RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000503687.2

RABGEF1-211, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 2

Gene RABGEF1, Length 4,139 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-211ENST00000503687 FUCA2Q9BTY2 467 aa14.51□□□□□ -0.09
RABGEF1-211ENST00000503687 ARFGAP3Q9NP61 516 aa14.51□□□□□ -0.09
RABGEF1-211ENST00000503687 IMPACTQ9P2X3 320 aa14.51□□□□□ -0.09
RABGEF1-211ENST00000503687 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa14.51□□□□□ -0.09
RABGEF1-211ENST00000503687 TMEM232C9JQI7 657 aa14.51□□□□□ -0.09
RABGEF1-211ENST00000503687 SIK1P57059 783 aa14.51□□□□□ -0.09
RABGEF1-211ENST00000503687 IQCB1Q15051 598 aa14.51□□□□□ -0.09
RABGEF1-211ENST00000503687 TDRD12Q587J7 1177 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
RABGEF1-211ENST00000503687 HINFPQ9BQA5 517 aa14.51□□□□□ -0.09
RABGEF1-211ENST00000503687 ISCA1Q9BUE6 129 aa14.51□□□□□ -0.09
RABGEF1-211ENST00000503687 UBA5Q9GZZ9 404 aa14.51□□□□□ -0.09
RABGEF1-211ENST00000503687 JADE2Q9NQC1 790 aa14.51□□□□□ -0.09
RABGEF1-211ENST00000503687 KCNQ2O43526 872 aa14.5□□□□□ -0.09
RABGEF1-211ENST00000503687 BAG3O95817 575 aa14.5□□□□□ -0.09
RABGEF1-211ENST00000503687 GOLGA8HP0CJ92 632 aa14.5□□□□□ -0.09
RABGEF1-211ENST00000503687 TFAP4Q01664 338 aa14.5□□□□□ -0.09
RABGEF1-211ENST00000503687 OXER1Q8TDS5 423 aa14.5□□□□□ -0.09
RABGEF1-211ENST00000503687 MEGF6O75095 1541 aa14.5□□□□□ -0.09
RABGEF1-211ENST00000503687 ANTXR2P58335 489 aa14.5□□□□□ -0.09
RABGEF1-211ENST00000503687 ETF1P62495 437 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
RABGEF1-211ENST00000503687 MLKLQ8NB16 471 aa14.5□□□□□ -0.09
RABGEF1-211ENST00000503687 PPP1R13BQ96KQ4 1090 aa14.5□□□□□ -0.09
RABGEF1-211ENST00000503687 CENPHQ9H3R5 247 aa14.5□□□□□ -0.09
RABGEF1-211ENST00000503687 LMAN1P49257 510 aa14.5□□□□□ -0.09
RABGEF1-211ENST00000503687 FKBP15Q5T1M5 1219 aa14.5□□□□□ -0.09
RABGEF1-211ENST00000503687 TPTE2Q6XPS3 522 aa14.5□□□□□ -0.09
RABGEF1-211ENST00000503687 CACNA2D4Q7Z3S7 1137 aa14.5□□□□□ -0.09
RABGEF1-211ENST00000503687 AK7Q96M32 723 aa14.5□□□□□ -0.09
RABGEF1-211ENST00000503687 PXDNLA1KZ92 1463 aa14.49□□□□□ -0.09
RABGEF1-211ENST00000503687 FAM170AA1A519 330 aa14.49□□□□□ -0.09
RABGEF1-211ENST00000503687 RIMBP2O15034 1052 aa14.49□□□□□ -0.09
RABGEF1-211ENST00000503687 PTGDRQ13258 359 aa14.49□□□□□ -0.09
RABGEF1-211ENST00000503687 SPECC1LQ69YQ0 1117 aa14.49□□□□□ -0.09
RABGEF1-211ENST00000503687 DTHD1Q6ZMT9 781 aa14.49□□□□□ -0.09
RABGEF1-211ENST00000503687 DHX40Q8IX18 779 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
RABGEF1-211ENST00000503687 NCBP1Q09161 790 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
RABGEF1-211ENST00000503687 MAPKAPK5Q8IW41 473 aa14.49□□□□□ -0.09
RABGEF1-211ENST00000503687 ACBD3Q9H3P7 528 aa14.49□□□□□ -0.09
RABGEF1-211ENST00000503687 RTL9Q8NET4 1388 aa14.49□□□□□ -0.09
RABGEF1-211ENST00000503687 SYNRGQ9UMZ2 1314 aa14.49□□□□□ -0.09
RABGEF1-211ENST00000503687 LDHBP07195 334 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
RABGEF1-211ENST00000503687 SPA17Q15506 151 aa14.49□□□□□ -0.09
RABGEF1-211ENST00000503687 PARP10Q53GL7 1025 aa14.49□□□□□ -0.09
RABGEF1-211ENST00000503687 KCNB2Q92953 911 aa14.49□□□□□ -0.09
RABGEF1-211ENST00000503687 FEZ1Q99689 392 aa14.49□□□□□ -0.09
RABGEF1-211ENST00000503687 SPTLC3Q9NUV7 552 aa14.49□□□□□ -0.09
RABGEF1-211ENST00000503687 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa14.49□□□□□ -0.09
RABGEF1-211ENST00000503687 ARID5AQ03989 594 aa14.48□□□□□ -0.09
RABGEF1-211ENST00000503687 UCHL5Q9Y5K5 329 aaKnown RBP eCLIP14.48□□□□□ -0.092e-7■■■□□ 16.3
RABGEF1-211ENST00000503687 BAZ2BQ9UIF8 2168 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
RABGEF1-211ENST00000503687 GOLGA6L9A6NEM1 432 aa14.48□□□□□ -0.09
RABGEF1-211ENST00000503687 ARHGAP6O43182 974 aa14.48□□□□□ -0.09
RABGEF1-211ENST00000503687 PPP2R3AQ06190 1150 aa14.48□□□□□ -0.09
RABGEF1-211ENST00000503687 SMAP1Q8IYB5 467 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
RABGEF1-211ENST00000503687 KLHL34Q8N239 644 aa14.48□□□□□ -0.09
RABGEF1-211ENST00000503687 CCDC148Q8NFR7 591 aa14.48□□□□□ -0.09
RABGEF1-211ENST00000503687 DPF2Q92785 391 aa14.48□□□□□ -0.09
RABGEF1-211ENST00000503687 SYMPKQ92797 1274 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
RABGEF1-211ENST00000503687 ZSCAN10Q96SZ4 725 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
RABGEF1-211ENST00000503687 SLF1Q9BQI6 1058 aa14.48□□□□□ -0.09
RABGEF1-211ENST00000503687 MMRN2Q9H8L6 949 aa14.48□□□□□ -0.09
RABGEF1-211ENST00000503687 KRT9P35527 623 aa14.48□□□□□ -0.09
RABGEF1-211ENST00000503687 RPS8P62241 208 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
RABGEF1-211ENST00000503687 LEKR1Q6ZMV7 388 aa14.48□□□□□ -0.09
RABGEF1-211ENST00000503687 EPC1Q9H2F5 836 aa14.48□□□□□ -0.09
RABGEF1-211ENST00000503687 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
RABGEF1-211ENST00000503687 FBXO3Q9UK99 471 aa14.48□□□□□ -0.09
RABGEF1-211ENST00000503687 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa14.48□□□□□ -0.09
RABGEF1-211ENST00000503687 MYO1BO43795 1136 aa14.47□□□□□ -0.09
RABGEF1-211ENST00000503687 SHC4Q6S5L8 630 aa14.47□□□□□ -0.09
RABGEF1-211ENST00000503687 CRACR2BQ8N4Y2 399 aaPredicted RBP14.47□□□□□ -0.09
RABGEF1-211ENST00000503687 TGFBRAP1Q8WUH2 860 aa14.47□□□□□ -0.09
RABGEF1-211ENST00000503687 EXOC1Q9NV70 894 aa14.47□□□□□ -0.09
RABGEF1-211ENST00000503687 DLG5Q8TDM6 1919 aa14.47□□□□□ -0.09
RABGEF1-211ENST00000503687 NMT2O60551 498 aa14.47□□□□□ -0.09
RABGEF1-211ENST00000503687 GDAP1L1Q96MZ0 367 aa14.47□□□□□ -0.09
RABGEF1-211ENST00000503687 PPP2R2CQ9Y2T4 447 aa14.47□□□□□ -0.09
RABGEF1-211ENST00000503687 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP14.47□□□□□ -0.09
RABGEF1-211ENST00000503687 PSMA7O14818 248 aa14.47□□□□□ -0.09
RABGEF1-211ENST00000503687 PLEKHA8P1O95397 391 aa14.47□□□□□ -0.09
RABGEF1-211ENST00000503687 USP49Q70CQ1 688 aa14.47□□□□□ -0.09
RABGEF1-211ENST00000503687 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP14.47□□□□□ -0.09
RABGEF1-211ENST00000503687 CTAGE1Q96RT6 745 aa14.47□□□□□ -0.09
RABGEF1-211ENST00000503687 ALDH8A1Q9H2A2 487 aaPredicted RBP14.47□□□□□ -0.09
RABGEF1-211ENST00000503687 FAM205CA6NFA0 338 aa14.47□□□□□ -0.09
RABGEF1-211ENST00000503687 AKR1B10O60218 316 aa14.47□□□□□ -0.09
RABGEF1-211ENST00000503687 ZNF287Q9HBT7 754 aa14.47□□□□□ -0.09
RABGEF1-211ENST00000503687 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP14.47□□□□□ -0.09
RABGEF1-211ENST00000503687 BMP15O95972 392 aa14.46□□□□□ -0.09
RABGEF1-211ENST00000503687 MMP1P03956 469 aa14.46□□□□□ -0.09
RABGEF1-211ENST00000503687 CALM1P0DP23 149 aa14.46□□□□□ -0.09
RABGEF1-211ENST00000503687 CALM2P0DP24 149 aa14.46□□□□□ -0.09
RABGEF1-211ENST00000503687 CALM3P0DP25 149 aa14.46□□□□□ -0.09
RABGEF1-211ENST00000503687 IFNAR1P17181 557 aa14.46□□□□□ -0.09
RABGEF1-211ENST00000503687 TNNI2P48788 182 aa14.46□□□□□ -0.09
RABGEF1-211ENST00000503687 CALML4Q96GE6 196 aa14.46□□□□□ -0.09
RABGEF1-211ENST00000503687 PSMB7Q99436 277 aa14.46□□□□□ -0.09
RABGEF1-211ENST00000503687 HNRNPUL1Q9BUJ2 856 aaKnown RBP eCLIP14.46□□□□□ -0.094e-6■■■■□ 23.2
RABGEF1-211ENST00000503687 MAN1B1Q9UKM7 699 aa14.46□□□□□ -0.09
RABGEF1-211ENST00000503687 CTAGE9A4FU28 777 aa14.46□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 107.6 ms