RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491266.5

RABGGTB-212, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, human

TSL 3

Gene RABGGTB, Length 961 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RABGGTB-212	ENST00000491266	ORC1	Q13415	861 aa		7.87	□□□□□ -1.15
RABGGTB-212	ENST00000491266	ITPK1	Q13572	414 aa		7.87	□□□□□ -1.15
RABGGTB-212	ENST00000491266	DNAJC10	Q8IXB1	793 aa		7.87	□□□□□ -1.15
RABGGTB-212	ENST00000491266	CSRNP1	Q96S65	589 aa		7.87	□□□□□ -1.15
RABGGTB-212	ENST00000491266	ABI2	Q9NYB9	513 aa	Predicted RBP	7.87	□□□□□ -1.15
RABGGTB-212	ENST00000491266	TMOD3	Q9NYL9	352 aa		7.87	□□□□□ -1.15
RABGGTB-212	ENST00000491266	FOXD3	Q9UJU5	478 aa	Predicted RBP	7.87	□□□□□ -1.15
RABGGTB-212	ENST00000491266	PAPPA	Q13219	1627 aa		7.86	□□□□□ -1.15
RABGGTB-212	ENST00000491266	SASH3	O75995	380 aa		7.86	□□□□□ -1.15
RABGGTB-212	ENST00000491266	MAP3K6	O95382	1288 aa		7.86	□□□□□ -1.15
RABGGTB-212	ENST00000491266	NEFL	P07196	543 aa		7.86	□□□□□ -1.15
RABGGTB-212	ENST00000491266	CT47B1	P0C2W7	299 aa	Predicted RBP	7.86	□□□□□ -1.15
RABGGTB-212	ENST00000491266	ZNF16	P17020	682 aa	Predicted RBP	7.86	□□□□□ -1.15
RABGGTB-212	ENST00000491266	TARS	P26639	723 aa	Known RBP	7.86	□□□□□ -1.15
RABGGTB-212	ENST00000491266	EAPP	Q56P03	285 aa	Predicted RBP	7.86	□□□□□ -1.15
RABGGTB-212	ENST00000491266	KRT27	Q7Z3Y8	459 aa		7.86	□□□□□ -1.15
RABGGTB-212	ENST00000491266	AMIGO3	Q86WK7	504 aa		7.86	□□□□□ -1.15
RABGGTB-212	ENST00000491266	TTC16	Q8NEE8	873 aa		7.86	□□□□□ -1.15
RABGGTB-212	ENST00000491266	PHAX	Q9H814	394 aa	Known RBP	7.86	□□□□□ -1.15
RABGGTB-212	ENST00000491266	AVEN	Q9NQS1	362 aa	Predicted RBP	7.86	□□□□□ -1.15
RABGGTB-212	ENST00000491266	CNTN3	Q9P232	1028 aa		7.86	□□□□□ -1.15
RABGGTB-212	ENST00000491266	NOB1	Q9ULX3	412 aa	Known RBP	7.86	□□□□□ -1.15
RABGGTB-212	ENST00000491266	EIF1AY	O14602	144 aa	Known RBP	7.85	□□□□□ -1.15
RABGGTB-212	ENST00000491266	MMP20	O60882	483 aa		7.85	□□□□□ -1.15
RABGGTB-212	ENST00000491266	A1BG	P04217	495 aa		7.85	□□□□□ -1.15
RABGGTB-212	ENST00000491266	TRIM27	P14373	513 aa		7.85	□□□□□ -1.15
RABGGTB-212	ENST00000491266	EIF2S2	P20042	333 aa	Known RBP	7.85	□□□□□ -1.15
RABGGTB-212	ENST00000491266	TAGLN	Q01995	201 aa	Known RBP	7.85	□□□□□ -1.15
RABGGTB-212	ENST00000491266	NFX1	Q12986	1120 aa	Known RBP	7.85	□□□□□ -1.15
RABGGTB-212	ENST00000491266	ALDH1L2	Q3SY69	923 aa		7.85	□□□□□ -1.15
RABGGTB-212	ENST00000491266	SMIM5	Q71RC9	77 aa		7.85	□□□□□ -1.15
RABGGTB-212	ENST00000491266	OR13H1	Q8NG92	308 aa		7.85	□□□□□ -1.15
RABGGTB-212	ENST00000491266	PANK1	Q8TE04	598 aa		7.85	□□□□□ -1.15
RABGGTB-212	ENST00000491266	SYTL4	Q96C24	671 aa	Predicted RBP	7.85	□□□□□ -1.15
RABGGTB-212	ENST00000491266	ZFYVE28	Q9HCC9	887 aa		7.85	□□□□□ -1.15
RABGGTB-212	ENST00000491266	SMC4	Q9NTJ3	1288 aa		7.85	□□□□□ -1.15
RABGGTB-212	ENST00000491266	CHPF2	Q9P2E5	772 aa		7.85	□□□□□ -1.15
RABGGTB-212	ENST00000491266	GTF3C5	Q9Y5Q8	519 aa	Predicted RBP	7.85	□□□□□ -1.15
RABGGTB-212	ENST00000491266	ERBB4	Q15303	1308 aa		7.84	□□□□□ -1.15
RABGGTB-212	ENST00000491266	DOT1L	Q8TEK3	1739 aa		7.84	□□□□□ -1.15
RABGGTB-212	ENST00000491266	PNMA6F	A0A0J9YX94	578 aa		7.84	□□□□□ -1.15
RABGGTB-212	ENST00000491266	CPNE3	O75131	537 aa	Known RBP	7.84	□□□□□ -1.15
RABGGTB-212	ENST00000491266	TRIM37	O94972	964 aa		7.84	□□□□□ -1.15
RABGGTB-212	ENST00000491266	HOXB7	P09629	217 aa		7.84	□□□□□ -1.15
RABGGTB-212	ENST00000491266	SNRPA1	P09661	255 aa	Known RBP	7.84	□□□□□ -1.15
RABGGTB-212	ENST00000491266	CYP19A1	P11511	503 aa	Predicted RBP	7.84	□□□□□ -1.15
RABGGTB-212	ENST00000491266	NFKB1	P19838	968 aa		7.84	□□□□□ -1.15
RABGGTB-212	ENST00000491266	SOX18	P35713	384 aa		7.84	□□□□□ -1.15
RABGGTB-212	ENST00000491266	ZNF468	Q5VIY5	522 aa	Predicted RBP	7.84	□□□□□ -1.15
RABGGTB-212	ENST00000491266	INTS5	Q6P9B9	1019 aa	Known RBP	7.84	□□□□□ -1.15
RABGGTB-212	ENST00000491266	C1orf127	Q8N9H9	656 aa		7.84	□□□□□ -1.15
RABGGTB-212	ENST00000491266	EXOC6	Q8TAG9	804 aa		7.84	□□□□□ -1.15
RABGGTB-212	ENST00000491266	GIPC2	Q8TF65	315 aa		7.84	□□□□□ -1.15
RABGGTB-212	ENST00000491266	FMNL2	Q96PY5	1086 aa		7.84	□□□□□ -1.15
RABGGTB-212	ENST00000491266	CRBN	Q96SW2	442 aa		7.84	□□□□□ -1.15
RABGGTB-212	ENST00000491266	MDFI	Q99750	246 aa		7.84	□□□□□ -1.15
RABGGTB-212	ENST00000491266	LRRC4B	Q9NT99	713 aa		7.84	□□□□□ -1.15
RABGGTB-212	ENST00000491266	PALLD	Q8WX93	1383 aa		7.84	□□□□□ -1.16
RABGGTB-212	ENST00000491266	LOC102724428	A0A0B4J2F2	783 aa		7.83	□□□□□ -1.16
RABGGTB-212	ENST00000491266		F6X3S4	739 aa		7.83	□□□□□ -1.16
RABGGTB-212	ENST00000491266	PHACTR2	O75167	634 aa		7.83	□□□□□ -1.16
RABGGTB-212	ENST00000491266	PRPF40A	O75400	957 aa	Known RBP	7.83	□□□□□ -1.16
RABGGTB-212	ENST00000491266	RARA	P10276	462 aa		7.83	□□□□□ -1.16
RABGGTB-212	ENST00000491266	MX2	P20592	715 aa		7.83	□□□□□ -1.16
RABGGTB-212	ENST00000491266	MAPK8	P45983	427 aa		7.83	□□□□□ -1.16
RABGGTB-212	ENST00000491266	SIK1	P57059	783 aa		7.83	□□□□□ -1.16
RABGGTB-212	ENST00000491266	KRT25	Q7Z3Z0	450 aa		7.83	□□□□□ -1.16
RABGGTB-212	ENST00000491266	LINC00116	Q8NCU8	138 aa		7.83	□□□□□ -1.16
RABGGTB-212	ENST00000491266	FBF1	Q8TES7	1133 aa		7.83	□□□□□ -1.16
RABGGTB-212	ENST00000491266	FRAT1	Q92837	279 aa	Predicted RBP	7.83	□□□□□ -1.16
RABGGTB-212	ENST00000491266	TLR7	Q9NYK1	1049 aa	Known RBP	7.83	□□□□□ -1.16
RABGGTB-212	ENST00000491266	UBR2	Q8IWV8	1755 aa		7.83	□□□□□ -1.16
RABGGTB-212	ENST00000491266	ADCY9	O60503	1353 aa		7.83	□□□□□ -1.16
RABGGTB-212	ENST00000491266	C5	P01031	1676 aa		7.83	□□□□□ -1.16
RABGGTB-212	ENST00000491266	BRWD3	Q6RI45	1802 aa		7.82	□□□□□ -1.16
RABGGTB-212	ENST00000491266	SOS1	Q07889	1333 aa	Predicted RBP	7.82	□□□□□ -1.16
RABGGTB-212	ENST00000491266	SIN3B	O75182	1162 aa		7.82	□□□□□ -1.16
RABGGTB-212	ENST00000491266	KIF4A	O95239	1232 aa		7.82	□□□□□ -1.16
RABGGTB-212	ENST00000491266	LDHB	P07195	334 aa	Known RBP	7.82	□□□□□ -1.16
RABGGTB-212	ENST00000491266	ARAF	P10398	606 aa		7.82	□□□□□ -1.16
RABGGTB-212	ENST00000491266	FGD1	P98174	961 aa		7.82	□□□□□ -1.16
RABGGTB-212	ENST00000491266	USPL1	Q5W0Q7	1092 aa		7.82	□□□□□ -1.16
RABGGTB-212	ENST00000491266	ALG1L	Q6GMV1	187 aa		7.82	□□□□□ -1.16
RABGGTB-212	ENST00000491266	ATF7IP	Q6VMQ6	1270 aa		7.82	□□□□□ -1.16
RABGGTB-212	ENST00000491266	FAM196A	Q6ZSG2	479 aa		7.82	□□□□□ -1.16
RABGGTB-212	ENST00000491266	TTLL7	Q6ZT98	887 aa		7.82	□□□□□ -1.16
RABGGTB-212	ENST00000491266	RAB44	Q7Z6P3	723 aa	Predicted RBP	7.82	□□□□□ -1.16
RABGGTB-212	ENST00000491266	TTC5	Q8N0Z6	440 aa		7.82	□□□□□ -1.16
RABGGTB-212	ENST00000491266	BHMT	Q93088	406 aa		7.82	□□□□□ -1.16
RABGGTB-212	ENST00000491266	PMEPA1	Q969W9	287 aa		7.82	□□□□□ -1.16
RABGGTB-212	ENST00000491266	ZNF428	Q96B54	188 aa		7.82	□□□□□ -1.16
RABGGTB-212	ENST00000491266	PNMA5	Q96PV4	448 aa		7.82	□□□□□ -1.16
RABGGTB-212	ENST00000491266	SETDB2	Q96T68	719 aa		7.82	□□□□□ -1.16
RABGGTB-212	ENST00000491266	DDX21	Q9NR30	783 aa	Known RBP eCLIP	7.82	□□□□□ -1.16
RABGGTB-212	ENST00000491266	KLF15	Q9UIH9	416 aa		7.82	□□□□□ -1.16
RABGGTB-212	ENST00000491266	WWC3	Q9ULE0	1092 aa		7.82	□□□□□ -1.16
RABGGTB-212	ENST00000491266	ITGB4	P16144	1822 aa		7.82	□□□□□ -1.16
RABGGTB-212	ENST00000491266	ABCC4	O15439	1325 aa		7.81	□□□□□ -1.16
RABGGTB-212	ENST00000491266	UNCX	A6NJT0	531 aa		7.81	□□□□□ -1.16
RABGGTB-212	ENST00000491266	EREG	O14944	169 aa		7.81	□□□□□ -1.16

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.9 ms