RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557215.5

CLMN-208, Transcript of calmin, human

TSL 3

Gene CLMN, Length 515 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CLMN-208	ENST00000557215	ZDHHC15	Q96MV8	337 aa		11.75	□□□□□ -0.53
CLMN-208	ENST00000557215	RIOK1	Q9BRS2	568 aa	Known RBP	11.75	□□□□□ -0.53
CLMN-208	ENST00000557215	MYOZ2	Q9NPC6	264 aa		11.75	□□□□□ -0.53
CLMN-208	ENST00000557215	ANO2	Q9NQ90	1003 aa		11.75	□□□□□ -0.53
CLMN-208	ENST00000557215	GPRC5D	Q9NZD1	345 aa		11.75	□□□□□ -0.53
CLMN-208	ENST00000557215	CNOT7	Q9UIV1	285 aa	Known RBP	11.75	□□□□□ -0.53
CLMN-208	ENST00000557215	PCDHAC2	Q9Y5I4	1007 aa		11.75	□□□□□ -0.53
CLMN-208	ENST00000557215	MYH7	P12883	1935 aa		11.74	□□□□□ -0.53
CLMN-208	ENST00000557215	GLTPD2	A6NH11	291 aa		11.74	□□□□□ -0.53
CLMN-208	ENST00000557215	BHMG1	C9JSJ3	638 aa	Predicted RBP	11.74	□□□□□ -0.53
CLMN-208	ENST00000557215	LILRB3	O75022	631 aa		11.74	□□□□□ -0.53
CLMN-208	ENST00000557215	FDX1	P10109	184 aa		11.74	□□□□□ -0.53
CLMN-208	ENST00000557215	LMOD1	P29536	600 aa	Predicted RBP	11.74	□□□□□ -0.53
CLMN-208	ENST00000557215	ZNF280A	P59817	542 aa	Predicted RBP	11.74	□□□□□ -0.53
CLMN-208	ENST00000557215	DLGAP5	Q15398	846 aa		11.74	□□□□□ -0.53
CLMN-208	ENST00000557215	APOBEC3H	Q6NTF7	200 aa	Known RBP	11.74	□□□□□ -0.53
CLMN-208	ENST00000557215	KIAA1211	Q6ZU35	1233 aa		11.74	□□□□□ -0.53
CLMN-208	ENST00000557215	CERS3	Q8IU89	383 aa		11.74	□□□□□ -0.53
CLMN-208	ENST00000557215	SH3RF3	Q8TEJ3	882 aa	Predicted RBP	11.74	□□□□□ -0.53
CLMN-208	ENST00000557215	ZFR	Q96KR1	1074 aa	Known RBP	11.74	□□□□□ -0.53
CLMN-208	ENST00000557215	STRBP	Q96SI9	672 aa	Known RBP	11.74	□□□□□ -0.53
CLMN-208	ENST00000557215	BACH2	Q9BYV9	841 aa		11.74	□□□□□ -0.53
CLMN-208	ENST00000557215	SLC4A4	Q9Y6R1	1079 aa		11.74	□□□□□ -0.53
CLMN-208	ENST00000557215	ADAMTSL1	Q8N6G6	1762 aa		11.74	□□□□□ -0.53
CLMN-208	ENST00000557215		H7C1D1	291 aa		11.73	□□□□□ -0.53
CLMN-208	ENST00000557215	PRKAB2	O43741	272 aa		11.73	□□□□□ -0.53
CLMN-208	ENST00000557215	EIF5B	O60841	1220 aa	Known RBP	11.73	□□□□□ -0.53
CLMN-208	ENST00000557215	REC8	O95072	547 aa		11.73	□□□□□ -0.53
CLMN-208	ENST00000557215	GNAT2	P19087	354 aa		11.73	□□□□□ -0.53
CLMN-208	ENST00000557215	EPS15	P42566	896 aa		11.73	□□□□□ -0.53
CLMN-208	ENST00000557215	UTRN	P46939	3433 aa		11.73	□□□□□ -0.53
CLMN-208	ENST00000557215	MMP14	P50281	582 aa		11.73	□□□□□ -0.53
CLMN-208	ENST00000557215	PPP4C	P60510	307 aa		11.73	□□□□□ -0.53
CLMN-208	ENST00000557215	LSM11	P83369	360 aa	Known RBP eCLIP	11.73	□□□□□ -0.53
CLMN-208	ENST00000557215	VPS53	Q5VIR6	699 aa		11.73	□□□□□ -0.53
CLMN-208	ENST00000557215	PRMT6	Q96LA8	375 aa	Predicted RBP	11.73	□□□□□ -0.53
CLMN-208	ENST00000557215	CRNKL1	Q9BZJ0	848 aa	Known RBP	11.73	□□□□□ -0.53
CLMN-208	ENST00000557215	USP40	Q9NVE5	1235 aa		11.73	□□□□□ -0.53
CLMN-208	ENST00000557215	PATL2	C9JE40	543 aa	Known RBP	11.72	□□□□□ -0.53
CLMN-208	ENST00000557215	EGFR	P00533	1210 aa		11.72	□□□□□ -0.53
CLMN-208	ENST00000557215	APP	P05067	770 aa		11.72	□□□□□ -0.53
CLMN-208	ENST00000557215	HSPD1	P10809	573 aa	Known RBP	11.72	□□□□□ -0.53
CLMN-208	ENST00000557215	USP5	P45974	858 aa		11.72	□□□□□ -0.53
CLMN-208	ENST00000557215	RHBDL3	P58872	404 aa		11.72	□□□□□ -0.53
CLMN-208	ENST00000557215	PTH1R	Q03431	593 aa		11.72	□□□□□ -0.53
CLMN-208	ENST00000557215	QPCT	Q16769	361 aa		11.72	□□□□□ -0.53
CLMN-208	ENST00000557215	KIF4B	Q2VIQ3	1234 aa		11.72	□□□□□ -0.53
CLMN-208	ENST00000557215	TBC1D10B	Q4KMP7	808 aa	Predicted RBP	11.72	□□□□□ -0.53
CLMN-208	ENST00000557215	CDC42EP5	Q6NZY7	148 aa		11.72	□□□□□ -0.53
CLMN-208	ENST00000557215	ADGRD1	Q6QNK2	874 aa		11.72	□□□□□ -0.53
CLMN-208	ENST00000557215	TEX11	Q8IYF3	940 aa		11.72	□□□□□ -0.53
CLMN-208	ENST00000557215	MTMR14	Q8NCE2	650 aa		11.72	□□□□□ -0.53
CLMN-208	ENST00000557215	SDR42E1	Q8WUS8	393 aa		11.72	□□□□□ -0.53
CLMN-208	ENST00000557215	LSG1	Q9H089	658 aa	Known RBP	11.72	□□□□□ -0.53
CLMN-208	ENST00000557215	TDRD3	Q9H7E2	651 aa	Known RBP	11.72	□□□□□ -0.53
CLMN-208	ENST00000557215	MYH2	Q9UKX2	1941 aa		11.71	□□□□□ -0.53
CLMN-208	ENST00000557215	WNT10B	O00744	389 aa		11.71	□□□□□ -0.53
CLMN-208	ENST00000557215	FOXP2	O15409	715 aa		11.71	□□□□□ -0.53
CLMN-208	ENST00000557215	MYO1B	O43795	1136 aa		11.71	□□□□□ -0.53
CLMN-208	ENST00000557215	CFH	P08603	1231 aa		11.71	□□□□□ -0.53
CLMN-208	ENST00000557215	CACNB3	P54284	484 aa		11.71	□□□□□ -0.53
CLMN-208	ENST00000557215	NBPF9	Q3BBW0	867 aa		11.71	□□□□□ -0.53
CLMN-208	ENST00000557215	TRPM4	Q8TD43	1214 aa		11.71	□□□□□ -0.53
CLMN-208	ENST00000557215	TGFBRAP1	Q8WUH2	860 aa		11.71	□□□□□ -0.53
CLMN-208	ENST00000557215	DSCC1	Q9BVC3	393 aa		11.71	□□□□□ -0.53
CLMN-208	ENST00000557215	ADARB2	Q9NS39	739 aa	Known RBP	11.71	□□□□□ -0.53
CLMN-208	ENST00000557215	CLRN2	A0PK11	232 aa		11.7	□□□□□ -0.54
CLMN-208	ENST00000557215	GSG1L2	A8MUP6	293 aa		11.7	□□□□□ -0.54
CLMN-208	ENST00000557215	TDO2	P48775	406 aa		11.7	□□□□□ -0.54
CLMN-208	ENST00000557215	PICALM	Q13492	652 aa		11.7	□□□□□ -0.54
CLMN-208	ENST00000557215	KMT5B	Q4FZB7	885 aa		11.7	□□□□□ -0.54
CLMN-208	ENST00000557215	IFNL3	Q8IZI9	196 aa		11.7	□□□□□ -0.54
CLMN-208	ENST00000557215	MAP4K1	Q92918	833 aa		11.7	□□□□□ -0.54
CLMN-208	ENST00000557215	LRCH3	Q96II8	777 aa		11.7	□□□□□ -0.54
CLMN-208	ENST00000557215	ZBED3	Q96IU2	234 aa	Predicted RBP	11.7	□□□□□ -0.54
CLMN-208	ENST00000557215	NACAP1	Q9BZK3	213 aa		11.7	□□□□□ -0.54
CLMN-208	ENST00000557215	UPF2	Q9HAU5	1272 aa	Known RBP	11.7	□□□□□ -0.54
CLMN-208	ENST00000557215	EPB41L4A	Q9HCS5	686 aa	Predicted RBP	11.7	□□□□□ -0.54
CLMN-208	ENST00000557215	TMOD2	Q9NZR1	351 aa		11.7	□□□□□ -0.54
CLMN-208	ENST00000557215	HACL1	Q9UJ83	578 aa		11.7	□□□□□ -0.54
CLMN-208	ENST00000557215	RPAP1	Q9BWH6	1393 aa	Predicted RBP	11.69	□□□□□ -0.54
CLMN-208	ENST00000557215	FLT1	P17948	1338 aa		11.69	□□□□□ -0.54
CLMN-208	ENST00000557215	POTEB3	A0JP26	581 aa		11.69	□□□□□ -0.54
CLMN-208	ENST00000557215	IQCA1L	A6NCM1	817 aa		11.69	□□□□□ -0.54
CLMN-208	ENST00000557215	WDHD1	O75717	1129 aa	Predicted RBP	11.69	□□□□□ -0.54
CLMN-208	ENST00000557215	EPHX2	P34913	555 aa		11.69	□□□□□ -0.54
CLMN-208	ENST00000557215	POTEB	Q6S5H4	581 aa		11.69	□□□□□ -0.54
CLMN-208	ENST00000557215	MAPKAPK5	Q8IW41	473 aa		11.69	□□□□□ -0.54
CLMN-208	ENST00000557215	USP26	Q9BXU7	913 aa		11.69	□□□□□ -0.54
CLMN-208	ENST00000557215	NAPB	Q9H115	298 aa		11.69	□□□□□ -0.54
CLMN-208	ENST00000557215	VEZT	Q9HBM0	779 aa		11.69	□□□□□ -0.54
CLMN-208	ENST00000557215	DCP1A	Q9NPI6	582 aa	Predicted RBP	11.69	□□□□□ -0.54
CLMN-208	ENST00000557215	DDX4	Q9NQI0	724 aa	Known RBP	11.69	□□□□□ -0.54
CLMN-208	ENST00000557215	ATP8A2	Q9NTI2	1148 aa		11.69	□□□□□ -0.54
CLMN-208	ENST00000557215	ZNF70	Q9UC06	446 aa	Predicted RBP	11.69	□□□□□ -0.54
CLMN-208	ENST00000557215	RBM8A	Q9Y5S9	174 aa	Known RBP	11.69	□□□□□ -0.54
CLMN-208	ENST00000557215	ASTN2	O75129	1339 aa	Predicted RBP	11.68	□□□□□ -0.54
CLMN-208	ENST00000557215	GOLGA8CP	A6NN73	597 aa		11.68	□□□□□ -0.54
CLMN-208	ENST00000557215	TCP10L2	B9ZVM9	353 aa		11.68	□□□□□ -0.54
CLMN-208	ENST00000557215	AP1G2	O75843	785 aa		11.68	□□□□□ -0.54

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