RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000615445.4

PTPRJ-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type J, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene PTPRJ, Length 4,773 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJ-208ENST00000615445 CAPZA3Q96KX2 299 aa23.23■■□□□ 1.31
PTPRJ-208ENST00000615445 PPIP5K2O43314 1243 aa23.23■■□□□ 1.31
PTPRJ-208ENST00000615445 USH1GQ495M9 461 aa23.23■■□□□ 1.31
PTPRJ-208ENST00000615445 PICK1Q9NRD5 415 aa23.23■■□□□ 1.31
PTPRJ-208ENST00000615445 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP23.22■■□□□ 1.31
PTPRJ-208ENST00000615445 PNMA1Q8ND90 353 aa23.22■■□□□ 1.31
PTPRJ-208ENST00000615445 FAM182BQ5T319 152 aa23.22■■□□□ 1.31
PTPRJ-208ENST00000615445 ZNF804BA4D1E1 1349 aa23.22■■□□□ 1.31
PTPRJ-208ENST00000615445 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa23.22■■□□□ 1.31
PTPRJ-208ENST00000615445 ECM2O94769 699 aaPredicted RBP23.22■■□□□ 1.31
PTPRJ-208ENST00000615445 SASH1O94885 1247 aa23.22■■□□□ 1.31
PTPRJ-208ENST00000615445 ACTN2P35609 894 aa23.22■■□□□ 1.31
PTPRJ-208ENST00000615445 DLGAP5Q15398 846 aa23.22■■□□□ 1.31
PTPRJ-208ENST00000615445 CCDC122Q5T0U0 273 aa23.22■■□□□ 1.31
PTPRJ-208ENST00000615445 PI16Q6UXB8 463 aa23.22■■□□□ 1.31
PTPRJ-208ENST00000615445 LMBR1Q8WVP7 490 aa23.21■■□□□ 1.31
PTPRJ-208ENST00000615445 GOLGA1Q92805 767 aa23.21■■□□□ 1.31
PTPRJ-208ENST00000615445 ZMYM6O95789 1325 aa23.21■■□□□ 1.31
PTPRJ-208ENST00000615445 NR1I2O75469 434 aa23.21■■□□□ 1.31
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PTPRJ-208ENST00000615445 BTBD18B2RXH4 712 aa23.21■■□□□ 1.31
PTPRJ-208ENST00000615445 SCRN1Q12765 414 aa23.21■■□□□ 1.31
PTPRJ-208ENST00000615445 HERC4Q5GLZ8 1057 aaPredicted RBP23.21■■□□□ 1.31
PTPRJ-208ENST00000615445 NCAPH2Q6IBW4 605 aa23.21■■□□□ 1.31
PTPRJ-208ENST00000615445 DYMQ7RTS9 669 aa23.21■■□□□ 1.31
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PTPRJ-208ENST00000615445 SMCO2A6NFE2 343 aa23.21■■□□□ 1.31
PTPRJ-208ENST00000615445 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP23.21■■□□□ 1.31
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PTPRJ-208ENST00000615445 SERTAD1Q9UHV2 236 aa23.2■■□□□ 1.31
PTPRJ-208ENST00000615445 CFBP00751 764 aa23.2■■□□□ 1.3
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PTPRJ-208ENST00000615445 GRM1Q13255 1194 aa23.2■■□□□ 1.3
PTPRJ-208ENST00000615445 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP23.2■■□□□ 1.3
PTPRJ-208ENST00000615445 POLA2Q14181 598 aa23.2■■□□□ 1.3
PTPRJ-208ENST00000615445 KIAA0825Q8IV33 1275 aa23.2■■□□□ 1.3
PTPRJ-208ENST00000615445 KRT222Q8N1A0 295 aa23.2■■□□□ 1.3
PTPRJ-208ENST00000615445 ATG3Q9NT62 314 aa23.2■■□□□ 1.3
PTPRJ-208ENST00000615445 FRMD4BQ9Y2L6 1034 aa23.2■■□□□ 1.3
PTPRJ-208ENST00000615445 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP23.19■■□□□ 1.3
PTPRJ-208ENST00000615445 PTCH1Q13635 1447 aa23.19■■□□□ 1.3
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PTPRJ-208ENST00000615445 SCNN1DP51172 638 aa23.19■■□□□ 1.3
PTPRJ-208ENST00000615445 DOK7Q18PE1 504 aa23.19■■□□□ 1.3
PTPRJ-208ENST00000615445 CABP7Q86V35 215 aa23.19■■□□□ 1.3
PTPRJ-208ENST00000615445 FBXO18Q8NFZ0 1043 aa23.19■■□□□ 1.3
PTPRJ-208ENST00000615445 KIAA1468Q9P260 1216 aa23.19■■□□□ 1.3
PTPRJ-208ENST00000615445 CETN3O15182 167 aa23.19■■□□□ 1.3
PTPRJ-208ENST00000615445 PNOCQ13519 176 aa23.19■■□□□ 1.3
PTPRJ-208ENST00000615445 EPB41P11171 864 aaKnown RBP23.18■■□□□ 1.3
PTPRJ-208ENST00000615445 FAM196AQ6ZSG2 479 aa23.18■■□□□ 1.3
PTPRJ-208ENST00000615445 BLZF1Q9H2G9 400 aa23.18■■□□□ 1.3
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PTPRJ-208ENST00000615445 CCDC91Q7Z6B0 441 aa23.18■■□□□ 1.3
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PTPRJ-208ENST00000615445 C17orf53Q8N3J3 647 aaPredicted RBP23.17■■□□□ 1.3
PTPRJ-208ENST00000615445 MED23Q9ULK4 1368 aa23.17■■□□□ 1.3
PTPRJ-208ENST00000615445 TMEM110-MUSTN1A8MSY1 372 aa23.17■■□□□ 1.3
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PTPRJ-208ENST00000615445 GJC1P36383 396 aa23.17■■□□□ 1.3
PTPRJ-208ENST00000615445 BLIDQ8IZY5 108 aa23.17■■□□□ 1.3
PTPRJ-208ENST00000615445 PPP1R9BQ96SB3 815 aa23.17■■□□□ 1.3
PTPRJ-208ENST00000615445 TAB2Q9NYJ8 693 aa23.17■■□□□ 1.3
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PTPRJ-208ENST00000615445 TRIM14Q14142 442 aa23.16■■□□□ 1.3
PTPRJ-208ENST00000615445 FLAD1Q8NFF5 587 aa23.16■■□□□ 1.3
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PTPRJ-208ENST00000615445 UNC13BO14795 1591 aa23.16■■□□□ 1.3
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PTPRJ-208ENST00000615445 GPT2Q8TD30 523 aa23.15■■□□□ 1.3
PTPRJ-208ENST00000615445 RHOXF2Q9BQY4 288 aa23.15■■□□□ 1.3
PTPRJ-208ENST00000615445 M0R2C6 588 aa23.15■■□□□ 1.3
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PTPRJ-208ENST00000615445 APOA5Q6Q788 366 aa23.15■■□□□ 1.3
PTPRJ-208ENST00000615445 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP23.15■■□□□ 1.3
PTPRJ-208ENST00000615445 PCDHA7Q9UN72 937 aa23.15■■□□□ 1.3
PTPRJ-208ENST00000615445 DDX39AO00148 427 aaKnown RBP23.15■■□□□ 1.3
PTPRJ-208ENST00000615445 SCG2P13521 617 aa23.15■■□□□ 1.3
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