RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491443.2

AGO3-206, Transcript of argonaute 3, RISC catalytic component, human

TSL 2

Gene AGO3, Length 548 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
AGO3-206	ENST00000491443	HMGCS2	P54868	508 aa		13.6	□□□□□ -0.23
AGO3-206	ENST00000491443	UBE3C	Q15386	1083 aa		13.6	□□□□□ -0.23
AGO3-206	ENST00000491443	LCORL	Q8N3X6	602 aa		13.6	□□□□□ -0.23
AGO3-206	ENST00000491443	ECHDC1	Q9NTX5	307 aa		13.6	□□□□□ -0.23
AGO3-206	ENST00000491443	SRRD	Q9UH36	339 aa		13.6	□□□□□ -0.23
AGO3-206	ENST00000491443	PNMA3	Q9UL41	463 aa		13.6	□□□□□ -0.23
AGO3-206	ENST00000491443	C19orf81	C9J6K1	198 aa		13.59	□□□□□ -0.23
AGO3-206	ENST00000491443	GDF11	O95390	407 aa		13.59	□□□□□ -0.23
AGO3-206	ENST00000491443	OSBP	P22059	807 aa		13.59	□□□□□ -0.23
AGO3-206	ENST00000491443	HOXA7	P31268	230 aa	Predicted RBP	13.59	□□□□□ -0.23
AGO3-206	ENST00000491443	PLCD1	P51178	756 aa		13.59	□□□□□ -0.23
AGO3-206	ENST00000491443	MTMR2	Q13614	643 aa		13.59	□□□□□ -0.23
AGO3-206	ENST00000491443	FAM110C	Q1W6H9	321 aa		13.59	□□□□□ -0.23
AGO3-206	ENST00000491443	SLC9C1	Q4G0N8	1177 aa		13.59	□□□□□ -0.23
AGO3-206	ENST00000491443	SMCR8	Q8TEV9	937 aa	Predicted RBP	13.59	□□□□□ -0.23
AGO3-206	ENST00000491443	TRIM34	Q9BYJ4	488 aa		13.59	□□□□□ -0.23
AGO3-206	ENST00000491443	DDX24	Q9GZR7	859 aa	Known RBP eCLIP	13.59	□□□□□ -0.23
AGO3-206	ENST00000491443	DCP1A	Q9NPI6	582 aa	Predicted RBP	13.59	□□□□□ -0.23
AGO3-206	ENST00000491443	BRCA2	P51587	3418 aa		13.59	□□□□□ -0.23
AGO3-206	ENST00000491443	NAV1	Q8NEY1	1877 aa		13.59	□□□□□ -0.23
AGO3-206	ENST00000491443	USP17L10	C9JJH3	530 aa		13.58	□□□□□ -0.24
AGO3-206	ENST00000491443	HOXD10	P28358	340 aa		13.58	□□□□□ -0.24
AGO3-206	ENST00000491443	SHMT1	P34896	483 aa		13.58	□□□□□ -0.24
AGO3-206	ENST00000491443	GCLC	P48506	637 aa	Predicted RBP	13.58	□□□□□ -0.24
AGO3-206	ENST00000491443	FCGRT	P55899	365 aa		13.58	□□□□□ -0.24
AGO3-206	ENST00000491443	PABPC4	Q13310	644 aa	Known RBP eCLIP	13.58	□□□□□ -0.24
AGO3-206	ENST00000491443	SLC4A8	Q2Y0W8	1093 aa		13.58	□□□□□ -0.24
AGO3-206	ENST00000491443	ASCC2	Q9H1I8	757 aa	Predicted RBP	13.58	□□□□□ -0.24
AGO3-206	ENST00000491443	POTEF	A5A3E0	1075 aa		13.57	□□□□□ -0.24
AGO3-206	ENST00000491443	GH2	P01242	217 aa		13.57	□□□□□ -0.24
AGO3-206	ENST00000491443	CHGB	P05060	677 aa		13.57	□□□□□ -0.24
AGO3-206	ENST00000491443	SLFNL1	Q499Z3	407 aa		13.57	□□□□□ -0.24
AGO3-206	ENST00000491443	NBPF11	Q86T75	865 aa		13.57	□□□□□ -0.24
AGO3-206	ENST00000491443	SDR42E1	Q8WUS8	393 aa		13.57	□□□□□ -0.24
AGO3-206	ENST00000491443	C12orf42	Q96LP6	360 aa		13.57	□□□□□ -0.24
AGO3-206	ENST00000491443	ARMT1	Q9H993	441 aa		13.57	□□□□□ -0.24
AGO3-206	ENST00000491443	ATP8A2	Q9NTI2	1148 aa		13.57	□□□□□ -0.24
AGO3-206	ENST00000491443	MORF4L1	Q9UBU8	362 aa		13.57	□□□□□ -0.24
AGO3-206	ENST00000491443	MBD4	O95243	580 aa		13.56	□□□□□ -0.24
AGO3-206	ENST00000491443	FMNL1	O95466	1100 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
AGO3-206	ENST00000491443	PRKCZ	Q05513	592 aa		13.56	□□□□□ -0.24
AGO3-206	ENST00000491443	ZSCAN25	Q6NSZ9	544 aa		13.56	□□□□□ -0.24
AGO3-206	ENST00000491443	KBTBD3	Q8NAB2	608 aa		13.56	□□□□□ -0.24
AGO3-206	ENST00000491443	GPATCH3	Q96I76	525 aa		13.56	□□□□□ -0.24
AGO3-206	ENST00000491443	KIAA1683	Q9H0B3	1180 aa		13.56	□□□□□ -0.24
AGO3-206	ENST00000491443	MCM9	Q9NXL9	1143 aa		13.56	□□□□□ -0.24
AGO3-206	ENST00000491443	TMOD4	Q9NZQ9	345 aa		13.56	□□□□□ -0.24
AGO3-206	ENST00000491443	TTC41P	Q6P2S7	1318 aa		13.56	□□□□□ -0.24
AGO3-206	ENST00000491443	MYPN	Q86TC9	1320 aa		13.56	□□□□□ -0.24
AGO3-206	ENST00000491443	MYH7	P12883	1935 aa		13.56	□□□□□ -0.24
AGO3-206	ENST00000491443	MKI67	P46013	3256 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
AGO3-206	ENST00000491443	POLR3D	P05423	398 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
AGO3-206	ENST00000491443	GUCY1A2	P33402	732 aa		13.55	□□□□□ -0.24
AGO3-206	ENST00000491443	EVX2	Q03828	476 aa		13.55	□□□□□ -0.24
AGO3-206	ENST00000491443	IRF5	Q13568	498 aa		13.55	□□□□□ -0.24
AGO3-206	ENST00000491443	ABCB5	Q2M3G0	1257 aa		13.55	□□□□□ -0.24
AGO3-206	ENST00000491443	CERKL	Q49MI3	558 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
AGO3-206	ENST00000491443	ANKRD13C	Q8N6S4	541 aa		13.55	□□□□□ -0.24
AGO3-206	ENST00000491443	SH3TC2	Q8TF17	1288 aa		13.55	□□□□□ -0.24
AGO3-206	ENST00000491443	BCL11A	Q9H165	835 aa		13.55	□□□□□ -0.24
AGO3-206	ENST00000491443	EMILIN3	Q9NT22	766 aa		13.55	□□□□□ -0.24
AGO3-206	ENST00000491443	SALL3	Q9BXA9	1300 aa		13.55	□□□□□ -0.24
AGO3-206	ENST00000491443	MGAM	O43451	1857 aa		13.55	□□□□□ -0.24
AGO3-206	ENST00000491443	PRKAB2	O43741	272 aa		13.54	□□□□□ -0.24
AGO3-206	ENST00000491443	GRK4	P32298	578 aa		13.54	□□□□□ -0.24
AGO3-206	ENST00000491443	HDAC1	Q13547	482 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
AGO3-206	ENST00000491443	AAMP	Q13685	434 aa		13.54	□□□□□ -0.24
AGO3-206	ENST00000491443	USP17L2	Q6R6M4	530 aa		13.54	□□□□□ -0.24
AGO3-206	ENST00000491443	PI4K2B	Q8TCG2	481 aa		13.54	□□□□□ -0.24
AGO3-206	ENST00000491443	RAET1E	Q8TD07	263 aa		13.54	□□□□□ -0.24
AGO3-206	ENST00000491443	CRBN	Q96SW2	442 aa		13.54	□□□□□ -0.24
AGO3-206	ENST00000491443	PUS7L	Q9H0K6	701 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
AGO3-206	ENST00000491443	SWAP70	Q9UH65	585 aa		13.54	□□□□□ -0.24
AGO3-206	ENST00000491443	TNPO2	O14787	897 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
AGO3-206	ENST00000491443	CYP2D6	P10635	497 aa		13.53	□□□□□ -0.24
AGO3-206	ENST00000491443	USP14	P54578	494 aa		13.53	□□□□□ -0.24
AGO3-206	ENST00000491443	HERVK_113	P62684	666 aa		13.53	□□□□□ -0.24
AGO3-206	ENST00000491443	IRX3	P78415	501 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24
AGO3-206	ENST00000491443	C12orf60	Q5U649	245 aa		13.53	□□□□□ -0.24
AGO3-206	ENST00000491443	TSHZ3	Q63HK5	1081 aa		13.53	□□□□□ -0.24
AGO3-206	ENST00000491443	POTEE	Q6S8J3	1075 aa		13.53	□□□□□ -0.24
AGO3-206	ENST00000491443	SLAIN1	Q8ND83	568 aa		13.53	□□□□□ -0.24
AGO3-206	ENST00000491443	PXYLP1	Q8TE99	480 aa		13.53	□□□□□ -0.24
AGO3-206	ENST00000491443	GTF3C2	Q8WUA4	911 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24
AGO3-206	ENST00000491443	APPBP2	Q92624	585 aa		13.53	□□□□□ -0.24
AGO3-206	ENST00000491443	P2RX7	Q99572	595 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
AGO3-206	ENST00000491443	TMEM106C	Q9BVX2	250 aa		13.53	□□□□□ -0.24
AGO3-206	ENST00000491443	CABP5	Q9NP86	173 aa		13.53	□□□□□ -0.24
AGO3-206	ENST00000491443	GABRQ	Q9UN88	632 aa		13.53	□□□□□ -0.24
AGO3-206	ENST00000491443	ERC2	O15083	957 aa		13.52	□□□□□ -0.25
AGO3-206	ENST00000491443	GLRX3	O76003	335 aa	Known RBP	13.52	□□□□□ -0.25
AGO3-206	ENST00000491443	ECM2	O94769	699 aa	Predicted RBP	13.52	□□□□□ -0.25
AGO3-206	ENST00000491443	ZFY	P08048	801 aa	Predicted RBP	13.52	□□□□□ -0.25
AGO3-206	ENST00000491443	VCAM1	P19320	739 aa		13.52	□□□□□ -0.25
AGO3-206	ENST00000491443	FLT3LG	P49771	235 aa		13.52	□□□□□ -0.25
AGO3-206	ENST00000491443	RAB3GAP1	Q15042	981 aa		13.52	□□□□□ -0.25
AGO3-206	ENST00000491443	GIMAP6	Q6P9H5	292 aa		13.52	□□□□□ -0.25
AGO3-206	ENST00000491443	C16orf86	Q6ZW13	317 aa		13.52	□□□□□ -0.25
AGO3-206	ENST00000491443	SLC44A5	Q8NCS7	719 aa		13.52	□□□□□ -0.25
AGO3-206	ENST00000491443	ACER1	Q8TDN7	264 aa		13.52	□□□□□ -0.25

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 135.7 ms