3.29
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Lca5Q80ST9 704 aa35.6■■■■□ 3.29
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Epha10Q8BYG9 1007 aa35.6■■■■□ 3.29
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 A0A1Y7VML8 143 aa35.59■■■■□ 3.29
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Ppef2O35385 757 aa35.59■■■■□ 3.29
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Mdh1bQ5F204 500 aa35.59■■■■□ 3.29
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Swap70Q6A028 585 aaKnown RBP35.59■■■■□ 3.29
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Kif1bpQ6ZPU9 617 aa35.59■■■■□ 3.29
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Gripap1Q8VD04 806 aa35.59■■■■□ 3.29
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Sv2cQ69ZS6 727 aa35.59■■■■□ 3.29
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Adgrg6Q6F3F9 1165 aa35.59■■■■□ 3.29
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Ppp2r5bQ6PD28 497 aa35.59■■■■□ 3.29
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Rbm19Q8R3C6 952 aaKnown RBP35.59■■■■□ 3.29
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Celf2Q9Z0H4 508 aaKnown RBP35.59■■■■□ 3.29
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Ccdc88aQ5SNZ0 1873 aa35.58■■■■□ 3.29
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Babam1Q3UI43 333 aa35.58■■■■□ 3.29
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Kctd1Q5M956 257 aa35.58■■■■□ 3.29
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Znf219Q6IQX8 726 aa35.58■■■■□ 3.29
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Riox2Q8CD15 465 aa35.58■■■■□ 3.29
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Myh7bA2AQP0 1941 aa35.57■■■■□ 3.29
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Gm30191A0A0U1RNT7 187 aa35.57■■■■□ 3.28
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 LdhaP06151 332 aaKnown RBP35.57■■■■□ 3.28
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Ttbk2Q3UVR3 1243 aa35.57■■■■□ 3.28
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Ms4a5Q810P8 197 aa35.57■■■■□ 3.28
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Triml1Q8BVP1 470 aa35.57■■■■□ 3.28
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Lrrc2Q8VDB8 371 aa35.57■■■■□ 3.28
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Myh8P13542 1937 aa35.57■■■■□ 3.28
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Oog1E9Q5G7 496 aa35.56■■■■□ 3.28
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Tbc1d5Q80XQ2 815 aa35.56■■■■□ 3.28
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Me3Q8BMF3 604 aa35.56■■■■□ 3.28
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Plcd3Q8K2J0 785 aa35.56■■■■□ 3.28
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Thsd7bQ6P4U0 1607 aa35.56■■■■□ 3.28
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Tshz1Q5DTH5 1084 aa35.56■■■■□ 3.28
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Nsrp1Q5NCR9 542 aa35.56■■■■□ 3.28
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 St18Q80TY4 1045 aa35.56■■■■□ 3.28
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Gmcl1Q920G9 524 aa35.56■■■■□ 3.28
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 80 ms