RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000635152.1

BRF1-222, Transcript of BRF1, RNA polymerase III transcription initiation factor subunit, human

TSL 2

Gene BRF1, Length 2,876 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BRF1-222	ENST00000635152	CFAP100	Q494V2	611 aa		15.03	■□□□□ -0
BRF1-222	ENST00000635152	FAM182B	Q5T319	152 aa		15.03	■□□□□ -0
BRF1-222	ENST00000635152	OSBPL5	Q9H0X9	879 aa	Predicted RBP	15.03	■□□□□ -0
BRF1-222	ENST00000635152	FANCL	Q9NW38	375 aa		15.03	■□□□□ -0
BRF1-222	ENST00000635152	SERTAD1	Q9UHV2	236 aa		15.03	■□□□□ -0
BRF1-222	ENST00000635152	FBXO2	Q9UK22	296 aa	Predicted RBP	15.03	■□□□□ -0
BRF1-222	ENST00000635152	PRDM4	Q9UKN5	801 aa		15.03	■□□□□ -0
BRF1-222	ENST00000635152	BMP6	P22004	513 aa		15.03	■□□□□ -0
BRF1-222	ENST00000635152	PDE4B	Q07343	736 aa		15.03	■□□□□ -0
BRF1-222	ENST00000635152	EARS2	Q5JPH6	523 aa	Known RBP	15.03	■□□□□ -0
BRF1-222	ENST00000635152	DOCK2	Q92608	1830 aa		15.03	■□□□□ -0
BRF1-222	ENST00000635152	IKBKB	O14920	756 aa		15.03	■□□□□ -0
BRF1-222	ENST00000635152	PRR29	P0C7W0	189 aa		15.03	■□□□□ -0
BRF1-222	ENST00000635152	PTPRE	P23469	700 aa		15.03	■□□□□ -0
BRF1-222	ENST00000635152	PRDX5	P30044	214 aa		15.03	■□□□□ -0
BRF1-222	ENST00000635152	FAM47A	Q5JRC9	791 aa		15.03	■□□□□ -0
BRF1-222	ENST00000635152	CTR9	Q6PD62	1173 aa		15.03	■□□□□ -0
BRF1-222	ENST00000635152	CATIP	Q7Z7H3	387 aa		15.03	■□□□□ -0
BRF1-222	ENST00000635152	IQCA1	Q86XH1	822 aa		15.03	■□□□□ -0
BRF1-222	ENST00000635152	CCAR2	Q8N163	923 aa	Known RBP	15.03	■□□□□ -0
BRF1-222	ENST00000635152	IMPACT	Q9P2X3	320 aa		15.03	■□□□□ -0
BRF1-222	ENST00000635152	FAM237A	A0A1B0GTK4	181 aa		15.02	■□□□□ -0
BRF1-222	ENST00000635152	RPS8	P62241	208 aa	Known RBP	15.02	■□□□□ -0
BRF1-222	ENST00000635152	MECOM	Q03112	1051 aa		15.02	■□□□□ -0
BRF1-222	ENST00000635152	GOLGA8F	Q08AF8	430 aa		15.02	■□□□□ -0
BRF1-222	ENST00000635152	GOLGA8DP	Q0D2H9	430 aa		15.02	■□□□□ -0
BRF1-222	ENST00000635152	NBPF5P	Q86XG9	351 aa	Predicted RBP	15.02	■□□□□ -0
BRF1-222	ENST00000635152	NPHP1	O15259	732 aa		15.02	□□□□□ -0.01
BRF1-222	ENST00000635152	POSTN	Q15063	836 aa		15.02	□□□□□ -0.01
BRF1-222	ENST00000635152	SLC51A	Q86UW1	340 aa		15.02	□□□□□ -0.01
BRF1-222	ENST00000635152	SETDB2	Q96T68	719 aa		15.02	□□□□□ -0.01
BRF1-222	ENST00000635152	CSRNP2	Q9H175	543 aa		15.02	□□□□□ -0.01
BRF1-222	ENST00000635152	ANAPC4	Q9UJX5	808 aa		15.02	□□□□□ -0.01
BRF1-222	ENST00000635152	PAXBP1	Q9Y5B6	917 aa		15.02	□□□□□ -0.01
BRF1-222	ENST00000635152	BAZ2B	Q9UIF8	2168 aa	Known RBP	15.02	□□□□□ -0.01
BRF1-222	ENST00000635152	CHD4	Q14839	1912 aa		15.01	□□□□□ -0.01
BRF1-222	ENST00000635152	CTIF	O43310	598 aa	Known RBP	15.01	□□□□□ -0.01
BRF1-222	ENST00000635152	PKN1	Q16512	942 aa		15.01	□□□□□ -0.01
BRF1-222	ENST00000635152	NSUN4	Q96CB9	384 aa	Known RBP	15.01	□□□□□ -0.01
BRF1-222	ENST00000635152	NLRP3	Q96P20	1036 aa		15.01	□□□□□ -0.01
BRF1-222	ENST00000635152	RNF26	Q9BY78	433 aa	Predicted RBP	15.01	□□□□□ -0.01
BRF1-222	ENST00000635152	PHLPP1	O60346	1717 aa		15.01	□□□□□ -0.01
BRF1-222	ENST00000635152	TMEM232	C9JQI7	657 aa		15.01	□□□□□ -0.01
BRF1-222	ENST00000635152	NOM1	Q5C9Z4	860 aa	Known RBP	15.01	□□□□□ -0.01
BRF1-222	ENST00000635152	BARGIN	Q6ZT62	677 aa		15.01	□□□□□ -0.01
BRF1-222	ENST00000635152	NYAP1	Q6ZVC0	841 aa		15.01	□□□□□ -0.01
BRF1-222	ENST00000635152	TXNRD3	Q86VQ6	643 aa		15.01	□□□□□ -0.01
BRF1-222	ENST00000635152	TRMT44	Q8IYL2	757 aa	Known RBP	15.01	□□□□□ -0.01
BRF1-222	ENST00000635152	NID2	Q14112	1375 aa		15.01	□□□□□ -0.01
BRF1-222	ENST00000635152	CYP2D6	P10635	497 aa		15	□□□□□ -0.01
BRF1-222	ENST00000635152	XBP1	P17861	261 aa		15	□□□□□ -0.01
BRF1-222	ENST00000635152	MDM2	Q00987	491 aa	Predicted RBP	15	□□□□□ -0.01
BRF1-222	ENST00000635152	PPP4R3B	Q5MIZ7	849 aa		15	□□□□□ -0.01
BRF1-222	ENST00000635152	E4F1	Q66K89	784 aa	Predicted RBP	15	□□□□□ -0.01
BRF1-222	ENST00000635152	PDCL2	Q8N4E4	241 aa		15	□□□□□ -0.01
BRF1-222	ENST00000635152	C8orf37	Q96NL8	207 aa		15	□□□□□ -0.01
BRF1-222	ENST00000635152	PRDM10	Q9NQV6	1147 aa		15	□□□□□ -0.01
BRF1-222	ENST00000635152	ECM29	Q5VYK3	1845 aa		15	□□□□□ -0.01
BRF1-222	ENST00000635152	WNT7A	O00755	349 aa		15	□□□□□ -0.01
BRF1-222	ENST00000635152	GNPAT	O15228	680 aa		15	□□□□□ -0.01
BRF1-222	ENST00000635152	HIBADH	P31937	336 aa	Known RBP	15	□□□□□ -0.01
BRF1-222	ENST00000635152	CCDC150	Q8NCX0	1101 aa		15	□□□□□ -0.01
BRF1-222	ENST00000635152	EPSTI1	Q96J88	318 aa		15	□□□□□ -0.01
BRF1-222	ENST00000635152	MTA3	Q9BTC8	594 aa		15	□□□□□ -0.01
BRF1-222	ENST00000635152	BRIP1	Q9BX63	1249 aa		15	□□□□□ -0.01
BRF1-222	ENST00000635152	MAN1B1	Q9UKM7	699 aa		15	□□□□□ -0.01
BRF1-222	ENST00000635152	TIAM2	Q8IVF5	1701 aa		15	□□□□□ -0.01
BRF1-222	ENST00000635152	NCBP1	Q09161	790 aa	Known RBP	14.99	□□□□□ -0.01
BRF1-222	ENST00000635152	TROAP	Q12815	778 aa		14.99	□□□□□ -0.01
BRF1-222	ENST00000635152	FBXO33	Q7Z6M2	555 aa		14.99	□□□□□ -0.01
BRF1-222	ENST00000635152	DHX58	Q96C10	678 aa		14.99	□□□□□ -0.01
BRF1-222	ENST00000635152	NOL12	Q9UGY1	213 aa	Known RBP eCLIP	14.99	□□□□□ -0.01
BRF1-222	ENST00000635152	HOOK1	Q9UJC3	728 aa	Known RBP	14.99	□□□□□ -0.01
BRF1-222	ENST00000635152	SRPRB	Q9Y5M8	271 aa	Known RBP	14.99	□□□□□ -0.01
BRF1-222	ENST00000635152		V9GYY5	206 aa	Predicted RBP	14.99	□□□□□ -0.01
BRF1-222	ENST00000635152	AHDC1	Q5TGY3	1603 aa	Predicted RBP	14.99	□□□□□ -0.01
BRF1-222	ENST00000635152	CIC	Q96RK0	1608 aa	Predicted RBP	14.99	□□□□□ -0.01
BRF1-222	ENST00000635152	TRIM75P	A6NK02	468 aa		14.99	□□□□□ -0.01
BRF1-222	ENST00000635152	ZPR1	O75312	459 aa		14.99	□□□□□ -0.01
BRF1-222	ENST00000635152	AFM	P43652	599 aa		14.99	□□□□□ -0.01
BRF1-222	ENST00000635152	SMARCE1	Q969G3	411 aa		14.99	□□□□□ -0.01
BRF1-222	ENST00000635152	DCP1A	Q9NPI6	582 aa	Predicted RBP	14.99	□□□□□ -0.01
BRF1-222	ENST00000635152	BAZ2A	Q9UIF9	1905 aa	Known RBP	14.99	□□□□□ -0.01
BRF1-222	ENST00000635152	CASP1	P29466	404 aa		14.99	□□□□□ -0.01
BRF1-222	ENST00000635152	KRT2	P35908	639 aa		14.99	□□□□□ -0.01
BRF1-222	ENST00000635152	RCAN1	P53805	252 aa		14.99	□□□□□ -0.01
BRF1-222	ENST00000635152	FMR1	Q06787	632 aa	Known RBP eCLIP	14.99	□□□□□ -0.01
BRF1-222	ENST00000635152	FUT2	Q10981	343 aa		14.99	□□□□□ -0.01
BRF1-222	ENST00000635152	ZNF174	Q15697	407 aa		14.99	□□□□□ -0.01
BRF1-222	ENST00000635152	AMIGO3	Q86WK7	504 aa		14.99	□□□□□ -0.01
BRF1-222	ENST00000635152	CEP131	Q9UPN4	1083 aa		14.99	□□□□□ -0.01
BRF1-222	ENST00000635152	MYH2	Q9UKX2	1941 aa		14.98	□□□□□ -0.01
BRF1-222	ENST00000635152	WNK3	Q9BYP7	1800 aa		14.98	□□□□□ -0.01
BRF1-222	ENST00000635152	CDK11B	P21127	795 aa	Known RBP	14.98	□□□□□ -0.01
BRF1-222	ENST00000635152	NGLY1	Q96IV0	654 aa		14.98	□□□□□ -0.01
BRF1-222	ENST00000635152	CCDC94	Q9BW85	323 aa	Predicted RBP	14.98	□□□□□ -0.01
BRF1-222	ENST00000635152	COL22A1	Q8NFW1	1626 aa	Predicted RBP	14.98	□□□□□ -0.01
BRF1-222	ENST00000635152	VEGFA	P15692	232 aa	Predicted RBP	14.98	□□□□□ -0.01
BRF1-222	ENST00000635152	PPP1R13B	Q96KQ4	1090 aa		14.98	□□□□□ -0.01
BRF1-222	ENST00000635152	PHF20	Q9BVI0	1012 aa		14.98	□□□□□ -0.01

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