RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000025354.3

Pggt1b-201, Transcript of Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Pggt1b, Length 2,736 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Krtap4-8B1AQA8 209 aa4.49□□□□□ -1.69
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Mt4P47945 62 aa4.45□□□□□ -1.7
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Lce1eQ9D139 143 aa4.44□□□□□ -1.7
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gm10272F7CZ33 110 aa4.43□□□□□ -1.7
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Krtap4-9B1AQA9 244 aa4.41□□□□□ -1.7
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gm38119A0A0A6YX29 146 aa4.37□□□□□ -1.71
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Sprr2gO70558 76 aa4.36□□□□□ -1.71
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gm11938Q9D3H4 131 aa4.34□□□□□ -1.71
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Syne1Q6ZWR6 8799 aa4.31□□□□□ -1.72
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gm11562A0PK51 136 aa4.3□□□□□ -1.72
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 4933428G20RikQ9D3X4 101 aa4.29□□□□□ -1.72
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Krtap4-13Q9D7P3 165 aa4.28□□□□□ -1.72
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Lce1cQ9D1C5 147 aa4.24□□□□□ -1.73
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Sprr2dO70555 85 aa4.23□□□□□ -1.73
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Lce1bQ9D149 137 aa4.21□□□□□ -1.74
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2300003K06RikA2A4M0 262 aa4.2□□□□□ -1.74
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Sprr2kO70562 68 aa4.2□□□□□ -1.74
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Lce3bQ9CQM7 98 aa4.12□□□□□ -1.75
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Lce1fB9EJP6 147 aa4.09□□□□□ -1.75
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Lce1a1Q9CQH5 143 aa4.09□□□□□ -1.75
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gm10100J3QK64 120 aa4.06□□□□□ -1.76
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Lce1lQ9D1G7 135 aa4.01□□□□□ -1.77
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gm45618A0A1B0GSA0 219 aa3.97□□□□□ -1.77
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gm10142J3KMP7 120 aa3.96□□□□□ -1.78
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Lce1kJ3QP15 125 aa3.94□□□□□ -1.78
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Krtap19-4Q925H7 84 aa3.93□□□□□ -1.78
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Lce3cQ91V05 98 aa3.88□□□□□ -1.79
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Sprr2iO70560 76 aa3.87□□□□□ -1.79
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Krtap6-3A0A087WQL6 57 aa3.86□□□□□ -1.79
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Krtap20-2E9Q0A8 60 aa3.85□□□□□ -1.79
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Lce3dE9Q8V1 98 aa3.85□□□□□ -1.79
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Macf1Q9QXZ0 7354 aaKnown RBP3.83□□□□□ -1.8
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Lce3eF8VQJ0 98 aa3.81□□□□□ -1.8
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Lce3fQ6PAI4 98 aa3.81□□□□□ -1.8
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 ObscnA2AAJ9 8891 aaKnown RBP3.8□□□□□ -1.8
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Sprr2hO70559 108 aa3.77□□□□□ -1.81
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gm11568A2A4M2 211 aa3.74□□□□□ -1.81
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Krtap9-1Q64526 186 aa3.74□□□□□ -1.81
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Mt1P02802 61 aaKnown RBP3.72□□□□□ -1.81
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Lce3aQ497I5 98 aa3.68□□□□□ -1.82
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Krtap5-2Q9D5Z7 189 aa3.65□□□□□ -1.83
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Sprr2eO70556 76 aa3.64□□□□□ -1.83
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Krtap31-1Q9D644 177 aa3.63□□□□□ -1.83
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Sprr2fO70557 76 aa3.61□□□□□ -1.83
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gm39115A0A1B0GSH7 232 aa3.57□□□□□ -1.84
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Krtap4-16Q91W93 202 aa3.57□□□□□ -1.84
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Kmt2dQ6PDK2 5588 aa3.54□□□□□ -1.84
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Hmcn1D3YXG0 5634 aa3.53□□□□□ -1.85
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gm11554B1AQB2 190 aa3.51□□□□□ -1.85
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Muc16A0A140LJ72 8478 aa3.5□□□□□ -1.85
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gm11559Q9D3H7 191 aa3.45□□□□□ -1.86
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gm10153A0A1B0GRL1 320 aa3.44□□□□□ -1.86
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gm4553A0A1B0GSA9 284 aa3.38□□□□□ -1.87
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gm2431E9Q8S1 172 aa3.33□□□□□ -1.88
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Mt3P28184 68 aa3.32□□□□□ -1.88
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gm45337A0A1B0GS71 263 aa3.3□□□□□ -1.88
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Krtap31-2Q8CAY5 177 aa3.27□□□□□ -1.89
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Muc19Q6PZE0 7524 aa3.26□□□□□ -1.89
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gm29735A0A1B0GT06 219 aa3.25□□□□□ -1.89
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gpr98Q8VHN7 6298 aaKnown RBP3.22□□□□□ -1.89
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 DstQ91ZU6 7393 aaKnown RBP3.2□□□□□ -1.9
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gm10024A0A0A0MQA4 119 aa3.19□□□□□ -1.9
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Eppk1Q8R0W0 6548 aa3.18□□□□□ -1.9
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gm40460A0A1B0GR10 244 aa3.18□□□□□ -1.9
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gm7579A0A1B0GRJ4 243 aa3.18□□□□□ -1.9
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Krtap5-5Q2TA51 241 aa3.18□□□□□ -1.9
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Krtap5-4Q62220 223 aa3.18□□□□□ -1.9
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gm11639A0A1D5RLM8 5808 aa3.12□□□□□ -1.91
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gm11567Q9D141 195 aa3.05□□□□□ -1.92
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 NebE9Q1W3 7152 aa3.03□□□□□ -1.92
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 AhnakE9Q616 5656 aaKnown RBP2.88□□□□□ -1.95
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Krtap5-1Q64507 230 aa2.86□□□□□ -1.95
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 1110025L11RikO09048 78 aa2.77□□□□□ -1.97
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Krtap6-5Q925H3 78 aa2.77□□□□□ -1.97
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gm4559A4IF42 199 aa2.72□□□□□ -1.97
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gm10229O08631 77 aa2.47□□□□□ -2.01
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Sprr2bO70554 98 aa2.36□□□□□ -2.03
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Krtap21-1Q925H4 128 aa2.26□□□□□ -2.05
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Phgr1Q8K0G7 91 aa2.22□□□□□ -2.05
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Krtap6-2O08884 159 aa2.12□□□□□ -2.07
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