Protein–RNA interactions for Protein: Q9R078

Prkab1, 5'-AMP-activated protein kinase subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkab1Q9R078 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC44.86■■■■■ 4.77
Prkab1Q9R078 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC41.49■■■■■ 4.23
Prkab1Q9R078 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.88■■■■■ 4.13
Prkab1Q9R078 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC39.15■■■■□ 3.86
Prkab1Q9R078 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC38.89■■■■□ 3.82
Prkab1Q9R078 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.42■■■■□ 3.74
Prkab1Q9R078 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC38.3■■■■□ 3.72
Prkab1Q9R078 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
Prkab1Q9R078 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
Prkab1Q9R078 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
Prkab1Q9R078 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
Prkab1Q9R078 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC37.42■■■■□ 3.58
Prkab1Q9R078 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
Prkab1Q9R078 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.16■■■■□ 3.54
Prkab1Q9R078 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
Prkab1Q9R078 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
Prkab1Q9R078 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC36.28■■■■□ 3.4
Prkab1Q9R078 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC36.2■■■■□ 3.38
Prkab1Q9R078 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC36.15■■■■□ 3.38
Prkab1Q9R078 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
Prkab1Q9R078 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC36.06■■■■□ 3.36
Prkab1Q9R078 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
Prkab1Q9R078 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.86■■■■□ 3.33
Prkab1Q9R078 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
Prkab1Q9R078 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
Prkab1Q9R078 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
Prkab1Q9R078 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
Prkab1Q9R078 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
Prkab1Q9R078 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
Prkab1Q9R078 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
Prkab1Q9R078 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
Prkab1Q9R078 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC35.43■■■■□ 3.26
Prkab1Q9R078 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC35.42■■■■□ 3.26
Prkab1Q9R078 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC35.36■■■■□ 3.25
Prkab1Q9R078 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC35.33■■■■□ 3.25
Prkab1Q9R078 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
Prkab1Q9R078 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
Prkab1Q9R078 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC34.76■■■■□ 3.15
Prkab1Q9R078 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.67■■■■□ 3.14
Prkab1Q9R078 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
Prkab1Q9R078 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC34.51■■■■□ 3.12
Prkab1Q9R078 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
Prkab1Q9R078 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
Prkab1Q9R078 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
Prkab1Q9R078 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
Prkab1Q9R078 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC34.31■■■■□ 3.08
Prkab1Q9R078 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
Prkab1Q9R078 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC34.26■■■■□ 3.08
Prkab1Q9R078 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.22■■■■□ 3.07
Prkab1Q9R078 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC34.09■■■■□ 3.05
Prkab1Q9R078 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC34.07■■■■□ 3.05
Prkab1Q9R078 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
Prkab1Q9R078 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
Prkab1Q9R078 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC33.93■■■■□ 3.02
Prkab1Q9R078 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC33.91■■■■□ 3.02
Prkab1Q9R078 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC33.81■■■■□ 3
Prkab1Q9R078 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
Prkab1Q9R078 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
Prkab1Q9R078 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
Prkab1Q9R078 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC33.69■■■□□ 2.98
Prkab1Q9R078 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC33.59■■■□□ 2.97
Prkab1Q9R078 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
Prkab1Q9R078 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.5■■■□□ 2.95
Prkab1Q9R078 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
Prkab1Q9R078 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
Prkab1Q9R078 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
Prkab1Q9R078 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
Prkab1Q9R078 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC33.34■■■□□ 2.93
Prkab1Q9R078 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC33.33■■■□□ 2.93
Prkab1Q9R078 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
Prkab1Q9R078 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.3■■■□□ 2.92
Prkab1Q9R078 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC33.3■■■□□ 2.92
Prkab1Q9R078 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
Prkab1Q9R078 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
Prkab1Q9R078 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC33.25■■■□□ 2.91
Prkab1Q9R078 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC33.25■■■□□ 2.91
Prkab1Q9R078 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
Prkab1Q9R078 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
Prkab1Q9R078 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
Prkab1Q9R078 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Prkab1Q9R078 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
Prkab1Q9R078 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC33.1■■■□□ 2.89
Prkab1Q9R078 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Prkab1Q9R078 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC33.07■■■□□ 2.88
Prkab1Q9R078 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
Prkab1Q9R078 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
Prkab1Q9R078 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
Prkab1Q9R078 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
Prkab1Q9R078 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
Prkab1Q9R078 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC32.92■■■□□ 2.86
Prkab1Q9R078 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC32.91■■■□□ 2.86
Prkab1Q9R078 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
Prkab1Q9R078 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC32.85■■■□□ 2.85
Prkab1Q9R078 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
Prkab1Q9R078 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC32.83■■■□□ 2.85
Prkab1Q9R078 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC32.81■■■□□ 2.84
Prkab1Q9R078 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
Prkab1Q9R078 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
Prkab1Q9R078 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC32.68■■■□□ 2.82
Prkab1Q9R078 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.67■■■□□ 2.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.1 ms