RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000554186.1

LINC00520-201, long intergenic non-protein coding RNA 520, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene LINC00520, Length 831 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00520-201ENST00000554186 RAP1GAPP47736 663 aa6.7□□□□□ -1.34
LINC00520-201ENST00000554186 PPM1JQ5JR12 505 aa6.7□□□□□ -1.34
LINC00520-201ENST00000554186 DTHD1Q6ZMT9 781 aa6.7□□□□□ -1.34
LINC00520-201ENST00000554186 C14orf37Q86TY3 774 aa6.7□□□□□ -1.34
LINC00520-201ENST00000554186 BHLHE22Q8NFJ8 381 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
LINC00520-201ENST00000554186 KCNK12Q9HB15 430 aa6.7□□□□□ -1.34
LINC00520-201ENST00000554186 C19orf73Q9NVV2 129 aa6.7□□□□□ -1.34
LINC00520-201ENST00000554186 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa6.7□□□□□ -1.34
LINC00520-201ENST00000554186 FYCO1Q9BQS8 1478 aa6.7□□□□□ -1.34
LINC00520-201ENST00000554186 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa6.7□□□□□ -1.34
LINC00520-201ENST00000554186 MAP3K1Q13233 1512 aa6.7□□□□□ -1.34
LINC00520-201ENST00000554186 ABCC2Q92887 1545 aa6.7□□□□□ -1.34
LINC00520-201ENST00000554186 TIAM1Q13009 1591 aa6.69□□□□□ -1.34
LINC00520-201ENST00000554186 FMN1Q68DA7 1419 aa6.69□□□□□ -1.34
LINC00520-201ENST00000554186 UACAQ9BZF9 1416 aa6.69□□□□□ -1.34
LINC00520-201ENST00000554186 TSPAN15O95858 294 aa6.69□□□□□ -1.34
LINC00520-201ENST00000554186 ERVK-24P63145 666 aa6.69□□□□□ -1.34
LINC00520-201ENST00000554186 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa6.69□□□□□ -1.34
LINC00520-201ENST00000554186 ERICH6Q7L0X2 663 aa6.69□□□□□ -1.34
LINC00520-201ENST00000554186 LRRC56Q8IYG6 542 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
LINC00520-201ENST00000554186 DNAJC25Q9H1X3 360 aa6.69□□□□□ -1.34
LINC00520-201ENST00000554186 C1orf115Q9H7X2 142 aa6.69□□□□□ -1.34
LINC00520-201ENST00000554186 PRDM10Q9NQV6 1147 aa6.69□□□□□ -1.34
LINC00520-201ENST00000554186 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa6.69□□□□□ -1.34
LINC00520-201ENST00000554186 TRAK1Q9UPV9 953 aa6.69□□□□□ -1.34
LINC00520-201ENST00000554186 KDM5BQ9UGL1 1544 aa6.69□□□□□ -1.34
LINC00520-201ENST00000554186 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
LINC00520-201ENST00000554186 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa6.69□□□□□ -1.34
LINC00520-201ENST00000554186 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
LINC00520-201ENST00000554186 EOMESO95936 686 aa6.68□□□□□ -1.34
LINC00520-201ENST00000554186 ARNTP27540 789 aa6.68□□□□□ -1.34
LINC00520-201ENST00000554186 ZNF252P-AS1Q0IIN9 211 aa6.68□□□□□ -1.34
LINC00520-201ENST00000554186 PDE3BQ13370 1112 aa6.68□□□□□ -1.34
LINC00520-201ENST00000554186 SYDE1Q6ZW31 735 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
LINC00520-201ENST00000554186 GRIN3AQ8TCU5 1115 aa6.68□□□□□ -1.34
LINC00520-201ENST00000554186 ASB11Q8WXH4 323 aa6.68□□□□□ -1.34
LINC00520-201ENST00000554186 CSRNP1Q96S65 589 aa6.68□□□□□ -1.34
LINC00520-201ENST00000554186 CACNA2D2Q9NY47 1150 aa6.68□□□□□ -1.34
LINC00520-201ENST00000554186 DCDC2CA8MYV0 355 aa6.67□□□□□ -1.34
LINC00520-201ENST00000554186 PRR33A8MZF0 331 aa6.67□□□□□ -1.34
LINC00520-201ENST00000554186 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP6.67□□□□□ -1.34
LINC00520-201ENST00000554186 C1QTNF9P0C862 333 aa6.67□□□□□ -1.34
LINC00520-201ENST00000554186 PPP2R3AQ06190 1150 aa6.67□□□□□ -1.34
LINC00520-201ENST00000554186 TOX2Q96NM4 488 aa6.67□□□□□ -1.34
LINC00520-201ENST00000554186 CARS2Q9HA77 564 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
LINC00520-201ENST00000554186 FAM53CQ9NYF3 392 aa6.67□□□□□ -1.34
LINC00520-201ENST00000554186 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa6.66□□□□□ -1.34
LINC00520-201ENST00000554186 KIF14Q15058 1648 aa6.66□□□□□ -1.34
LINC00520-201ENST00000554186 HECW1Q76N89 1606 aa6.66□□□□□ -1.34
LINC00520-201ENST00000554186 RASIP1Q5U651 963 aa6.66□□□□□ -1.34
LINC00520-201ENST00000554186 BCO2Q9BYV7 579 aa6.66□□□□□ -1.34
LINC00520-201ENST00000554186 ATP13A1Q9HD20 1204 aa6.66□□□□□ -1.34
LINC00520-201ENST00000554186 LMCD1Q9NZU5 365 aa6.66□□□□□ -1.34
LINC00520-201ENST00000554186 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa6.66□□□□□ -1.34
LINC00520-201ENST00000554186 PAGE1O75459 146 aa6.65□□□□□ -1.34
LINC00520-201ENST00000554186 GLI1P08151 1106 aa6.65□□□□□ -1.34
LINC00520-201ENST00000554186 ZSCAN22P10073 491 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
LINC00520-201ENST00000554186 RING1Q06587 406 aa6.65□□□□□ -1.34
LINC00520-201ENST00000554186 CYB5RLQ6IPT4 315 aa6.65□□□□□ -1.34
LINC00520-201ENST00000554186 LILRA6Q6PI73 481 aa6.65□□□□□ -1.34
LINC00520-201ENST00000554186 C12orf40Q86WS4 652 aa6.65□□□□□ -1.34
LINC00520-201ENST00000554186 TMC1Q8TDI8 760 aa6.65□□□□□ -1.34
LINC00520-201ENST00000554186 KIRREL1Q96J84 757 aa6.65□□□□□ -1.34
LINC00520-201ENST00000554186 AKAP2Q9Y2D5 859 aa6.65□□□□□ -1.34
LINC00520-201ENST00000554186 ABCC10Q5T3U5 1492 aa6.65□□□□□ -1.35
LINC00520-201ENST00000554186 NME2P22392 152 aa6.64□□□□□ -1.35
LINC00520-201ENST00000554186 AFMP43652 599 aa6.64□□□□□ -1.35
LINC00520-201ENST00000554186 ACSBG1Q96GR2 724 aa6.64□□□□□ -1.35
LINC00520-201ENST00000554186 HSPA12BQ96MM6 686 aa6.64□□□□□ -1.35
LINC00520-201ENST00000554186 CBX8Q9HC52 389 aa6.64□□□□□ -1.35
LINC00520-201ENST00000554186 SEMA3GQ9NS98 782 aa6.64□□□□□ -1.35
LINC00520-201ENST00000554186 CLCN7P51798 805 aa6.63□□□□□ -1.35
LINC00520-201ENST00000554186 ZBTB37Q5TC79 503 aa6.63□□□□□ -1.35
LINC00520-201ENST00000554186 NXPE4Q6UWF7 544 aa6.63□□□□□ -1.35
LINC00520-201ENST00000554186 MPZL3Q6UWV2 235 aa6.63□□□□□ -1.35
LINC00520-201ENST00000554186 ARMCX6Q7L4S7 300 aa6.63□□□□□ -1.35
LINC00520-201ENST00000554186 CYFIP1Q7L576 1253 aa6.63□□□□□ -1.35
LINC00520-201ENST00000554186 PHLDB1Q86UU1 1377 aa6.63□□□□□ -1.35
LINC00520-201ENST00000554186 HOMEZQ8IX15 550 aa6.63□□□□□ -1.35
LINC00520-201ENST00000554186 C3orf58Q8NDZ4 430 aa6.63□□□□□ -1.35
LINC00520-201ENST00000554186 CITED4Q96RK1 184 aa6.63□□□□□ -1.35
LINC00520-201ENST00000554186 DIRC2Q96SL1 478 aa6.63□□□□□ -1.35
LINC00520-201ENST00000554186 KRTAP9-3Q9BYQ3 159 aa6.63□□□□□ -1.35
LINC00520-201ENST00000554186 GNAT3A8MTJ3 354 aa6.62□□□□□ -1.35
LINC00520-201ENST00000554186 SLITRK5O94991 958 aa6.62□□□□□ -1.35
LINC00520-201ENST00000554186 BMP6P22004 513 aa6.62□□□□□ -1.35
LINC00520-201ENST00000554186 ANKLE2Q86XL3 938 aa6.62□□□□□ -1.35
LINC00520-201ENST00000554186 ALKBH8Q96BT7 664 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
LINC00520-201ENST00000554186 PPP1R16BQ96T49 567 aa6.62□□□□□ -1.35
LINC00520-201ENST00000554186 PRDM5Q9NQX1 630 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
LINC00520-201ENST00000554186 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa6.62□□□□□ -1.35
LINC00520-201ENST00000554186 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP6.61□□□□□ -1.35
LINC00520-201ENST00000554186 CCDC18Q5T9S5 1454 aa6.61□□□□□ -1.35
LINC00520-201ENST00000554186 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP6.61□□□□□ -1.35
LINC00520-201ENST00000554186 NCANO14594 1321 aa6.61□□□□□ -1.35
LINC00520-201ENST00000554186 BUD31P41223 144 aaPredicted RBP6.61□□□□□ -1.35
LINC00520-201ENST00000554186 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP6.61□□□□□ -1.35
LINC00520-201ENST00000554186 TMEM67Q5HYA8 995 aa6.61□□□□□ -1.35
LINC00520-201ENST00000554186 CDKAL1Q5VV42 579 aa6.61□□□□□ -1.35
LINC00520-201ENST00000554186 TTLL10Q6ZVT0 673 aa6.61□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 11.1 ms