RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000613939.1

HOXA11-AS1_1.1-201, humanhuman

BASIC

Gene HOXA11-AS1_1, Length 98 nt, Biotype misc RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 GPATCH3Q96I76 525 aa27.27■■□□□ 1.96
HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 WDR18Q9BV38 432 aa27.27■■□□□ 1.96
HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 AS3MTQ9HBK9 375 aa27.27■■□□□ 1.96
HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 ZBTB21Q9ULJ3 1066 aa27.27■■□□□ 1.96
HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 AGTPBP1Q9UPW5 1226 aa27.27■■□□□ 1.96
HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 BCRP11274 1271 aa27.26■■□□□ 1.95
HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 ARHGEF6Q15052 776 aa27.26■■□□□ 1.95
HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 PROCA1Q8NCQ7 364 aaPredicted RBP27.26■■□□□ 1.95
HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 MCM9Q9NXL9 1143 aa27.26■■□□□ 1.95
HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 LOC285556D6RIA3 1793 aa27.26■■□□□ 1.95
HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 KIF22Q14807 665 aa27.25■■□□□ 1.95
HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 SH3D19Q5HYK7 790 aa27.25■■□□□ 1.95
HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 GINM1Q9NU53 330 aa27.25■■□□□ 1.95
HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 GH2P01242 217 aa27.24■■□□□ 1.95
HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 CYP2D6P10635 497 aa27.24■■□□□ 1.95
HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 SHMT1P34896 483 aa27.24■■□□□ 1.95
HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP27.24■■□□□ 1.95
HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 MTMR2Q13614 643 aa27.24■■□□□ 1.95
HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 PUS7LQ9H0K6 701 aaKnown RBP27.24■■□□□ 1.95
HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 BAZ2AQ9UIF9 1905 aaKnown RBP27.24■■□□□ 1.95
HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 BACE1P56817 501 aa27.23■■□□□ 1.95
HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 GABPAQ06546 454 aa27.23■■□□□ 1.95
HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 ZSCAN25Q6NSZ9 544 aa27.23■■□□□ 1.95
HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 KBTBD3Q8NAB2 608 aa27.23■■□□□ 1.95
HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 TRIM47Q96LD4 638 aa27.23■■□□□ 1.95
HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa27.23■■□□□ 1.95
HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 TTC41PQ6P2S7 1318 aa27.22■■□□□ 1.95
HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 PSMC4P43686 418 aa27.22■■□□□ 1.95
HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 CERKLQ49MI3 558 aaPredicted RBP27.22■■□□□ 1.95
HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 PI4K2BQ8TCG2 481 aa27.22■■□□□ 1.95
HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 ANKRD45Q5TZF3 282 aa27.21■■□□□ 1.95
HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 ATP8A2Q9NTI2 1148 aa27.21■■□□□ 1.95
HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 SMIM22K7EJ46 135 aa27.2■■□□□ 1.94
HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 EXOC6Q8TAG9 804 aa27.2■■□□□ 1.94
HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 SMCR8Q8TEV9 937 aaPredicted RBP27.2■■□□□ 1.94
HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 SALL3Q9BXA9 1300 aa27.19■■□□□ 1.94
HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 MGAMO43451 1857 aa27.19■■□□□ 1.94
HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 USP17L10C9JJH3 530 aa27.19■■□□□ 1.94
HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 GNRH1P01148 92 aa27.19■■□□□ 1.94
HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 MLLT1Q03111 559 aaPredicted RBP27.19■■□□□ 1.94
HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 ABCB5Q2M3G0 1257 aa27.19■■□□□ 1.94
HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 GCC1Q96CN9 775 aa27.19■■□□□ 1.94
HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 DYNLL2Q96FJ2 89 aa27.19■■□□□ 1.94
HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 SLC4A4Q9Y6R1 1079 aa27.19■■□□□ 1.94
HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 CYP2D7A0A087X1C5 515 aa27.18■■□□□ 1.94
HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 C19orf81C9J6K1 198 aa27.18■■□□□ 1.94
HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 RNF113AO15541 343 aaKnown RBP27.18■■□□□ 1.94
HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 FMNL1O95466 1100 aaPredicted RBP27.18■■□□□ 1.94
HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 MX1P20591 662 aa27.18■■□□□ 1.94
HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 RAB3GAP1Q15042 981 aa27.18■■□□□ 1.94
HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 SLC44A5Q8NCS7 719 aa27.18■■□□□ 1.94
HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 OSBP2Q969R2 916 aa27.18■■□□□ 1.94
HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 ARMC5Q96C12 935 aa27.18■■□□□ 1.94
HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 ASCC2Q9H1I8 757 aaPredicted RBP27.18■■□□□ 1.94
HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 TMOD4Q9NZQ9 345 aa27.18■■□□□ 1.94
HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 PNMA3Q9UL41 463 aa27.18■■□□□ 1.94
HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 ERC2O15083 957 aa27.17■■□□□ 1.94
HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 GLRX3O76003 335 aaKnown RBP27.17■■□□□ 1.94
HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 OSBPP22059 807 aa27.17■■□□□ 1.94
HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 GUCY1A2P33402 732 aa27.17■■□□□ 1.94
HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 AAMPQ13685 434 aa27.17■■□□□ 1.94
HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 ANKRD13CQ8N6S4 541 aa27.17■■□□□ 1.94
HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 STRBPQ96SI9 672 aaKnown RBP27.17■■□□□ 1.94
HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 EMILIN3Q9NT22 766 aa27.17■■□□□ 1.94
HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 SRRDQ9UH36 339 aa27.17■■□□□ 1.94
HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP27.17■■□□□ 1.94
HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 USP17L12C9JPN9 530 aa27.16■■□□□ 1.94
HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 USP17L21D6R901 530 aa27.16■■□□□ 1.94
HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP27.16■■□□□ 1.94
HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 C12orf60Q5U649 245 aa27.16■■□□□ 1.94
HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 CABP5Q9NP86 173 aa27.16■■□□□ 1.94
HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 HOXA7P31268 230 aaPredicted RBP27.15■■□□□ 1.94
HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 ACER1Q8TDN7 264 aa27.15■■□□□ 1.94
HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 APPBP2Q92624 585 aa27.15■■□□□ 1.94
HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 PRMT2P55345 433 aa27.14■■□□□ 1.94
HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 FCGRTP55899 365 aa27.14■■□□□ 1.94
HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 SEPT2Q15019 361 aa27.14■■□□□ 1.94
HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa27.14■■□□□ 1.94
HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 CTR9Q6PD62 1173 aa27.14■■□□□ 1.94
HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 USP17L2Q6R6M4 530 aa27.14■■□□□ 1.94
HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP27.14■■□□□ 1.94
HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 DOCK3Q8IZD9 2030 aa27.13■■□□□ 1.93
HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 BRCA2P51587 3418 aa27.13■■□□□ 1.93
HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 IGHDP01880 384 aa27.13■■□□□ 1.93
HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 ZFYP08048 801 aaPredicted RBP27.13■■□□□ 1.93
HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 HOXD10P28358 340 aa27.13■■□□□ 1.93
HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 ZYXQ15942 572 aaKnown RBP27.13■■□□□ 1.93
HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 SH3TC2Q8TF17 1288 aa27.13■■□□□ 1.93
HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 ZNF333Q96JL9 665 aa27.13■■□□□ 1.93
HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 P2RX7Q99572 595 aaKnown RBP27.13■■□□□ 1.93
HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 MYH8P13535 1937 aa27.13■■□□□ 1.93
HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 TNRC18O15417 2968 aaPredicted RBP27.13■■□□□ 1.93
HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 KIAA0100Q14667 2235 aaKnown RBP27.12■■□□□ 1.93
HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 POTEFA5A3E0 1075 aa27.12■■□□□ 1.93
HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 GSG1L2A8MUP6 293 aa27.12■■□□□ 1.93
HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 M0R2C6 588 aa27.12■■□□□ 1.93
HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 GCLCP48506 637 aaPredicted RBP27.12■■□□□ 1.93
HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 FAM110CQ1W6H9 321 aa27.12■■□□□ 1.93
HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP27.12■■□□□ 1.93
HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 STAP2Q9UGK3 403 aa27.12■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18 ms