RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560983.1

HERC1-211, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase family member 1, humanhuman

TSL 2

Gene HERC1, Length 457 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC1-211ENST00000560983 HIF3AQ9Y2N7 669 aa5.82□□□□□ -1.48
HERC1-211ENST00000560983 EREGO14944 169 aa5.81□□□□□ -1.48
HERC1-211ENST00000560983 TOMM70O94826 608 aa5.81□□□□□ -1.48
HERC1-211ENST00000560983 TGFB1P01137 390 aa5.81□□□□□ -1.48
HERC1-211ENST00000560983 PREPP48147 710 aa5.81□□□□□ -1.48
HERC1-211ENST00000560983 EVA1CP58658 441 aa5.81□□□□□ -1.48
HERC1-211ENST00000560983 EHHADHQ08426 723 aa5.81□□□□□ -1.48
HERC1-211ENST00000560983 MTMR3Q13615 1198 aa5.81□□□□□ -1.48
HERC1-211ENST00000560983 PEAR1Q5VY43 1037 aaPredicted RBP5.81□□□□□ -1.48
HERC1-211ENST00000560983 HGSNATQ68CP4 663 aa5.81□□□□□ -1.48
HERC1-211ENST00000560983 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa5.81□□□□□ -1.48
HERC1-211ENST00000560983 SNX29Q8TEQ0 813 aa5.81□□□□□ -1.48
HERC1-211ENST00000560983 FAM83CQ9BQN1 747 aa5.81□□□□□ -1.48
HERC1-211ENST00000560983 DBNDD2Q9BQY9 259 aa5.81□□□□□ -1.48
HERC1-211ENST00000560983 PCMTD2Q9NV79 361 aa5.81□□□□□ -1.48
HERC1-211ENST00000560983 STK26Q9P289 416 aa5.81□□□□□ -1.48
HERC1-211ENST00000560983 KIAA0232Q92628 1395 aa5.8□□□□□ -1.48
HERC1-211ENST00000560983 NRXN1Q9ULB1 1477 aa5.8□□□□□ -1.48
HERC1-211ENST00000560983 SOX1O00570 391 aaPredicted RBP5.8□□□□□ -1.48
HERC1-211ENST00000560983 COBLO75128 1261 aa5.8□□□□□ -1.48
HERC1-211ENST00000560983 FAM13AO94988 1023 aa5.8□□□□□ -1.48
HERC1-211ENST00000560983 SSTR4P31391 388 aa5.8□□□□□ -1.48
HERC1-211ENST00000560983 USP5P45974 858 aa5.8□□□□□ -1.48
HERC1-211ENST00000560983 C19orf57Q0VDD7 668 aa5.8□□□□□ -1.48
HERC1-211ENST00000560983 C8orf34Q49A92 452 aa5.8□□□□□ -1.48
HERC1-211ENST00000560983 TRIM42Q8IWZ5 723 aa5.8□□□□□ -1.48
HERC1-211ENST00000560983 BSNDQ8WZ55 320 aa5.8□□□□□ -1.48
HERC1-211ENST00000560983 OSMRQ99650 979 aa5.8□□□□□ -1.48
HERC1-211ENST00000560983 TMPRSS13Q9BYE2 586 aa5.8□□□□□ -1.48
HERC1-211ENST00000560983 SUGCTQ9HAC7 445 aa5.8□□□□□ -1.48
HERC1-211ENST00000560983 FOXD3Q9UJU5 478 aaPredicted RBP5.8□□□□□ -1.48
HERC1-211ENST00000560983 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP5.8□□□□□ -1.48
HERC1-211ENST00000560983 AATKQ6ZMQ8 1374 aa5.8□□□□□ -1.48
HERC1-211ENST00000560983 ABCC11Q96J66 1382 aa5.8□□□□□ -1.48
HERC1-211ENST00000560983 CROCC2H7BZ55 1655 aa5.79□□□□□ -1.48
HERC1-211ENST00000560983 HMX2A2RU54 273 aa5.79□□□□□ -1.48
HERC1-211ENST00000560983 FAM177BA6PVY3 158 aa5.79□□□□□ -1.48
HERC1-211ENST00000560983 TIAF1O95411 115 aa5.79□□□□□ -1.48
HERC1-211ENST00000560983 EDN3P14138 238 aa5.79□□□□□ -1.48
HERC1-211ENST00000560983 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP5.79□□□□□ -1.48
HERC1-211ENST00000560983 ZNF827Q17R98 1081 aa5.79□□□□□ -1.48
HERC1-211ENST00000560983 MCTP1Q6DN14 999 aa5.79□□□□□ -1.48
HERC1-211ENST00000560983 TMEM132EQ6IEE7 984 aa5.79□□□□□ -1.48
HERC1-211ENST00000560983 KRTAP1-3Q8IUG1 177 aa5.79□□□□□ -1.48
HERC1-211ENST00000560983 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP5.79□□□□□ -1.48
HERC1-211ENST00000560983 RUSC1Q9BVN2 902 aa5.79□□□□□ -1.48
HERC1-211ENST00000560983 NRSN2Q9GZP1 204 aa5.79□□□□□ -1.48
HERC1-211ENST00000560983 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP5.79□□□□□ -1.48
HERC1-211ENST00000560983 SSH2Q76I76 1423 aa5.79□□□□□ -1.48
HERC1-211ENST00000560983 NUP155O75694 1391 aa5.79□□□□□ -1.48
HERC1-211ENST00000560983 IQGAP3Q86VI3 1631 aa5.78□□□□□ -1.48
HERC1-211ENST00000560983 PHACTR2O75167 634 aa5.78□□□□□ -1.48
HERC1-211ENST00000560983 ESRRAP11474 423 aaPredicted RBP5.78□□□□□ -1.48
HERC1-211ENST00000560983 NLRP12P59046 1061 aa5.78□□□□□ -1.48
HERC1-211ENST00000560983 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP5.78□□□□□ -1.48
HERC1-211ENST00000560983 ECM1Q16610 540 aa5.78□□□□□ -1.48
HERC1-211ENST00000560983 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP5.78□□□□□ -1.48
HERC1-211ENST00000560983 DTX1Q86Y01 620 aa5.78□□□□□ -1.48
HERC1-211ENST00000560983 KRTAP19-1Q8IUB9 90 aa5.78□□□□□ -1.48
HERC1-211ENST00000560983 SMG8Q8ND04 991 aaKnown RBP5.78□□□□□ -1.48
HERC1-211ENST00000560983 ZFYVE28Q9HCC9 887 aa5.78□□□□□ -1.48
HERC1-211ENST00000560983 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa5.78□□□□□ -1.48
HERC1-211ENST00000560983 E9PCH4 1651 aa5.78□□□□□ -1.48
HERC1-211ENST00000560983 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP5.78□□□□□ -1.48
HERC1-211ENST00000560983 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa5.77□□□□□ -1.49
HERC1-211ENST00000560983 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa5.77□□□□□ -1.49
HERC1-211ENST00000560983 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa5.77□□□□□ -1.49
HERC1-211ENST00000560983 BCL9O00512 1426 aa5.77□□□□□ -1.49
HERC1-211ENST00000560983 OVOS2Q6IE36 1432 aa5.77□□□□□ -1.49
HERC1-211ENST00000560983 LOC100289279A0A1B0GTE1 492 aa5.77□□□□□ -1.49
HERC1-211ENST00000560983 ADAMTS4O75173 837 aa5.77□□□□□ -1.49
HERC1-211ENST00000560983 HSPA1AP0DMV8 641 aaKnown RBP5.77□□□□□ -1.49
HERC1-211ENST00000560983 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP5.77□□□□□ -1.49
HERC1-211ENST00000560983 BMP3P12645 472 aa5.77□□□□□ -1.49
HERC1-211ENST00000560983 POLD1P28340 1107 aa5.77□□□□□ -1.49
HERC1-211ENST00000560983 ARL4DP49703 201 aa5.77□□□□□ -1.49
HERC1-211ENST00000560983 IKBKEQ14164 716 aa5.77□□□□□ -1.49
HERC1-211ENST00000560983 DDB1Q16531 1140 aa5.77□□□□□ -1.49
HERC1-211ENST00000560983 EGFL7Q9UHF1 273 aa5.77□□□□□ -1.49
HERC1-211ENST00000560983 DLGAP3O95886 979 aa5.76□□□□□ -1.49
HERC1-211ENST00000560983 BEND4Q6ZU67 534 aa5.76□□□□□ -1.49
HERC1-211ENST00000560983 TTC16Q8NEE8 873 aa5.76□□□□□ -1.49
HERC1-211ENST00000560983 SHKBP1Q8TBC3 707 aa5.76□□□□□ -1.49
HERC1-211ENST00000560983 SLC7A3Q8WY07 619 aa5.76□□□□□ -1.49
HERC1-211ENST00000560983 LATS2Q9NRM7 1088 aa5.76□□□□□ -1.49
HERC1-211ENST00000560983 CCDC87Q9NVE4 849 aa5.76□□□□□ -1.49
HERC1-211ENST00000560983 MTMR7Q9Y216 660 aa5.76□□□□□ -1.49
HERC1-211ENST00000560983 ABCA3Q99758 1704 aa5.76□□□□□ -1.49
HERC1-211ENST00000560983 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa5.75□□□□□ -1.49
HERC1-211ENST00000560983 PEAK1Q9H792 1746 aa5.75□□□□□ -1.49
HERC1-211ENST00000560983 CARNS1A5YM72 827 aa5.75□□□□□ -1.49
HERC1-211ENST00000560983 FDX2Q6P4F2 183 aa5.75□□□□□ -1.49
HERC1-211ENST00000560983 GALNT12Q8IXK2 581 aa5.75□□□□□ -1.49
HERC1-211ENST00000560983 NMRK2Q9NPI5 230 aa5.75□□□□□ -1.49
HERC1-211ENST00000560983 USTQ9Y2C2 406 aa5.75□□□□□ -1.49
HERC1-211ENST00000560983 OAS3Q9Y6K5 1087 aaKnown RBP5.75□□□□□ -1.49
HERC1-211ENST00000560983 ATP7BP35670 1465 aa5.75□□□□□ -1.49
HERC1-211ENST00000560983 KIF1AQ12756 1690 aa5.75□□□□□ -1.49
HERC1-211ENST00000560983 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa5.74□□□□□ -1.49
HERC1-211ENST00000560983 TNS2Q63HR2 1409 aa5.74□□□□□ -1.49
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48.8 ms