Protein–RNA interactions for Protein: O55123

Mmp10, Stromelysin-2, mousemouse

Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp10O55123 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC45.83■■■■■ 4.93
Mmp10O55123 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC42.53■■■■■ 4.4
Mmp10O55123 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.84■■■■■ 4.29
Mmp10O55123 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC39.87■■■■□ 3.97
Mmp10O55123 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC39.75■■■■□ 3.95
Mmp10O55123 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC38.84■■■■□ 3.81
Mmp10O55123 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.7■■■■□ 3.79
Mmp10O55123 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.65■■■■□ 3.78
Mmp10O55123 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC38.5■■■■□ 3.75
Mmp10O55123 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC38.21■■■■□ 3.71
Mmp10O55123 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
Mmp10O55123 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
Mmp10O55123 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC37.29■■■■□ 3.56
Mmp10O55123 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
Mmp10O55123 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
Mmp10O55123 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC36.98■■■■□ 3.51
Mmp10O55123 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.9■■■■□ 3.5
Mmp10O55123 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
Mmp10O55123 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC36.74■■■■□ 3.47
Mmp10O55123 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.5■■■■□ 3.43
Mmp10O55123 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
Mmp10O55123 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
Mmp10O55123 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
Mmp10O55123 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
Mmp10O55123 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC36.28■■■■□ 3.4
Mmp10O55123 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC36.24■■■■□ 3.39
Mmp10O55123 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
Mmp10O55123 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC36.07■■■■□ 3.36
Mmp10O55123 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
Mmp10O55123 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
Mmp10O55123 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
Mmp10O55123 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
Mmp10O55123 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.52■■■■□ 3.28
Mmp10O55123 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC35.43■■■■□ 3.26
Mmp10O55123 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
Mmp10O55123 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
Mmp10O55123 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC35.17■■■■□ 3.22
Mmp10O55123 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.15■■■■□ 3.22
Mmp10O55123 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC35.05■■■■□ 3.2
Mmp10O55123 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
Mmp10O55123 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
Mmp10O55123 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
Mmp10O55123 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC34.86■■■■□ 3.17
Mmp10O55123 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC34.77■■■■□ 3.16
Mmp10O55123 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC34.75■■■■□ 3.15
Mmp10O55123 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC34.62■■■■□ 3.13
Mmp10O55123 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
Mmp10O55123 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC34.48■■■■□ 3.11
Mmp10O55123 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
Mmp10O55123 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC34.34■■■■□ 3.09
Mmp10O55123 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC34.34■■■■□ 3.09
Mmp10O55123 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC34.26■■■■□ 3.08
Mmp10O55123 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.25■■■■□ 3.07
Mmp10O55123 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC34.24■■■■□ 3.07
Mmp10O55123 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
Mmp10O55123 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
Mmp10O55123 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC34.11■■■■□ 3.05
Mmp10O55123 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
Mmp10O55123 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC34.07■■■■□ 3.04
Mmp10O55123 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
Mmp10O55123 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
Mmp10O55123 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC33.94■■■■□ 3.02
Mmp10O55123 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC33.92■■■■□ 3.02
Mmp10O55123 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC33.92■■■■□ 3.02
Mmp10O55123 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
Mmp10O55123 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
Mmp10O55123 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.89■■■■□ 3.02
Mmp10O55123 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC33.81■■■■□ 3
Mmp10O55123 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
Mmp10O55123 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
Mmp10O55123 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
Mmp10O55123 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
Mmp10O55123 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
Mmp10O55123 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC33.65■■■□□ 2.98
Mmp10O55123 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
Mmp10O55123 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC33.57■■■□□ 2.96
Mmp10O55123 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.56■■■□□ 2.96
Mmp10O55123 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
Mmp10O55123 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
Mmp10O55123 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
Mmp10O55123 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
Mmp10O55123 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Mmp10O55123 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
Mmp10O55123 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
Mmp10O55123 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC33.24■■■□□ 2.91
Mmp10O55123 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
Mmp10O55123 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC33.22■■■□□ 2.91
Mmp10O55123 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
Mmp10O55123 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC33.19■■■□□ 2.9
Mmp10O55123 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC33.08■■■□□ 2.89
Mmp10O55123 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC33.04■■■□□ 2.88
Mmp10O55123 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.03■■■□□ 2.88
Mmp10O55123 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC33■■■□□ 2.87
Mmp10O55123 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
Mmp10O55123 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
Mmp10O55123 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.86
Mmp10O55123 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.89■■■□□ 2.86
Mmp10O55123 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
Mmp10O55123 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
Mmp10O55123 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms