RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000591041.5

CAPNS1-212, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 3

Gene CAPNS1, Length 812 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-212ENST00000591041 PSMD14O00487 310 aa26.39■■□□□ 1.82
CAPNS1-212ENST00000591041 ENTPD3O75355 529 aa26.39■■□□□ 1.82
CAPNS1-212ENST00000591041 PRDM1O75626 825 aa26.39■■□□□ 1.82
CAPNS1-212ENST00000591041 RAD17O75943 681 aa26.39■■□□□ 1.82
CAPNS1-212ENST00000591041 TFAP4Q01664 338 aa26.39■■□□□ 1.82
CAPNS1-212ENST00000591041 CFAP100Q494V2 611 aa26.39■■□□□ 1.82
CAPNS1-212ENST00000591041 ZNF654Q8IZM8 581 aa26.39■■□□□ 1.82
CAPNS1-212ENST00000591041 EHD4Q9H223 541 aa26.39■■□□□ 1.82
CAPNS1-212ENST00000591041 KAT14Q9H8E8 782 aa26.39■■□□□ 1.82
CAPNS1-212ENST00000591041 INCENPQ9NQS7 918 aa26.39■■□□□ 1.82
CAPNS1-212ENST00000591041 MYH1P12882 1939 aa26.38■■□□□ 1.81
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CAPNS1-212ENST00000591041 TRIM29Q14134 588 aa26.38■■□□□ 1.81
CAPNS1-212ENST00000591041 SEC23AQ15436 765 aa26.38■■□□□ 1.81
CAPNS1-212ENST00000591041 CTCFLQ8NI51 663 aaPredicted RBP26.38■■□□□ 1.81
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CAPNS1-212ENST00000591041 MAP3K14Q99558 947 aa26.37■■□□□ 1.81
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CAPNS1-212ENST00000591041 ORC3Q9UBD5 711 aaPredicted RBP26.37■■□□□ 1.81
CAPNS1-212ENST00000591041 HPS5Q9UPZ3 1129 aa26.37■■□□□ 1.81
CAPNS1-212ENST00000591041 STK36Q9NRP7 1315 aa26.37■■□□□ 1.81
CAPNS1-212ENST00000591041 GNAQP50148 359 aa26.36■■□□□ 1.81
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CAPNS1-212ENST00000591041 ANKS1AQ92625 1134 aa26.36■■□□□ 1.81
CAPNS1-212ENST00000591041 DDX11Q96FC9 970 aa26.36■■□□□ 1.81
CAPNS1-212ENST00000591041 CCDC17Q96LX7 622 aa26.36■■□□□ 1.81
CAPNS1-212ENST00000591041 NCOA5Q9HCD5 579 aaKnown RBP26.36■■□□□ 1.81
CAPNS1-212ENST00000591041 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP26.36■■□□□ 1.81
CAPNS1-212ENST00000591041 PI4KBQ9UBF8 816 aa26.36■■□□□ 1.81
CAPNS1-212ENST00000591041 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa26.36■■□□□ 1.81
CAPNS1-212ENST00000591041 SCN9AQ15858 1988 aa26.36■■□□□ 1.81
CAPNS1-212ENST00000591041 CDK5RAP2Q96SN8 1893 aa26.36■■□□□ 1.81
CAPNS1-212ENST00000591041 COL2A1P02458 1487 aaPredicted RBP26.36■■□□□ 1.81
CAPNS1-212ENST00000591041 JAK2O60674 1132 aa26.35■■□□□ 1.81
CAPNS1-212ENST00000591041 XBP1P17861 261 aa26.35■■□□□ 1.81
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CAPNS1-212ENST00000591041 FOXP4Q8IVH2 680 aaPredicted RBP26.35■■□□□ 1.81
CAPNS1-212ENST00000591041 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP26.35■■□□□ 1.81
CAPNS1-212ENST00000591041 FANCBQ8NB91 859 aa26.35■■□□□ 1.81
CAPNS1-212ENST00000591041 NUP133Q8WUM0 1156 aa26.35■■□□□ 1.81
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CAPNS1-212ENST00000591041 ZDHHC9Q9Y397 364 aa26.35■■□□□ 1.81
CAPNS1-212ENST00000591041 TACC3Q9Y6A5 838 aa26.35■■□□□ 1.81
CAPNS1-212ENST00000591041 IFNAR1P17181 557 aa26.34■■□□□ 1.81
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CAPNS1-212ENST00000591041 C8orf76Q96K31 380 aa26.34■■□□□ 1.81
CAPNS1-212ENST00000591041 GMLQ99445 158 aa26.34■■□□□ 1.81
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CAPNS1-212ENST00000591041 CXCL9Q07325 125 aa26.33■■□□□ 1.81
CAPNS1-212ENST00000591041 FAM47AQ5JRC9 791 aa26.33■■□□□ 1.81
CAPNS1-212ENST00000591041 MCTP1Q6DN14 999 aa26.33■■□□□ 1.81
CAPNS1-212ENST00000591041 DYNLL2Q96FJ2 89 aa26.33■■□□□ 1.81
CAPNS1-212ENST00000591041 SPDYE2BA6NHP3 402 aa26.32■■□□□ 1.8
CAPNS1-212ENST00000591041 SPDYE6P0CI01 402 aa26.32■■□□□ 1.8
CAPNS1-212ENST00000591041 RASA1P20936 1047 aa26.32■■□□□ 1.8
CAPNS1-212ENST00000591041 TNNI2P48788 182 aa26.32■■□□□ 1.8
CAPNS1-212ENST00000591041 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP26.32■■□□□ 1.8
CAPNS1-212ENST00000591041 ATL3Q6DD88 541 aa26.32■■□□□ 1.8
CAPNS1-212ENST00000591041 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP26.32■■□□□ 1.8
CAPNS1-212ENST00000591041 ZNF646O15015 1829 aaPredicted RBP26.32■■□□□ 1.8
CAPNS1-212ENST00000591041 CTDNEP1O95476 244 aa26.31■■□□□ 1.8
CAPNS1-212ENST00000591041 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa26.31■■□□□ 1.8
CAPNS1-212ENST00000591041 LZTS2Q9BRK4 669 aa26.31■■□□□ 1.8
CAPNS1-212ENST00000591041 FMNL1O95466 1100 aaPredicted RBP26.3■■□□□ 1.8
CAPNS1-212ENST00000591041 KRT85P78386 507 aa26.3■■□□□ 1.8
CAPNS1-212ENST00000591041 DPF2Q92785 391 aa26.3■■□□□ 1.8
CAPNS1-212ENST00000591041 PLIN4Q96Q06 1357 aa26.3■■□□□ 1.8
CAPNS1-212ENST00000591041 DEXIO95424 95 aa26.29■■□□□ 1.8
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CAPNS1-212ENST00000591041 GABPAQ06546 454 aa26.29■■□□□ 1.8
CAPNS1-212ENST00000591041 TNFAIP1Q13829 316 aa26.29■■□□□ 1.8
CAPNS1-212ENST00000591041 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP26.29■■□□□ 1.8
CAPNS1-212ENST00000591041 RNF26Q9BY78 433 aaPredicted RBP26.29■■□□□ 1.8
CAPNS1-212ENST00000591041 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP26.29■■□□□ 1.8
CAPNS1-212ENST00000591041 DDX4Q9NQI0 724 aaKnown RBP26.29■■□□□ 1.8
CAPNS1-212ENST00000591041 TOP1P11387 765 aaKnown RBP26.28■■□□□ 1.8
CAPNS1-212ENST00000591041 SLC26A6Q9BXS9 759 aa26.28■■□□□ 1.8
CAPNS1-212ENST00000591041 HERC5Q9UII4 1024 aaKnown RBP26.28■■□□□ 1.8
CAPNS1-212ENST00000591041 CFAP45Q9UL16 551 aa26.28■■□□□ 1.8
CAPNS1-212ENST00000591041 STX8Q9UNK0 236 aa26.28■■□□□ 1.8
CAPNS1-212ENST00000591041 MBD3O95983 291 aa26.27■■□□□ 1.8
CAPNS1-212ENST00000591041 LMNB1P20700 586 aa26.27■■□□□ 1.8
CAPNS1-212ENST00000591041 GNL2Q13823 731 aaKnown RBP26.27■■□□□ 1.8
CAPNS1-212ENST00000591041 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa26.27■■□□□ 1.8
CAPNS1-212ENST00000591041 CCDC144CPQ8IYA2 1237 aa26.27■■□□□ 1.8
CAPNS1-212ENST00000591041 PNMA1Q8ND90 353 aa26.27■■□□□ 1.8
CAPNS1-212ENST00000591041 FAM151AQ8WW52 585 aa26.27■■□□□ 1.8
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