RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000566515.5

CCNDBP1-208, Transcript of cyclin D1 binding protein 1, humanhuman

TSL 5

Gene CCNDBP1, Length 1,634 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1-208ENST00000566515 ZHX2Q9Y6X8 837 aa25.02■■□□□ 1.6
CCNDBP1-208ENST00000566515 PPIL2Q13356 520 aa25.01■■□□□ 1.59
CCNDBP1-208ENST00000566515 CERKLQ49MI3 558 aaPredicted RBP25.01■■□□□ 1.59
CCNDBP1-208ENST00000566515 CDK8P49336 464 aa25.01■■□□□ 1.59
CCNDBP1-208ENST00000566515 C16orf86Q6ZW13 317 aa25.01■■□□□ 1.59
CCNDBP1-208ENST00000566515 SWAP70Q9UH65 585 aa25.01■■□□□ 1.59
CCNDBP1-208ENST00000566515 FGAP02671 866 aa25■■□□□ 1.59
CCNDBP1-208ENST00000566515 MAP2K1Q02750 393 aaPredicted RBP25■■□□□ 1.59
CCNDBP1-208ENST00000566515 RUFY2Q8WXA3 655 aa25■■□□□ 1.59
CCNDBP1-208ENST00000566515 MANSC4A6NHS7 340 aaPredicted RBP24.99■■□□□ 1.59
CCNDBP1-208ENST00000566515 GH2P01242 217 aa24.99■■□□□ 1.59
CCNDBP1-208ENST00000566515 ASNSP08243 561 aa24.99■■□□□ 1.59
CCNDBP1-208ENST00000566515 ALX1Q15699 326 aa24.99■■□□□ 1.59
CCNDBP1-208ENST00000566515 MS4A4AQ96JQ5 239 aa24.99■■□□□ 1.59
CCNDBP1-208ENST00000566515 ZBTB21Q9ULJ3 1066 aa24.99■■□□□ 1.59
CCNDBP1-208ENST00000566515 PPARAQ07869 468 aa24.98■■□□□ 1.59
CCNDBP1-208ENST00000566515 ABCB5Q2M3G0 1257 aa24.98■■□□□ 1.59
CCNDBP1-208ENST00000566515 WBP1LQ9NX94 342 aa24.98■■□□□ 1.59
CCNDBP1-208ENST00000566515 TM4SF4P48230 202 aa24.97■■□□□ 1.59
CCNDBP1-208ENST00000566515 GTF2A2P52657 109 aa24.97■■□□□ 1.59
CCNDBP1-208ENST00000566515 SREBF2Q12772 1141 aa24.97■■□□□ 1.59
CCNDBP1-208ENST00000566515 TAOK2Q9UL54 1235 aa24.97■■□□□ 1.59
CCNDBP1-208ENST00000566515 AFG3L2Q9Y4W6 797 aa24.97■■□□□ 1.59
CCNDBP1-208ENST00000566515 ROBO3Q96MS0 1386 aa24.97■■□□□ 1.59
CCNDBP1-208ENST00000566515 RAD50Q92878 1312 aa24.97■■□□□ 1.59
CCNDBP1-208ENST00000566515 USP17L5A8MUK1 530 aa24.97■■□□□ 1.59
CCNDBP1-208ENST00000566515 SNAPC2Q13487 334 aa24.97■■□□□ 1.59
CCNDBP1-208ENST00000566515 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP24.97■■□□□ 1.59
CCNDBP1-208ENST00000566515 TRIM75PA6NK02 468 aa24.96■■□□□ 1.59
CCNDBP1-208ENST00000566515 MPHOSPH10O00566 681 aaKnown RBP24.96■■□□□ 1.59
CCNDBP1-208ENST00000566515 CTDSPL2Q05D32 466 aa24.96■■□□□ 1.59
CCNDBP1-208ENST00000566515 KCNH4Q9UQ05 1017 aa24.96■■□□□ 1.59
CCNDBP1-208ENST00000566515 PTPRFP10586 1907 aa24.96■■□□□ 1.59
CCNDBP1-208ENST00000566515 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa24.95■■□□□ 1.58
CCNDBP1-208ENST00000566515 SGSM2O43147 1006 aa24.95■■□□□ 1.58
CCNDBP1-208ENST00000566515 INHBEP58166 350 aa24.95■■□□□ 1.58
CCNDBP1-208ENST00000566515 RAB3GAP1Q15042 981 aa24.95■■□□□ 1.58
CCNDBP1-208ENST00000566515 CCL15Q16663 113 aa24.95■■□□□ 1.58
CCNDBP1-208ENST00000566515 BRI3BPQ8WY22 251 aa24.95■■□□□ 1.58
CCNDBP1-208ENST00000566515 MKNK2Q9HBH9 465 aa24.95■■□□□ 1.58
CCNDBP1-208ENST00000566515 CABP5Q9NP86 173 aa24.95■■□□□ 1.58
CCNDBP1-208ENST00000566515 GINM1Q9NU53 330 aa24.95■■□□□ 1.58
CCNDBP1-208ENST00000566515 HSPA1AP0DMV8 641 aaKnown RBP24.94■■□□□ 1.58
CCNDBP1-208ENST00000566515 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP24.94■■□□□ 1.58
CCNDBP1-208ENST00000566515 AKR1B1P15121 316 aa24.94■■□□□ 1.58
CCNDBP1-208ENST00000566515 SPP2Q13103 211 aa24.94■■□□□ 1.58
CCNDBP1-208ENST00000566515 PTPN18Q99952 460 aa24.94■■□□□ 1.58
CCNDBP1-208ENST00000566515 BEGAINQ9BUH8 593 aa24.94■■□□□ 1.58
CCNDBP1-208ENST00000566515 DSCC1Q9BVC3 393 aa24.94■■□□□ 1.58
CCNDBP1-208ENST00000566515 ZMYM6O95789 1325 aa24.94■■□□□ 1.58
CCNDBP1-208ENST00000566515 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP24.94■■□□□ 1.58
CCNDBP1-208ENST00000566515 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP24.94■■□□□ 1.58
CCNDBP1-208ENST00000566515 CXCL11O14625 94 aa24.94■■□□□ 1.58
CCNDBP1-208ENST00000566515 PRDM1O75626 825 aa24.94■■□□□ 1.58
CCNDBP1-208ENST00000566515 CETPP11597 493 aa24.94■■□□□ 1.58
CCNDBP1-208ENST00000566515 GUCY1A2P33402 732 aa24.94■■□□□ 1.58
CCNDBP1-208ENST00000566515 ZNF280CQ8ND82 737 aa24.94■■□□□ 1.58
CCNDBP1-208ENST00000566515 INCENPQ9NQS7 918 aa24.94■■□□□ 1.58
CCNDBP1-208ENST00000566515 SLC3A2P08195 630 aaKnown RBP24.93■■□□□ 1.58
CCNDBP1-208ENST00000566515 RASA1P20936 1047 aa24.93■■□□□ 1.58
CCNDBP1-208ENST00000566515 HAND2P61296 217 aa24.93■■□□□ 1.58
CCNDBP1-208ENST00000566515 SEPT2Q15019 361 aa24.93■■□□□ 1.58
CCNDBP1-208ENST00000566515 IFNL1Q8IU54 200 aa24.93■■□□□ 1.58
CCNDBP1-208ENST00000566515 AS3MTQ9HBK9 375 aa24.93■■□□□ 1.58
CCNDBP1-208ENST00000566515 RNF186Q9NXI6 227 aa24.93■■□□□ 1.58
CCNDBP1-208ENST00000566515 ANAPC4Q9UJX5 808 aa24.93■■□□□ 1.58
CCNDBP1-208ENST00000566515 PTH1RQ03431 593 aa24.92■■□□□ 1.58
CCNDBP1-208ENST00000566515 CCDC17Q96LX7 622 aa24.92■■□□□ 1.58
CCNDBP1-208ENST00000566515 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa24.92■■□□□ 1.58
CCNDBP1-208ENST00000566515 CDC45O75419 566 aa24.91■■□□□ 1.58
CCNDBP1-208ENST00000566515 TRPA1O75762 1119 aa24.91■■□□□ 1.58
CCNDBP1-208ENST00000566515 PDE4BQ07343 736 aa24.91■■□□□ 1.58
CCNDBP1-208ENST00000566515 WDR18Q9BV38 432 aa24.91■■□□□ 1.58
CCNDBP1-208ENST00000566515 TBC1D2Q9BYX2 928 aa24.91■■□□□ 1.58
CCNDBP1-208ENST00000566515 ZNF287Q9HBT7 754 aa24.91■■□□□ 1.58
CCNDBP1-208ENST00000566515 TACC3Q9Y6A5 838 aa24.91■■□□□ 1.58
CCNDBP1-208ENST00000566515 A0A0G2JLL6 359 aaPredicted RBP24.9■■□□□ 1.58
CCNDBP1-208ENST00000566515 MOGSQ13724 837 aa24.9■■□□□ 1.58
CCNDBP1-208ENST00000566515 TMEM179Q6ZVK1 233 aa24.9■■□□□ 1.58
CCNDBP1-208ENST00000566515 PRRT2Q7Z6L0 340 aaPredicted RBP24.9■■□□□ 1.58
CCNDBP1-208ENST00000566515 TSKSQ9UJT2 592 aa24.9■■□□□ 1.58
CCNDBP1-208ENST00000566515 LAMA4Q16363 1823 aa24.9■■□□□ 1.58
CCNDBP1-208ENST00000566515 CLEC10AQ8IUN9 316 aa24.9■■□□□ 1.58
CCNDBP1-208ENST00000566515 ZNF444Q8N0Y2 327 aaPredicted RBP24.9■■□□□ 1.58
CCNDBP1-208ENST00000566515 FOXN1O15353 648 aa24.89■■□□□ 1.57
CCNDBP1-208ENST00000566515 DGKZQ13574 1117 aa24.89■■□□□ 1.57
CCNDBP1-208ENST00000566515 MTMR2Q13614 643 aa24.89■■□□□ 1.57
CCNDBP1-208ENST00000566515 GADL1Q6ZQY3 521 aa24.89■■□□□ 1.57
CCNDBP1-208ENST00000566515 FAM43AQ8N2R8 423 aa24.89■■□□□ 1.57
CCNDBP1-208ENST00000566515 NBPF3Q9H094 633 aa24.89■■□□□ 1.57
CCNDBP1-208ENST00000566515 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP24.89■■□□□ 1.57
CCNDBP1-208ENST00000566515 BTBD19C9JJ37 291 aa24.88■■□□□ 1.57
CCNDBP1-208ENST00000566515 ZNF213O14771 459 aa24.88■■□□□ 1.57
CCNDBP1-208ENST00000566515 HMGCS2P54868 508 aa24.88■■□□□ 1.57
CCNDBP1-208ENST00000566515 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa24.88■■□□□ 1.57
CCNDBP1-208ENST00000566515 CASC1Q6TDU7 716 aa24.88■■□□□ 1.57
CCNDBP1-208ENST00000566515 ACER1Q8TDN7 264 aa24.88■■□□□ 1.57
CCNDBP1-208ENST00000566515 CTNNA3Q9UI47 895 aa24.88■■□□□ 1.57
CCNDBP1-208ENST00000566515 USP17L10C9JJH3 530 aa24.87■■□□□ 1.57
CCNDBP1-208ENST00000566515 BACE1P56817 501 aa24.87■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.8 ms